Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JYU9

Protein Details
Accession C4JYU9    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
479-504LEHKRRAAGGRIRKDKRNYNNAEIGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
482-495KRRAAGGRIRKDKR
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005550  Kinetochore_Ndc80  
IPR038273  Ndc80_sf  
Gene Ontology GO:0031262  C:Ndc80 complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0051315  P:attachment of mitotic spindle microtubules to kinetochore  
GO:0051301  P:cell division  
KEGG ure:UREG_07350  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03801  Ndc80_HEC  
Amino Acid Sequences MGPAPHQSFFAQTPVPAGVPRDPRPLRDRSFQARISQEILEYLTQNNFELEMKHSLTQNTLRSPTQKDFNYIFQWLYRRIDPGYKFQKSIDSEVPPILKQLRYPFEKSITKSQLAAVGGQNWPTFLGMLHWMMQLAQMLERYFMDQYDYACAEAGVDVTGDRIIFRFLSGAYHDWLQGGEDEDDAEAEKRLIPHVEAMAAEFERGNEKYIQEMQALEEENRALRDQIEELEKNAPDMAKLEKHFKILEDDKRKFEDYNENVQGKIEKYDNRIKLLEEEVKKVDGELQSAEEERLDLQSSVDKQGITIQDIDRMNSERDRLQKSVEDILVRLEETHARVMEKEAEANRKLEELEDVVKTYNTLAYQTGLIPSAATNAKQDNYELHLNVNQNNFSSSQLGRSQNRGSPEGDRLLADAFTGYSPANLINLDLRGVVRNNFVALRKDIYERRKIALDDDMNRRDLLDNIKEAMEEKRSEVEALEHKRRAAGGRIRKDKRNYNNAEIGVGRSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.2
4 0.22
5 0.24
6 0.31
7 0.36
8 0.44
9 0.44
10 0.5
11 0.55
12 0.61
13 0.59
14 0.6
15 0.64
16 0.62
17 0.69
18 0.66
19 0.67
20 0.62
21 0.59
22 0.54
23 0.46
24 0.37
25 0.3
26 0.28
27 0.22
28 0.19
29 0.18
30 0.17
31 0.16
32 0.16
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.16
38 0.19
39 0.21
40 0.23
41 0.25
42 0.25
43 0.29
44 0.34
45 0.35
46 0.36
47 0.37
48 0.38
49 0.41
50 0.46
51 0.47
52 0.49
53 0.46
54 0.46
55 0.45
56 0.48
57 0.47
58 0.43
59 0.38
60 0.34
61 0.36
62 0.35
63 0.36
64 0.31
65 0.3
66 0.31
67 0.37
68 0.36
69 0.42
70 0.48
71 0.47
72 0.47
73 0.45
74 0.5
75 0.46
76 0.49
77 0.45
78 0.39
79 0.37
80 0.39
81 0.4
82 0.32
83 0.32
84 0.3
85 0.24
86 0.24
87 0.3
88 0.34
89 0.38
90 0.43
91 0.43
92 0.47
93 0.52
94 0.53
95 0.56
96 0.54
97 0.49
98 0.46
99 0.43
100 0.4
101 0.34
102 0.32
103 0.23
104 0.21
105 0.2
106 0.21
107 0.2
108 0.15
109 0.15
110 0.12
111 0.11
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.12
132 0.11
133 0.12
134 0.14
135 0.15
136 0.13
137 0.13
138 0.12
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.08
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.07
189 0.07
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.14
196 0.16
197 0.17
198 0.15
199 0.15
200 0.13
201 0.15
202 0.16
203 0.13
204 0.11
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.17
218 0.17
219 0.16
220 0.16
221 0.14
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.12
226 0.14
227 0.19
228 0.2
229 0.22
230 0.22
231 0.21
232 0.25
233 0.28
234 0.35
235 0.39
236 0.41
237 0.42
238 0.44
239 0.44
240 0.39
241 0.35
242 0.36
243 0.31
244 0.37
245 0.4
246 0.38
247 0.37
248 0.37
249 0.35
250 0.26
251 0.23
252 0.18
253 0.15
254 0.2
255 0.28
256 0.3
257 0.31
258 0.31
259 0.3
260 0.29
261 0.3
262 0.32
263 0.25
264 0.26
265 0.24
266 0.24
267 0.23
268 0.21
269 0.21
270 0.14
271 0.13
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.06
284 0.09
285 0.11
286 0.12
287 0.13
288 0.12
289 0.11
290 0.15
291 0.16
292 0.14
293 0.16
294 0.14
295 0.19
296 0.2
297 0.2
298 0.17
299 0.19
300 0.19
301 0.18
302 0.2
303 0.17
304 0.23
305 0.28
306 0.27
307 0.27
308 0.28
309 0.3
310 0.33
311 0.31
312 0.25
313 0.2
314 0.21
315 0.19
316 0.16
317 0.13
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.13
325 0.14
326 0.17
327 0.16
328 0.19
329 0.2
330 0.25
331 0.26
332 0.27
333 0.25
334 0.22
335 0.22
336 0.18
337 0.16
338 0.12
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.12
346 0.11
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.12
362 0.14
363 0.15
364 0.16
365 0.16
366 0.15
367 0.19
368 0.22
369 0.2
370 0.2
371 0.23
372 0.25
373 0.28
374 0.29
375 0.25
376 0.22
377 0.23
378 0.21
379 0.19
380 0.2
381 0.17
382 0.18
383 0.24
384 0.3
385 0.32
386 0.36
387 0.39
388 0.39
389 0.43
390 0.41
391 0.36
392 0.33
393 0.35
394 0.33
395 0.3
396 0.27
397 0.23
398 0.22
399 0.19
400 0.15
401 0.11
402 0.08
403 0.07
404 0.08
405 0.07
406 0.06
407 0.07
408 0.07
409 0.08
410 0.07
411 0.08
412 0.09
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.11
417 0.13
418 0.15
419 0.16
420 0.16
421 0.16
422 0.18
423 0.2
424 0.23
425 0.24
426 0.25
427 0.26
428 0.26
429 0.32
430 0.38
431 0.42
432 0.49
433 0.47
434 0.48
435 0.5
436 0.48
437 0.45
438 0.47
439 0.46
440 0.45
441 0.51
442 0.51
443 0.47
444 0.46
445 0.44
446 0.36
447 0.32
448 0.32
449 0.28
450 0.28
451 0.28
452 0.28
453 0.27
454 0.28
455 0.29
456 0.26
457 0.22
458 0.22
459 0.24
460 0.25
461 0.26
462 0.25
463 0.26
464 0.3
465 0.38
466 0.44
467 0.43
468 0.42
469 0.44
470 0.45
471 0.44
472 0.44
473 0.46
474 0.48
475 0.56
476 0.66
477 0.71
478 0.78
479 0.83
480 0.83
481 0.84
482 0.84
483 0.82
484 0.79
485 0.81
486 0.72
487 0.67
488 0.57