Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C4JQA5

Protein Details
Accession C4JQA5    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MSNTKRKSRRNGGTNIDKRDFHydrophilic
807-828IPLPRPNRTKPKRATQKTDSDKHydrophilic
837-868AAKLRRQKEKEEEKERKRKLKEEKEKAKKLASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
788-795RGSKKGRK
812-823PNRTKPKRATQK
828-866KASSALEKEAAKLRRQKEKEEEKERKRKLKEEKEKAKKL
Subcellular Location(s) plas 22, nucl 2, mito 2, mito_nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042530  EME1/EME2_C  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011701  MFS  
IPR036259  MFS_trans_sf  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
IPR047521  XPF_nuclease_EME1_ascomycetes  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0022857  F:transmembrane transporter activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
KEGG ure:UREG_04659  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
PF07690  MFS_1  
CDD cd17354  MFS_Mch1p_like  
cd20085  XPF_nuclease_Mms4  
Amino Acid Sequences MSNTKRKSRRNGGTNIDKRDFDANRSLLGRVAHSEDIEYDRRTGVPGRSSTDSDGLLSDVVSEIVDRDREMLKREMVRVGSFIWGVLTASCAGSITGFSIYGPLLLSRLHYSQFRVNTVAVAAEMTMYLPVPLFGYLCDRYSPGPVALLSAFLFGPGYLLAALTFRSGPPPDAGGSGWPYWVMILAFLGVGAGTASMYLAAVSTCAKNFAQSKHKGLMLAMPIAAFGLSGMWQSQVGRHLLCEWGPNGEKGDVDVFKYFLFLAILLFSVGLVGSFALRLVDEEKLIDEAVEELERSGYLDESSFFRPREEVNAEYGTFGAENNGTVGIDDGDGDSVTSSQEEKQKKTWLLNQETKLFLRDRTMWWLAAGFFLASGPGEAYINNVGTVIHTLTPSSYPPNLPPPAGHPSLHVTIIALTSTAARLLTGSLSDAFAPTSRTRYQSQEEYSPVRSKRRLTLSRLAFLIPSALLLSLGYLYLSTPFPLQHPSSFVTTTTLVGFGYGAIFSLVPIIISVVWGVENFGTNWGIVAMVPALGATLWGMVYSAGYEAAIELKLGDTGRLIDYFWKLLTSHLVPTAHGPPARTSTYDYIPSALVHEAKALQPAMAEVISLLSSPETCRPHRSRKSSTSKHGLVRLSNDLLSDILDDSLLELEEIAQPPKRRKLDTALDIPSSQNRLATHTVLSSFISNDSFERSGSYEIRKSTLQRFESWNDEISDPVLSSPRRINTSYHEISKRSTNVIKIDDSFDDIVEDDLLGDPFQFSPPPASQSAFSDRTSGLLAKLRDQPARGSKKGRKATASVQSSDEDIPLPRPNRTKPKRATQKTDSDKASSALEKEAAKLRRQKEKEEEKERKRKLKEEKEKAKKLASDIAQANKLKINKKESTPEMLIDLSSTFQGSSIGTQVNEYMRHLEVQTNFIATEIPNIVSWRRKVTAIYNDEAGHWEPCPLRIEKEGHVLCFLTAQNFVDLVASSGASQTVESHFQNVIRHYPGCKIIYLIEGLFAYMRKNQNIRNRAYQAAVLRQIGDSHDATTEQRSSSRRSAKTPAPSAIDDDRVEDALLQLQIQHHCLIYQTATAAETAEWIKNFTEHISTIPYRRERISMQNAAFCMDTGQVKTGTDADDTYIKMLEEIQRITAPIAYGVAMKYSNVRELVNGMKAHGPLSLQDVKKCANKSGALTEARIGPAVSKRLHKIFTSVDPCSADI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.85
3 0.79
4 0.68
5 0.61
6 0.61
7 0.53
8 0.47
9 0.48
10 0.4
11 0.4
12 0.41
13 0.39
14 0.33
15 0.32
16 0.29
17 0.23
18 0.27
19 0.24
20 0.22
21 0.23
22 0.22
23 0.26
24 0.28
25 0.27
26 0.23
27 0.23
28 0.23
29 0.25
30 0.28
31 0.28
32 0.32
33 0.34
34 0.38
35 0.41
36 0.43
37 0.44
38 0.42
39 0.36
40 0.29
41 0.26
42 0.21
43 0.17
44 0.14
45 0.11
46 0.08
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.13
55 0.17
56 0.2
57 0.25
58 0.28
59 0.32
60 0.37
61 0.4
62 0.43
63 0.41
64 0.4
65 0.37
66 0.33
67 0.29
68 0.24
69 0.2
70 0.15
71 0.12
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.11
94 0.13
95 0.15
96 0.18
97 0.19
98 0.24
99 0.3
100 0.34
101 0.34
102 0.33
103 0.31
104 0.29
105 0.28
106 0.24
107 0.16
108 0.12
109 0.09
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.13
123 0.14
124 0.16
125 0.17
126 0.17
127 0.18
128 0.22
129 0.24
130 0.19
131 0.19
132 0.17
133 0.19
134 0.17
135 0.18
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.07
142 0.08
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.07
153 0.12
154 0.13
155 0.15
156 0.16
157 0.18
158 0.17
159 0.18
160 0.18
161 0.17
162 0.19
163 0.18
164 0.16
165 0.14
166 0.13
167 0.12
168 0.13
169 0.1
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.02
181 0.02
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.11
193 0.11
194 0.16
195 0.21
196 0.28
197 0.36
198 0.4
199 0.46
200 0.47
201 0.49
202 0.44
203 0.4
204 0.38
205 0.31
206 0.27
207 0.21
208 0.17
209 0.15
210 0.14
211 0.14
212 0.08
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.07
221 0.09
222 0.12
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.18
230 0.15
231 0.19
232 0.2
233 0.2
234 0.22
235 0.2
236 0.2
237 0.18
238 0.22
239 0.17
240 0.18
241 0.17
242 0.16
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.1
247 0.09
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.1
289 0.15
290 0.18
291 0.18
292 0.19
293 0.2
294 0.2
295 0.26
296 0.28
297 0.25
298 0.26
299 0.28
300 0.27
301 0.26
302 0.24
303 0.18
304 0.13
305 0.11
306 0.08
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.04
323 0.04
324 0.05
325 0.06
326 0.09
327 0.17
328 0.21
329 0.25
330 0.3
331 0.37
332 0.4
333 0.45
334 0.48
335 0.51
336 0.55
337 0.6
338 0.59
339 0.56
340 0.55
341 0.5
342 0.46
343 0.38
344 0.3
345 0.26
346 0.25
347 0.23
348 0.28
349 0.29
350 0.26
351 0.25
352 0.25
353 0.21
354 0.18
355 0.16
356 0.08
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.1
381 0.12
382 0.13
383 0.13
384 0.16
385 0.23
386 0.24
387 0.24
388 0.23
389 0.25
390 0.29
391 0.3
392 0.28
393 0.22
394 0.25
395 0.26
396 0.26
397 0.2
398 0.15
399 0.13
400 0.13
401 0.11
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.1
421 0.1
422 0.14
423 0.16
424 0.19
425 0.22
426 0.26
427 0.31
428 0.34
429 0.36
430 0.36
431 0.37
432 0.37
433 0.39
434 0.4
435 0.39
436 0.39
437 0.4
438 0.38
439 0.42
440 0.49
441 0.52
442 0.53
443 0.59
444 0.57
445 0.55
446 0.53
447 0.46
448 0.36
449 0.29
450 0.22
451 0.13
452 0.09
453 0.06
454 0.05
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.07
468 0.08
469 0.12
470 0.13
471 0.13
472 0.15
473 0.17
474 0.19
475 0.19
476 0.18
477 0.16
478 0.15
479 0.15
480 0.13
481 0.11
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.05
486 0.05
487 0.04
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.04
493 0.04
494 0.03
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.04
514 0.04
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.02
521 0.02
522 0.02
523 0.02
524 0.02
525 0.02
526 0.02
527 0.02
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.03
535 0.04
536 0.04
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.04
544 0.05
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.07
549 0.08
550 0.09
551 0.09
552 0.08
553 0.08
554 0.08
555 0.11
556 0.1
557 0.11
558 0.13
559 0.13
560 0.13
561 0.15
562 0.17
563 0.17
564 0.17
565 0.16
566 0.15
567 0.18
568 0.19
569 0.17
570 0.18
571 0.18
572 0.19
573 0.21
574 0.2
575 0.17
576 0.16
577 0.15
578 0.13
579 0.12
580 0.1
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.09
586 0.08
587 0.07
588 0.06
589 0.06
590 0.07
591 0.05
592 0.05
593 0.03
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.03
600 0.04
601 0.1
602 0.13
603 0.15
604 0.23
605 0.29
606 0.39
607 0.48
608 0.56
609 0.58
610 0.65
611 0.75
612 0.74
613 0.75
614 0.73
615 0.69
616 0.65
617 0.62
618 0.53
619 0.44
620 0.4
621 0.36
622 0.28
623 0.23
624 0.2
625 0.15
626 0.13
627 0.11
628 0.09
629 0.06
630 0.05
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.04
635 0.04
636 0.03
637 0.03
638 0.03
639 0.05
640 0.06
641 0.07
642 0.1
643 0.12
644 0.17
645 0.25
646 0.28
647 0.28
648 0.31
649 0.37
650 0.43
651 0.46
652 0.48
653 0.43
654 0.41
655 0.39
656 0.37
657 0.31
658 0.25
659 0.19
660 0.15
661 0.13
662 0.16
663 0.17
664 0.17
665 0.16
666 0.15
667 0.15
668 0.14
669 0.14
670 0.1
671 0.09
672 0.08
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.1
677 0.1
678 0.1
679 0.1
680 0.11
681 0.13
682 0.15
683 0.18
684 0.18
685 0.18
686 0.21
687 0.21
688 0.23
689 0.28
690 0.34
691 0.32
692 0.32
693 0.36
694 0.36
695 0.39
696 0.37
697 0.32
698 0.26
699 0.24
700 0.21
701 0.17
702 0.15
703 0.1
704 0.09
705 0.11
706 0.09
707 0.11
708 0.15
709 0.17
710 0.2
711 0.22
712 0.23
713 0.25
714 0.34
715 0.35
716 0.38
717 0.38
718 0.36
719 0.36
720 0.4
721 0.35
722 0.31
723 0.3
724 0.27
725 0.28
726 0.3
727 0.3
728 0.26
729 0.26
730 0.22
731 0.22
732 0.19
733 0.15
734 0.12
735 0.11
736 0.1
737 0.07
738 0.07
739 0.04
740 0.05
741 0.05
742 0.04
743 0.04
744 0.04
745 0.05
746 0.05
747 0.05
748 0.05
749 0.09
750 0.1
751 0.14
752 0.15
753 0.16
754 0.16
755 0.19
756 0.26
757 0.25
758 0.24
759 0.23
760 0.22
761 0.21
762 0.22
763 0.19
764 0.14
765 0.16
766 0.16
767 0.18
768 0.25
769 0.28
770 0.28
771 0.29
772 0.33
773 0.38
774 0.45
775 0.45
776 0.48
777 0.5
778 0.59
779 0.65
780 0.64
781 0.58
782 0.54
783 0.58
784 0.58
785 0.56
786 0.47
787 0.42
788 0.38
789 0.36
790 0.32
791 0.25
792 0.16
793 0.12
794 0.13
795 0.17
796 0.18
797 0.21
798 0.26
799 0.33
800 0.43
801 0.5
802 0.57
803 0.59
804 0.69
805 0.76
806 0.79
807 0.81
808 0.77
809 0.81
810 0.78
811 0.78
812 0.7
813 0.61
814 0.54
815 0.46
816 0.4
817 0.31
818 0.25
819 0.18
820 0.19
821 0.16
822 0.17
823 0.23
824 0.24
825 0.28
826 0.35
827 0.4
828 0.47
829 0.5
830 0.56
831 0.59
832 0.67
833 0.72
834 0.75
835 0.8
836 0.8
837 0.88
838 0.88
839 0.87
840 0.81
841 0.8
842 0.8
843 0.81
844 0.82
845 0.82
846 0.85
847 0.87
848 0.89
849 0.85
850 0.79
851 0.7
852 0.62
853 0.58
854 0.49
855 0.45
856 0.41
857 0.41
858 0.42
859 0.4
860 0.38
861 0.34
862 0.37
863 0.36
864 0.38
865 0.42
866 0.41
867 0.45
868 0.52
869 0.51
870 0.54
871 0.49
872 0.44
873 0.37
874 0.33
875 0.28
876 0.2
877 0.17
878 0.1
879 0.08
880 0.08
881 0.06
882 0.05
883 0.06
884 0.06
885 0.07
886 0.08
887 0.1
888 0.09
889 0.1
890 0.12
891 0.14
892 0.14
893 0.14
894 0.15
895 0.14
896 0.15
897 0.16
898 0.19
899 0.18
900 0.2
901 0.19
902 0.17
903 0.16
904 0.15
905 0.15
906 0.1
907 0.12
908 0.1
909 0.11
910 0.11
911 0.12
912 0.15
913 0.2
914 0.22
915 0.24
916 0.25
917 0.25
918 0.27
919 0.34
920 0.41
921 0.4
922 0.4
923 0.38
924 0.36
925 0.35
926 0.35
927 0.29
928 0.2
929 0.15
930 0.17
931 0.14
932 0.17
933 0.21
934 0.19
935 0.21
936 0.25
937 0.29
938 0.28
939 0.38
940 0.36
941 0.33
942 0.33
943 0.3
944 0.25
945 0.24
946 0.22
947 0.13
948 0.13
949 0.13
950 0.12
951 0.12
952 0.12
953 0.1
954 0.09
955 0.09
956 0.08
957 0.07
958 0.06
959 0.07
960 0.07
961 0.06
962 0.07
963 0.07
964 0.09
965 0.13
966 0.13
967 0.16
968 0.17
969 0.19
970 0.23
971 0.24
972 0.26
973 0.26
974 0.27
975 0.26
976 0.3
977 0.34
978 0.32
979 0.29
980 0.26
981 0.24
982 0.24
983 0.24
984 0.19
985 0.14
986 0.13
987 0.12
988 0.12
989 0.11
990 0.1
991 0.15
992 0.2
993 0.23
994 0.28
995 0.35
996 0.45
997 0.53
998 0.57
999 0.6
1000 0.6
1001 0.58
1002 0.55
1003 0.52
1004 0.46
1005 0.44
1006 0.42
1007 0.33
1008 0.3
1009 0.28
1010 0.27
1011 0.24
1012 0.23
1013 0.17
1014 0.14
1015 0.14
1016 0.15
1017 0.16
1018 0.19
1019 0.19
1020 0.17
1021 0.21
1022 0.23
1023 0.29
1024 0.37
1025 0.46
1026 0.46
1027 0.5
1028 0.56
1029 0.59
1030 0.66
1031 0.66
1032 0.61
1033 0.56
1034 0.53
1035 0.53
1036 0.49
1037 0.45
1038 0.36
1039 0.32
1040 0.28
1041 0.24
1042 0.23
1043 0.17
1044 0.14
1045 0.13
1046 0.13
1047 0.11
1048 0.11
1049 0.14
1050 0.16
1051 0.18
1052 0.18
1053 0.15
1054 0.15
1055 0.16
1056 0.16
1057 0.14
1058 0.13
1059 0.12
1060 0.11
1061 0.12
1062 0.11
1063 0.11
1064 0.09
1065 0.1
1066 0.11
1067 0.14
1068 0.13
1069 0.14
1070 0.15
1071 0.15
1072 0.16
1073 0.16
1074 0.17
1075 0.15
1076 0.16
1077 0.22
1078 0.25
1079 0.28
1080 0.36
1081 0.39
1082 0.39
1083 0.41
1084 0.43
1085 0.41
1086 0.48
1087 0.53
1088 0.54
1089 0.52
1090 0.53
1091 0.51
1092 0.48
1093 0.43
1094 0.33
1095 0.24
1096 0.18
1097 0.17
1098 0.14
1099 0.17
1100 0.16
1101 0.16
1102 0.18
1103 0.18
1104 0.17
1105 0.16
1106 0.15
1107 0.15
1108 0.17
1109 0.17
1110 0.17
1111 0.16
1112 0.14
1113 0.13
1114 0.16
1115 0.2
1116 0.22
1117 0.22
1118 0.24
1119 0.23
1120 0.24
1121 0.25
1122 0.23
1123 0.17
1124 0.13
1125 0.13
1126 0.11
1127 0.11
1128 0.11
1129 0.12
1130 0.11
1131 0.11
1132 0.15
1133 0.17
1134 0.21
1135 0.21
1136 0.21
1137 0.2
1138 0.24
1139 0.28
1140 0.29
1141 0.28
1142 0.25
1143 0.27
1144 0.28
1145 0.27
1146 0.24
1147 0.2
1148 0.15
1149 0.22
1150 0.28
1151 0.27
1152 0.29
1153 0.33
1154 0.36
1155 0.42
1156 0.44
1157 0.42
1158 0.4
1159 0.42
1160 0.44
1161 0.47
1162 0.49
1163 0.45
1164 0.44
1165 0.42
1166 0.38
1167 0.35
1168 0.31
1169 0.24
1170 0.21
1171 0.24
1172 0.29
1173 0.31
1174 0.34
1175 0.4
1176 0.46
1177 0.49
1178 0.46
1179 0.46
1180 0.46
1181 0.51
1182 0.52
1183 0.48
1184 0.46