Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JRH1

Protein Details
Accession C4JRH1    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
187-211NNEAKVFNPEKKKRKREGYEEGDYTHydrophilic
325-351QRLRDQDTSRKKKERRRENERKQKEIVBasic
658-692ALNARPIKKVREAKGRKKMKQAQRLEKLKKKSALLHydrophilic
705-730QSIARMMSRAMKKKPKQNVKLVVARGHydrophilic
749-768VDARLKKDVRAQKRLAKKAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
197-202KKKRKR
286-300KVREKFGLAVKKGGK
334-348RKKKERRRENERKQK
653-689REKLRALNARPIKKVREAKGRKKMKQAQRLEKLKKKS
712-768SRAMKKKPKQNVKLVVARGGNRGISGRPRGVKGKYKIVDARLKKDVRAQKRLAKKAK
Subcellular Location(s) mito 13.5, mito_nucl 12.499, nucl 10, cyto_mito 9.666, cyto_nucl 7.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
KEGG ure:UREG_05060  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MASLKKAKCFLIFARHLSWCQVAAECMPTDSLIVGVDLSPIKPIPRVITFQSDITTDKCRATIRQHLKTWKADTVLHDGAPNVGTAWVQDAFSQAELVLQSLKLATEFLVPGGSFVTKVFRSKDYNPLLWVFKQLFTSVEATKPPSSRNVSAEIFVVCRGFKAPKHIDPKFLDSRHVFAELQDPTPNNEAKVFNPEKKKRKREGYEEGDYTQHKEIAVTEFINTTDPIAILGTYNTLSFQQSASGDLALATLERLPETTDEIRKCCEDLKVLGKKEFRTLLRWRLKVREKFGLAVKKGGKKTEEQEEVAEIEPMDEELAIQEELQRLRDQDTSRKKKERRRENERKQKEIVRLQMHMITPTDIGMEQSGPLGEGSMFSIKPIAREGATKKVTSGRMVHVESDDDEESSATGDEESDEEEDRLERDLDALYERYQEDREMRDSKLRAKKARKDLETEEWEGFSDSNKDDGSDEEDGDTFQPQSLTLRSRPANGLSNKAAMFFDQDLFQGLEDIDDEDERMEEEQEQSQPVQDEAPGEDGSEVYETTDNESEMSVDPSSMAKESKGRSERFDEEPRDDPRTKDGKLNIDIITAEAMALAQQMATGEKTSADVVDDGFNKFSFRDVDGLPEWFLDDESKHSKIQRPTTAAAAAAIREKLRALNARPIKKVREAKGRKKMKQAQRLEKLKKKSALLAEDEGVSERDKAQSIARMMSRAMKKKPKQNVKLVVARGGNRGISGRPRGVKGKYKIVDARLKKDVRAQKRLAKKAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.51
3 0.49
4 0.47
5 0.43
6 0.33
7 0.29
8 0.26
9 0.21
10 0.19
11 0.22
12 0.19
13 0.18
14 0.16
15 0.15
16 0.14
17 0.12
18 0.11
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.06
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.11
27 0.12
28 0.13
29 0.15
30 0.18
31 0.21
32 0.24
33 0.29
34 0.31
35 0.38
36 0.39
37 0.38
38 0.37
39 0.33
40 0.3
41 0.29
42 0.3
43 0.24
44 0.23
45 0.25
46 0.26
47 0.3
48 0.36
49 0.44
50 0.49
51 0.56
52 0.63
53 0.69
54 0.73
55 0.75
56 0.73
57 0.67
58 0.6
59 0.54
60 0.5
61 0.5
62 0.45
63 0.38
64 0.34
65 0.29
66 0.27
67 0.23
68 0.19
69 0.11
70 0.09
71 0.08
72 0.07
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.12
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.11
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.08
102 0.09
103 0.14
104 0.14
105 0.18
106 0.21
107 0.25
108 0.31
109 0.35
110 0.45
111 0.46
112 0.47
113 0.46
114 0.47
115 0.46
116 0.4
117 0.42
118 0.34
119 0.29
120 0.27
121 0.25
122 0.22
123 0.21
124 0.23
125 0.19
126 0.2
127 0.2
128 0.23
129 0.27
130 0.27
131 0.27
132 0.31
133 0.36
134 0.37
135 0.38
136 0.4
137 0.37
138 0.36
139 0.36
140 0.29
141 0.23
142 0.2
143 0.18
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.14
148 0.15
149 0.24
150 0.31
151 0.38
152 0.48
153 0.5
154 0.55
155 0.56
156 0.62
157 0.61
158 0.55
159 0.53
160 0.45
161 0.46
162 0.39
163 0.39
164 0.31
165 0.23
166 0.28
167 0.23
168 0.24
169 0.24
170 0.23
171 0.22
172 0.27
173 0.27
174 0.2
175 0.23
176 0.22
177 0.21
178 0.3
179 0.32
180 0.35
181 0.45
182 0.54
183 0.61
184 0.7
185 0.79
186 0.79
187 0.85
188 0.87
189 0.86
190 0.87
191 0.84
192 0.81
193 0.74
194 0.66
195 0.58
196 0.5
197 0.43
198 0.34
199 0.27
200 0.19
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.18
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.14
209 0.15
210 0.13
211 0.1
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.09
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.06
236 0.06
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.11
245 0.15
246 0.21
247 0.23
248 0.24
249 0.26
250 0.26
251 0.26
252 0.23
253 0.21
254 0.18
255 0.2
256 0.28
257 0.34
258 0.36
259 0.4
260 0.41
261 0.4
262 0.42
263 0.44
264 0.36
265 0.35
266 0.39
267 0.45
268 0.5
269 0.53
270 0.52
271 0.55
272 0.63
273 0.64
274 0.63
275 0.6
276 0.53
277 0.51
278 0.55
279 0.54
280 0.45
281 0.45
282 0.45
283 0.43
284 0.44
285 0.44
286 0.39
287 0.35
288 0.38
289 0.4
290 0.39
291 0.33
292 0.32
293 0.29
294 0.29
295 0.25
296 0.22
297 0.12
298 0.08
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.03
304 0.03
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.08
310 0.08
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.13
315 0.18
316 0.18
317 0.25
318 0.36
319 0.45
320 0.52
321 0.61
322 0.66
323 0.71
324 0.79
325 0.81
326 0.8
327 0.82
328 0.86
329 0.87
330 0.91
331 0.9
332 0.85
333 0.79
334 0.74
335 0.71
336 0.65
337 0.62
338 0.54
339 0.47
340 0.43
341 0.42
342 0.36
343 0.29
344 0.23
345 0.16
346 0.12
347 0.11
348 0.1
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.05
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.04
361 0.05
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.09
366 0.08
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.13
372 0.15
373 0.21
374 0.23
375 0.23
376 0.23
377 0.27
378 0.28
379 0.27
380 0.27
381 0.21
382 0.24
383 0.25
384 0.24
385 0.19
386 0.19
387 0.17
388 0.17
389 0.14
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.04
397 0.03
398 0.03
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.05
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.08
417 0.1
418 0.1
419 0.11
420 0.11
421 0.12
422 0.13
423 0.15
424 0.2
425 0.2
426 0.21
427 0.26
428 0.28
429 0.35
430 0.41
431 0.46
432 0.5
433 0.56
434 0.64
435 0.69
436 0.76
437 0.7
438 0.67
439 0.65
440 0.65
441 0.6
442 0.54
443 0.44
444 0.35
445 0.33
446 0.27
447 0.22
448 0.14
449 0.11
450 0.09
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.14
457 0.13
458 0.12
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.11
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.08
469 0.1
470 0.14
471 0.15
472 0.21
473 0.22
474 0.24
475 0.26
476 0.27
477 0.33
478 0.31
479 0.34
480 0.29
481 0.32
482 0.29
483 0.28
484 0.25
485 0.17
486 0.18
487 0.14
488 0.13
489 0.1
490 0.1
491 0.11
492 0.11
493 0.11
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.06
498 0.07
499 0.06
500 0.05
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.08
509 0.1
510 0.11
511 0.12
512 0.12
513 0.13
514 0.13
515 0.13
516 0.12
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.12
521 0.11
522 0.1
523 0.1
524 0.09
525 0.09
526 0.09
527 0.08
528 0.06
529 0.08
530 0.07
531 0.11
532 0.12
533 0.11
534 0.11
535 0.11
536 0.11
537 0.1
538 0.12
539 0.09
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.09
547 0.15
548 0.17
549 0.26
550 0.32
551 0.33
552 0.37
553 0.43
554 0.46
555 0.48
556 0.54
557 0.49
558 0.47
559 0.51
560 0.51
561 0.52
562 0.49
563 0.43
564 0.43
565 0.45
566 0.42
567 0.42
568 0.44
569 0.44
570 0.46
571 0.49
572 0.4
573 0.35
574 0.33
575 0.27
576 0.22
577 0.14
578 0.1
579 0.06
580 0.05
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.03
585 0.03
586 0.04
587 0.05
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.07
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.12
599 0.14
600 0.14
601 0.15
602 0.14
603 0.14
604 0.14
605 0.15
606 0.13
607 0.13
608 0.16
609 0.15
610 0.2
611 0.21
612 0.23
613 0.21
614 0.19
615 0.18
616 0.14
617 0.14
618 0.1
619 0.09
620 0.14
621 0.19
622 0.21
623 0.23
624 0.28
625 0.35
626 0.42
627 0.5
628 0.53
629 0.54
630 0.53
631 0.55
632 0.51
633 0.44
634 0.37
635 0.29
636 0.21
637 0.18
638 0.18
639 0.14
640 0.13
641 0.14
642 0.14
643 0.19
644 0.26
645 0.27
646 0.35
647 0.44
648 0.5
649 0.57
650 0.61
651 0.6
652 0.63
653 0.68
654 0.67
655 0.69
656 0.73
657 0.77
658 0.82
659 0.87
660 0.84
661 0.86
662 0.88
663 0.87
664 0.87
665 0.87
666 0.87
667 0.87
668 0.91
669 0.9
670 0.89
671 0.87
672 0.85
673 0.81
674 0.73
675 0.7
676 0.67
677 0.63
678 0.6
679 0.54
680 0.47
681 0.41
682 0.38
683 0.32
684 0.25
685 0.2
686 0.15
687 0.13
688 0.14
689 0.14
690 0.15
691 0.18
692 0.23
693 0.25
694 0.3
695 0.31
696 0.3
697 0.3
698 0.38
699 0.43
700 0.45
701 0.52
702 0.56
703 0.63
704 0.71
705 0.81
706 0.83
707 0.84
708 0.86
709 0.87
710 0.85
711 0.86
712 0.79
713 0.75
714 0.69
715 0.62
716 0.55
717 0.47
718 0.39
719 0.32
720 0.31
721 0.28
722 0.3
723 0.34
724 0.38
725 0.39
726 0.44
727 0.5
728 0.56
729 0.62
730 0.61
731 0.65
732 0.61
733 0.65
734 0.66
735 0.67
736 0.7
737 0.67
738 0.68
739 0.67
740 0.66
741 0.6
742 0.63
743 0.65
744 0.65
745 0.68
746 0.69
747 0.68
748 0.76