Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JSD4

Protein Details
Accession C4JSD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-79AEIRRYKPRTPGLRHLRRPVNDBasic
361-397WGLPAKSGYKTRPKRKVNKMVVTPRPRNQGKRRRGYNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-122AEIRRYKPRTPGLRHLRRPVNDHLWKGRPIHELTFPKKGQGKGGRNNTGHITVRHRGGGHKRRIR
345-395GGGRGKSKGNVHPKSPWGLPAKSGYKTRPKRKVNKMVVTPRPRNQGKRRRG
Subcellular Location(s) mito 24, nucl 1, plas 1, pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR022666  Rbsml_prot_L2_RNA-bd_dom  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR002171  Ribosomal_L2  
IPR022669  Ribosomal_L2_C  
IPR014726  Ribosomal_L2_dom3  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG ure:UREG_05373  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00181  Ribosomal_L2  
PF03947  Ribosomal_L2_C  
Amino Acid Sequences MLQPRIPLRGLQHSCKYFSSLLSRTYATVVESQPAAPEASVDTISSFVPPPSHAKGGAEIRRYKPRTPGLRHLRRPVNDHLWKGRPIHELTFPKKGQGKGGRNNTGHITVRHRGGGHKRRIRMVDFNRKEPGPHLVERIEHDPNRSAHIALIRSKLTKKRSYIIATEGMRAGDVVQSYRAGIPQDLWDSMGGVIDPGVLAARTAWRGNCLPLHMIPIGTLVYNVGLHKDKGGQLCRSAGTFATIVAKAFEGFDPESDVITDERGETKHLTLQDKHRLKKLSEHVTLRLQSGEIRLIHKDCCATIGVASNENYHYRQLGKAGRKRWLGIRPTVRGLAMNAMDHPHGGGRGKSKGNVHPKSPWGLPAKSGYKTRPKRKVNKMVVTPRPRNQGKRRRGYN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.54
3 0.53
4 0.44
5 0.42
6 0.43
7 0.37
8 0.37
9 0.37
10 0.36
11 0.32
12 0.32
13 0.29
14 0.22
15 0.23
16 0.21
17 0.2
18 0.2
19 0.19
20 0.18
21 0.19
22 0.17
23 0.12
24 0.11
25 0.1
26 0.11
27 0.12
28 0.11
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.12
33 0.11
34 0.1
35 0.11
36 0.13
37 0.19
38 0.23
39 0.25
40 0.25
41 0.25
42 0.31
43 0.39
44 0.43
45 0.45
46 0.47
47 0.5
48 0.6
49 0.63
50 0.6
51 0.6
52 0.63
53 0.66
54 0.67
55 0.72
56 0.73
57 0.8
58 0.84
59 0.84
60 0.83
61 0.77
62 0.75
63 0.72
64 0.72
65 0.68
66 0.66
67 0.64
68 0.6
69 0.6
70 0.58
71 0.55
72 0.5
73 0.47
74 0.44
75 0.45
76 0.48
77 0.49
78 0.55
79 0.49
80 0.49
81 0.51
82 0.49
83 0.5
84 0.52
85 0.57
86 0.57
87 0.66
88 0.69
89 0.64
90 0.65
91 0.59
92 0.53
93 0.47
94 0.41
95 0.38
96 0.32
97 0.34
98 0.34
99 0.32
100 0.34
101 0.42
102 0.48
103 0.52
104 0.55
105 0.57
106 0.61
107 0.64
108 0.62
109 0.62
110 0.62
111 0.63
112 0.6
113 0.6
114 0.59
115 0.54
116 0.5
117 0.42
118 0.39
119 0.33
120 0.3
121 0.29
122 0.27
123 0.28
124 0.3
125 0.33
126 0.32
127 0.27
128 0.28
129 0.29
130 0.28
131 0.31
132 0.29
133 0.24
134 0.2
135 0.23
136 0.24
137 0.22
138 0.25
139 0.22
140 0.24
141 0.28
142 0.33
143 0.36
144 0.4
145 0.39
146 0.41
147 0.46
148 0.48
149 0.45
150 0.43
151 0.43
152 0.37
153 0.35
154 0.31
155 0.24
156 0.2
157 0.17
158 0.13
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.06
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.04
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.09
193 0.1
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.16
200 0.13
201 0.13
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.08
206 0.07
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.11
216 0.14
217 0.18
218 0.23
219 0.22
220 0.22
221 0.24
222 0.24
223 0.22
224 0.2
225 0.15
226 0.12
227 0.11
228 0.1
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.08
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.07
249 0.08
250 0.09
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.15
255 0.2
256 0.24
257 0.27
258 0.35
259 0.43
260 0.5
261 0.52
262 0.55
263 0.55
264 0.52
265 0.56
266 0.57
267 0.57
268 0.56
269 0.56
270 0.54
271 0.56
272 0.56
273 0.47
274 0.38
275 0.29
276 0.23
277 0.21
278 0.22
279 0.17
280 0.18
281 0.2
282 0.21
283 0.22
284 0.22
285 0.21
286 0.17
287 0.17
288 0.16
289 0.13
290 0.12
291 0.17
292 0.17
293 0.19
294 0.19
295 0.19
296 0.2
297 0.22
298 0.22
299 0.18
300 0.18
301 0.17
302 0.18
303 0.23
304 0.3
305 0.37
306 0.43
307 0.48
308 0.54
309 0.56
310 0.58
311 0.59
312 0.59
313 0.55
314 0.58
315 0.61
316 0.57
317 0.58
318 0.57
319 0.49
320 0.42
321 0.37
322 0.33
323 0.25
324 0.21
325 0.18
326 0.18
327 0.18
328 0.17
329 0.16
330 0.11
331 0.12
332 0.14
333 0.16
334 0.2
335 0.26
336 0.3
337 0.34
338 0.39
339 0.46
340 0.55
341 0.57
342 0.57
343 0.57
344 0.59
345 0.6
346 0.55
347 0.54
348 0.5
349 0.45
350 0.44
351 0.46
352 0.47
353 0.46
354 0.51
355 0.51
356 0.55
357 0.65
358 0.72
359 0.74
360 0.79
361 0.84
362 0.9
363 0.93
364 0.92
365 0.92
366 0.92
367 0.92
368 0.92
369 0.92
370 0.89
371 0.85
372 0.85
373 0.83
374 0.83
375 0.84
376 0.84
377 0.84