Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JP11

Protein Details
Accession C4JP11    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
261-310SAPFFLKKGDVKRKVLKKRYAEMGGKERTKSIERRRKKMASRERREMPATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-308AGHRRRERGLIREGKKSAPFFLKKGDVKRKVLKKRYAEMGGKERTKSIERRRKKMASRERREMP
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
KEGG ure:UREG_03070  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MALLDALNRRIKARVDEDDSEVFSESSSEQADIEVDSDLEESESESGSEAEIQPDEESSDASASEPEDVNTTLNQISFGALAKAQTSLGHDTTTRKRAHTTTTSPLDDIRARIRATRDEKASKPPSSSAKKETPPTRSSKHAPTIQSSKHAVSRRRTVVDAGATAGPKPRDPRFDSAVQHTGNPHAAKNYAFLDEYRSSEVSALRRQIAQSTDAAEQARLRRQLTSMADRMRAFERKRQAEEVVAGHRRRERGLIREGKKSAPFFLKKGDVKRKVLKKRYAEMGGKERTKSIERRRKKMASRERREMPATRRVVEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.46
3 0.48
4 0.51
5 0.5
6 0.47
7 0.4
8 0.34
9 0.26
10 0.18
11 0.16
12 0.12
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.09
17 0.1
18 0.1
19 0.09
20 0.1
21 0.08
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.07
31 0.06
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.11
56 0.12
57 0.11
58 0.13
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.1
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.21
79 0.27
80 0.34
81 0.33
82 0.31
83 0.34
84 0.35
85 0.41
86 0.43
87 0.42
88 0.43
89 0.47
90 0.46
91 0.43
92 0.41
93 0.37
94 0.31
95 0.28
96 0.23
97 0.21
98 0.2
99 0.23
100 0.25
101 0.3
102 0.34
103 0.38
104 0.41
105 0.42
106 0.44
107 0.51
108 0.55
109 0.48
110 0.44
111 0.43
112 0.45
113 0.46
114 0.48
115 0.45
116 0.46
117 0.48
118 0.54
119 0.56
120 0.54
121 0.52
122 0.54
123 0.5
124 0.49
125 0.49
126 0.48
127 0.49
128 0.48
129 0.45
130 0.44
131 0.47
132 0.43
133 0.43
134 0.38
135 0.33
136 0.33
137 0.37
138 0.38
139 0.37
140 0.43
141 0.43
142 0.43
143 0.42
144 0.37
145 0.34
146 0.29
147 0.24
148 0.17
149 0.14
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.11
154 0.12
155 0.16
156 0.17
157 0.23
158 0.27
159 0.31
160 0.33
161 0.38
162 0.39
163 0.4
164 0.43
165 0.36
166 0.33
167 0.29
168 0.26
169 0.24
170 0.23
171 0.18
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.16
176 0.15
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.17
181 0.17
182 0.18
183 0.19
184 0.18
185 0.16
186 0.17
187 0.2
188 0.18
189 0.21
190 0.21
191 0.2
192 0.21
193 0.21
194 0.23
195 0.22
196 0.2
197 0.16
198 0.17
199 0.17
200 0.18
201 0.18
202 0.15
203 0.17
204 0.19
205 0.24
206 0.24
207 0.24
208 0.23
209 0.23
210 0.3
211 0.32
212 0.35
213 0.35
214 0.35
215 0.39
216 0.38
217 0.4
218 0.38
219 0.4
220 0.36
221 0.37
222 0.44
223 0.47
224 0.51
225 0.52
226 0.49
227 0.45
228 0.45
229 0.41
230 0.4
231 0.4
232 0.37
233 0.37
234 0.39
235 0.38
236 0.36
237 0.4
238 0.38
239 0.37
240 0.47
241 0.53
242 0.54
243 0.6
244 0.61
245 0.59
246 0.59
247 0.54
248 0.49
249 0.48
250 0.48
251 0.42
252 0.46
253 0.5
254 0.5
255 0.58
256 0.64
257 0.62
258 0.67
259 0.74
260 0.78
261 0.8
262 0.84
263 0.83
264 0.81
265 0.8
266 0.81
267 0.81
268 0.76
269 0.73
270 0.73
271 0.72
272 0.67
273 0.61
274 0.54
275 0.5
276 0.51
277 0.53
278 0.55
279 0.57
280 0.62
281 0.7
282 0.78
283 0.83
284 0.85
285 0.86
286 0.86
287 0.87
288 0.87
289 0.89
290 0.86
291 0.83
292 0.8
293 0.77
294 0.72
295 0.71
296 0.66