Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JH42

Protein Details
Accession C4JH42    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
227-247SSSASRRRPGKRVSKRKAAAEHydrophilic
278-300IWLPDIRKRRKADLRPRGAQKDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-159KLRRTFRAERRGRE
231-253SRRRPGKRVSKRKAAAEIASKRK
285-290KRRKAD
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ure:UREG_01293  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MPFPIWCSTCQPPDSVLIGQGVRFNAEKKKVGNYYSTPIYSFRMKHGACGGWIEIRTDPKNTEYVVTEGARKKITSEFGKGDYEEDGVAEIRVKLPGEEGDVEDPLARLEGKVADKTKYMSAQTRMEELLKKQARDWDDPYEQSRKLRRTFRAERRGREAMEKKAEVLKDKMSLGIDLVEESEADNVRAGMVDFGSSASESVNGFPARTRTRPLFDSGQPTTSETSSSSASRRRPGKRVSKRKAAAEIASKRKAILQQEIKGNTKATIDPFLNDVNEIWLPDIRKRRKADLRPRGAQKDVDEDSPAIDDRGTDNIRDIEDRKQVAKSTENEQGKGVLSLVHYDSDTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.32
3 0.27
4 0.24
5 0.23
6 0.23
7 0.24
8 0.2
9 0.19
10 0.19
11 0.21
12 0.26
13 0.32
14 0.35
15 0.35
16 0.44
17 0.47
18 0.49
19 0.52
20 0.48
21 0.49
22 0.49
23 0.48
24 0.4
25 0.37
26 0.37
27 0.36
28 0.33
29 0.32
30 0.36
31 0.34
32 0.37
33 0.4
34 0.39
35 0.33
36 0.34
37 0.31
38 0.25
39 0.26
40 0.24
41 0.21
42 0.26
43 0.27
44 0.27
45 0.27
46 0.25
47 0.27
48 0.26
49 0.26
50 0.21
51 0.22
52 0.23
53 0.22
54 0.27
55 0.28
56 0.31
57 0.31
58 0.28
59 0.28
60 0.28
61 0.35
62 0.33
63 0.35
64 0.35
65 0.37
66 0.39
67 0.37
68 0.33
69 0.26
70 0.22
71 0.16
72 0.12
73 0.1
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.12
91 0.11
92 0.08
93 0.08
94 0.06
95 0.05
96 0.06
97 0.1
98 0.11
99 0.16
100 0.18
101 0.19
102 0.2
103 0.22
104 0.24
105 0.23
106 0.24
107 0.25
108 0.28
109 0.31
110 0.31
111 0.31
112 0.3
113 0.29
114 0.28
115 0.24
116 0.3
117 0.28
118 0.27
119 0.27
120 0.32
121 0.34
122 0.36
123 0.38
124 0.35
125 0.35
126 0.37
127 0.39
128 0.38
129 0.35
130 0.36
131 0.39
132 0.38
133 0.42
134 0.48
135 0.51
136 0.56
137 0.65
138 0.7
139 0.74
140 0.75
141 0.72
142 0.72
143 0.69
144 0.6
145 0.59
146 0.53
147 0.49
148 0.48
149 0.44
150 0.37
151 0.37
152 0.37
153 0.3
154 0.27
155 0.22
156 0.18
157 0.18
158 0.18
159 0.15
160 0.14
161 0.11
162 0.1
163 0.08
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.16
194 0.19
195 0.2
196 0.24
197 0.24
198 0.27
199 0.29
200 0.33
201 0.33
202 0.32
203 0.37
204 0.35
205 0.33
206 0.3
207 0.3
208 0.27
209 0.21
210 0.19
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.14
215 0.16
216 0.21
217 0.25
218 0.31
219 0.39
220 0.44
221 0.5
222 0.58
223 0.66
224 0.71
225 0.79
226 0.8
227 0.82
228 0.81
229 0.78
230 0.76
231 0.69
232 0.62
233 0.61
234 0.61
235 0.58
236 0.57
237 0.51
238 0.44
239 0.43
240 0.43
241 0.38
242 0.39
243 0.39
244 0.41
245 0.49
246 0.53
247 0.53
248 0.5
249 0.46
250 0.37
251 0.31
252 0.27
253 0.22
254 0.23
255 0.21
256 0.2
257 0.21
258 0.21
259 0.2
260 0.18
261 0.16
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.12
266 0.13
267 0.14
268 0.2
269 0.31
270 0.35
271 0.43
272 0.48
273 0.57
274 0.65
275 0.74
276 0.79
277 0.8
278 0.82
279 0.83
280 0.87
281 0.83
282 0.76
283 0.69
284 0.61
285 0.58
286 0.5
287 0.43
288 0.36
289 0.3
290 0.27
291 0.25
292 0.23
293 0.15
294 0.12
295 0.11
296 0.1
297 0.18
298 0.18
299 0.17
300 0.2
301 0.21
302 0.23
303 0.26
304 0.27
305 0.27
306 0.33
307 0.36
308 0.35
309 0.37
310 0.39
311 0.39
312 0.44
313 0.4
314 0.39
315 0.45
316 0.47
317 0.44
318 0.41
319 0.39
320 0.33
321 0.31
322 0.25
323 0.18
324 0.14
325 0.17
326 0.17
327 0.17