Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JQA5

Protein Details
Accession C4JQA5    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MSNTKRKSRRNGGTNIDKRDFHydrophilic
807-828IPLPRPNRTKPKRATQKTDSDKHydrophilic
837-868AAKLRRQKEKEEEKERKRKLKEEKEKAKKLASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
788-795RGSKKGRK
812-823PNRTKPKRATQK
828-866KASSALEKEAAKLRRQKEKEEEKERKRKLKEEKEKAKKL
Subcellular Location(s) plas 22, nucl 2, mito 2, mito_nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042530  EME1/EME2_C  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011701  MFS  
IPR036259  MFS_trans_sf  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
IPR047521  XPF_nuclease_EME1_ascomycetes  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0022857  F:transmembrane transporter activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
KEGG ure:UREG_04659  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
PF07690  MFS_1  
CDD cd17354  MFS_Mch1p_like  
cd20085  XPF_nuclease_Mms4  
Amino Acid Sequences MSNTKRKSRRNGGTNIDKRDFDANRSLLGRVAHSEDIEYDRRTGVPGRSSTDSDGLLSDVVSEIVDRDREMLKREMVRVGSFIWGVLTASCAGSITGFSIYGPLLLSRLHYSQFRVNTVAVAAEMTMYLPVPLFGYLCDRYSPGPVALLSAFLFGPGYLLAALTFRSGPPPDAGGSGWPYWVMILAFLGVGAGTASMYLAAVSTCAKNFAQSKHKGLMLAMPIAAFGLSGMWQSQVGRHLLCEWGPNGEKGDVDVFKYFLFLAILLFSVGLVGSFALRLVDEEKLIDEAVEELERSGYLDESSFFRPREEVNAEYGTFGAENNGTVGIDDGDGDSVTSSQEEKQKKTWLLNQETKLFLRDRTMWWLAAGFFLASGPGEAYINNVGTVIHTLTPSSYPPNLPPPAGHPSLHVTIIALTSTAARLLTGSLSDAFAPTSRTRYQSQEEYSPVRSKRRLTLSRLAFLIPSALLLSLGYLYLSTPFPLQHPSSFVTTTTLVGFGYGAIFSLVPIIISVVWGVENFGTNWGIVAMVPALGATLWGMVYSAGYEAAIELKLGDTGRLIDYFWKLLTSHLVPTAHGPPARTSTYDYIPSALVHEAKALQPAMAEVISLLSSPETCRPHRSRKSSTSKHGLVRLSNDLLSDILDDSLLELEEIAQPPKRRKLDTALDIPSSQNRLATHTVLSSFISNDSFERSGSYEIRKSTLQRFESWNDEISDPVLSSPRRINTSYHEISKRSTNVIKIDDSFDDIVEDDLLGDPFQFSPPPASQSAFSDRTSGLLAKLRDQPARGSKKGRKATASVQSSDEDIPLPRPNRTKPKRATQKTDSDKASSALEKEAAKLRRQKEKEEEKERKRKLKEEKEKAKKLASDIAQANKLKINKKESTPEMLIDLSSTFQGSSIGTQVNEYMRHLEVQTNFIATEIPNIVSWRRKVTAIYNDEAGHWEPCPLRIEKEGHVLCFLTAQNFVDLVASSGASQTVESHFQNVIRHYPGCKIIYLIEGLFAYMRKNQNIRNRAYQAAVLRQIGDSHDATTEQRSSSRRSAKTPAPSAIDDDRVEDALLQLQIQHHCLIYQTATAAETAEWIKNFTEHISTIPYRRERISMQNAAFCMDTGQVKTGTDADDTYIKMLEEIQRITAPIAYGVAMKYSNVRELVNGMKAHGPLSLQDVKKCANKSGALTEARIGPAVSKRLHKIFTSVDPCSADI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.85
3 0.79
4 0.68
5 0.61
6 0.61
7 0.53
8 0.47
9 0.48
10 0.4
11 0.4
12 0.41
13 0.39
14 0.33
15 0.32
16 0.29
17 0.23
18 0.27
19 0.24
20 0.22
21 0.23
22 0.22
23 0.26
24 0.28
25 0.27
26 0.23
27 0.23
28 0.23
29 0.25
30 0.28
31 0.28
32 0.32
33 0.34
34 0.38
35 0.41
36 0.43
37 0.44
38 0.42
39 0.36
40 0.29
41 0.26
42 0.21
43 0.17
44 0.14
45 0.11
46 0.08
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.13
55 0.17
56 0.2
57 0.25
58 0.28
59 0.32
60 0.37
61 0.4
62 0.43
63 0.41
64 0.4
65 0.37
66 0.33
67 0.29
68 0.24
69 0.2
70 0.15
71 0.12
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.11
94 0.13
95 0.15
96 0.18
97 0.19
98 0.24
99 0.3
100 0.34
101 0.34
102 0.33
103 0.31
104 0.29
105 0.28
106 0.24
107 0.16
108 0.12
109 0.09
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.13
123 0.14
124 0.16
125 0.17
126 0.17
127 0.18
128 0.22
129 0.24
130 0.19
131 0.19
132 0.17
133 0.19
134 0.17
135 0.18
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.07
142 0.08
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.07
153 0.12
154 0.13
155 0.15
156 0.16
157 0.18
158 0.17
159 0.18
160 0.18
161 0.17
162 0.19
163 0.18
164 0.16
165 0.14
166 0.13
167 0.12
168 0.13
169 0.1
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.02
181 0.02
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.11
193 0.11
194 0.16
195 0.21
196 0.28
197 0.36
198 0.4
199 0.46
200 0.47
201 0.49
202 0.44
203 0.4
204 0.38
205 0.31
206 0.27
207 0.21
208 0.17
209 0.15
210 0.14
211 0.14
212 0.08
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.07
221 0.09
222 0.12
223 0.14
224 0.14
225 0.15
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.18
230 0.15
231 0.19
232 0.2
233 0.2
234 0.22
235 0.2
236 0.2
237 0.18
238 0.22
239 0.17
240 0.18
241 0.17
242 0.16
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.1
247 0.09
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.05
266 0.06
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.1
289 0.15
290 0.18
291 0.18
292 0.19
293 0.2
294 0.2
295 0.26
296 0.28
297 0.25
298 0.26
299 0.28
300 0.27
301 0.26
302 0.24
303 0.18
304 0.13
305 0.11
306 0.08
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.04
323 0.04
324 0.05
325 0.06
326 0.09
327 0.17
328 0.21
329 0.25
330 0.3
331 0.37
332 0.4
333 0.45
334 0.48
335 0.51
336 0.55
337 0.6
338 0.59
339 0.56
340 0.55
341 0.5
342 0.46
343 0.38
344 0.3
345 0.26
346 0.25
347 0.23
348 0.28
349 0.29
350 0.26
351 0.25
352 0.25
353 0.21
354 0.18
355 0.16
356 0.08
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.1
381 0.12
382 0.13
383 0.13
384 0.16
385 0.23
386 0.24
387 0.24
388 0.23
389 0.25
390 0.29
391 0.3
392 0.28
393 0.22
394 0.25
395 0.26
396 0.26
397 0.2
398 0.15
399 0.13
400 0.13
401 0.11
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.1
421 0.1
422 0.14
423 0.16
424 0.19
425 0.22
426 0.26
427 0.31
428 0.34
429 0.36
430 0.36
431 0.37
432 0.37
433 0.39
434 0.4
435 0.39
436 0.39
437 0.4
438 0.38
439 0.42
440 0.49
441 0.52
442 0.53
443 0.59
444 0.57
445 0.55
446 0.53
447 0.46
448 0.36
449 0.29
450 0.22
451 0.13
452 0.09
453 0.06
454 0.05
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.07
468 0.08
469 0.12
470 0.13
471 0.13
472 0.15
473 0.17
474 0.19
475 0.19
476 0.18
477 0.16
478 0.15
479 0.15
480 0.13
481 0.11
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.05
486 0.05
487 0.04
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.04
493 0.04
494 0.03
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.04
514 0.04
515 0.03
516 0.03
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.02
521 0.02
522 0.02
523 0.02
524 0.02
525 0.02
526 0.02
527 0.02
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.03
535 0.04
536 0.04
537 0.03
538 0.03
539 0.03
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.04
544 0.05
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.07
549 0.08
550 0.09
551 0.09
552 0.08
553 0.08
554 0.08
555 0.11
556 0.1
557 0.11
558 0.13
559 0.13
560 0.13
561 0.15
562 0.17
563 0.17
564 0.17
565 0.16
566 0.15
567 0.18
568 0.19
569 0.17
570 0.18
571 0.18
572 0.19
573 0.21
574 0.2
575 0.17
576 0.16
577 0.15
578 0.13
579 0.12
580 0.1
581 0.08
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.09
586 0.08
587 0.07
588 0.06
589 0.06
590 0.07
591 0.05
592 0.05
593 0.03
594 0.03
595 0.03
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.03
600 0.04
601 0.1
602 0.13
603 0.15
604 0.23
605 0.29
606 0.39
607 0.48
608 0.56
609 0.58
610 0.65
611 0.75
612 0.74
613 0.75
614 0.73
615 0.69
616 0.65
617 0.62
618 0.53
619 0.44
620 0.4
621 0.36
622 0.28
623 0.23
624 0.2
625 0.15
626 0.13
627 0.11
628 0.09
629 0.06
630 0.05
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.04
635 0.04
636 0.03
637 0.03
638 0.03
639 0.05
640 0.06
641 0.07
642 0.1
643 0.12
644 0.17
645 0.25
646 0.28
647 0.28
648 0.31
649 0.37
650 0.43
651 0.46
652 0.48
653 0.43
654 0.41
655 0.39
656 0.37
657 0.31
658 0.25
659 0.19
660 0.15
661 0.13
662 0.16
663 0.17
664 0.17
665 0.16
666 0.15
667 0.15
668 0.14
669 0.14
670 0.1
671 0.09
672 0.08
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.1
677 0.1
678 0.1
679 0.1
680 0.11
681 0.13
682 0.15
683 0.18
684 0.18
685 0.18
686 0.21
687 0.21
688 0.23
689 0.28
690 0.34
691 0.32
692 0.32
693 0.36
694 0.36
695 0.39
696 0.37
697 0.32
698 0.26
699 0.24
700 0.21
701 0.17
702 0.15
703 0.1
704 0.09
705 0.11
706 0.09
707 0.11
708 0.15
709 0.17
710 0.2
711 0.22
712 0.23
713 0.25
714 0.34
715 0.35
716 0.38
717 0.38
718 0.36
719 0.36
720 0.4
721 0.35
722 0.31
723 0.3
724 0.27
725 0.28
726 0.3
727 0.3
728 0.26
729 0.26
730 0.22
731 0.22
732 0.19
733 0.15
734 0.12
735 0.11
736 0.1
737 0.07
738 0.07
739 0.04
740 0.05
741 0.05
742 0.04
743 0.04
744 0.04
745 0.05
746 0.05
747 0.05
748 0.05
749 0.09
750 0.1
751 0.14
752 0.15
753 0.16
754 0.16
755 0.19
756 0.26
757 0.25
758 0.24
759 0.23
760 0.22
761 0.21
762 0.22
763 0.19
764 0.14
765 0.16
766 0.16
767 0.18
768 0.25
769 0.28
770 0.28
771 0.29
772 0.33
773 0.38
774 0.45
775 0.45
776 0.48
777 0.5
778 0.59
779 0.65
780 0.64
781 0.58
782 0.54
783 0.58
784 0.58
785 0.56
786 0.47
787 0.42
788 0.38
789 0.36
790 0.32
791 0.25
792 0.16
793 0.12
794 0.13
795 0.17
796 0.18
797 0.21
798 0.26
799 0.33
800 0.43
801 0.5
802 0.57
803 0.59
804 0.69
805 0.76
806 0.79
807 0.81
808 0.77
809 0.81
810 0.78
811 0.78
812 0.7
813 0.61
814 0.54
815 0.46
816 0.4
817 0.31
818 0.25
819 0.18
820 0.19
821 0.16
822 0.17
823 0.23
824 0.24
825 0.28
826 0.35
827 0.4
828 0.47
829 0.5
830 0.56
831 0.59
832 0.67
833 0.72
834 0.75
835 0.8
836 0.8
837 0.88
838 0.88
839 0.87
840 0.81
841 0.8
842 0.8
843 0.81
844 0.82
845 0.82
846 0.85
847 0.87
848 0.89
849 0.85
850 0.79
851 0.7
852 0.62
853 0.58
854 0.49
855 0.45
856 0.41
857 0.41
858 0.42
859 0.4
860 0.38
861 0.34
862 0.37
863 0.36
864 0.38
865 0.42
866 0.41
867 0.45
868 0.52
869 0.51
870 0.54
871 0.49
872 0.44
873 0.37
874 0.33
875 0.28
876 0.2
877 0.17
878 0.1
879 0.08
880 0.08
881 0.06
882 0.05
883 0.06
884 0.06
885 0.07
886 0.08
887 0.1
888 0.09
889 0.1
890 0.12
891 0.14
892 0.14
893 0.14
894 0.15
895 0.14
896 0.15
897 0.16
898 0.19
899 0.18
900 0.2
901 0.19
902 0.17
903 0.16
904 0.15
905 0.15
906 0.1
907 0.12
908 0.1
909 0.11
910 0.11
911 0.12
912 0.15
913 0.2
914 0.22
915 0.24
916 0.25
917 0.25
918 0.27
919 0.34
920 0.41
921 0.4
922 0.4
923 0.38
924 0.36
925 0.35
926 0.35
927 0.29
928 0.2
929 0.15
930 0.17
931 0.14
932 0.17
933 0.21
934 0.19
935 0.21
936 0.25
937 0.29
938 0.28
939 0.38
940 0.36
941 0.33
942 0.33
943 0.3
944 0.25
945 0.24
946 0.22
947 0.13
948 0.13
949 0.13
950 0.12
951 0.12
952 0.12
953 0.1
954 0.09
955 0.09
956 0.08
957 0.07
958 0.06
959 0.07
960 0.07
961 0.06
962 0.07
963 0.07
964 0.09
965 0.13
966 0.13
967 0.16
968 0.17
969 0.19
970 0.23
971 0.24
972 0.26
973 0.26
974 0.27
975 0.26
976 0.3
977 0.34
978 0.32
979 0.29
980 0.26
981 0.24
982 0.24
983 0.24
984 0.19
985 0.14
986 0.13
987 0.12
988 0.12
989 0.11
990 0.1
991 0.15
992 0.2
993 0.23
994 0.28
995 0.35
996 0.45
997 0.53
998 0.57
999 0.6
1000 0.6
1001 0.58
1002 0.55
1003 0.52
1004 0.46
1005 0.44
1006 0.42
1007 0.33
1008 0.3
1009 0.28
1010 0.27
1011 0.24
1012 0.23
1013 0.17
1014 0.14
1015 0.14
1016 0.15
1017 0.16
1018 0.19
1019 0.19
1020 0.17
1021 0.21
1022 0.23
1023 0.29
1024 0.37
1025 0.46
1026 0.46
1027 0.5
1028 0.56
1029 0.59
1030 0.66
1031 0.66
1032 0.61
1033 0.56
1034 0.53
1035 0.53
1036 0.49
1037 0.45
1038 0.36
1039 0.32
1040 0.28
1041 0.24
1042 0.23
1043 0.17
1044 0.14
1045 0.13
1046 0.13
1047 0.11
1048 0.11
1049 0.14
1050 0.16
1051 0.18
1052 0.18
1053 0.15
1054 0.15
1055 0.16
1056 0.16
1057 0.14
1058 0.13
1059 0.12
1060 0.11
1061 0.12
1062 0.11
1063 0.11
1064 0.09
1065 0.1
1066 0.11
1067 0.14
1068 0.13
1069 0.14
1070 0.15
1071 0.15
1072 0.16
1073 0.16
1074 0.17
1075 0.15
1076 0.16
1077 0.22
1078 0.25
1079 0.28
1080 0.36
1081 0.39
1082 0.39
1083 0.41
1084 0.43
1085 0.41
1086 0.48
1087 0.53
1088 0.54
1089 0.52
1090 0.53
1091 0.51
1092 0.48
1093 0.43
1094 0.33
1095 0.24
1096 0.18
1097 0.17
1098 0.14
1099 0.17
1100 0.16
1101 0.16
1102 0.18
1103 0.18
1104 0.17
1105 0.16
1106 0.15
1107 0.15
1108 0.17
1109 0.17
1110 0.17
1111 0.16
1112 0.14
1113 0.13
1114 0.16
1115 0.2
1116 0.22
1117 0.22
1118 0.24
1119 0.23
1120 0.24
1121 0.25
1122 0.23
1123 0.17
1124 0.13
1125 0.13
1126 0.11
1127 0.11
1128 0.11
1129 0.12
1130 0.11
1131 0.11
1132 0.15
1133 0.17
1134 0.21
1135 0.21
1136 0.21
1137 0.2
1138 0.24
1139 0.28
1140 0.29
1141 0.28
1142 0.25
1143 0.27
1144 0.28
1145 0.27
1146 0.24
1147 0.2
1148 0.15
1149 0.22
1150 0.28
1151 0.27
1152 0.29
1153 0.33
1154 0.36
1155 0.42
1156 0.44
1157 0.42
1158 0.4
1159 0.42
1160 0.44
1161 0.47
1162 0.49
1163 0.45
1164 0.44
1165 0.42
1166 0.38
1167 0.35
1168 0.31
1169 0.24
1170 0.21
1171 0.24
1172 0.29
1173 0.31
1174 0.34
1175 0.4
1176 0.46
1177 0.49
1178 0.46
1179 0.46
1180 0.46
1181 0.51
1182 0.52
1183 0.48
1184 0.46