Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JPK1

Protein Details
Accession C4JPK1    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
199-223SGGRVSKPQRAKRTPRSTPKSKALDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
184-220KFKKLAPAPGRKGQSSGGRVSKPQRAKRTPRSTPKSK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR007526  SWIRM  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
KEGG ure:UREG_03173  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04433  SWIRM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50934  SWIRM  
Amino Acid Sequences MTRLPVSSLVSPPEAEPLDSFNAPCYQPPFPSSNKLPPIAPERAQSQTDMDLPSPPVTPYERSRKINSAQQPDANAVAGPSRDPVLFPSDRRSSAFENEPLFGPELAPPAAQALVEKHIAKRKSTGRVKFQPPTRDEYMLALACASRVITNYNRNPGAWAKKERQIFDRQWDTLHPKTHESNSKFKKLAPAPGRKGQSSGGRVSKPQRAKRTPRSTPKSKALDSFESTPARSAPKPRVIGTNRDDTDYNSLPDYSPPLATLRGTKGLKADWKGQVLDLSNDPDRNALDSSEISLAATLRLSCATYLCSKRRIFEARLHALRRGKEFRKTDAQQACKIDVNKASKLWTAYDRVGWFNADYFKQYN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.22
3 0.2
4 0.2
5 0.23
6 0.23
7 0.23
8 0.2
9 0.23
10 0.22
11 0.25
12 0.26
13 0.24
14 0.26
15 0.3
16 0.32
17 0.32
18 0.4
19 0.44
20 0.48
21 0.51
22 0.51
23 0.48
24 0.49
25 0.51
26 0.5
27 0.45
28 0.39
29 0.38
30 0.4
31 0.4
32 0.36
33 0.31
34 0.28
35 0.28
36 0.27
37 0.23
38 0.21
39 0.22
40 0.22
41 0.21
42 0.18
43 0.18
44 0.19
45 0.23
46 0.28
47 0.37
48 0.44
49 0.48
50 0.53
51 0.57
52 0.59
53 0.63
54 0.65
55 0.63
56 0.6
57 0.58
58 0.54
59 0.48
60 0.44
61 0.35
62 0.26
63 0.17
64 0.14
65 0.11
66 0.1
67 0.09
68 0.1
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.16
73 0.19
74 0.2
75 0.27
76 0.3
77 0.32
78 0.33
79 0.36
80 0.32
81 0.35
82 0.39
83 0.36
84 0.34
85 0.33
86 0.32
87 0.29
88 0.27
89 0.21
90 0.16
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.09
102 0.12
103 0.13
104 0.16
105 0.23
106 0.25
107 0.25
108 0.31
109 0.36
110 0.43
111 0.51
112 0.56
113 0.59
114 0.66
115 0.73
116 0.72
117 0.72
118 0.71
119 0.64
120 0.63
121 0.57
122 0.5
123 0.43
124 0.38
125 0.35
126 0.26
127 0.23
128 0.16
129 0.12
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.04
134 0.05
135 0.08
136 0.12
137 0.21
138 0.24
139 0.3
140 0.3
141 0.29
142 0.32
143 0.34
144 0.37
145 0.35
146 0.38
147 0.36
148 0.41
149 0.45
150 0.45
151 0.44
152 0.45
153 0.42
154 0.44
155 0.45
156 0.39
157 0.36
158 0.37
159 0.39
160 0.35
161 0.37
162 0.3
163 0.28
164 0.3
165 0.35
166 0.4
167 0.38
168 0.44
169 0.44
170 0.49
171 0.47
172 0.45
173 0.48
174 0.42
175 0.48
176 0.47
177 0.51
178 0.5
179 0.56
180 0.57
181 0.49
182 0.48
183 0.42
184 0.4
185 0.34
186 0.33
187 0.32
188 0.3
189 0.33
190 0.36
191 0.4
192 0.43
193 0.47
194 0.52
195 0.57
196 0.65
197 0.73
198 0.79
199 0.81
200 0.83
201 0.85
202 0.83
203 0.81
204 0.81
205 0.76
206 0.68
207 0.63
208 0.58
209 0.54
210 0.49
211 0.45
212 0.41
213 0.35
214 0.33
215 0.29
216 0.25
217 0.24
218 0.23
219 0.24
220 0.27
221 0.34
222 0.37
223 0.37
224 0.45
225 0.45
226 0.51
227 0.49
228 0.51
229 0.44
230 0.43
231 0.42
232 0.34
233 0.38
234 0.31
235 0.28
236 0.19
237 0.19
238 0.17
239 0.18
240 0.19
241 0.14
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.14
246 0.14
247 0.17
248 0.16
249 0.23
250 0.24
251 0.24
252 0.25
253 0.27
254 0.33
255 0.32
256 0.36
257 0.33
258 0.36
259 0.35
260 0.34
261 0.33
262 0.29
263 0.28
264 0.23
265 0.22
266 0.22
267 0.22
268 0.21
269 0.19
270 0.18
271 0.18
272 0.17
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.11
291 0.18
292 0.26
293 0.3
294 0.38
295 0.39
296 0.41
297 0.49
298 0.53
299 0.49
300 0.5
301 0.55
302 0.57
303 0.63
304 0.64
305 0.62
306 0.61
307 0.61
308 0.61
309 0.61
310 0.56
311 0.59
312 0.6
313 0.61
314 0.66
315 0.65
316 0.66
317 0.66
318 0.66
319 0.64
320 0.63
321 0.59
322 0.55
323 0.53
324 0.48
325 0.46
326 0.46
327 0.43
328 0.41
329 0.41
330 0.39
331 0.39
332 0.38
333 0.35
334 0.35
335 0.34
336 0.38
337 0.37
338 0.36
339 0.36
340 0.33
341 0.29
342 0.27
343 0.29
344 0.25