Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JUQ9

Protein Details
Accession C4JUQ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
406-439IPDVVLVKKHYPRKKKNKARNWRLKRLDRDEEEPBasic
470-493RSTLALYKAKQTRKQNTHPDQMGDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
413-431KKHYPRKKKNKARNWRLKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039768  Nmd3  
IPR007064  Nmd3_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0043023  F:ribosomal large subunit binding  
GO:0015031  P:protein transport  
KEGG ure:UREG_04862  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04981  NMD3  
Amino Acid Sequences MSMDLDTPVSFEPVSFQPQQQTATILCCNCGAPIDGTTAAGALCEDCIKLTIDISEGIQREATLHMCKDCERWLQPPSQWISASLESRELLALCLRKLRGLSKVRIIDASFLWTEPHSKRIKVKITIQQEALQGTILQQTFEVEYVVASQQCPECAKSYTANTWRASVQVRQKVPHKRTFLHLEQLILKHGAHKDTINIKEVKDGLDFFFSQRNHAEKLVDFLSSVAPVRVKKSQQLISMDIHTSTKSYKISFSVELIPICKDDLVALPIKLARSLGNISPLTLCYRVGTSVNLLDPNTLQTADVPAPIYWRSPFKNIADVQELVEFIVMDIEPIGQSSGRFYLAEATVARASDLGSNDTTYFTRTHLGGVLHPGDSVMGYHITGTNFNDENYEALEQNSTYSSMIPDVVLVKKHYPRKKKNKARNWRLKRLDRDEEEPSSSSNRQQNQNRLEEDFELFLRDIEEDTELRSTLALYKAKQTRKQNTHPDQMGDVEMNVDDEDNEDDDDDGVPKINMDELLDEFEELNMEDNQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.25
4 0.29
5 0.32
6 0.35
7 0.32
8 0.32
9 0.27
10 0.29
11 0.32
12 0.26
13 0.24
14 0.23
15 0.22
16 0.19
17 0.19
18 0.17
19 0.14
20 0.15
21 0.17
22 0.16
23 0.16
24 0.16
25 0.14
26 0.12
27 0.1
28 0.09
29 0.05
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.08
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.1
39 0.11
40 0.12
41 0.13
42 0.17
43 0.16
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.16
49 0.18
50 0.17
51 0.18
52 0.2
53 0.21
54 0.23
55 0.25
56 0.29
57 0.33
58 0.33
59 0.36
60 0.39
61 0.44
62 0.44
63 0.5
64 0.49
65 0.45
66 0.42
67 0.38
68 0.39
69 0.37
70 0.37
71 0.3
72 0.27
73 0.23
74 0.23
75 0.22
76 0.16
77 0.13
78 0.15
79 0.16
80 0.15
81 0.2
82 0.2
83 0.21
84 0.23
85 0.26
86 0.31
87 0.36
88 0.4
89 0.44
90 0.48
91 0.47
92 0.48
93 0.45
94 0.38
95 0.31
96 0.29
97 0.21
98 0.17
99 0.17
100 0.14
101 0.2
102 0.18
103 0.26
104 0.26
105 0.3
106 0.37
107 0.45
108 0.53
109 0.53
110 0.61
111 0.62
112 0.66
113 0.66
114 0.61
115 0.56
116 0.49
117 0.43
118 0.35
119 0.26
120 0.18
121 0.14
122 0.17
123 0.13
124 0.11
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.09
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.1
138 0.12
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.17
143 0.19
144 0.2
145 0.23
146 0.3
147 0.35
148 0.4
149 0.38
150 0.38
151 0.36
152 0.35
153 0.34
154 0.32
155 0.34
156 0.36
157 0.38
158 0.4
159 0.48
160 0.56
161 0.6
162 0.62
163 0.59
164 0.53
165 0.57
166 0.61
167 0.56
168 0.53
169 0.47
170 0.41
171 0.39
172 0.37
173 0.33
174 0.25
175 0.22
176 0.18
177 0.19
178 0.18
179 0.16
180 0.16
181 0.19
182 0.25
183 0.28
184 0.28
185 0.28
186 0.27
187 0.29
188 0.29
189 0.26
190 0.2
191 0.19
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.13
196 0.18
197 0.17
198 0.18
199 0.2
200 0.22
201 0.21
202 0.22
203 0.23
204 0.17
205 0.2
206 0.18
207 0.15
208 0.13
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.1
213 0.07
214 0.08
215 0.09
216 0.12
217 0.17
218 0.18
219 0.22
220 0.28
221 0.32
222 0.35
223 0.37
224 0.37
225 0.34
226 0.34
227 0.3
228 0.24
229 0.2
230 0.15
231 0.12
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.16
239 0.17
240 0.18
241 0.18
242 0.18
243 0.18
244 0.17
245 0.16
246 0.13
247 0.12
248 0.1
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.07
261 0.08
262 0.1
263 0.1
264 0.14
265 0.14
266 0.15
267 0.15
268 0.15
269 0.15
270 0.13
271 0.13
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.09
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.1
295 0.11
296 0.12
297 0.11
298 0.15
299 0.16
300 0.19
301 0.23
302 0.23
303 0.3
304 0.3
305 0.32
306 0.31
307 0.29
308 0.27
309 0.23
310 0.22
311 0.14
312 0.13
313 0.09
314 0.05
315 0.06
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.11
331 0.11
332 0.13
333 0.12
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.11
342 0.11
343 0.1
344 0.11
345 0.12
346 0.13
347 0.13
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.13
352 0.12
353 0.12
354 0.14
355 0.15
356 0.14
357 0.18
358 0.18
359 0.16
360 0.16
361 0.15
362 0.11
363 0.1
364 0.09
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.08
370 0.09
371 0.1
372 0.11
373 0.15
374 0.15
375 0.15
376 0.16
377 0.14
378 0.14
379 0.14
380 0.14
381 0.1
382 0.1
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.1
396 0.12
397 0.14
398 0.16
399 0.21
400 0.28
401 0.37
402 0.46
403 0.54
404 0.63
405 0.72
406 0.81
407 0.87
408 0.91
409 0.93
410 0.95
411 0.95
412 0.96
413 0.95
414 0.94
415 0.94
416 0.92
417 0.91
418 0.89
419 0.88
420 0.81
421 0.76
422 0.71
423 0.64
424 0.58
425 0.48
426 0.41
427 0.36
428 0.33
429 0.34
430 0.35
431 0.38
432 0.44
433 0.52
434 0.6
435 0.63
436 0.68
437 0.64
438 0.6
439 0.56
440 0.49
441 0.43
442 0.35
443 0.27
444 0.22
445 0.19
446 0.16
447 0.14
448 0.12
449 0.11
450 0.1
451 0.12
452 0.1
453 0.12
454 0.13
455 0.12
456 0.12
457 0.11
458 0.11
459 0.13
460 0.19
461 0.21
462 0.22
463 0.31
464 0.39
465 0.48
466 0.55
467 0.62
468 0.66
469 0.72
470 0.81
471 0.83
472 0.84
473 0.86
474 0.82
475 0.74
476 0.66
477 0.58
478 0.5
479 0.39
480 0.3
481 0.21
482 0.16
483 0.14
484 0.12
485 0.1
486 0.07
487 0.08
488 0.1
489 0.1
490 0.1
491 0.09
492 0.1
493 0.1
494 0.11
495 0.11
496 0.09
497 0.1
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.11
502 0.11
503 0.11
504 0.13
505 0.13
506 0.17
507 0.17
508 0.17
509 0.15
510 0.14
511 0.14
512 0.12
513 0.13