Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JQU1

Protein Details
Accession C4JQU1    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
356-378NDAKQQQKANKMRRERQNRDNFVHydrophilic
746-779VGSRGAKRYRRDGRDPDRMADRPRRDKESQRLLTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
649-683PTSHREKDRDRERGRGRGRDRDRERERERERPSSR
748-770SRGAKRYRRDGRDPDRMADRPRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002713  FF_domain  
IPR036517  FF_domain_sf  
IPR039726  Prp40-like  
IPR001202  WW_dom  
IPR036020  WW_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG ure:UREG_03423  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01846  FF  
PF00397  WW  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51676  FF  
PS01159  WW_DOMAIN_1  
PS50020  WW_DOMAIN_2  
CDD cd00201  WW  
Amino Acid Sequences MDTMGSNPVSAFPLWQEARNADGRVYYYNVQTKATQWAKPFELMTSQERALANQPWKEYTAEGGRKYWYNTETKKSSWEMPDIYKNALSKGQDLGRLTPGTADFVAGGVTTLSAYPPHRDRADHERNIGERRTLYGTAEMNGTVGSQHAELDYPTFEDAEAAFMKLLKRHGVQADWNWEQAMRVVIRDPQYRALKDPRDRKAAFEKYVVEALTQEKDRAKERLAKLRTDFGTMLRRHPEIKHYSRWKTIYPIIQCETIFRSTSDENERRQFFEEYILELKKDTAEAEANMRKISKENLAGILRGLDLEPYTRWSEARDLIYSNGQIQSELQSKILTQSDILIAFENHIKLLERTFNDAKQQQKANKMRRERQNRDNFVDLLRDFRNQGKIKAGSKWMDLFPLIQEDIRYKHMLGQPGSTPLDLFWDVVEEEERSLRAPRNDVLDVLDDKRYELTLKTTFDEFALIMKADRRTERIDHETLQLIFNRLREKVVRRTEDEKHAASRHQRRAVDALRSRIKRLDPPIRVSDTWEQVKQRVEKTEEYHAVDNEELRCSAFDKAVRRLKEKEEDAERDREASDRDRREAYDRFDRLDRSERGHRSTHATYRAERRATSRLSRTPEPDAYEADRRKAQADRERSYRKASGLSPVPTSHREKDRDRERGRGRGRDRDRERERERERPSSRHVGHYDRERRDWEEEREKLYPSRADPRSSREELDYGVEEVSRSTSSQMVGERRRRRDSETESVGSRGAKRYRRDGRDPDRMADRPRRDKESQRLLTKGSCMDIASENSNTECFRGKENPAVHSGSEEGEIEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.27
4 0.26
5 0.31
6 0.34
7 0.34
8 0.26
9 0.27
10 0.26
11 0.25
12 0.29
13 0.27
14 0.29
15 0.35
16 0.35
17 0.35
18 0.35
19 0.34
20 0.4
21 0.42
22 0.4
23 0.38
24 0.43
25 0.44
26 0.46
27 0.44
28 0.35
29 0.36
30 0.35
31 0.35
32 0.33
33 0.31
34 0.32
35 0.31
36 0.32
37 0.31
38 0.34
39 0.37
40 0.36
41 0.38
42 0.36
43 0.37
44 0.37
45 0.33
46 0.31
47 0.35
48 0.37
49 0.37
50 0.37
51 0.39
52 0.41
53 0.43
54 0.43
55 0.38
56 0.41
57 0.44
58 0.51
59 0.52
60 0.51
61 0.54
62 0.52
63 0.54
64 0.49
65 0.49
66 0.45
67 0.46
68 0.53
69 0.49
70 0.48
71 0.44
72 0.4
73 0.36
74 0.36
75 0.31
76 0.25
77 0.29
78 0.29
79 0.31
80 0.32
81 0.32
82 0.33
83 0.32
84 0.3
85 0.27
86 0.24
87 0.22
88 0.2
89 0.17
90 0.12
91 0.11
92 0.11
93 0.08
94 0.08
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.05
100 0.08
101 0.1
102 0.16
103 0.2
104 0.26
105 0.28
106 0.3
107 0.35
108 0.43
109 0.52
110 0.51
111 0.52
112 0.52
113 0.53
114 0.57
115 0.54
116 0.46
117 0.37
118 0.35
119 0.35
120 0.3
121 0.28
122 0.27
123 0.26
124 0.24
125 0.24
126 0.2
127 0.15
128 0.14
129 0.12
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.08
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.11
151 0.12
152 0.14
153 0.17
154 0.18
155 0.19
156 0.23
157 0.26
158 0.28
159 0.32
160 0.35
161 0.41
162 0.39
163 0.38
164 0.33
165 0.3
166 0.27
167 0.23
168 0.21
169 0.13
170 0.12
171 0.13
172 0.18
173 0.23
174 0.27
175 0.28
176 0.32
177 0.39
178 0.39
179 0.43
180 0.48
181 0.51
182 0.56
183 0.63
184 0.62
185 0.65
186 0.64
187 0.63
188 0.65
189 0.64
190 0.58
191 0.53
192 0.48
193 0.41
194 0.43
195 0.37
196 0.27
197 0.2
198 0.19
199 0.2
200 0.18
201 0.18
202 0.19
203 0.21
204 0.24
205 0.26
206 0.28
207 0.33
208 0.39
209 0.46
210 0.47
211 0.5
212 0.49
213 0.54
214 0.51
215 0.45
216 0.4
217 0.34
218 0.4
219 0.35
220 0.38
221 0.34
222 0.34
223 0.33
224 0.34
225 0.38
226 0.39
227 0.43
228 0.48
229 0.54
230 0.58
231 0.62
232 0.63
233 0.57
234 0.53
235 0.53
236 0.51
237 0.45
238 0.45
239 0.4
240 0.4
241 0.38
242 0.34
243 0.31
244 0.26
245 0.23
246 0.18
247 0.2
248 0.17
249 0.22
250 0.3
251 0.31
252 0.33
253 0.4
254 0.41
255 0.39
256 0.41
257 0.38
258 0.29
259 0.31
260 0.27
261 0.23
262 0.25
263 0.24
264 0.21
265 0.19
266 0.19
267 0.13
268 0.13
269 0.1
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.16
274 0.19
275 0.19
276 0.2
277 0.2
278 0.18
279 0.18
280 0.2
281 0.18
282 0.18
283 0.19
284 0.24
285 0.25
286 0.24
287 0.23
288 0.21
289 0.16
290 0.13
291 0.11
292 0.06
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.09
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.12
301 0.15
302 0.18
303 0.2
304 0.18
305 0.18
306 0.19
307 0.2
308 0.19
309 0.17
310 0.15
311 0.13
312 0.12
313 0.11
314 0.14
315 0.16
316 0.16
317 0.15
318 0.13
319 0.13
320 0.16
321 0.17
322 0.13
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.08
329 0.07
330 0.08
331 0.09
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.07
337 0.09
338 0.13
339 0.13
340 0.19
341 0.21
342 0.22
343 0.26
344 0.3
345 0.32
346 0.33
347 0.38
348 0.36
349 0.44
350 0.52
351 0.56
352 0.6
353 0.66
354 0.69
355 0.73
356 0.8
357 0.77
358 0.79
359 0.8
360 0.78
361 0.73
362 0.67
363 0.58
364 0.47
365 0.44
366 0.33
367 0.26
368 0.21
369 0.18
370 0.16
371 0.18
372 0.26
373 0.24
374 0.25
375 0.27
376 0.31
377 0.32
378 0.34
379 0.36
380 0.29
381 0.29
382 0.3
383 0.24
384 0.2
385 0.18
386 0.15
387 0.11
388 0.11
389 0.1
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.1
394 0.12
395 0.13
396 0.11
397 0.17
398 0.19
399 0.24
400 0.23
401 0.23
402 0.21
403 0.24
404 0.25
405 0.19
406 0.16
407 0.11
408 0.13
409 0.11
410 0.11
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.08
416 0.05
417 0.05
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.08
422 0.11
423 0.12
424 0.14
425 0.15
426 0.2
427 0.2
428 0.2
429 0.19
430 0.18
431 0.18
432 0.18
433 0.18
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.12
438 0.1
439 0.09
440 0.12
441 0.14
442 0.16
443 0.17
444 0.18
445 0.18
446 0.17
447 0.17
448 0.12
449 0.09
450 0.08
451 0.07
452 0.07
453 0.09
454 0.11
455 0.13
456 0.14
457 0.16
458 0.19
459 0.22
460 0.27
461 0.3
462 0.31
463 0.3
464 0.31
465 0.31
466 0.28
467 0.27
468 0.22
469 0.18
470 0.17
471 0.18
472 0.18
473 0.16
474 0.17
475 0.2
476 0.25
477 0.32
478 0.39
479 0.41
480 0.44
481 0.49
482 0.52
483 0.55
484 0.54
485 0.46
486 0.42
487 0.4
488 0.39
489 0.43
490 0.48
491 0.48
492 0.51
493 0.5
494 0.48
495 0.54
496 0.54
497 0.54
498 0.48
499 0.48
500 0.49
501 0.49
502 0.49
503 0.46
504 0.44
505 0.41
506 0.46
507 0.48
508 0.44
509 0.49
510 0.52
511 0.53
512 0.5
513 0.49
514 0.45
515 0.41
516 0.4
517 0.38
518 0.34
519 0.33
520 0.38
521 0.38
522 0.36
523 0.36
524 0.37
525 0.38
526 0.4
527 0.44
528 0.43
529 0.42
530 0.4
531 0.34
532 0.32
533 0.28
534 0.27
535 0.2
536 0.16
537 0.13
538 0.11
539 0.11
540 0.11
541 0.12
542 0.13
543 0.15
544 0.19
545 0.28
546 0.35
547 0.38
548 0.41
549 0.44
550 0.47
551 0.52
552 0.5
553 0.48
554 0.49
555 0.52
556 0.51
557 0.52
558 0.46
559 0.38
560 0.36
561 0.3
562 0.26
563 0.27
564 0.32
565 0.32
566 0.34
567 0.35
568 0.37
569 0.41
570 0.43
571 0.42
572 0.43
573 0.41
574 0.41
575 0.42
576 0.42
577 0.4
578 0.44
579 0.4
580 0.36
581 0.44
582 0.45
583 0.47
584 0.48
585 0.45
586 0.44
587 0.48
588 0.48
589 0.47
590 0.45
591 0.46
592 0.52
593 0.58
594 0.53
595 0.48
596 0.46
597 0.45
598 0.48
599 0.5
600 0.49
601 0.48
602 0.53
603 0.56
604 0.55
605 0.55
606 0.53
607 0.5
608 0.43
609 0.4
610 0.38
611 0.42
612 0.4
613 0.38
614 0.37
615 0.33
616 0.35
617 0.36
618 0.4
619 0.4
620 0.47
621 0.49
622 0.56
623 0.62
624 0.62
625 0.64
626 0.59
627 0.52
628 0.48
629 0.43
630 0.42
631 0.41
632 0.41
633 0.38
634 0.36
635 0.38
636 0.38
637 0.43
638 0.42
639 0.44
640 0.48
641 0.51
642 0.59
643 0.66
644 0.71
645 0.69
646 0.72
647 0.71
648 0.75
649 0.76
650 0.76
651 0.73
652 0.73
653 0.77
654 0.78
655 0.78
656 0.79
657 0.79
658 0.8
659 0.79
660 0.79
661 0.78
662 0.77
663 0.76
664 0.76
665 0.74
666 0.7
667 0.72
668 0.72
669 0.68
670 0.67
671 0.65
672 0.6
673 0.61
674 0.65
675 0.67
676 0.62
677 0.64
678 0.59
679 0.58
680 0.59
681 0.59
682 0.58
683 0.58
684 0.56
685 0.57
686 0.55
687 0.53
688 0.49
689 0.47
690 0.43
691 0.38
692 0.44
693 0.43
694 0.47
695 0.48
696 0.52
697 0.55
698 0.54
699 0.51
700 0.45
701 0.42
702 0.37
703 0.37
704 0.31
705 0.24
706 0.21
707 0.18
708 0.15
709 0.14
710 0.14
711 0.11
712 0.1
713 0.1
714 0.12
715 0.13
716 0.16
717 0.21
718 0.28
719 0.37
720 0.47
721 0.55
722 0.61
723 0.69
724 0.69
725 0.71
726 0.72
727 0.71
728 0.71
729 0.7
730 0.65
731 0.58
732 0.56
733 0.5
734 0.43
735 0.38
736 0.36
737 0.37
738 0.4
739 0.45
740 0.54
741 0.63
742 0.68
743 0.75
744 0.77
745 0.79
746 0.83
747 0.81
748 0.76
749 0.73
750 0.7
751 0.69
752 0.68
753 0.68
754 0.68
755 0.71
756 0.74
757 0.73
758 0.78
759 0.8
760 0.81
761 0.8
762 0.76
763 0.73
764 0.69
765 0.65
766 0.6
767 0.52
768 0.42
769 0.34
770 0.27
771 0.26
772 0.26
773 0.26
774 0.25
775 0.24
776 0.23
777 0.22
778 0.24
779 0.22
780 0.2
781 0.22
782 0.2
783 0.25
784 0.31
785 0.34
786 0.41
787 0.45
788 0.47
789 0.46
790 0.47
791 0.41
792 0.37
793 0.33
794 0.26
795 0.23
796 0.2