Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JYK5

Protein Details
Accession C4JYK5    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-48SLKNPHPTPIRRPQTKPTTHPKTTHydrophilic
340-368PPSFSHSKDPRRVNKRKKRKAPETAAEIEHydrophilic
424-443TDKPKQPKSNKKQQIPEPTEHydrophilic
552-575PSTAGGAHKPRKRRKGRIGDVTYLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
348-360DPRRVNKRKKRKA
557-568GAHKPRKRRKGR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
KEGG ure:UREG_07256  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MATIRPTRLPPPSRAANRPVERLASLKNPHPTPIRRPQTKPTTHPKTTTCPNPGCPAPHIVEDDGQKVCSGCGTVISEANIVSEITFGESSSGAAIVQGTFIGADQSHGRSTGPGFQRGGGVESREITEQNGNRYIAQLSRALNIPESASKAAGQVFKLAVGLNFIQGRRTKTVAAICLYVACRRQDGNTVMLIDFADVLMINVFKLGRTYKALLDELRLGGNIFIMNPIDPESLIYRFAKQLEFGPSMMQVASEAVRIVQRMNRDWMITGRRPAGICGAALILAARMNNFRRTVREVVYVVKVTELTIHQRLNEFKATESGDLTVDQFRSVDLETSHDPPSFSHSKDPRRVNKRKKRKAPETAAEIEDDEEDTSPTPPASKRPRRVDADGFAVPDIPIDPAILGPEEQVHQLSTESNTTTSGTDKPKQPKSNKKQQIPEPTEEDLASESALESEMTALLSSGSSLVASAGPPKTTPPSNAESSSAKRQGKPVSDSQDIDPAEFDSDPEVRHCLLSPTEVEIKERIWVHENKDYLRAQQAKALKRALAAADPSTAGGAHKPRKRRKGRIGDVTYLAGEGGDGDRASSRASTPAEATRLMLERRGFSKKINYSLLEKLYEDDVEVKRKESESEGVQSRSRSRSQSVARSIRSSSVVSDRGFGGLNSLRSSARSRILKGTQAAAAVLRASATPEPSRRAFPVPRATPVAAKVPEPEPEPEPEPAQPLNPNEEILGYIPETEPARPTVEGGYDEDEEEEEEEDEDAEEDDDRIDAAFSGNYYDEGSEGGYDDDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.69
3 0.69
4 0.7
5 0.7
6 0.65
7 0.58
8 0.52
9 0.48
10 0.46
11 0.44
12 0.43
13 0.43
14 0.48
15 0.46
16 0.51
17 0.56
18 0.58
19 0.58
20 0.65
21 0.69
22 0.69
23 0.74
24 0.78
25 0.8
26 0.82
27 0.82
28 0.82
29 0.81
30 0.79
31 0.79
32 0.74
33 0.72
34 0.72
35 0.72
36 0.7
37 0.66
38 0.64
39 0.64
40 0.63
41 0.58
42 0.52
43 0.48
44 0.42
45 0.4
46 0.39
47 0.34
48 0.34
49 0.33
50 0.34
51 0.29
52 0.26
53 0.23
54 0.2
55 0.18
56 0.14
57 0.13
58 0.09
59 0.12
60 0.14
61 0.15
62 0.17
63 0.18
64 0.17
65 0.16
66 0.16
67 0.13
68 0.1
69 0.09
70 0.07
71 0.06
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.09
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.05
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.05
89 0.06
90 0.05
91 0.07
92 0.09
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.16
99 0.23
100 0.25
101 0.28
102 0.29
103 0.29
104 0.31
105 0.3
106 0.31
107 0.24
108 0.22
109 0.18
110 0.18
111 0.19
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.23
116 0.23
117 0.27
118 0.31
119 0.3
120 0.29
121 0.3
122 0.3
123 0.24
124 0.24
125 0.22
126 0.19
127 0.2
128 0.22
129 0.21
130 0.21
131 0.2
132 0.19
133 0.17
134 0.19
135 0.17
136 0.16
137 0.15
138 0.16
139 0.19
140 0.2
141 0.18
142 0.18
143 0.17
144 0.16
145 0.16
146 0.15
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.15
152 0.15
153 0.19
154 0.22
155 0.27
156 0.27
157 0.29
158 0.27
159 0.29
160 0.34
161 0.34
162 0.32
163 0.28
164 0.24
165 0.25
166 0.25
167 0.24
168 0.23
169 0.19
170 0.2
171 0.2
172 0.21
173 0.25
174 0.27
175 0.26
176 0.25
177 0.25
178 0.23
179 0.23
180 0.21
181 0.14
182 0.11
183 0.08
184 0.06
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.07
194 0.09
195 0.11
196 0.15
197 0.18
198 0.19
199 0.23
200 0.25
201 0.24
202 0.25
203 0.25
204 0.21
205 0.19
206 0.17
207 0.13
208 0.11
209 0.11
210 0.08
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.09
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.11
221 0.11
222 0.14
223 0.15
224 0.14
225 0.16
226 0.17
227 0.17
228 0.15
229 0.18
230 0.22
231 0.23
232 0.21
233 0.2
234 0.19
235 0.19
236 0.17
237 0.13
238 0.07
239 0.06
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.09
247 0.1
248 0.13
249 0.16
250 0.2
251 0.21
252 0.21
253 0.22
254 0.25
255 0.3
256 0.3
257 0.31
258 0.28
259 0.29
260 0.29
261 0.28
262 0.26
263 0.2
264 0.16
265 0.13
266 0.11
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.08
275 0.11
276 0.14
277 0.17
278 0.18
279 0.21
280 0.27
281 0.31
282 0.3
283 0.32
284 0.3
285 0.3
286 0.32
287 0.28
288 0.23
289 0.19
290 0.16
291 0.12
292 0.13
293 0.11
294 0.13
295 0.16
296 0.16
297 0.17
298 0.2
299 0.21
300 0.23
301 0.25
302 0.21
303 0.18
304 0.2
305 0.21
306 0.19
307 0.18
308 0.15
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.07
321 0.1
322 0.12
323 0.15
324 0.17
325 0.16
326 0.16
327 0.15
328 0.21
329 0.21
330 0.21
331 0.26
332 0.32
333 0.4
334 0.48
335 0.56
336 0.6
337 0.67
338 0.77
339 0.8
340 0.83
341 0.87
342 0.89
343 0.91
344 0.92
345 0.92
346 0.92
347 0.89
348 0.85
349 0.8
350 0.73
351 0.62
352 0.52
353 0.42
354 0.31
355 0.22
356 0.16
357 0.09
358 0.06
359 0.05
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.07
365 0.08
366 0.16
367 0.26
368 0.35
369 0.44
370 0.52
371 0.59
372 0.62
373 0.67
374 0.64
375 0.56
376 0.51
377 0.43
378 0.35
379 0.28
380 0.23
381 0.17
382 0.12
383 0.1
384 0.05
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.09
408 0.1
409 0.14
410 0.18
411 0.22
412 0.28
413 0.36
414 0.44
415 0.52
416 0.6
417 0.66
418 0.71
419 0.77
420 0.8
421 0.79
422 0.79
423 0.79
424 0.81
425 0.75
426 0.69
427 0.62
428 0.55
429 0.48
430 0.39
431 0.31
432 0.21
433 0.15
434 0.11
435 0.07
436 0.05
437 0.04
438 0.05
439 0.04
440 0.03
441 0.03
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.04
455 0.04
456 0.07
457 0.08
458 0.08
459 0.09
460 0.1
461 0.13
462 0.15
463 0.17
464 0.18
465 0.22
466 0.25
467 0.26
468 0.28
469 0.28
470 0.3
471 0.35
472 0.38
473 0.36
474 0.35
475 0.39
476 0.42
477 0.44
478 0.45
479 0.44
480 0.43
481 0.43
482 0.44
483 0.39
484 0.4
485 0.34
486 0.3
487 0.24
488 0.17
489 0.15
490 0.14
491 0.13
492 0.08
493 0.09
494 0.09
495 0.1
496 0.11
497 0.1
498 0.11
499 0.11
500 0.11
501 0.11
502 0.13
503 0.12
504 0.14
505 0.19
506 0.19
507 0.2
508 0.18
509 0.18
510 0.21
511 0.21
512 0.19
513 0.2
514 0.23
515 0.27
516 0.31
517 0.33
518 0.3
519 0.35
520 0.34
521 0.3
522 0.35
523 0.34
524 0.29
525 0.33
526 0.38
527 0.38
528 0.42
529 0.42
530 0.34
531 0.31
532 0.32
533 0.28
534 0.23
535 0.19
536 0.15
537 0.14
538 0.13
539 0.13
540 0.11
541 0.1
542 0.08
543 0.1
544 0.16
545 0.24
546 0.29
547 0.39
548 0.49
549 0.59
550 0.7
551 0.77
552 0.8
553 0.84
554 0.89
555 0.9
556 0.86
557 0.8
558 0.71
559 0.62
560 0.5
561 0.39
562 0.29
563 0.17
564 0.11
565 0.07
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.06
571 0.06
572 0.07
573 0.07
574 0.08
575 0.12
576 0.13
577 0.14
578 0.17
579 0.2
580 0.21
581 0.21
582 0.21
583 0.19
584 0.21
585 0.21
586 0.23
587 0.21
588 0.22
589 0.26
590 0.31
591 0.3
592 0.3
593 0.39
594 0.4
595 0.45
596 0.47
597 0.45
598 0.44
599 0.48
600 0.48
601 0.4
602 0.34
603 0.29
604 0.26
605 0.23
606 0.19
607 0.19
608 0.19
609 0.24
610 0.24
611 0.25
612 0.26
613 0.26
614 0.28
615 0.25
616 0.27
617 0.24
618 0.31
619 0.34
620 0.35
621 0.36
622 0.38
623 0.4
624 0.4
625 0.4
626 0.37
627 0.35
628 0.41
629 0.46
630 0.52
631 0.57
632 0.6
633 0.59
634 0.58
635 0.56
636 0.5
637 0.46
638 0.37
639 0.3
640 0.29
641 0.3
642 0.28
643 0.28
644 0.25
645 0.23
646 0.23
647 0.19
648 0.18
649 0.17
650 0.18
651 0.18
652 0.2
653 0.19
654 0.21
655 0.25
656 0.24
657 0.29
658 0.32
659 0.34
660 0.41
661 0.45
662 0.48
663 0.46
664 0.45
665 0.38
666 0.34
667 0.31
668 0.23
669 0.2
670 0.14
671 0.11
672 0.09
673 0.07
674 0.09
675 0.1
676 0.14
677 0.19
678 0.22
679 0.28
680 0.3
681 0.34
682 0.35
683 0.41
684 0.43
685 0.46
686 0.53
687 0.52
688 0.54
689 0.56
690 0.54
691 0.5
692 0.47
693 0.47
694 0.37
695 0.34
696 0.33
697 0.3
698 0.31
699 0.31
700 0.31
701 0.26
702 0.29
703 0.31
704 0.3
705 0.31
706 0.28
707 0.3
708 0.28
709 0.29
710 0.29
711 0.29
712 0.33
713 0.31
714 0.3
715 0.26
716 0.25
717 0.23
718 0.18
719 0.17
720 0.11
721 0.12
722 0.11
723 0.14
724 0.15
725 0.15
726 0.16
727 0.16
728 0.19
729 0.18
730 0.19
731 0.19
732 0.2
733 0.21
734 0.21
735 0.23
736 0.21
737 0.21
738 0.2
739 0.18
740 0.16
741 0.15
742 0.13
743 0.09
744 0.09
745 0.09
746 0.09
747 0.09
748 0.08
749 0.08
750 0.08
751 0.08
752 0.07
753 0.07
754 0.07
755 0.07
756 0.07
757 0.06
758 0.06
759 0.07
760 0.08
761 0.07
762 0.1
763 0.1
764 0.11
765 0.12
766 0.11
767 0.1
768 0.1
769 0.11
770 0.08
771 0.09