Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JHB6

Protein Details
Accession C4JHB6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-42AIEETRKLKLQKKAEREREKVLRFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-34LKLQKKAER
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 14, nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG ure:UREG_02689  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MQLINTAIYDQEAQARAKAIEETRKLKLQKKAEREREKVLRFAQHIGVPASAPDPGIIGARPDSYKVVIQDIPFQVVKGGSKLVRLSNDPTTANATPKRVSVGGVAFVRSKNGNLHRLGAVVSKKKTGVVKKKDELCKRFTATGTCYKGPKCPYIHDPNKVAICKEFLQTGKCNAGPACDLSHEPSPERSPTCVHFLRGRCSNPECRYAHVRVTPGAPVCRNFAILGFCDKGAECCDRHVVECPDYANTGKCNKQKCPLPHIDRAGQIRKLAANKAGNNNAEEENDDAEDISSEEENYDEIDSDDVDSDELDDEPEFINAGAQAGEEVMNQDDFIGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.21
4 0.21
5 0.26
6 0.25
7 0.31
8 0.38
9 0.41
10 0.44
11 0.51
12 0.56
13 0.59
14 0.62
15 0.64
16 0.66
17 0.72
18 0.78
19 0.82
20 0.86
21 0.84
22 0.85
23 0.84
24 0.78
25 0.74
26 0.69
27 0.65
28 0.58
29 0.56
30 0.5
31 0.42
32 0.42
33 0.36
34 0.31
35 0.23
36 0.21
37 0.17
38 0.14
39 0.11
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.12
48 0.13
49 0.14
50 0.15
51 0.16
52 0.18
53 0.18
54 0.21
55 0.21
56 0.21
57 0.27
58 0.26
59 0.28
60 0.25
61 0.24
62 0.21
63 0.19
64 0.19
65 0.13
66 0.16
67 0.13
68 0.16
69 0.18
70 0.2
71 0.22
72 0.24
73 0.27
74 0.28
75 0.31
76 0.29
77 0.28
78 0.3
79 0.29
80 0.31
81 0.3
82 0.29
83 0.26
84 0.26
85 0.28
86 0.22
87 0.22
88 0.19
89 0.18
90 0.19
91 0.19
92 0.2
93 0.18
94 0.18
95 0.19
96 0.16
97 0.16
98 0.18
99 0.23
100 0.28
101 0.27
102 0.3
103 0.29
104 0.29
105 0.28
106 0.26
107 0.25
108 0.25
109 0.25
110 0.25
111 0.24
112 0.27
113 0.32
114 0.37
115 0.43
116 0.46
117 0.54
118 0.59
119 0.67
120 0.73
121 0.76
122 0.71
123 0.66
124 0.62
125 0.56
126 0.52
127 0.45
128 0.4
129 0.35
130 0.39
131 0.38
132 0.34
133 0.34
134 0.32
135 0.36
136 0.36
137 0.37
138 0.31
139 0.3
140 0.36
141 0.44
142 0.49
143 0.49
144 0.48
145 0.46
146 0.48
147 0.44
148 0.37
149 0.27
150 0.24
151 0.2
152 0.19
153 0.18
154 0.15
155 0.17
156 0.18
157 0.2
158 0.2
159 0.18
160 0.19
161 0.16
162 0.16
163 0.14
164 0.13
165 0.12
166 0.1
167 0.1
168 0.12
169 0.15
170 0.14
171 0.15
172 0.16
173 0.17
174 0.19
175 0.2
176 0.19
177 0.18
178 0.19
179 0.25
180 0.24
181 0.24
182 0.28
183 0.29
184 0.33
185 0.37
186 0.37
187 0.35
188 0.38
189 0.45
190 0.41
191 0.47
192 0.42
193 0.41
194 0.45
195 0.43
196 0.43
197 0.38
198 0.36
199 0.29
200 0.3
201 0.28
202 0.25
203 0.26
204 0.22
205 0.2
206 0.22
207 0.21
208 0.2
209 0.17
210 0.16
211 0.15
212 0.14
213 0.16
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.14
220 0.16
221 0.13
222 0.14
223 0.19
224 0.19
225 0.2
226 0.26
227 0.27
228 0.25
229 0.26
230 0.25
231 0.22
232 0.23
233 0.23
234 0.18
235 0.18
236 0.22
237 0.28
238 0.32
239 0.37
240 0.4
241 0.48
242 0.54
243 0.58
244 0.62
245 0.65
246 0.67
247 0.69
248 0.71
249 0.67
250 0.63
251 0.64
252 0.61
253 0.53
254 0.46
255 0.4
256 0.39
257 0.38
258 0.35
259 0.36
260 0.36
261 0.39
262 0.45
263 0.49
264 0.47
265 0.44
266 0.44
267 0.38
268 0.32
269 0.27
270 0.21
271 0.17
272 0.15
273 0.14
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.08
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.07
305 0.08
306 0.07
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.07
313 0.06
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.09