Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A093XRF5

Protein Details
Accession A0A093XRF5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-43SGASVEKKVQRRRKSSGLGGEHydrophilic
65-98GLLRARSERDRKARPYSKRRKAKSMLRRIKHYALBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-94ARSERDRKARPYSKRRKAKSMLRRIK
Subcellular Location(s) plas 24, nucl 1, E.R. 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016439  Lag1/Lac1-like  
IPR006634  TLC-dom  
IPR013599  TRAM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0050291  F:sphingosine N-acyltransferase activity  
GO:0046513  P:ceramide biosynthetic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF08390  TRAM1  
PF03798  TRAM_LAG1_CLN8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50922  TLC  
Amino Acid Sequences MEKTEPFPALDERVNRLLPEETSGASVEKKVQRRRKSSGLGGEIRAGDTGVPAMATMELKTQSAGLLRARSERDRKARPYSKRRKAKSMLRRIKHYALKYTWITPLAILGVFAAVYAVNPTGIVNRFIWLSYKRPIPAGSPAGTEHKYGKGYWDYAFLSFYIVVLSFTREFIMQMLLRPLSIRCGLRSRAKQSRFMEQVYTAIYFACSGPAGMYVMSRTPVWYFNIAGMYEGFPHRELSADFKFYYLFQAAYWAQQAIVLLLGMEKPRKDFKELVGHHIVSLLLIGLSYRFHFTYIGLAVYTTHDISDFFLATSKTLNYIDHPLVGPYFGLFTFVWIYMRHYLNLRILLSLFFEFKTVGPYELNWETEQYKCDLSQVITAALLASLQCLNLFWLFSILRIAYRFLFFNALSDERSDAEDDEEFDREMRDEKERAEREKKELSSISEVSVPSIRLNGSAEDVETSGASTSATPLRKSSRRKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.35
3 0.34
4 0.32
5 0.27
6 0.28
7 0.24
8 0.19
9 0.2
10 0.21
11 0.19
12 0.18
13 0.18
14 0.22
15 0.28
16 0.37
17 0.46
18 0.55
19 0.64
20 0.72
21 0.78
22 0.8
23 0.81
24 0.81
25 0.8
26 0.79
27 0.73
28 0.66
29 0.62
30 0.52
31 0.44
32 0.35
33 0.26
34 0.17
35 0.12
36 0.11
37 0.06
38 0.06
39 0.05
40 0.05
41 0.06
42 0.07
43 0.07
44 0.1
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.11
49 0.12
50 0.13
51 0.16
52 0.16
53 0.19
54 0.21
55 0.26
56 0.31
57 0.38
58 0.44
59 0.5
60 0.56
61 0.61
62 0.67
63 0.73
64 0.78
65 0.8
66 0.84
67 0.86
68 0.87
69 0.88
70 0.88
71 0.87
72 0.88
73 0.87
74 0.87
75 0.87
76 0.87
77 0.83
78 0.84
79 0.81
80 0.8
81 0.77
82 0.71
83 0.68
84 0.6
85 0.6
86 0.55
87 0.51
88 0.45
89 0.39
90 0.34
91 0.25
92 0.23
93 0.17
94 0.14
95 0.11
96 0.08
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.03
102 0.03
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.09
109 0.1
110 0.13
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.14
115 0.17
116 0.16
117 0.19
118 0.22
119 0.26
120 0.26
121 0.28
122 0.29
123 0.28
124 0.32
125 0.33
126 0.29
127 0.26
128 0.27
129 0.3
130 0.3
131 0.28
132 0.23
133 0.22
134 0.23
135 0.21
136 0.24
137 0.23
138 0.24
139 0.23
140 0.25
141 0.22
142 0.21
143 0.22
144 0.17
145 0.15
146 0.12
147 0.12
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.09
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.12
160 0.1
161 0.1
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.15
169 0.15
170 0.15
171 0.2
172 0.24
173 0.32
174 0.39
175 0.44
176 0.49
177 0.52
178 0.58
179 0.56
180 0.6
181 0.55
182 0.5
183 0.44
184 0.35
185 0.33
186 0.26
187 0.24
188 0.15
189 0.11
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.05
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.09
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.13
213 0.12
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.13
226 0.14
227 0.16
228 0.15
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.16
233 0.11
234 0.09
235 0.07
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.1
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.05
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.15
255 0.16
256 0.21
257 0.22
258 0.26
259 0.36
260 0.37
261 0.41
262 0.4
263 0.39
264 0.34
265 0.33
266 0.27
267 0.16
268 0.15
269 0.08
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.1
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.09
288 0.1
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.1
301 0.09
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.16
307 0.16
308 0.17
309 0.17
310 0.15
311 0.14
312 0.14
313 0.12
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.11
324 0.15
325 0.17
326 0.19
327 0.19
328 0.19
329 0.22
330 0.24
331 0.28
332 0.25
333 0.2
334 0.19
335 0.18
336 0.18
337 0.16
338 0.14
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.13
344 0.12
345 0.13
346 0.12
347 0.13
348 0.18
349 0.2
350 0.21
351 0.18
352 0.19
353 0.19
354 0.21
355 0.22
356 0.18
357 0.17
358 0.15
359 0.17
360 0.17
361 0.16
362 0.18
363 0.17
364 0.16
365 0.14
366 0.14
367 0.12
368 0.1
369 0.09
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.13
384 0.12
385 0.13
386 0.14
387 0.16
388 0.14
389 0.16
390 0.17
391 0.15
392 0.19
393 0.16
394 0.18
395 0.2
396 0.2
397 0.19
398 0.19
399 0.2
400 0.17
401 0.18
402 0.17
403 0.13
404 0.14
405 0.14
406 0.15
407 0.16
408 0.16
409 0.15
410 0.14
411 0.15
412 0.13
413 0.16
414 0.16
415 0.21
416 0.22
417 0.25
418 0.36
419 0.41
420 0.49
421 0.55
422 0.57
423 0.58
424 0.65
425 0.63
426 0.6
427 0.57
428 0.54
429 0.51
430 0.48
431 0.42
432 0.37
433 0.35
434 0.31
435 0.3
436 0.25
437 0.19
438 0.2
439 0.18
440 0.16
441 0.18
442 0.16
443 0.17
444 0.17
445 0.17
446 0.16
447 0.16
448 0.14
449 0.12
450 0.12
451 0.09
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.1
456 0.16
457 0.2
458 0.21
459 0.26
460 0.35
461 0.44