Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JDF3

Protein Details
Accession C4JDF3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-257LDGARRRLGKFKRNARESRGIMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-251ARRRLGKFKRNAR
Subcellular Location(s) cyto 7, cyto_nucl 7, nucl 5, extr 5, E.R. 3, golg 3, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045242  Syntaxin  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG ure:UREG_00371  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05739  SNARE  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50192  T_SNARE  
CDD cd15859  SNARE_SYN8  
Amino Acid Sequences MSNPGQLFLLADHVKLSLLERQRAISLNLEPNSQDGEISRSLDSLREGIESVEKEARRLEEDGDSSFVDLKEQAVSLRQQLQDLESQFYDNPSSSSNDTLSSPNDPSLAGDFVKASSASASTTLKHPTPQHPISKSVRFTDTLTAQAEDEDPNRRALLQPYRDTPSPTLDHSHLTNEEIHMHHAQIMREQDDQLDRLGESIGRQHQLSIQIGDELEDHVALLDEVDGHVDRHAGRLDGARRRLGKFKRNARESRGIMWIIGLIIVLVILIVILK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.16
4 0.16
5 0.22
6 0.26
7 0.27
8 0.29
9 0.31
10 0.33
11 0.33
12 0.3
13 0.3
14 0.33
15 0.33
16 0.32
17 0.3
18 0.29
19 0.3
20 0.25
21 0.19
22 0.12
23 0.15
24 0.16
25 0.18
26 0.17
27 0.14
28 0.15
29 0.16
30 0.16
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.11
35 0.11
36 0.15
37 0.15
38 0.17
39 0.22
40 0.21
41 0.21
42 0.23
43 0.24
44 0.23
45 0.23
46 0.22
47 0.21
48 0.22
49 0.23
50 0.22
51 0.2
52 0.18
53 0.19
54 0.16
55 0.12
56 0.11
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.11
63 0.14
64 0.19
65 0.19
66 0.19
67 0.2
68 0.21
69 0.23
70 0.23
71 0.22
72 0.16
73 0.17
74 0.16
75 0.17
76 0.16
77 0.12
78 0.11
79 0.1
80 0.13
81 0.13
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.15
86 0.16
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.14
91 0.14
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.1
110 0.12
111 0.13
112 0.16
113 0.19
114 0.23
115 0.3
116 0.35
117 0.39
118 0.39
119 0.44
120 0.46
121 0.48
122 0.45
123 0.39
124 0.36
125 0.31
126 0.3
127 0.27
128 0.23
129 0.2
130 0.19
131 0.17
132 0.15
133 0.14
134 0.13
135 0.1
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.18
144 0.25
145 0.27
146 0.29
147 0.32
148 0.36
149 0.37
150 0.38
151 0.34
152 0.3
153 0.26
154 0.25
155 0.25
156 0.22
157 0.23
158 0.21
159 0.22
160 0.18
161 0.17
162 0.17
163 0.14
164 0.16
165 0.14
166 0.17
167 0.15
168 0.14
169 0.16
170 0.18
171 0.18
172 0.19
173 0.21
174 0.2
175 0.2
176 0.2
177 0.19
178 0.18
179 0.18
180 0.15
181 0.14
182 0.11
183 0.1
184 0.11
185 0.09
186 0.08
187 0.12
188 0.15
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.19
193 0.23
194 0.24
195 0.2
196 0.17
197 0.16
198 0.16
199 0.16
200 0.14
201 0.1
202 0.08
203 0.07
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.11
219 0.13
220 0.12
221 0.13
222 0.19
223 0.27
224 0.33
225 0.37
226 0.42
227 0.45
228 0.48
229 0.56
230 0.58
231 0.61
232 0.63
233 0.69
234 0.73
235 0.79
236 0.82
237 0.81
238 0.83
239 0.76
240 0.71
241 0.66
242 0.56
243 0.46
244 0.39
245 0.31
246 0.21
247 0.17
248 0.12
249 0.06
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.02
254 0.02