FuNGI

C4JV04

Protein Details

Accession

C4JV04

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
145-166	DETQEKLSKTRRKRPIPEDWAT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 18.5, cyto_nucl 12.833, cyto_mito 11.166, nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024977 Apc4-like_WD40_dom IPR013915 Pre-mRNA_splic_Prp19 IPR038959 Prp19 IPR003613 Ubox_domain IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0000974 C:Prp19 complex GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0061630 F:ubiquitin protein ligase activity GO:0006281 P:DNA repair GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0070534 P:protein K63-linked ubiquitination
KEGG	ure:UREG_04957 -
Pfam	View protein in Pfam PF12894 ANAPC4_WD40 PF08606 Prp19
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2

Amino Acid Sequences

MIGNVFEKRLIEAYIAEHGKEPVTGEEITIDDLIELKSARVVRPRPPTLTSIPSLLGVFQEEWDALALETFTLRQTLAQTRQELSTALYQHDAAVRVIARLRKERDEARDALSKVSVGAGRASASGDAMQVDSTGLPEAVVTRIDETQEKLSKTRRKRPIPEDWATTETVQQFKPVTASDPLYPGGKSLSLNESGELALVGGVDGVAGIYSLTDRSIIASLKGGGGAITDAIWVKEKAVISTSTGLVKVFENGDEIASFNSHAGEVMALAKHPTGDIVASVGVDKSYVLYDLTTATVVAQIFSDSALSCVQFHPDGHLLAAGAGDGQIKIFDVKTGTNAASFTCSGALKTVFFSENGIWLASVTEGSSSVSIWDLRKSEVVKVLEIGNRVDSLSWDYTGQFLLTGGPNGLTVQQYSKSAKSWSEPLRSAVPAVAVAWGRLAQQIVALNAEGVITLVGSG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.24
3	0.22
4	0.22
5	0.22
6	0.21
7	0.21
8	0.2
9	0.13
10	0.16
11	0.15
12	0.14
13	0.14
14	0.14
15	0.16
16	0.14
17	0.12
18	0.08
19	0.1
20	0.1
21	0.1
22	0.09
23	0.08
24	0.12
25	0.15
26	0.18
27	0.26
28	0.3
29	0.38
30	0.48
31	0.54
32	0.55
33	0.56
34	0.58
35	0.55
36	0.57
37	0.5
38	0.42
39	0.37
40	0.33
41	0.29
42	0.24
43	0.18
44	0.15
45	0.13
46	0.11
47	0.11
48	0.09
49	0.1
50	0.1
51	0.1
52	0.07
53	0.07
54	0.07
55	0.06
56	0.06
57	0.06
58	0.06
59	0.06
60	0.06
61	0.07
62	0.12
63	0.2
64	0.27
65	0.32
66	0.34
67	0.36
68	0.36
69	0.36
70	0.32
71	0.27
72	0.25
73	0.21
74	0.19
75	0.18
76	0.18
77	0.18
78	0.2
79	0.19
80	0.14
81	0.15
82	0.14
83	0.14
84	0.18
85	0.2
86	0.22
87	0.29
88	0.33
89	0.36
90	0.41
91	0.46
92	0.5
93	0.53
94	0.51
95	0.48
96	0.5
97	0.46
98	0.41
99	0.35
100	0.28
101	0.21
102	0.21
103	0.17
104	0.11
105	0.11
106	0.1
107	0.1
108	0.1
109	0.11
110	0.08
111	0.08
112	0.08
113	0.07
114	0.07
115	0.06
116	0.06
117	0.06
118	0.06
119	0.05
120	0.05
121	0.05
122	0.05
123	0.05
124	0.05
125	0.05
126	0.06
127	0.06
128	0.06
129	0.08
130	0.08
131	0.1
132	0.11
133	0.12
134	0.18
135	0.22
136	0.23
137	0.26
138	0.34
139	0.42
140	0.5
141	0.58
142	0.62
143	0.68
144	0.76
145	0.81
146	0.83
147	0.83
148	0.79
149	0.73
150	0.67
151	0.59
152	0.51
153	0.43
154	0.35
155	0.28
156	0.25
157	0.2
158	0.19
159	0.17
160	0.15
161	0.16
162	0.13
163	0.14
164	0.14
165	0.16
166	0.14
167	0.16
168	0.16
169	0.16
170	0.15
171	0.13
172	0.11
173	0.1
174	0.1
175	0.1
176	0.12
177	0.13
178	0.13
179	0.13
180	0.13
181	0.12
182	0.11
183	0.09
184	0.06
185	0.04
186	0.04
187	0.03
188	0.02
189	0.02
190	0.02
191	0.02
192	0.02
193	0.01
194	0.02
195	0.02
196	0.02
197	0.02
198	0.02
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.04
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.07
207	0.08
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.05
212	0.04
213	0.04
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.04
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.1
226	0.1
227	0.1
228	0.12
229	0.12
230	0.11
231	0.11
232	0.1
233	0.1
234	0.09
235	0.09
236	0.08
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.08
241	0.07
242	0.07
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.05
275	0.05
276	0.04
277	0.05
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.05
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.07
291	0.04
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.07
296	0.08
297	0.1
298	0.1
299	0.1
300	0.13
301	0.15
302	0.15
303	0.14
304	0.14
305	0.12
306	0.1
307	0.1
308	0.06
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.05
317	0.05
318	0.06
319	0.07
320	0.08
321	0.1
322	0.13
323	0.13
324	0.13
325	0.13
326	0.12
327	0.14
328	0.13
329	0.12
330	0.12
331	0.11
332	0.11
333	0.13
334	0.14
335	0.11
336	0.12
337	0.14
338	0.13
339	0.13
340	0.15
341	0.13
342	0.15
343	0.15
344	0.14
345	0.11
346	0.1
347	0.11
348	0.09
349	0.08
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.08
358	0.1
359	0.11
360	0.15
361	0.15
362	0.17
363	0.21
364	0.22
365	0.25
366	0.3
367	0.3
368	0.27
369	0.27
370	0.3
371	0.29
372	0.29
373	0.26
374	0.2
375	0.18
376	0.18
377	0.16
378	0.13
379	0.16
380	0.16
381	0.16
382	0.15
383	0.15
384	0.16
385	0.16
386	0.15
387	0.1
388	0.08
389	0.1
390	0.1
391	0.11
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.11
396	0.13
397	0.11
398	0.11
399	0.13
400	0.15
401	0.19
402	0.23
403	0.25
404	0.26
405	0.28
406	0.3
407	0.31
408	0.39
409	0.43
410	0.47
411	0.47
412	0.48
413	0.5
414	0.47
415	0.44
416	0.36
417	0.28
418	0.21
419	0.19
420	0.19
421	0.14
422	0.13
423	0.13
424	0.13
425	0.12
426	0.14
427	0.14
428	0.1
429	0.13
430	0.15
431	0.15
432	0.15
433	0.14
434	0.13
435	0.12
436	0.12
437	0.09
438	0.06
439	0.05

C4JV04

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer