Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JPC4

Protein Details
Accession C4JPC4    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-337NSSKSAAKTKANKPNKDRDPKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
264-268RKRAR
273-294TGAVKKRKEMGMPVKFKTGKPA
326-334KANKPNKDR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013246  SAGA_su_Sgf11  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070461  C:SAGA-type complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG ure:UREG_04506  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08209  Sgf11  
Amino Acid Sequences MAGPDVENAGQLKDQTGTLAAVTRHILDDTIYNIIHDIVAKVHREEKMARATSAVIAVRQLAEKDAHASGDAAEGQHSMAAPNGGGLNPAKVETDAAVYDGGRVYLKGNPLVTTKEILCPNCQLPRLLYPLFGEGARPPPDSNKQYCRKLPPVRMPGRDVHGNPFSVERITKKKKNQGTDNNTPASSPPATAEPSSAPNSFKLLPDKMYVPTTKCPNCPRYFLVTKSAQHLDRCLGITTRQSSRNRTPFDSAINTPSAPAPASRKRARDEEETGAVKKRKEMGMPVKFKTGKPAIPSKLKNGTTPGMVSPGSPTSVNSSKSAAKTKANKPNKDRDPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.13
4 0.12
5 0.11
6 0.15
7 0.14
8 0.15
9 0.16
10 0.16
11 0.16
12 0.15
13 0.15
14 0.11
15 0.13
16 0.13
17 0.15
18 0.14
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.11
24 0.1
25 0.1
26 0.14
27 0.16
28 0.18
29 0.23
30 0.24
31 0.27
32 0.29
33 0.32
34 0.38
35 0.39
36 0.37
37 0.33
38 0.32
39 0.3
40 0.31
41 0.25
42 0.16
43 0.14
44 0.14
45 0.14
46 0.14
47 0.13
48 0.11
49 0.12
50 0.12
51 0.14
52 0.14
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.06
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.09
80 0.08
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.1
93 0.12
94 0.13
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.19
99 0.19
100 0.18
101 0.17
102 0.2
103 0.23
104 0.23
105 0.23
106 0.24
107 0.26
108 0.28
109 0.28
110 0.24
111 0.22
112 0.24
113 0.28
114 0.25
115 0.23
116 0.19
117 0.19
118 0.19
119 0.17
120 0.14
121 0.1
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.16
126 0.2
127 0.28
128 0.32
129 0.37
130 0.4
131 0.46
132 0.51
133 0.56
134 0.58
135 0.6
136 0.63
137 0.66
138 0.66
139 0.69
140 0.69
141 0.67
142 0.63
143 0.56
144 0.52
145 0.48
146 0.39
147 0.34
148 0.29
149 0.26
150 0.23
151 0.22
152 0.18
153 0.15
154 0.15
155 0.13
156 0.21
157 0.28
158 0.35
159 0.41
160 0.49
161 0.54
162 0.61
163 0.68
164 0.69
165 0.7
166 0.72
167 0.7
168 0.64
169 0.58
170 0.5
171 0.4
172 0.33
173 0.24
174 0.15
175 0.11
176 0.11
177 0.13
178 0.13
179 0.14
180 0.11
181 0.14
182 0.17
183 0.18
184 0.16
185 0.16
186 0.18
187 0.18
188 0.19
189 0.2
190 0.19
191 0.19
192 0.2
193 0.22
194 0.21
195 0.23
196 0.23
197 0.22
198 0.25
199 0.32
200 0.33
201 0.38
202 0.43
203 0.48
204 0.49
205 0.51
206 0.49
207 0.5
208 0.51
209 0.47
210 0.47
211 0.44
212 0.43
213 0.43
214 0.44
215 0.38
216 0.35
217 0.34
218 0.29
219 0.25
220 0.25
221 0.21
222 0.17
223 0.16
224 0.2
225 0.23
226 0.26
227 0.32
228 0.35
229 0.41
230 0.5
231 0.57
232 0.57
233 0.57
234 0.57
235 0.51
236 0.53
237 0.5
238 0.42
239 0.37
240 0.34
241 0.29
242 0.25
243 0.23
244 0.19
245 0.14
246 0.15
247 0.19
248 0.25
249 0.34
250 0.4
251 0.44
252 0.48
253 0.55
254 0.58
255 0.58
256 0.56
257 0.53
258 0.53
259 0.51
260 0.49
261 0.49
262 0.47
263 0.4
264 0.39
265 0.39
266 0.36
267 0.37
268 0.44
269 0.48
270 0.54
271 0.61
272 0.58
273 0.62
274 0.61
275 0.58
276 0.57
277 0.53
278 0.46
279 0.46
280 0.53
281 0.51
282 0.58
283 0.62
284 0.6
285 0.64
286 0.61
287 0.58
288 0.54
289 0.5
290 0.43
291 0.41
292 0.34
293 0.28
294 0.26
295 0.23
296 0.21
297 0.2
298 0.19
299 0.17
300 0.17
301 0.21
302 0.27
303 0.29
304 0.27
305 0.3
306 0.34
307 0.39
308 0.46
309 0.43
310 0.47
311 0.54
312 0.62
313 0.7
314 0.74
315 0.79
316 0.79
317 0.85