Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JXM4

Protein Details
Accession C4JXM4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
249-273DPDDETRPSKRRKNKGRLKDEEDDYAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-265PSKRRKNKGR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
KEGG ure:UREG_06397  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11404  bHLHzip_Mlx_like  
Amino Acid Sequences MSEHVHGHGGRSAPGPFGCDHGAGNSGFHFEWPDLPPTFEGSTTSLPSQPLVPQRIHRQTTMPDKAGPPSSDVLAAASMLYQNGMNGNDYSSTFTSQIFTENGLEDLSSHQAHIKQARYGLGEENRRLRFNSTRRNHTYTDTAFPPKAGPDTESEPAPHKEQIFGPLRWGSDAGFAEQGYQVPADQPTMEERTTEILHNLECFESQSSAPNTRPSSPNPRRRPGRNGSGLGALRSPDSFQQSSPIDRTDPDDETRPSKRRKNKGRLKDEEDDYLQPSLGRPSNSRRDRRWSSNSGAQSRRSKIHVIKPPRENLSEEQKRANHILSEQKRRNLIKQGFDELCGLVPDLRGGGFSKSTMLAQAGDWLQDLLEGNEILKHQLEDLKAQTGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.19
4 0.22
5 0.21
6 0.2
7 0.19
8 0.17
9 0.2
10 0.17
11 0.18
12 0.14
13 0.15
14 0.14
15 0.14
16 0.15
17 0.12
18 0.17
19 0.19
20 0.23
21 0.21
22 0.23
23 0.24
24 0.26
25 0.26
26 0.22
27 0.21
28 0.2
29 0.22
30 0.23
31 0.24
32 0.22
33 0.22
34 0.22
35 0.22
36 0.24
37 0.28
38 0.3
39 0.31
40 0.36
41 0.46
42 0.55
43 0.56
44 0.52
45 0.49
46 0.53
47 0.59
48 0.6
49 0.53
50 0.47
51 0.46
52 0.48
53 0.49
54 0.42
55 0.35
56 0.29
57 0.27
58 0.24
59 0.22
60 0.18
61 0.12
62 0.11
63 0.08
64 0.07
65 0.06
66 0.05
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.15
78 0.14
79 0.15
80 0.15
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.16
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.11
91 0.11
92 0.09
93 0.1
94 0.11
95 0.1
96 0.1
97 0.12
98 0.14
99 0.18
100 0.24
101 0.25
102 0.24
103 0.26
104 0.28
105 0.28
106 0.27
107 0.29
108 0.3
109 0.33
110 0.34
111 0.4
112 0.4
113 0.39
114 0.39
115 0.37
116 0.4
117 0.43
118 0.51
119 0.5
120 0.58
121 0.63
122 0.67
123 0.64
124 0.58
125 0.56
126 0.48
127 0.45
128 0.39
129 0.36
130 0.31
131 0.3
132 0.27
133 0.21
134 0.2
135 0.16
136 0.14
137 0.13
138 0.18
139 0.19
140 0.18
141 0.19
142 0.21
143 0.22
144 0.23
145 0.22
146 0.18
147 0.19
148 0.19
149 0.26
150 0.27
151 0.25
152 0.26
153 0.26
154 0.25
155 0.24
156 0.23
157 0.16
158 0.14
159 0.15
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.08
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.12
180 0.13
181 0.13
182 0.11
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.12
194 0.13
195 0.16
196 0.17
197 0.21
198 0.23
199 0.24
200 0.27
201 0.27
202 0.37
203 0.44
204 0.54
205 0.57
206 0.64
207 0.69
208 0.72
209 0.77
210 0.73
211 0.73
212 0.7
213 0.64
214 0.56
215 0.54
216 0.48
217 0.39
218 0.32
219 0.23
220 0.16
221 0.14
222 0.13
223 0.1
224 0.14
225 0.14
226 0.14
227 0.19
228 0.2
229 0.22
230 0.23
231 0.22
232 0.18
233 0.18
234 0.22
235 0.21
236 0.21
237 0.21
238 0.24
239 0.24
240 0.29
241 0.36
242 0.39
243 0.44
244 0.5
245 0.58
246 0.64
247 0.74
248 0.79
249 0.83
250 0.86
251 0.89
252 0.89
253 0.87
254 0.84
255 0.76
256 0.69
257 0.62
258 0.52
259 0.43
260 0.35
261 0.27
262 0.19
263 0.17
264 0.17
265 0.17
266 0.18
267 0.19
268 0.27
269 0.38
270 0.47
271 0.54
272 0.55
273 0.62
274 0.68
275 0.74
276 0.74
277 0.7
278 0.68
279 0.68
280 0.7
281 0.68
282 0.65
283 0.63
284 0.62
285 0.59
286 0.56
287 0.52
288 0.51
289 0.51
290 0.56
291 0.58
292 0.61
293 0.66
294 0.7
295 0.73
296 0.71
297 0.66
298 0.61
299 0.57
300 0.58
301 0.57
302 0.52
303 0.52
304 0.49
305 0.51
306 0.49
307 0.46
308 0.36
309 0.32
310 0.41
311 0.42
312 0.52
313 0.54
314 0.56
315 0.62
316 0.64
317 0.66
318 0.66
319 0.64
320 0.62
321 0.6
322 0.63
323 0.56
324 0.54
325 0.49
326 0.38
327 0.32
328 0.24
329 0.19
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.09
336 0.1
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.14
342 0.14
343 0.15
344 0.15
345 0.13
346 0.12
347 0.17
348 0.16
349 0.15
350 0.15
351 0.14
352 0.12
353 0.13
354 0.14
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.12
360 0.13
361 0.13
362 0.14
363 0.13
364 0.14
365 0.18
366 0.2
367 0.23
368 0.25