Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JHZ2

Protein Details
Accession C4JHZ2    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MKAPKSKTKAPKADEKVLSKHydrophilic
42-68KKVASKTAKELEKKKKKPPTPSESSESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-60PKSKTKAPKADEKVLSKVKNGGVTKPSATPKAKSKEVAKKVASKTAKELEKKKKKPP
458-486GRGGRGGGRGGGRGGRGGPRGGARGGRGG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG ure:UREG_01417  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MKAPKSKTKAPKADEKVLSKVKNGGVTKPSATPKAKSKEVAKKVASKTAKELEKKKKKPPTPSESSESDSDEEMKNVSSGSESESESEVEQKRAPAKAASKKVQPKSESESSSESSSSEEEPSKAKAVESASESESESEEEPEPKVTKQAAKGKKVESESESSSESESESETSGGVDVKATNESEESDSESESESDEAPAKTKKAIKEESASDDSEDESGSDEESSSEEEEDEKPAKSQKRKAESDEVPVTKKAKKDSDESNASANLFVGNLSWNVDEEWLRSEFESFGELSGVRIVTDRDSGRSRGFGYVEFTNAEDAAKAFEAKKGAELDGRPLNLDYANARQNAGGAKDRSQARAKSFGDQTSPESDTLFIGNISFGADENAIQETFSSYGTISGIRLPTDPESGRPKGFGYIQFSSVDEARSALNELQGSELAGRAMRLDFSTPRQNSGGGFGGRGGRGGGRGGGRGGRGGPRGGARGGRGGSTNRGGFGDFSGHKTTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.76
3 0.74
4 0.73
5 0.69
6 0.61
7 0.59
8 0.52
9 0.53
10 0.5
11 0.47
12 0.43
13 0.45
14 0.45
15 0.45
16 0.47
17 0.47
18 0.49
19 0.48
20 0.53
21 0.57
22 0.6
23 0.59
24 0.64
25 0.66
26 0.71
27 0.75
28 0.71
29 0.72
30 0.71
31 0.74
32 0.69
33 0.61
34 0.6
35 0.59
36 0.62
37 0.61
38 0.67
39 0.68
40 0.74
41 0.8
42 0.82
43 0.84
44 0.85
45 0.87
46 0.88
47 0.86
48 0.85
49 0.83
50 0.78
51 0.72
52 0.67
53 0.58
54 0.5
55 0.42
56 0.34
57 0.3
58 0.24
59 0.21
60 0.17
61 0.15
62 0.13
63 0.11
64 0.1
65 0.09
66 0.08
67 0.11
68 0.13
69 0.13
70 0.15
71 0.16
72 0.17
73 0.16
74 0.23
75 0.21
76 0.21
77 0.22
78 0.24
79 0.28
80 0.29
81 0.3
82 0.29
83 0.36
84 0.43
85 0.51
86 0.53
87 0.58
88 0.65
89 0.71
90 0.73
91 0.67
92 0.63
93 0.62
94 0.64
95 0.57
96 0.51
97 0.48
98 0.42
99 0.41
100 0.36
101 0.27
102 0.21
103 0.2
104 0.18
105 0.16
106 0.16
107 0.15
108 0.17
109 0.19
110 0.2
111 0.19
112 0.18
113 0.18
114 0.18
115 0.2
116 0.21
117 0.22
118 0.2
119 0.2
120 0.21
121 0.18
122 0.16
123 0.15
124 0.13
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.16
130 0.17
131 0.16
132 0.19
133 0.2
134 0.23
135 0.3
136 0.39
137 0.45
138 0.5
139 0.56
140 0.55
141 0.58
142 0.56
143 0.51
144 0.45
145 0.41
146 0.37
147 0.33
148 0.31
149 0.26
150 0.23
151 0.2
152 0.16
153 0.12
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.12
178 0.1
179 0.09
180 0.1
181 0.07
182 0.08
183 0.1
184 0.1
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.17
189 0.21
190 0.24
191 0.29
192 0.33
193 0.34
194 0.37
195 0.39
196 0.41
197 0.39
198 0.36
199 0.28
200 0.25
201 0.21
202 0.17
203 0.14
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.1
219 0.11
220 0.1
221 0.11
222 0.17
223 0.23
224 0.29
225 0.36
226 0.42
227 0.49
228 0.53
229 0.57
230 0.6
231 0.56
232 0.56
233 0.55
234 0.48
235 0.41
236 0.39
237 0.37
238 0.3
239 0.31
240 0.29
241 0.28
242 0.29
243 0.32
244 0.36
245 0.41
246 0.43
247 0.42
248 0.39
249 0.34
250 0.31
251 0.26
252 0.2
253 0.12
254 0.07
255 0.06
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.09
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.11
286 0.11
287 0.14
288 0.16
289 0.18
290 0.19
291 0.2
292 0.2
293 0.19
294 0.19
295 0.17
296 0.18
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.14
301 0.12
302 0.11
303 0.1
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.13
314 0.14
315 0.14
316 0.17
317 0.17
318 0.2
319 0.22
320 0.22
321 0.2
322 0.18
323 0.18
324 0.15
325 0.16
326 0.12
327 0.13
328 0.17
329 0.17
330 0.17
331 0.16
332 0.18
333 0.19
334 0.2
335 0.21
336 0.19
337 0.21
338 0.27
339 0.29
340 0.32
341 0.37
342 0.38
343 0.36
344 0.43
345 0.42
346 0.42
347 0.44
348 0.41
349 0.38
350 0.36
351 0.35
352 0.3
353 0.31
354 0.24
355 0.21
356 0.2
357 0.17
358 0.16
359 0.13
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.07
380 0.08
381 0.09
382 0.09
383 0.08
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.13
388 0.14
389 0.16
390 0.21
391 0.21
392 0.23
393 0.3
394 0.32
395 0.33
396 0.31
397 0.3
398 0.29
399 0.32
400 0.32
401 0.32
402 0.31
403 0.32
404 0.32
405 0.31
406 0.3
407 0.27
408 0.22
409 0.15
410 0.13
411 0.12
412 0.12
413 0.14
414 0.12
415 0.14
416 0.13
417 0.14
418 0.15
419 0.14
420 0.14
421 0.12
422 0.11
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.09
429 0.1
430 0.13
431 0.16
432 0.22
433 0.32
434 0.32
435 0.35
436 0.35
437 0.35
438 0.32
439 0.34
440 0.34
441 0.24
442 0.24
443 0.22
444 0.25
445 0.24
446 0.23
447 0.19
448 0.14
449 0.14
450 0.15
451 0.17
452 0.15
453 0.16
454 0.18
455 0.2
456 0.2
457 0.21
458 0.22
459 0.24
460 0.25
461 0.25
462 0.26
463 0.27
464 0.3
465 0.31
466 0.31
467 0.27
468 0.31
469 0.31
470 0.29
471 0.29
472 0.29
473 0.32
474 0.36
475 0.35
476 0.3
477 0.29
478 0.29
479 0.26
480 0.25
481 0.26
482 0.21
483 0.25