Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JDH1

Protein Details
Accession C4JDH1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-45DGEPPSRNPFKKFRARRPTRRTDSFAVRSHydrophilic
569-595HGKAGFKTGSPKRKRRFETLRESRVSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-34KKFRARRP
575-584KTGSPKRKRR
Subcellular Location(s) plas 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004713  CaH_exchang  
IPR004837  NaCa_Exmemb  
IPR044880  NCX_ion-bd_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005774  C:vacuolar membrane  
GO:0015369  F:calcium:proton antiporter activity  
KEGG ure:UREG_00697  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01699  Na_Ca_ex  
Amino Acid Sequences MHIYRRQARNIAWYDEDGEPPSRNPFKKFRARRPTRRTDSFAVRSESDAISMNEYTRRENIADDLQHLPHPNTLPVPSSAGTDGTRVDGALTGIPSGADSMHSAVPLQRPETGNSSLGNQPIRRRGTKAEQSETPNETVMEDPESLGAKDNKQKYTFVGQLKATLLNSWVNVLLLAAPVGIIVHHIHLDPIVVFVVNFVAIMTGETVGGLLNATFGNAVELIVSILALFKDEIVIVKTSLIGSILSNLLLVMGMSFFLGGFNRIEQNFNLTVAQTAASLLALAVGSLIIPTAFHEWSEAGENGIAPLSRGTSIILLFVYGCYLFFQLKSHTEMYNKPSEKVARRREQIESGDAIKGIAQIGAGISASMGGHNAQRVPIHTPEEESEEPELHLFVALFTLAASTALVGVCAEALVSSIDAITTRGHISETFVGLILLPIVGNAAEHATAVTVAVKDKMDLSIGVAVGSSMQIALLVLPLIVVIGWIAARSPNRQPISTDNRQKTQPIKPPSPSTRPVPLLLKVPIAKNGLGKPEPIHIQSLYPADVPQTTLPVDQTTKLYSSLGDQIVGHGKAGFKTGSPKRKRRFETLRESRVSAGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.41
3 0.39
4 0.32
5 0.3
6 0.26
7 0.25
8 0.32
9 0.37
10 0.39
11 0.44
12 0.5
13 0.57
14 0.67
15 0.76
16 0.78
17 0.81
18 0.88
19 0.92
20 0.93
21 0.94
22 0.93
23 0.91
24 0.87
25 0.84
26 0.83
27 0.79
28 0.75
29 0.69
30 0.6
31 0.53
32 0.49
33 0.41
34 0.32
35 0.27
36 0.22
37 0.21
38 0.2
39 0.2
40 0.21
41 0.22
42 0.24
43 0.24
44 0.26
45 0.23
46 0.24
47 0.27
48 0.29
49 0.3
50 0.3
51 0.31
52 0.29
53 0.31
54 0.32
55 0.29
56 0.26
57 0.26
58 0.25
59 0.24
60 0.24
61 0.24
62 0.23
63 0.25
64 0.21
65 0.21
66 0.2
67 0.2
68 0.19
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.14
73 0.12
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.1
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.13
92 0.18
93 0.2
94 0.2
95 0.23
96 0.24
97 0.27
98 0.31
99 0.31
100 0.28
101 0.26
102 0.28
103 0.26
104 0.28
105 0.3
106 0.28
107 0.31
108 0.38
109 0.44
110 0.43
111 0.44
112 0.48
113 0.53
114 0.59
115 0.61
116 0.59
117 0.58
118 0.61
119 0.63
120 0.59
121 0.49
122 0.41
123 0.33
124 0.28
125 0.23
126 0.19
127 0.15
128 0.12
129 0.11
130 0.12
131 0.13
132 0.12
133 0.15
134 0.17
135 0.19
136 0.26
137 0.32
138 0.36
139 0.37
140 0.38
141 0.38
142 0.42
143 0.45
144 0.42
145 0.41
146 0.36
147 0.37
148 0.37
149 0.35
150 0.28
151 0.21
152 0.19
153 0.15
154 0.15
155 0.12
156 0.11
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.04
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.03
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.14
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.02
271 0.02
272 0.02
273 0.02
274 0.02
275 0.02
276 0.02
277 0.03
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.1
285 0.09
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.07
291 0.06
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.07
313 0.09
314 0.11
315 0.14
316 0.16
317 0.17
318 0.19
319 0.22
320 0.26
321 0.32
322 0.31
323 0.29
324 0.31
325 0.35
326 0.41
327 0.47
328 0.52
329 0.52
330 0.55
331 0.57
332 0.57
333 0.57
334 0.51
335 0.44
336 0.36
337 0.29
338 0.26
339 0.22
340 0.19
341 0.13
342 0.11
343 0.08
344 0.06
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.04
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.08
362 0.1
363 0.13
364 0.16
365 0.18
366 0.18
367 0.19
368 0.19
369 0.25
370 0.24
371 0.22
372 0.2
373 0.18
374 0.17
375 0.16
376 0.15
377 0.08
378 0.08
379 0.06
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.03
385 0.04
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.02
399 0.03
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.11
414 0.13
415 0.13
416 0.12
417 0.12
418 0.11
419 0.1
420 0.1
421 0.07
422 0.05
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.08
440 0.09
441 0.09
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.09
446 0.1
447 0.11
448 0.11
449 0.1
450 0.09
451 0.09
452 0.08
453 0.08
454 0.06
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.03
466 0.03
467 0.03
468 0.02
469 0.02
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.07
474 0.09
475 0.14
476 0.2
477 0.28
478 0.32
479 0.33
480 0.36
481 0.42
482 0.5
483 0.56
484 0.6
485 0.58
486 0.59
487 0.61
488 0.64
489 0.62
490 0.62
491 0.61
492 0.6
493 0.62
494 0.64
495 0.71
496 0.74
497 0.75
498 0.7
499 0.66
500 0.66
501 0.61
502 0.59
503 0.54
504 0.48
505 0.46
506 0.43
507 0.43
508 0.37
509 0.36
510 0.37
511 0.35
512 0.34
513 0.33
514 0.35
515 0.36
516 0.34
517 0.34
518 0.31
519 0.33
520 0.36
521 0.33
522 0.33
523 0.26
524 0.26
525 0.28
526 0.28
527 0.24
528 0.21
529 0.19
530 0.17
531 0.17
532 0.19
533 0.16
534 0.16
535 0.15
536 0.16
537 0.17
538 0.2
539 0.21
540 0.2
541 0.22
542 0.22
543 0.23
544 0.22
545 0.22
546 0.18
547 0.19
548 0.24
549 0.22
550 0.21
551 0.19
552 0.21
553 0.27
554 0.27
555 0.24
556 0.19
557 0.2
558 0.19
559 0.22
560 0.2
561 0.15
562 0.25
563 0.34
564 0.43
565 0.52
566 0.62
567 0.69
568 0.79
569 0.85
570 0.85
571 0.87
572 0.87
573 0.87
574 0.88
575 0.88
576 0.82
577 0.77