Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JDU5

Protein Details
Accession C4JDU5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-53GDVTLGRRRSQRVRNSRKGATSLHydrophilic
1208-1233RGIRGDLVRRKKQKSAKGNPNGHSGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1216-1224RRKKQKSAK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR009463  DUF1087  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
IPR040934  Znf-CCCH_6  
IPR041684  Znf-PHD-like  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG ure:UREG_00572  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06465  DUF1087  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PF18585  zf-CCCH_6  
PF15446  zf-PHD-like  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd15489  PHD_SF  
cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MQPVRRSRRLTSGPKLHAFSDLQDDSDELNGDVTLGRRRSQRVRNSRKGATSLAERKEDDISEVEVAQTGSKYSGAREVFEVLPRDNLFRTHHQQACATCLYEDPGPLVYCQGCTSSYHKTCLGPRGQRLHLVTKVNNGYFILQCRACLGTACGKDKLAPHLGNCSKCHKAGFFSSPLRPQLTARQEQTQREENGGVDPSIAVDIGQINNAENVMFRCMTCKRSWHMSHLPPKSKKTYIADSDDDNDNGSLEDDYELCKRRFSEYSRQWQCQDCLTAPGEIEALVAWRPLDLDSYTPGYTSDMLPELSKEYLVKWRKSSYFKVTWMRGDWVWGVTAAAMRKAFHKSTKSLKPCMSTEDAIPEEYLQIDIALDIRYSNVVSNRTYEIDLARIGEVVEVYAKYKGLTYEEAVWEKPPDPSNTDQWNSFQVAYANWVQGRYIQRPNRIRLKKHLLSIRSKNFGDHLVKREQPSILVGGQLMNYQLQGLNWMYELWHQQKNAILADEMGLGKTIQVIAFFATLIQDHSCWPFLVVVPNSTVPNWRSEIKRWAPSLRVVTYYGLSTSRKLVRDYEMFPDAKGGLRCHIVVTSYETMTDDQGRRVLSTIPWQGLVVDEGHRLKNDKSQLYDCLSKINFPFKLLLTGTPLQNNIRELFNLIQFCDPSKDAEELESRYQNLTADNITELHKMIFPFFLRRTKALVLDFLPPMTQIIVPVSMTIVQKKLYKSILAKNPQLIKAIFKKAGPLKQSERHNLNNILIQLRKCLCHPFVYSNAIEERGVNSTLLHRNLVEASSKLQLLELLLPKLQERGHRVLIFSQFLGFLDIIEDFLDGLGLLHLRLDGSLSSLQRQKRIDQFNAPNSPYFTFLLSTRAGGVGINLATADTVIIMDPDFNPHQDIQALSRAHRIGQQRKVLVFQLMTKGTVEEKIIQIGRKKMALDQALIGFMDAEEDAGVDLASILCHGADALFDDDDEGDVHYDHKSIEKLLEQSENTKTSDDTSAESQFSFVKVWTNESANLEDRSDEAETSTPNSTVWDKILKEREHIAEQEALAKAETLGRGKRKRQEVNYSLPESPLRQNKPDSDMEFTGAEVESDIDSLNSDISVAPEQANKRGLSSALARPYKRAKVIDLDGPVDSPSICCVACDGIHPLGHCRLKQAGVEHCGLCGIAHFGHSRTCPHLNSESQVASMLSSLKQSTEQRALVEEATKYLRGIRGDLVRRKKQKSAKGNPNGHSGGALSALPVGLIPTAPPPQPQQPVTATPPAYWNPSYCPYPPTHGAPNAYDYSATYPPRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.75
3 0.65
4 0.6
5 0.52
6 0.43
7 0.42
8 0.34
9 0.28
10 0.26
11 0.26
12 0.22
13 0.22
14 0.2
15 0.11
16 0.11
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.12
21 0.18
22 0.19
23 0.24
24 0.29
25 0.37
26 0.46
27 0.55
28 0.63
29 0.67
30 0.76
31 0.83
32 0.85
33 0.86
34 0.82
35 0.76
36 0.69
37 0.63
38 0.63
39 0.61
40 0.58
41 0.55
42 0.5
43 0.48
44 0.47
45 0.42
46 0.35
47 0.28
48 0.25
49 0.21
50 0.2
51 0.18
52 0.16
53 0.16
54 0.14
55 0.12
56 0.1
57 0.1
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.2
62 0.2
63 0.22
64 0.23
65 0.26
66 0.25
67 0.3
68 0.32
69 0.25
70 0.3
71 0.29
72 0.3
73 0.27
74 0.29
75 0.3
76 0.35
77 0.42
78 0.46
79 0.49
80 0.49
81 0.53
82 0.5
83 0.51
84 0.45
85 0.38
86 0.29
87 0.25
88 0.25
89 0.22
90 0.2
91 0.16
92 0.17
93 0.16
94 0.16
95 0.18
96 0.16
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.14
101 0.17
102 0.21
103 0.29
104 0.32
105 0.34
106 0.36
107 0.39
108 0.44
109 0.5
110 0.55
111 0.52
112 0.57
113 0.61
114 0.61
115 0.63
116 0.62
117 0.61
118 0.58
119 0.56
120 0.5
121 0.51
122 0.55
123 0.48
124 0.45
125 0.38
126 0.35
127 0.31
128 0.33
129 0.3
130 0.23
131 0.23
132 0.24
133 0.24
134 0.21
135 0.2
136 0.19
137 0.22
138 0.28
139 0.32
140 0.31
141 0.31
142 0.33
143 0.35
144 0.38
145 0.38
146 0.35
147 0.33
148 0.41
149 0.47
150 0.5
151 0.5
152 0.5
153 0.45
154 0.45
155 0.47
156 0.39
157 0.37
158 0.39
159 0.42
160 0.43
161 0.45
162 0.48
163 0.5
164 0.52
165 0.49
166 0.44
167 0.4
168 0.42
169 0.45
170 0.47
171 0.45
172 0.51
173 0.54
174 0.58
175 0.62
176 0.6
177 0.53
178 0.48
179 0.46
180 0.37
181 0.35
182 0.31
183 0.24
184 0.16
185 0.14
186 0.12
187 0.11
188 0.1
189 0.06
190 0.05
191 0.07
192 0.07
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.16
205 0.19
206 0.23
207 0.25
208 0.3
209 0.32
210 0.42
211 0.45
212 0.49
213 0.56
214 0.61
215 0.68
216 0.72
217 0.77
218 0.73
219 0.76
220 0.75
221 0.69
222 0.67
223 0.64
224 0.63
225 0.6
226 0.6
227 0.55
228 0.5
229 0.5
230 0.45
231 0.39
232 0.31
233 0.24
234 0.17
235 0.15
236 0.13
237 0.09
238 0.07
239 0.08
240 0.07
241 0.09
242 0.14
243 0.19
244 0.19
245 0.21
246 0.22
247 0.26
248 0.33
249 0.37
250 0.43
251 0.48
252 0.59
253 0.65
254 0.68
255 0.66
256 0.65
257 0.6
258 0.54
259 0.48
260 0.38
261 0.34
262 0.31
263 0.29
264 0.23
265 0.22
266 0.17
267 0.12
268 0.11
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.11
281 0.15
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.15
287 0.14
288 0.13
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.13
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.2
299 0.27
300 0.31
301 0.33
302 0.39
303 0.45
304 0.51
305 0.57
306 0.56
307 0.56
308 0.6
309 0.63
310 0.61
311 0.58
312 0.55
313 0.51
314 0.42
315 0.37
316 0.31
317 0.23
318 0.19
319 0.15
320 0.12
321 0.09
322 0.11
323 0.09
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.14
328 0.19
329 0.22
330 0.26
331 0.3
332 0.33
333 0.42
334 0.51
335 0.55
336 0.57
337 0.58
338 0.57
339 0.53
340 0.53
341 0.49
342 0.4
343 0.34
344 0.33
345 0.3
346 0.25
347 0.24
348 0.18
349 0.14
350 0.13
351 0.12
352 0.06
353 0.05
354 0.05
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.06
363 0.08
364 0.11
365 0.13
366 0.14
367 0.17
368 0.18
369 0.2
370 0.2
371 0.19
372 0.16
373 0.15
374 0.15
375 0.13
376 0.11
377 0.1
378 0.09
379 0.08
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.11
391 0.12
392 0.13
393 0.17
394 0.2
395 0.21
396 0.21
397 0.21
398 0.2
399 0.19
400 0.21
401 0.2
402 0.19
403 0.22
404 0.25
405 0.31
406 0.36
407 0.37
408 0.35
409 0.33
410 0.33
411 0.31
412 0.27
413 0.21
414 0.15
415 0.14
416 0.16
417 0.16
418 0.15
419 0.13
420 0.13
421 0.12
422 0.17
423 0.21
424 0.23
425 0.31
426 0.34
427 0.43
428 0.5
429 0.57
430 0.62
431 0.65
432 0.65
433 0.65
434 0.7
435 0.66
436 0.66
437 0.66
438 0.61
439 0.63
440 0.67
441 0.64
442 0.6
443 0.55
444 0.49
445 0.44
446 0.44
447 0.41
448 0.36
449 0.35
450 0.35
451 0.38
452 0.39
453 0.4
454 0.34
455 0.28
456 0.24
457 0.22
458 0.16
459 0.13
460 0.12
461 0.1
462 0.1
463 0.09
464 0.08
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.05
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.07
476 0.09
477 0.14
478 0.16
479 0.19
480 0.19
481 0.2
482 0.23
483 0.24
484 0.23
485 0.19
486 0.15
487 0.11
488 0.12
489 0.12
490 0.1
491 0.07
492 0.07
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.08
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.14
517 0.14
518 0.14
519 0.14
520 0.16
521 0.16
522 0.15
523 0.18
524 0.13
525 0.15
526 0.16
527 0.18
528 0.2
529 0.24
530 0.33
531 0.35
532 0.4
533 0.4
534 0.41
535 0.4
536 0.41
537 0.42
538 0.34
539 0.3
540 0.26
541 0.24
542 0.22
543 0.2
544 0.16
545 0.13
546 0.12
547 0.11
548 0.15
549 0.18
550 0.19
551 0.21
552 0.22
553 0.24
554 0.27
555 0.29
556 0.28
557 0.28
558 0.26
559 0.25
560 0.24
561 0.2
562 0.19
563 0.18
564 0.15
565 0.12
566 0.13
567 0.14
568 0.13
569 0.13
570 0.1
571 0.09
572 0.14
573 0.14
574 0.12
575 0.12
576 0.13
577 0.13
578 0.13
579 0.16
580 0.12
581 0.11
582 0.13
583 0.13
584 0.13
585 0.13
586 0.14
587 0.11
588 0.16
589 0.18
590 0.16
591 0.16
592 0.16
593 0.15
594 0.14
595 0.14
596 0.08
597 0.07
598 0.09
599 0.1
600 0.1
601 0.11
602 0.12
603 0.12
604 0.17
605 0.22
606 0.22
607 0.23
608 0.25
609 0.28
610 0.3
611 0.32
612 0.27
613 0.27
614 0.24
615 0.23
616 0.23
617 0.25
618 0.22
619 0.2
620 0.21
621 0.16
622 0.19
623 0.18
624 0.17
625 0.16
626 0.18
627 0.17
628 0.17
629 0.18
630 0.15
631 0.16
632 0.17
633 0.13
634 0.12
635 0.11
636 0.12
637 0.12
638 0.14
639 0.13
640 0.12
641 0.12
642 0.11
643 0.12
644 0.12
645 0.11
646 0.1
647 0.11
648 0.11
649 0.11
650 0.13
651 0.14
652 0.15
653 0.17
654 0.17
655 0.15
656 0.15
657 0.15
658 0.13
659 0.12
660 0.1
661 0.08
662 0.07
663 0.07
664 0.08
665 0.09
666 0.09
667 0.09
668 0.09
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.1
673 0.1
674 0.14
675 0.17
676 0.22
677 0.22
678 0.23
679 0.26
680 0.26
681 0.28
682 0.25
683 0.24
684 0.2
685 0.21
686 0.2
687 0.16
688 0.15
689 0.11
690 0.11
691 0.09
692 0.07
693 0.05
694 0.05
695 0.06
696 0.06
697 0.06
698 0.06
699 0.08
700 0.09
701 0.09
702 0.1
703 0.12
704 0.15
705 0.16
706 0.19
707 0.17
708 0.21
709 0.24
710 0.31
711 0.37
712 0.4
713 0.41
714 0.43
715 0.45
716 0.43
717 0.41
718 0.34
719 0.3
720 0.3
721 0.33
722 0.3
723 0.26
724 0.3
725 0.33
726 0.37
727 0.35
728 0.34
729 0.36
730 0.41
731 0.47
732 0.48
733 0.49
734 0.48
735 0.5
736 0.47
737 0.42
738 0.38
739 0.33
740 0.28
741 0.25
742 0.21
743 0.21
744 0.2
745 0.2
746 0.18
747 0.21
748 0.2
749 0.22
750 0.25
751 0.24
752 0.26
753 0.3
754 0.29
755 0.26
756 0.25
757 0.22
758 0.19
759 0.16
760 0.13
761 0.11
762 0.12
763 0.1
764 0.09
765 0.13
766 0.17
767 0.18
768 0.17
769 0.15
770 0.15
771 0.16
772 0.16
773 0.13
774 0.09
775 0.1
776 0.11
777 0.11
778 0.11
779 0.1
780 0.09
781 0.09
782 0.12
783 0.12
784 0.12
785 0.12
786 0.12
787 0.13
788 0.15
789 0.16
790 0.16
791 0.2
792 0.24
793 0.3
794 0.3
795 0.31
796 0.32
797 0.34
798 0.3
799 0.24
800 0.2
801 0.14
802 0.13
803 0.14
804 0.1
805 0.07
806 0.06
807 0.06
808 0.06
809 0.06
810 0.06
811 0.04
812 0.04
813 0.04
814 0.03
815 0.03
816 0.03
817 0.03
818 0.03
819 0.03
820 0.03
821 0.03
822 0.03
823 0.04
824 0.04
825 0.06
826 0.1
827 0.1
828 0.14
829 0.19
830 0.21
831 0.26
832 0.28
833 0.31
834 0.36
835 0.43
836 0.44
837 0.48
838 0.54
839 0.57
840 0.61
841 0.57
842 0.49
843 0.44
844 0.41
845 0.34
846 0.27
847 0.2
848 0.15
849 0.14
850 0.17
851 0.15
852 0.14
853 0.12
854 0.11
855 0.1
856 0.09
857 0.09
858 0.07
859 0.06
860 0.06
861 0.05
862 0.05
863 0.05
864 0.05
865 0.04
866 0.02
867 0.03
868 0.03
869 0.03
870 0.03
871 0.04
872 0.04
873 0.08
874 0.09
875 0.1
876 0.12
877 0.12
878 0.13
879 0.13
880 0.14
881 0.12
882 0.18
883 0.19
884 0.18
885 0.22
886 0.22
887 0.21
888 0.26
889 0.33
890 0.35
891 0.42
892 0.47
893 0.46
894 0.47
895 0.48
896 0.45
897 0.38
898 0.3
899 0.25
900 0.24
901 0.21
902 0.21
903 0.19
904 0.18
905 0.16
906 0.17
907 0.16
908 0.13
909 0.12
910 0.16
911 0.18
912 0.2
913 0.24
914 0.27
915 0.28
916 0.28
917 0.28
918 0.27
919 0.32
920 0.31
921 0.27
922 0.24
923 0.23
924 0.21
925 0.2
926 0.17
927 0.1
928 0.08
929 0.07
930 0.05
931 0.04
932 0.03
933 0.04
934 0.04
935 0.04
936 0.04
937 0.03
938 0.03
939 0.03
940 0.03
941 0.03
942 0.03
943 0.03
944 0.03
945 0.03
946 0.03
947 0.03
948 0.05
949 0.06
950 0.06
951 0.06
952 0.07
953 0.07
954 0.08
955 0.08
956 0.06
957 0.05
958 0.06
959 0.07
960 0.07
961 0.08
962 0.07
963 0.1
964 0.1
965 0.11
966 0.13
967 0.16
968 0.18
969 0.2
970 0.24
971 0.23
972 0.26
973 0.29
974 0.29
975 0.27
976 0.25
977 0.23
978 0.21
979 0.23
980 0.2
981 0.18
982 0.2
983 0.21
984 0.21
985 0.21
986 0.19
987 0.16
988 0.16
989 0.14
990 0.11
991 0.15
992 0.15
993 0.19
994 0.21
995 0.23
996 0.24
997 0.26
998 0.29
999 0.26
1000 0.27
1001 0.23
1002 0.2
1003 0.19
1004 0.19
1005 0.17
1006 0.14
1007 0.12
1008 0.12
1009 0.12
1010 0.15
1011 0.16
1012 0.13
1013 0.12
1014 0.15
1015 0.15
1016 0.15
1017 0.17
1018 0.2
1019 0.21
1020 0.28
1021 0.37
1022 0.36
1023 0.37
1024 0.41
1025 0.43
1026 0.41
1027 0.4
1028 0.35
1029 0.29
1030 0.28
1031 0.3
1032 0.25
1033 0.21
1034 0.17
1035 0.16
1036 0.13
1037 0.13
1038 0.15
1039 0.15
1040 0.2
1041 0.3
1042 0.38
1043 0.45
1044 0.53
1045 0.61
1046 0.68
1047 0.73
1048 0.78
1049 0.75
1050 0.77
1051 0.77
1052 0.74
1053 0.64
1054 0.57
1055 0.49
1056 0.42
1057 0.43
1058 0.42
1059 0.39
1060 0.4
1061 0.44
1062 0.46
1063 0.5
1064 0.54
1065 0.49
1066 0.46
1067 0.42
1068 0.39
1069 0.34
1070 0.3
1071 0.26
1072 0.19
1073 0.16
1074 0.09
1075 0.09
1076 0.07
1077 0.07
1078 0.07
1079 0.05
1080 0.06
1081 0.06
1082 0.06
1083 0.05
1084 0.05
1085 0.05
1086 0.07
1087 0.09
1088 0.1
1089 0.11
1090 0.16
1091 0.18
1092 0.22
1093 0.27
1094 0.25
1095 0.25
1096 0.25
1097 0.24
1098 0.23
1099 0.27
1100 0.29
1101 0.34
1102 0.4
1103 0.39
1104 0.43
1105 0.51
1106 0.54
1107 0.55
1108 0.5
1109 0.45
1110 0.47
1111 0.51
1112 0.51
1113 0.46
1114 0.42
1115 0.36
1116 0.33
1117 0.3
1118 0.22
1119 0.18
1120 0.12
1121 0.1
1122 0.1
1123 0.09
1124 0.09
1125 0.1
1126 0.11
1127 0.12
1128 0.14
1129 0.17
1130 0.18
1131 0.19
1132 0.2
1133 0.23
1134 0.29
1135 0.34
1136 0.32
1137 0.31
1138 0.32
1139 0.34
1140 0.36
1141 0.38
1142 0.38
1143 0.37
1144 0.42
1145 0.37
1146 0.34
1147 0.31
1148 0.27
1149 0.21
1150 0.14
1151 0.12
1152 0.08
1153 0.11
1154 0.12
1155 0.13
1156 0.18
1157 0.2
1158 0.22
1159 0.26
1160 0.31
1161 0.3
1162 0.34
1163 0.4
1164 0.39
1165 0.4
1166 0.42
1167 0.37
1168 0.32
1169 0.31
1170 0.26
1171 0.19
1172 0.17
1173 0.16
1174 0.11
1175 0.12
1176 0.12
1177 0.12
1178 0.18
1179 0.22
1180 0.28
1181 0.33
1182 0.34
1183 0.33
1184 0.36
1185 0.37
1186 0.33
1187 0.32
1188 0.25
1189 0.22
1190 0.23
1191 0.23
1192 0.2
1193 0.22
1194 0.24
1195 0.22
1196 0.24
1197 0.27
1198 0.34
1199 0.43
1200 0.52
1201 0.58
1202 0.64
1203 0.72
1204 0.75
1205 0.78
1206 0.79
1207 0.8
1208 0.82
1209 0.83
1210 0.84
1211 0.85
1212 0.89
1213 0.83
1214 0.82
1215 0.73
1216 0.62
1217 0.51
1218 0.4
1219 0.3
1220 0.23
1221 0.19
1222 0.1
1223 0.09
1224 0.09
1225 0.08
1226 0.07
1227 0.06
1228 0.05
1229 0.05
1230 0.06
1231 0.1
1232 0.14
1233 0.16
1234 0.19
1235 0.24
1236 0.32
1237 0.39
1238 0.4
1239 0.41
1240 0.42
1241 0.47
1242 0.5
1243 0.52
1244 0.46
1245 0.39
1246 0.43
1247 0.4
1248 0.41
1249 0.37
1250 0.33
1251 0.32
1252 0.36
1253 0.4
1254 0.36
1255 0.38
1256 0.35
1257 0.41
1258 0.44
1259 0.44
1260 0.46
1261 0.48
1262 0.5
1263 0.48
1264 0.5
1265 0.45
1266 0.41
1267 0.35
1268 0.28
1269 0.28
1270 0.3