Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JZ93

Protein Details
Accession C4JZ93    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-40QKRAAPDEHSDRKQKRKKQWRTPGPKLNVKRTIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-32DRKQKRKKQWRTPGPK
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 12, cyto 10, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG ure:UREG_07494  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51165  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MSEVAGQKRAAPDEHSDRKQKRKKQWRTPGPKLNVKRTIESGDSGIFVTCDRGREGKCTAEILDLLSQEVPNAAPNESEENDSAAAGSEDDIEAQIRKEVECMKPTKKSRALFEAVRLDIPCVLFIRMDKTLDPVDLVHRICMDAHANPEKKRSRYVKRLTPITSIRKLRSGGLEELAGEVLEPHFHTGSSKKYAIRPSVRNNHEWPRDTVIQLVARAVGQGHTVDLKNYDVLILVEVMQCVEILRCALGSFVGDQHALDSSAAVGVGVSIDPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.53
3 0.59
4 0.64
5 0.73
6 0.8
7 0.81
8 0.83
9 0.84
10 0.88
11 0.9
12 0.93
13 0.93
14 0.94
15 0.95
16 0.94
17 0.92
18 0.91
19 0.88
20 0.86
21 0.84
22 0.77
23 0.7
24 0.64
25 0.6
26 0.52
27 0.45
28 0.37
29 0.28
30 0.25
31 0.21
32 0.17
33 0.12
34 0.1
35 0.13
36 0.12
37 0.13
38 0.15
39 0.19
40 0.21
41 0.25
42 0.28
43 0.28
44 0.28
45 0.28
46 0.26
47 0.23
48 0.22
49 0.19
50 0.19
51 0.15
52 0.14
53 0.13
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.1
63 0.14
64 0.15
65 0.17
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.09
72 0.08
73 0.06
74 0.06
75 0.05
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.1
86 0.14
87 0.17
88 0.22
89 0.27
90 0.3
91 0.38
92 0.42
93 0.49
94 0.52
95 0.52
96 0.51
97 0.53
98 0.53
99 0.46
100 0.47
101 0.43
102 0.36
103 0.33
104 0.29
105 0.23
106 0.19
107 0.18
108 0.13
109 0.09
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.09
122 0.1
123 0.13
124 0.13
125 0.11
126 0.1
127 0.11
128 0.1
129 0.11
130 0.11
131 0.08
132 0.12
133 0.19
134 0.22
135 0.23
136 0.31
137 0.36
138 0.36
139 0.43
140 0.48
141 0.5
142 0.58
143 0.65
144 0.66
145 0.67
146 0.72
147 0.67
148 0.64
149 0.62
150 0.58
151 0.58
152 0.54
153 0.48
154 0.46
155 0.44
156 0.39
157 0.36
158 0.33
159 0.27
160 0.24
161 0.22
162 0.18
163 0.17
164 0.15
165 0.11
166 0.06
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.08
175 0.11
176 0.16
177 0.21
178 0.24
179 0.25
180 0.3
181 0.37
182 0.44
183 0.49
184 0.52
185 0.56
186 0.63
187 0.64
188 0.64
189 0.64
190 0.65
191 0.64
192 0.6
193 0.54
194 0.51
195 0.49
196 0.45
197 0.41
198 0.36
199 0.3
200 0.27
201 0.24
202 0.17
203 0.14
204 0.14
205 0.13
206 0.09
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.05
253 0.04
254 0.05