Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JIG0

Protein Details
Accession C4JIG0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
307-329EMEAKKAKLERKKKLAALSKSRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
155-183ERMSKAKRERLLKEAKQRELEASKGKKPN
310-329AKKAKLERKKKLAALSKSRR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 11, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
KEGG ure:UREG_01497  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSFLNSVLTSIGTGDASIIPPSTHRQSASAPIPPITTKAPTIRNNNALSLGQKRKADDNVLRPTKVTRITKPSSVSATPQSRPSTPQAPVRTSSASKPATSLTPKSTPPHKSLNTTSSKPPVKGSYADIMAQAKALQQQKPLNVGLIRHQTVAKERMSKAKRERLLKEAKQRELEASKGKKPNMSGGSPALASRFKADRLHLRKSSSEPDYKGTARPSTTPSYTGTSGLPSRRGTKIIEKGSQGKPPRPRIRDEYLGTDEEDEGEDYYDDYSDASSDMEAGVMDVEEEEQAALRLARVEDERELKAEMEAKKAKLERKKKLAALSKSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.09
4 0.1
5 0.1
6 0.09
7 0.11
8 0.18
9 0.22
10 0.24
11 0.24
12 0.27
13 0.29
14 0.38
15 0.41
16 0.41
17 0.38
18 0.35
19 0.37
20 0.34
21 0.34
22 0.29
23 0.26
24 0.24
25 0.29
26 0.36
27 0.42
28 0.49
29 0.54
30 0.58
31 0.57
32 0.54
33 0.51
34 0.43
35 0.39
36 0.4
37 0.4
38 0.38
39 0.38
40 0.39
41 0.41
42 0.44
43 0.49
44 0.47
45 0.49
46 0.55
47 0.57
48 0.55
49 0.51
50 0.49
51 0.47
52 0.48
53 0.45
54 0.41
55 0.45
56 0.49
57 0.54
58 0.55
59 0.53
60 0.49
61 0.44
62 0.41
63 0.41
64 0.42
65 0.39
66 0.42
67 0.41
68 0.38
69 0.4
70 0.42
71 0.39
72 0.37
73 0.43
74 0.43
75 0.43
76 0.44
77 0.43
78 0.42
79 0.38
80 0.36
81 0.36
82 0.32
83 0.29
84 0.28
85 0.26
86 0.27
87 0.29
88 0.3
89 0.27
90 0.29
91 0.32
92 0.35
93 0.41
94 0.41
95 0.41
96 0.47
97 0.44
98 0.46
99 0.48
100 0.52
101 0.5
102 0.49
103 0.49
104 0.48
105 0.48
106 0.44
107 0.42
108 0.37
109 0.33
110 0.32
111 0.31
112 0.26
113 0.24
114 0.24
115 0.22
116 0.2
117 0.17
118 0.15
119 0.12
120 0.09
121 0.13
122 0.17
123 0.16
124 0.21
125 0.24
126 0.25
127 0.28
128 0.28
129 0.25
130 0.22
131 0.21
132 0.21
133 0.24
134 0.23
135 0.21
136 0.21
137 0.2
138 0.23
139 0.26
140 0.23
141 0.23
142 0.23
143 0.32
144 0.34
145 0.41
146 0.44
147 0.49
148 0.52
149 0.54
150 0.55
151 0.54
152 0.62
153 0.6
154 0.63
155 0.61
156 0.6
157 0.55
158 0.53
159 0.48
160 0.4
161 0.37
162 0.35
163 0.32
164 0.35
165 0.38
166 0.38
167 0.37
168 0.36
169 0.4
170 0.36
171 0.33
172 0.29
173 0.25
174 0.25
175 0.23
176 0.22
177 0.16
178 0.12
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.16
184 0.19
185 0.27
186 0.33
187 0.41
188 0.41
189 0.43
190 0.43
191 0.45
192 0.48
193 0.44
194 0.43
195 0.36
196 0.36
197 0.38
198 0.36
199 0.35
200 0.32
201 0.3
202 0.26
203 0.27
204 0.28
205 0.29
206 0.29
207 0.27
208 0.26
209 0.27
210 0.27
211 0.26
212 0.21
213 0.2
214 0.22
215 0.22
216 0.24
217 0.22
218 0.26
219 0.26
220 0.28
221 0.28
222 0.34
223 0.4
224 0.43
225 0.45
226 0.44
227 0.49
228 0.52
229 0.56
230 0.52
231 0.51
232 0.54
233 0.6
234 0.67
235 0.63
236 0.66
237 0.66
238 0.68
239 0.69
240 0.63
241 0.59
242 0.53
243 0.5
244 0.44
245 0.38
246 0.3
247 0.22
248 0.2
249 0.13
250 0.09
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.08
282 0.09
283 0.12
284 0.14
285 0.17
286 0.21
287 0.25
288 0.26
289 0.26
290 0.27
291 0.24
292 0.25
293 0.28
294 0.25
295 0.3
296 0.34
297 0.33
298 0.4
299 0.45
300 0.51
301 0.55
302 0.64
303 0.65
304 0.7
305 0.78
306 0.76
307 0.81
308 0.83
309 0.82