FuNGI

C4JNF1

Protein Details

Accession

C4JNF1

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
328-348	GGTPIRKKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
429-455	GGWQDRGKQARRKGAKGKRGKNGNEVL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
110-119	KAKKDKGKMK
333-338	RKKKRK
434-449	RGKQARRKGAKGKRGK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
KEGG	ure:UREG_04357 -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKRGWIDKKTATTYQLFHRSQNDPLIHDPEADDRVLHQVSGPSQKPIAPKTTRVLKDLETEFANSRARENEGEAANYGIFYDDSEYDYMQHLRELGKGGGEAHFVEAKAKKDKGKMKRLEDALAEGTLEDDFDGLSLRDSSSTYGGNDAFSTASSYVRKPTYQDQQNIPDAIAGFQPDMDPRLREALEALDDEAFVDQDGDEDIFGALVDGGLDAEVDPDEWRDKFFEEEYDDGWDSDCTEKAPVQPMTSSTTTNDVDSKHFNPSGTDSEIPAHDAPIPDAAHDDGDWLKNFAKYKKDMKSKPSPVEHSENASERHTATSTMFTVGGTPIRKKKRKGALTNPSAYSMTSSSLARTEGLRLLDDRFERVEALYALDEEGEDYEGSSMADDMSVASGLSKFSQTPSMISQSANVPVREDFNSVMDDFLGGWQDRGKQARRKGAKGKRGKNGNEVLGMRMLDEIRQGLGPAKVPEKV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.56
3	0.55
4	0.57
5	0.51
6	0.49
7	0.51
8	0.5
9	0.5
10	0.55
11	0.48
12	0.42
13	0.45
14	0.45
15	0.39
16	0.37
17	0.33
18	0.29
19	0.29
20	0.25
21	0.2
22	0.16
23	0.21
24	0.2
25	0.19
26	0.16
27	0.17
28	0.22
29	0.31
30	0.31
31	0.28
32	0.29
33	0.33
34	0.37
35	0.38
36	0.43
37	0.39
38	0.43
39	0.48
40	0.56
41	0.56
42	0.53
43	0.52
44	0.45
45	0.48
46	0.45
47	0.4
48	0.31
49	0.31
50	0.3
51	0.31
52	0.33
53	0.25
54	0.25
55	0.25
56	0.26
57	0.25
58	0.27
59	0.29
60	0.26
61	0.26
62	0.24
63	0.23
64	0.2
65	0.18
66	0.15
67	0.09
68	0.07
69	0.07
70	0.09
71	0.08
72	0.1
73	0.11
74	0.11
75	0.12
76	0.15
77	0.16
78	0.13
79	0.13
80	0.13
81	0.13
82	0.15
83	0.17
84	0.15
85	0.14
86	0.15
87	0.15
88	0.14
89	0.15
90	0.13
91	0.12
92	0.13
93	0.12
94	0.17
95	0.19
96	0.22
97	0.28
98	0.32
99	0.34
100	0.41
101	0.51
102	0.56
103	0.63
104	0.68
105	0.68
106	0.72
107	0.71
108	0.66
109	0.57
110	0.51
111	0.41
112	0.32
113	0.25
114	0.17
115	0.14
116	0.1
117	0.09
118	0.05
119	0.03
120	0.03
121	0.03
122	0.04
123	0.04
124	0.05
125	0.05
126	0.06
127	0.06
128	0.07
129	0.09
130	0.1
131	0.11
132	0.1
133	0.12
134	0.12
135	0.12
136	0.12
137	0.11
138	0.09
139	0.08
140	0.1
141	0.08
142	0.1
143	0.12
144	0.13
145	0.17
146	0.19
147	0.19
148	0.21
149	0.27
150	0.35
151	0.41
152	0.46
153	0.46
154	0.5
155	0.53
156	0.5
157	0.43
158	0.34
159	0.26
160	0.21
161	0.16
162	0.11
163	0.07
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.08
168	0.09
169	0.09
170	0.09
171	0.13
172	0.13
173	0.13
174	0.13
175	0.12
176	0.12
177	0.12
178	0.11
179	0.08
180	0.07
181	0.08
182	0.07
183	0.05
184	0.04
185	0.04
186	0.03
187	0.03
188	0.04
189	0.04
190	0.03
191	0.04
192	0.04
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.02
198	0.03
199	0.02
200	0.02
201	0.02
202	0.02
203	0.02
204	0.02
205	0.03
206	0.03
207	0.03
208	0.04
209	0.06
210	0.06
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.09
215	0.1
216	0.11
217	0.12
218	0.13
219	0.13
220	0.15
221	0.14
222	0.13
223	0.13
224	0.11
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.06
229	0.07
230	0.08
231	0.09
232	0.15
233	0.15
234	0.15
235	0.15
236	0.16
237	0.2
238	0.2
239	0.19
240	0.14
241	0.18
242	0.17
243	0.17
244	0.18
245	0.14
246	0.15
247	0.19
248	0.2
249	0.19
250	0.2
251	0.19
252	0.19
253	0.21
254	0.22
255	0.22
256	0.2
257	0.17
258	0.17
259	0.17
260	0.19
261	0.15
262	0.13
263	0.11
264	0.11
265	0.1
266	0.13
267	0.12
268	0.1
269	0.11
270	0.1
271	0.09
272	0.09
273	0.1
274	0.07
275	0.09
276	0.09
277	0.1
278	0.11
279	0.13
280	0.17
281	0.2
282	0.24
283	0.28
284	0.37
285	0.44
286	0.53
287	0.56
288	0.61
289	0.68
290	0.71
291	0.74
292	0.72
293	0.68
294	0.64
295	0.65
296	0.58
297	0.51
298	0.46
299	0.41
300	0.36
301	0.32
302	0.27
303	0.21
304	0.21
305	0.18
306	0.15
307	0.14
308	0.14
309	0.14
310	0.14
311	0.14
312	0.12
313	0.12
314	0.12
315	0.15
316	0.14
317	0.19
318	0.26
319	0.36
320	0.44
321	0.48
322	0.56
323	0.63
324	0.71
325	0.76
326	0.79
327	0.79
328	0.81
329	0.82
330	0.73
331	0.65
332	0.55
333	0.45
334	0.36
335	0.25
336	0.18
337	0.14
338	0.14
339	0.12
340	0.13
341	0.13
342	0.12
343	0.12
344	0.13
345	0.14
346	0.15
347	0.15
348	0.15
349	0.17
350	0.21
351	0.21
352	0.2
353	0.18
354	0.18
355	0.17
356	0.17
357	0.17
358	0.13
359	0.14
360	0.12
361	0.11
362	0.1
363	0.09
364	0.09
365	0.07
366	0.07
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.05
375	0.04
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.05
380	0.05
381	0.04
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.08
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.16
390	0.16
391	0.19
392	0.22
393	0.26
394	0.26
395	0.26
396	0.26
397	0.23
398	0.3
399	0.31
400	0.27
401	0.24
402	0.24
403	0.28
404	0.27
405	0.27
406	0.21
407	0.18
408	0.21
409	0.19
410	0.18
411	0.15
412	0.13
413	0.11
414	0.11
415	0.13
416	0.1
417	0.11
418	0.13
419	0.17
420	0.22
421	0.29
422	0.37
423	0.42
424	0.5
425	0.61
426	0.67
427	0.72
428	0.78
429	0.81
430	0.83
431	0.85
432	0.86
433	0.85
434	0.87
435	0.83
436	0.82
437	0.79
438	0.73
439	0.7
440	0.61
441	0.53
442	0.46
443	0.41
444	0.31
445	0.26
446	0.22
447	0.15
448	0.16
449	0.14
450	0.13
451	0.13
452	0.13
453	0.15
454	0.17
455	0.2
456	0.23

C4JNF1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer