Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JJL4

Protein Details
Accession C4JJL4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-63LSTSEVTSPKKRKRPEPATDDEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-53KRK
105-122KPRKRAMSTPKTGERRSK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 11.333, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG ure:UREG_01821  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MTFLRKSNFRGSTLLSQVEGERTKEHVSRTVDQDDSSDDPLSTSEVTSPKKRKRPEPATDDEPISSSDESEQLERSSVTPGPKRRPRAVWSPIDLVADSTEATPKPRKRAMSTPKTGERRSKRISTTQETDTSKDLSNRSATSRLLSETSMFFQRTPKRSITYTHKHPKSVPRPVRAEKKPEFIVPRGEPYGSSPGQPQKHADHHEFKVPRALPNDIFSGSSIPTDSSREIVESVLFDDGSGSSSPLSSVAPSNMDLTTDEKRWLDASPEDFVRCPACNALLDPEYLAEFELIQGLSIKKQMQVCRQHKRWTAERDWRLREYPTINWESLENRLHKYFADLEKILTRKRPSFFRNYLETSNPGNSKRDNYRLTANSQFEMMSSGYYGPRGSRMMMDSIIMKFATKIRHLAPSDPLMQATGVSGFVQAVLVPELTVMLVRDDMGVDDENARQIMRDSSMIGNLLNEQPDDIVIVDECGNSQN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.38
3 0.34
4 0.33
5 0.36
6 0.32
7 0.26
8 0.23
9 0.25
10 0.3
11 0.32
12 0.33
13 0.35
14 0.39
15 0.43
16 0.48
17 0.5
18 0.46
19 0.43
20 0.41
21 0.38
22 0.34
23 0.3
24 0.25
25 0.19
26 0.18
27 0.18
28 0.18
29 0.15
30 0.12
31 0.14
32 0.2
33 0.25
34 0.35
35 0.45
36 0.52
37 0.61
38 0.69
39 0.74
40 0.79
41 0.85
42 0.85
43 0.84
44 0.83
45 0.8
46 0.76
47 0.68
48 0.57
49 0.47
50 0.38
51 0.32
52 0.23
53 0.18
54 0.15
55 0.15
56 0.16
57 0.16
58 0.16
59 0.14
60 0.15
61 0.15
62 0.15
63 0.16
64 0.18
65 0.23
66 0.29
67 0.37
68 0.47
69 0.55
70 0.62
71 0.66
72 0.7
73 0.69
74 0.72
75 0.73
76 0.7
77 0.67
78 0.63
79 0.57
80 0.51
81 0.45
82 0.35
83 0.26
84 0.18
85 0.13
86 0.1
87 0.11
88 0.1
89 0.15
90 0.23
91 0.27
92 0.35
93 0.41
94 0.46
95 0.49
96 0.6
97 0.66
98 0.68
99 0.72
100 0.72
101 0.75
102 0.77
103 0.76
104 0.75
105 0.72
106 0.71
107 0.7
108 0.69
109 0.65
110 0.67
111 0.7
112 0.68
113 0.64
114 0.59
115 0.6
116 0.55
117 0.51
118 0.44
119 0.39
120 0.33
121 0.32
122 0.29
123 0.24
124 0.26
125 0.25
126 0.27
127 0.27
128 0.26
129 0.23
130 0.24
131 0.22
132 0.2
133 0.19
134 0.17
135 0.15
136 0.17
137 0.18
138 0.17
139 0.16
140 0.22
141 0.3
142 0.33
143 0.36
144 0.37
145 0.37
146 0.39
147 0.45
148 0.47
149 0.48
150 0.54
151 0.6
152 0.6
153 0.6
154 0.63
155 0.67
156 0.67
157 0.69
158 0.67
159 0.64
160 0.69
161 0.74
162 0.78
163 0.73
164 0.73
165 0.66
166 0.64
167 0.58
168 0.55
169 0.52
170 0.44
171 0.45
172 0.37
173 0.37
174 0.32
175 0.3
176 0.25
177 0.24
178 0.28
179 0.21
180 0.2
181 0.2
182 0.26
183 0.28
184 0.29
185 0.3
186 0.29
187 0.35
188 0.39
189 0.41
190 0.4
191 0.4
192 0.46
193 0.44
194 0.39
195 0.4
196 0.36
197 0.34
198 0.3
199 0.32
200 0.25
201 0.26
202 0.27
203 0.2
204 0.19
205 0.15
206 0.14
207 0.11
208 0.1
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.11
245 0.13
246 0.13
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.13
254 0.14
255 0.15
256 0.16
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.13
262 0.12
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.13
268 0.12
269 0.11
270 0.11
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.05
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.1
285 0.1
286 0.13
287 0.18
288 0.23
289 0.3
290 0.41
291 0.49
292 0.58
293 0.63
294 0.68
295 0.71
296 0.72
297 0.72
298 0.7
299 0.7
300 0.7
301 0.72
302 0.72
303 0.7
304 0.67
305 0.61
306 0.54
307 0.5
308 0.43
309 0.38
310 0.36
311 0.35
312 0.31
313 0.29
314 0.29
315 0.25
316 0.27
317 0.28
318 0.24
319 0.23
320 0.24
321 0.24
322 0.23
323 0.25
324 0.27
325 0.24
326 0.28
327 0.25
328 0.26
329 0.31
330 0.34
331 0.33
332 0.33
333 0.35
334 0.35
335 0.38
336 0.45
337 0.46
338 0.53
339 0.58
340 0.57
341 0.59
342 0.57
343 0.57
344 0.51
345 0.49
346 0.42
347 0.41
348 0.39
349 0.34
350 0.33
351 0.32
352 0.35
353 0.39
354 0.45
355 0.42
356 0.41
357 0.48
358 0.48
359 0.51
360 0.52
361 0.47
362 0.39
363 0.37
364 0.33
365 0.25
366 0.24
367 0.18
368 0.11
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.13
376 0.14
377 0.14
378 0.15
379 0.17
380 0.19
381 0.19
382 0.19
383 0.18
384 0.18
385 0.18
386 0.15
387 0.13
388 0.12
389 0.15
390 0.2
391 0.19
392 0.23
393 0.24
394 0.33
395 0.35
396 0.37
397 0.38
398 0.38
399 0.39
400 0.36
401 0.33
402 0.25
403 0.23
404 0.2
405 0.15
406 0.11
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.12
433 0.13
434 0.14
435 0.14
436 0.14
437 0.12
438 0.13
439 0.15
440 0.15
441 0.16
442 0.17
443 0.18
444 0.21
445 0.21
446 0.19
447 0.17
448 0.18
449 0.19
450 0.18
451 0.16
452 0.14
453 0.14
454 0.13
455 0.13
456 0.11
457 0.09
458 0.08
459 0.1
460 0.1
461 0.1