Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CIE2

Protein Details
Accession Q6CIE2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-26GFDATGRKPRERKQQGEEDSLDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039900  Pat1-like  
IPR019167  PAT1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000290  P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA  
KEGG kla:KLLA0_F27357g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09770  PAT1  
Amino Acid Sequences MSFFGFDATGRKPRERKQQGEEDSLDFEETYQGLGDYEPEEDDLLNDETFGTGADLGTDFDFGYGKGELGAGSGSGRAPAPAPVSYASIANAKMNRQADCKPGFEQSLDMQPMESLWGNSSGNQQQQVQPQAPTQFQAPPQVQQQGAPNVEGLAIQSLDRQQQMAMPPQPGFYGMQPPQNPGYGFIPQGFPQGQYQQFPGQNIPPVIPNQFGNAGFPNQPVNPQEQFQQVPPIMYNQTQGNIAHHMQHPQMAMPPMQNQPPVQPQQPHQQQLPPQYLPQQHQQDQQHQQQHQQQQVFQQPHSVDTAARTQAVRSTQDYEHSNSPTPVPTESEQVPTPPHTPREYRRGPRRFGTQDPLTDEELRRLQIRQSKVDKILRHSGVMTPRDKDFITRYQLSQIVTDDPYNEDFYFQVYKIIQRGVTPSESNKDSIAKAYLEHSGHRLGGRYKRTDVALQRMQSQVEKAVTVAKERPQKSKGGLDNAKEGVLGKISATRNSKAPRKQLQIPTHKEDSPALSSQSSSALDEVSESLQGVDINAKRRRSSYALSSSVDHRTVLSRSGGRKFILSLIETVYEEVLELEAQLRSGQQPDSSKLWEALHVEDHGFDVSPFISILSFDKGIKIMPRIMNFLSREEKIKLFNCFFKELSHLNVIVISSYKTTPLPTKDQLKKMELFQSVFLKIIVSFLSSSAEFLEVMSLLINVIQNNNVSFITTSRIGLNLITVLISRAALMKQDVSRGKLLSSVEVSTWSEVYDRLFTSLETKLTAIFPTPEYMQHAISVYEQDSTQYDQSYIWQFLASLALSGKLNHQRILIDEVRDEIFEVISKAEELNAPSQQDPKLAYQRNKFYQDLNLFLNVMGLVARDGEITELK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.71
3 0.75
4 0.76
5 0.82
6 0.81
7 0.81
8 0.75
9 0.66
10 0.59
11 0.51
12 0.42
13 0.31
14 0.24
15 0.18
16 0.14
17 0.12
18 0.09
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.09
23 0.08
24 0.09
25 0.09
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.12
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.07
50 0.1
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.11
67 0.14
68 0.14
69 0.16
70 0.16
71 0.19
72 0.19
73 0.19
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.2
78 0.21
79 0.21
80 0.27
81 0.3
82 0.31
83 0.33
84 0.36
85 0.39
86 0.41
87 0.42
88 0.37
89 0.39
90 0.37
91 0.34
92 0.33
93 0.27
94 0.32
95 0.3
96 0.27
97 0.23
98 0.21
99 0.2
100 0.2
101 0.18
102 0.1
103 0.1
104 0.13
105 0.14
106 0.15
107 0.21
108 0.24
109 0.26
110 0.29
111 0.3
112 0.32
113 0.38
114 0.43
115 0.4
116 0.37
117 0.37
118 0.39
119 0.37
120 0.33
121 0.29
122 0.27
123 0.27
124 0.33
125 0.31
126 0.3
127 0.34
128 0.38
129 0.35
130 0.33
131 0.37
132 0.36
133 0.35
134 0.32
135 0.28
136 0.22
137 0.22
138 0.2
139 0.14
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.11
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.13
149 0.16
150 0.2
151 0.26
152 0.27
153 0.27
154 0.27
155 0.27
156 0.27
157 0.25
158 0.23
159 0.17
160 0.22
161 0.22
162 0.29
163 0.3
164 0.33
165 0.33
166 0.35
167 0.33
168 0.27
169 0.28
170 0.23
171 0.23
172 0.21
173 0.21
174 0.19
175 0.23
176 0.2
177 0.18
178 0.19
179 0.25
180 0.26
181 0.25
182 0.28
183 0.3
184 0.32
185 0.32
186 0.32
187 0.28
188 0.3
189 0.29
190 0.27
191 0.23
192 0.23
193 0.23
194 0.21
195 0.19
196 0.17
197 0.19
198 0.19
199 0.18
200 0.18
201 0.19
202 0.18
203 0.19
204 0.2
205 0.16
206 0.2
207 0.19
208 0.23
209 0.22
210 0.22
211 0.24
212 0.26
213 0.27
214 0.25
215 0.3
216 0.25
217 0.24
218 0.23
219 0.24
220 0.21
221 0.2
222 0.22
223 0.16
224 0.17
225 0.18
226 0.18
227 0.16
228 0.18
229 0.18
230 0.2
231 0.21
232 0.23
233 0.21
234 0.23
235 0.21
236 0.18
237 0.2
238 0.18
239 0.18
240 0.16
241 0.2
242 0.21
243 0.23
244 0.24
245 0.21
246 0.24
247 0.3
248 0.32
249 0.33
250 0.34
251 0.35
252 0.44
253 0.51
254 0.5
255 0.45
256 0.46
257 0.46
258 0.5
259 0.52
260 0.43
261 0.37
262 0.4
263 0.42
264 0.4
265 0.44
266 0.44
267 0.42
268 0.48
269 0.51
270 0.54
271 0.57
272 0.62
273 0.61
274 0.54
275 0.57
276 0.58
277 0.59
278 0.57
279 0.51
280 0.45
281 0.43
282 0.5
283 0.45
284 0.38
285 0.36
286 0.3
287 0.29
288 0.29
289 0.23
290 0.16
291 0.15
292 0.2
293 0.15
294 0.16
295 0.15
296 0.14
297 0.17
298 0.19
299 0.2
300 0.17
301 0.21
302 0.2
303 0.25
304 0.27
305 0.27
306 0.29
307 0.29
308 0.28
309 0.24
310 0.24
311 0.22
312 0.2
313 0.18
314 0.17
315 0.16
316 0.18
317 0.18
318 0.2
319 0.19
320 0.19
321 0.19
322 0.19
323 0.21
324 0.2
325 0.22
326 0.23
327 0.29
328 0.33
329 0.41
330 0.48
331 0.54
332 0.62
333 0.66
334 0.66
335 0.65
336 0.69
337 0.65
338 0.6
339 0.58
340 0.51
341 0.47
342 0.46
343 0.44
344 0.38
345 0.35
346 0.31
347 0.26
348 0.24
349 0.22
350 0.19
351 0.17
352 0.19
353 0.23
354 0.26
355 0.31
356 0.34
357 0.38
358 0.44
359 0.49
360 0.47
361 0.46
362 0.51
363 0.44
364 0.39
365 0.35
366 0.32
367 0.33
368 0.35
369 0.32
370 0.25
371 0.25
372 0.26
373 0.25
374 0.23
375 0.21
376 0.22
377 0.26
378 0.26
379 0.26
380 0.27
381 0.3
382 0.28
383 0.25
384 0.2
385 0.16
386 0.15
387 0.15
388 0.12
389 0.11
390 0.12
391 0.13
392 0.12
393 0.1
394 0.09
395 0.11
396 0.12
397 0.1
398 0.12
399 0.1
400 0.12
401 0.12
402 0.14
403 0.12
404 0.11
405 0.13
406 0.13
407 0.15
408 0.14
409 0.14
410 0.17
411 0.17
412 0.18
413 0.16
414 0.16
415 0.14
416 0.14
417 0.14
418 0.11
419 0.11
420 0.11
421 0.15
422 0.14
423 0.14
424 0.15
425 0.14
426 0.14
427 0.14
428 0.15
429 0.15
430 0.21
431 0.26
432 0.27
433 0.27
434 0.28
435 0.29
436 0.32
437 0.31
438 0.33
439 0.32
440 0.3
441 0.31
442 0.31
443 0.3
444 0.25
445 0.23
446 0.17
447 0.13
448 0.12
449 0.1
450 0.13
451 0.12
452 0.14
453 0.16
454 0.19
455 0.26
456 0.28
457 0.34
458 0.33
459 0.35
460 0.36
461 0.42
462 0.4
463 0.42
464 0.44
465 0.39
466 0.41
467 0.39
468 0.35
469 0.27
470 0.24
471 0.15
472 0.11
473 0.09
474 0.05
475 0.11
476 0.12
477 0.17
478 0.2
479 0.2
480 0.26
481 0.31
482 0.39
483 0.39
484 0.47
485 0.51
486 0.54
487 0.61
488 0.65
489 0.69
490 0.72
491 0.72
492 0.69
493 0.65
494 0.59
495 0.52
496 0.43
497 0.37
498 0.3
499 0.25
500 0.2
501 0.16
502 0.16
503 0.15
504 0.16
505 0.13
506 0.1
507 0.09
508 0.08
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.06
513 0.06
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.09
520 0.11
521 0.19
522 0.24
523 0.26
524 0.27
525 0.28
526 0.33
527 0.33
528 0.34
529 0.34
530 0.38
531 0.39
532 0.4
533 0.4
534 0.38
535 0.37
536 0.33
537 0.25
538 0.18
539 0.16
540 0.16
541 0.17
542 0.17
543 0.18
544 0.22
545 0.26
546 0.28
547 0.26
548 0.26
549 0.25
550 0.24
551 0.22
552 0.19
553 0.16
554 0.14
555 0.15
556 0.14
557 0.13
558 0.1
559 0.08
560 0.07
561 0.06
562 0.05
563 0.04
564 0.04
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.06
570 0.06
571 0.08
572 0.09
573 0.12
574 0.15
575 0.18
576 0.21
577 0.22
578 0.22
579 0.23
580 0.23
581 0.22
582 0.21
583 0.19
584 0.18
585 0.17
586 0.16
587 0.13
588 0.13
589 0.11
590 0.09
591 0.08
592 0.06
593 0.06
594 0.06
595 0.06
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.07
600 0.09
601 0.1
602 0.1
603 0.11
604 0.11
605 0.13
606 0.15
607 0.16
608 0.19
609 0.22
610 0.24
611 0.27
612 0.27
613 0.32
614 0.31
615 0.33
616 0.31
617 0.28
618 0.3
619 0.29
620 0.3
621 0.3
622 0.32
623 0.34
624 0.33
625 0.37
626 0.37
627 0.38
628 0.37
629 0.32
630 0.33
631 0.28
632 0.29
633 0.27
634 0.23
635 0.19
636 0.2
637 0.19
638 0.14
639 0.13
640 0.1
641 0.09
642 0.09
643 0.1
644 0.1
645 0.13
646 0.18
647 0.22
648 0.29
649 0.33
650 0.43
651 0.5
652 0.57
653 0.61
654 0.6
655 0.58
656 0.55
657 0.56
658 0.49
659 0.43
660 0.39
661 0.37
662 0.33
663 0.3
664 0.26
665 0.19
666 0.15
667 0.15
668 0.11
669 0.08
670 0.08
671 0.08
672 0.1
673 0.09
674 0.1
675 0.09
676 0.1
677 0.08
678 0.08
679 0.08
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.05
684 0.04
685 0.06
686 0.07
687 0.07
688 0.07
689 0.09
690 0.09
691 0.1
692 0.12
693 0.1
694 0.1
695 0.11
696 0.11
697 0.13
698 0.14
699 0.14
700 0.13
701 0.14
702 0.14
703 0.13
704 0.13
705 0.09
706 0.08
707 0.07
708 0.07
709 0.07
710 0.07
711 0.07
712 0.06
713 0.07
714 0.08
715 0.09
716 0.1
717 0.14
718 0.15
719 0.23
720 0.26
721 0.27
722 0.3
723 0.29
724 0.28
725 0.28
726 0.27
727 0.23
728 0.23
729 0.2
730 0.17
731 0.19
732 0.2
733 0.18
734 0.17
735 0.14
736 0.12
737 0.12
738 0.14
739 0.14
740 0.13
741 0.14
742 0.15
743 0.15
744 0.18
745 0.2
746 0.19
747 0.17
748 0.17
749 0.16
750 0.17
751 0.17
752 0.15
753 0.15
754 0.15
755 0.16
756 0.17
757 0.18
758 0.22
759 0.23
760 0.22
761 0.22
762 0.21
763 0.19
764 0.19
765 0.2
766 0.15
767 0.14
768 0.13
769 0.13
770 0.14
771 0.17
772 0.18
773 0.16
774 0.16
775 0.15
776 0.2
777 0.23
778 0.23
779 0.2
780 0.18
781 0.17
782 0.17
783 0.19
784 0.14
785 0.1
786 0.09
787 0.11
788 0.11
789 0.12
790 0.19
791 0.26
792 0.28
793 0.29
794 0.3
795 0.29
796 0.32
797 0.39
798 0.35
799 0.29
800 0.27
801 0.28
802 0.27
803 0.26
804 0.24
805 0.17
806 0.13
807 0.12
808 0.12
809 0.1
810 0.1
811 0.1
812 0.09
813 0.1
814 0.12
815 0.14
816 0.18
817 0.2
818 0.22
819 0.24
820 0.28
821 0.27
822 0.28
823 0.29
824 0.32
825 0.39
826 0.46
827 0.53
828 0.58
829 0.67
830 0.72
831 0.75
832 0.69
833 0.62
834 0.63
835 0.59
836 0.55
837 0.48
838 0.41
839 0.35
840 0.33
841 0.31
842 0.2
843 0.15
844 0.11
845 0.08
846 0.06
847 0.06
848 0.07
849 0.06
850 0.06