Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JXB1

Protein Details
Accession C4JXB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-66GNDPYVKVMRQKNDPRNQQKLFDHydrophilic
268-292PQNLRSFIQRRGRARKKGSKFALFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-285RRGRARKKG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038248  Dicer_dimer_sf  
IPR005034  Dicer_dimerisation_dom  
IPR014720  dsRBD_dom  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0051607  P:defense response to virus  
GO:0050688  P:regulation of defense response to virus  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG ure:UREG_06284  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03368  Dicer_dimer  
PF00271  Helicase_C  
PF00636  Ribonuclease_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51327  DICER_DSRBF  
PS50137  DS_RBD  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS00517  RNASE_3_1  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences MHREDMMQFVYMPRYYNIEYQNDFWNGLSKAEVLSFILDKLEIGNDPYVKVMRQKNDPRNQQKLFDAITKRKTPCLEQLTKCSNRMAVIHEELGPWAANSFLTRCMKQLRDKYSNSPETNWTDWDREDHLYITSVLSQVTPSNLDEYLDVEPNEVSTKVNKLIDFLENEHVNGSIGIIFARERSTVVMLTHLLSLHPRTKHIGTIAFLGSSSFASRKSDITELHNTKAQMTALDDLRNGKKNLIIATSVLEEGIDVPACDLVICFDFPQNLRSFIQRRGRARKKGSKFALFVDIQDHAAISTLKAVEETMKGLYLENERTLEELQLLEEAEEDGYDGFRIKSTGALLTLSNARNHLSHFCGILACEYADTEPTFMVQGDELSGLSAKVILPNFFEPRLREFRGISTWRTERMAKRDAAFQAYVALYKAGLVNDYLMPINHRENSADDVGSMERPSFANVSDIFDPWATVANQWQKATELYQSVIEISTDSQVISPMLMVLPVGLPCDISFRLFWDENTTFLVSATRTTQKFAAELVSLAADTTSILLSSLFSQKMMPGKLDFSWLFLPRMDLIESSIKEWCKSVRGKIFLNDIEKDSTALKALGLVRRIDNRSRPFTFEDLVWKYIENEATDGANVNEEDTASCEVLHVEGKVWPKRTDFLHPVANLDTSKMHHTAKCFHPASECTIDKLPIQYTRFTLFIPCLIHNIEKTLIADELARTILRPVKFSDLSLVLTAISSSVAREASNYQRLEFLGDSLLKLYTSIELAAKNLQWPEGLLTSRKSHVVSNSHLAKAATETGLDRFILTKPFSGAKWRPSYNTDHVHAGDEEGSPRVMSTKVLADVVEALIGAANIDGADEKTLDCLKVFLPEINWSPLDESVGLLYRNATDSGDEYSMVLPEIEELLGYTFTKKSLVLAALTHPSSTTSRHSYQRLEFIGDSVLDIIVVQALFGSPREFAHYNMHLMRTALVNADFLAFLCMNVYVEKDRGEAVENIKKKVKIEMTKRKSHLWGFMKHSQSWDIVHAQNSAIKQHEELQEEINERLNSSQSYPWTLLCRLDAAKFFSDIIESILGAIFIDSQGSMSACEAFLERIGLMRYVRRVLSENIDFMHPKQRLGHLANALSVRYETKQTLESEARRWECTVRVGDEEIVRVGDGISNIEAETRAAEAAVAVLRTRECRNESQMPDDGMSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.31
4 0.35
5 0.37
6 0.39
7 0.39
8 0.46
9 0.42
10 0.4
11 0.34
12 0.34
13 0.28
14 0.26
15 0.24
16 0.18
17 0.17
18 0.17
19 0.17
20 0.12
21 0.13
22 0.13
23 0.12
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.11
28 0.12
29 0.1
30 0.12
31 0.16
32 0.16
33 0.17
34 0.2
35 0.2
36 0.2
37 0.28
38 0.33
39 0.35
40 0.45
41 0.56
42 0.64
43 0.72
44 0.82
45 0.83
46 0.86
47 0.84
48 0.78
49 0.71
50 0.67
51 0.6
52 0.57
53 0.56
54 0.54
55 0.58
56 0.62
57 0.6
58 0.61
59 0.61
60 0.59
61 0.6
62 0.61
63 0.63
64 0.6
65 0.67
66 0.7
67 0.72
68 0.68
69 0.61
70 0.52
71 0.45
72 0.42
73 0.37
74 0.34
75 0.32
76 0.32
77 0.3
78 0.29
79 0.26
80 0.25
81 0.2
82 0.14
83 0.1
84 0.08
85 0.07
86 0.09
87 0.1
88 0.17
89 0.22
90 0.22
91 0.26
92 0.34
93 0.4
94 0.48
95 0.55
96 0.57
97 0.61
98 0.65
99 0.71
100 0.73
101 0.76
102 0.7
103 0.64
104 0.61
105 0.59
106 0.56
107 0.52
108 0.45
109 0.38
110 0.36
111 0.37
112 0.34
113 0.3
114 0.29
115 0.26
116 0.23
117 0.21
118 0.21
119 0.18
120 0.16
121 0.14
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.13
128 0.12
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.13
133 0.15
134 0.16
135 0.17
136 0.16
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.16
141 0.14
142 0.12
143 0.12
144 0.16
145 0.2
146 0.24
147 0.23
148 0.23
149 0.26
150 0.29
151 0.3
152 0.29
153 0.31
154 0.28
155 0.28
156 0.27
157 0.24
158 0.2
159 0.16
160 0.14
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.14
179 0.12
180 0.13
181 0.17
182 0.21
183 0.22
184 0.23
185 0.27
186 0.29
187 0.32
188 0.33
189 0.33
190 0.28
191 0.31
192 0.29
193 0.24
194 0.22
195 0.19
196 0.16
197 0.12
198 0.12
199 0.09
200 0.1
201 0.13
202 0.15
203 0.16
204 0.19
205 0.23
206 0.24
207 0.29
208 0.39
209 0.39
210 0.4
211 0.42
212 0.39
213 0.35
214 0.35
215 0.29
216 0.2
217 0.18
218 0.2
219 0.19
220 0.2
221 0.2
222 0.23
223 0.28
224 0.32
225 0.31
226 0.28
227 0.27
228 0.29
229 0.3
230 0.27
231 0.23
232 0.18
233 0.19
234 0.19
235 0.17
236 0.13
237 0.11
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.08
252 0.09
253 0.12
254 0.13
255 0.18
256 0.18
257 0.2
258 0.21
259 0.27
260 0.3
261 0.36
262 0.45
263 0.48
264 0.55
265 0.63
266 0.72
267 0.75
268 0.82
269 0.83
270 0.82
271 0.85
272 0.84
273 0.8
274 0.73
275 0.66
276 0.62
277 0.52
278 0.44
279 0.36
280 0.29
281 0.22
282 0.2
283 0.16
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.11
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.13
301 0.14
302 0.16
303 0.16
304 0.17
305 0.16
306 0.17
307 0.18
308 0.15
309 0.12
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.08
329 0.09
330 0.1
331 0.1
332 0.11
333 0.1
334 0.12
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.16
339 0.17
340 0.16
341 0.18
342 0.19
343 0.17
344 0.17
345 0.17
346 0.16
347 0.16
348 0.15
349 0.14
350 0.12
351 0.08
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.06
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.11
378 0.14
379 0.17
380 0.17
381 0.2
382 0.18
383 0.24
384 0.3
385 0.31
386 0.3
387 0.29
388 0.3
389 0.36
390 0.37
391 0.33
392 0.33
393 0.32
394 0.32
395 0.34
396 0.36
397 0.34
398 0.37
399 0.41
400 0.37
401 0.37
402 0.41
403 0.39
404 0.38
405 0.32
406 0.25
407 0.22
408 0.2
409 0.19
410 0.13
411 0.11
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.07
420 0.08
421 0.08
422 0.07
423 0.08
424 0.1
425 0.13
426 0.13
427 0.13
428 0.13
429 0.15
430 0.18
431 0.19
432 0.16
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.13
437 0.11
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.1
445 0.1
446 0.14
447 0.14
448 0.14
449 0.13
450 0.13
451 0.12
452 0.09
453 0.12
454 0.09
455 0.08
456 0.13
457 0.19
458 0.22
459 0.22
460 0.22
461 0.21
462 0.21
463 0.22
464 0.19
465 0.14
466 0.11
467 0.12
468 0.12
469 0.11
470 0.1
471 0.09
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.05
478 0.06
479 0.06
480 0.05
481 0.05
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.03
486 0.03
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.08
497 0.09
498 0.14
499 0.14
500 0.14
501 0.19
502 0.19
503 0.19
504 0.21
505 0.19
506 0.15
507 0.14
508 0.15
509 0.08
510 0.09
511 0.11
512 0.14
513 0.14
514 0.16
515 0.17
516 0.17
517 0.17
518 0.17
519 0.15
520 0.1
521 0.1
522 0.09
523 0.07
524 0.06
525 0.06
526 0.05
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.04
535 0.05
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.1
541 0.14
542 0.15
543 0.14
544 0.12
545 0.14
546 0.14
547 0.18
548 0.16
549 0.14
550 0.17
551 0.17
552 0.17
553 0.16
554 0.16
555 0.13
556 0.14
557 0.12
558 0.09
559 0.09
560 0.13
561 0.13
562 0.13
563 0.15
564 0.14
565 0.14
566 0.15
567 0.14
568 0.16
569 0.18
570 0.23
571 0.27
572 0.3
573 0.32
574 0.33
575 0.37
576 0.34
577 0.35
578 0.29
579 0.25
580 0.22
581 0.21
582 0.19
583 0.14
584 0.12
585 0.09
586 0.08
587 0.07
588 0.08
589 0.11
590 0.12
591 0.13
592 0.14
593 0.15
594 0.19
595 0.22
596 0.23
597 0.28
598 0.31
599 0.36
600 0.37
601 0.38
602 0.37
603 0.36
604 0.33
605 0.27
606 0.28
607 0.24
608 0.24
609 0.21
610 0.18
611 0.17
612 0.18
613 0.18
614 0.12
615 0.1
616 0.09
617 0.09
618 0.09
619 0.09
620 0.07
621 0.06
622 0.06
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.05
627 0.06
628 0.07
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.07
634 0.07
635 0.06
636 0.05
637 0.09
638 0.14
639 0.18
640 0.21
641 0.22
642 0.23
643 0.26
644 0.27
645 0.31
646 0.3
647 0.3
648 0.33
649 0.31
650 0.32
651 0.29
652 0.28
653 0.21
654 0.18
655 0.15
656 0.11
657 0.13
658 0.14
659 0.15
660 0.16
661 0.18
662 0.23
663 0.26
664 0.34
665 0.32
666 0.3
667 0.31
668 0.31
669 0.35
670 0.35
671 0.32
672 0.25
673 0.25
674 0.25
675 0.23
676 0.23
677 0.19
678 0.18
679 0.19
680 0.19
681 0.2
682 0.21
683 0.21
684 0.19
685 0.18
686 0.13
687 0.15
688 0.15
689 0.14
690 0.14
691 0.14
692 0.15
693 0.14
694 0.16
695 0.13
696 0.12
697 0.12
698 0.11
699 0.09
700 0.09
701 0.09
702 0.07
703 0.07
704 0.07
705 0.07
706 0.06
707 0.08
708 0.12
709 0.13
710 0.14
711 0.15
712 0.21
713 0.21
714 0.21
715 0.22
716 0.19
717 0.19
718 0.18
719 0.16
720 0.1
721 0.09
722 0.09
723 0.06
724 0.05
725 0.04
726 0.04
727 0.05
728 0.05
729 0.05
730 0.07
731 0.1
732 0.15
733 0.22
734 0.23
735 0.22
736 0.23
737 0.23
738 0.25
739 0.21
740 0.16
741 0.12
742 0.12
743 0.11
744 0.11
745 0.11
746 0.08
747 0.08
748 0.08
749 0.06
750 0.06
751 0.07
752 0.07
753 0.07
754 0.08
755 0.1
756 0.1
757 0.12
758 0.12
759 0.11
760 0.1
761 0.1
762 0.11
763 0.12
764 0.13
765 0.12
766 0.15
767 0.17
768 0.18
769 0.2
770 0.19
771 0.19
772 0.23
773 0.27
774 0.27
775 0.33
776 0.35
777 0.34
778 0.34
779 0.32
780 0.26
781 0.23
782 0.21
783 0.13
784 0.1
785 0.1
786 0.1
787 0.11
788 0.1
789 0.09
790 0.09
791 0.1
792 0.13
793 0.13
794 0.13
795 0.14
796 0.16
797 0.17
798 0.24
799 0.27
800 0.31
801 0.38
802 0.39
803 0.4
804 0.42
805 0.49
806 0.47
807 0.49
808 0.43
809 0.39
810 0.38
811 0.37
812 0.34
813 0.27
814 0.21
815 0.15
816 0.14
817 0.11
818 0.11
819 0.08
820 0.08
821 0.08
822 0.08
823 0.07
824 0.08
825 0.1
826 0.11
827 0.12
828 0.12
829 0.11
830 0.11
831 0.11
832 0.09
833 0.06
834 0.05
835 0.04
836 0.04
837 0.04
838 0.03
839 0.03
840 0.02
841 0.03
842 0.03
843 0.03
844 0.04
845 0.04
846 0.05
847 0.07
848 0.08
849 0.09
850 0.08
851 0.09
852 0.09
853 0.12
854 0.13
855 0.12
856 0.13
857 0.17
858 0.19
859 0.21
860 0.21
861 0.18
862 0.18
863 0.17
864 0.17
865 0.13
866 0.11
867 0.09
868 0.11
869 0.1
870 0.09
871 0.09
872 0.09
873 0.1
874 0.1
875 0.09
876 0.08
877 0.09
878 0.12
879 0.12
880 0.12
881 0.11
882 0.11
883 0.11
884 0.1
885 0.09
886 0.06
887 0.05
888 0.06
889 0.05
890 0.05
891 0.04
892 0.05
893 0.06
894 0.07
895 0.08
896 0.08
897 0.08
898 0.1
899 0.09
900 0.1
901 0.13
902 0.14
903 0.13
904 0.14
905 0.17
906 0.2
907 0.2
908 0.19
909 0.15
910 0.16
911 0.17
912 0.18
913 0.21
914 0.23
915 0.28
916 0.34
917 0.39
918 0.42
919 0.45
920 0.5
921 0.46
922 0.43
923 0.39
924 0.33
925 0.3
926 0.24
927 0.2
928 0.13
929 0.11
930 0.07
931 0.06
932 0.05
933 0.05
934 0.05
935 0.04
936 0.04
937 0.04
938 0.04
939 0.05
940 0.06
941 0.06
942 0.07
943 0.13
944 0.14
945 0.16
946 0.24
947 0.26
948 0.3
949 0.31
950 0.33
951 0.27
952 0.27
953 0.25
954 0.19
955 0.18
956 0.14
957 0.12
958 0.11
959 0.11
960 0.11
961 0.1
962 0.08
963 0.11
964 0.09
965 0.08
966 0.08
967 0.08
968 0.08
969 0.09
970 0.11
971 0.1
972 0.11
973 0.12
974 0.13
975 0.13
976 0.13
977 0.16
978 0.17
979 0.22
980 0.29
981 0.32
982 0.35
983 0.4
984 0.41
985 0.39
986 0.44
987 0.46
988 0.47
989 0.56
990 0.63
991 0.66
992 0.74
993 0.76
994 0.74
995 0.71
996 0.66
997 0.65
998 0.61
999 0.6
1000 0.58
1001 0.63
1002 0.62
1003 0.57
1004 0.55
1005 0.47
1006 0.42
1007 0.36
1008 0.31
1009 0.29
1010 0.27
1011 0.27
1012 0.26
1013 0.24
1014 0.25
1015 0.25
1016 0.24
1017 0.21
1018 0.19
1019 0.19
1020 0.25
1021 0.3
1022 0.3
1023 0.3
1024 0.31
1025 0.32
1026 0.33
1027 0.33
1028 0.32
1029 0.26
1030 0.24
1031 0.23
1032 0.22
1033 0.2
1034 0.21
1035 0.24
1036 0.2
1037 0.25
1038 0.26
1039 0.27
1040 0.3
1041 0.3
1042 0.29
1043 0.26
1044 0.27
1045 0.24
1046 0.27
1047 0.27
1048 0.27
1049 0.27
1050 0.26
1051 0.25
1052 0.22
1053 0.21
1054 0.17
1055 0.16
1056 0.12
1057 0.1
1058 0.09
1059 0.09
1060 0.09
1061 0.07
1062 0.07
1063 0.05
1064 0.04
1065 0.05
1066 0.04
1067 0.05
1068 0.06
1069 0.06
1070 0.07
1071 0.07
1072 0.08
1073 0.08
1074 0.09
1075 0.09
1076 0.09
1077 0.09
1078 0.1
1079 0.09
1080 0.11
1081 0.12
1082 0.14
1083 0.15
1084 0.19
1085 0.22
1086 0.25
1087 0.25
1088 0.25
1089 0.28
1090 0.3
1091 0.36
1092 0.35
1093 0.33
1094 0.31
1095 0.33
1096 0.32
1097 0.3
1098 0.36
1099 0.29
1100 0.28
1101 0.3
1102 0.34
1103 0.39
1104 0.42
1105 0.47
1106 0.44
1107 0.44
1108 0.46
1109 0.43
1110 0.37
1111 0.3
1112 0.27
1113 0.22
1114 0.18
1115 0.21
1116 0.18
1117 0.2
1118 0.25
1119 0.25
1120 0.32
1121 0.38
1122 0.39
1123 0.42
1124 0.5
1125 0.5
1126 0.48
1127 0.48
1128 0.44
1129 0.39
1130 0.42
1131 0.41
1132 0.35
1133 0.36
1134 0.36
1135 0.37
1136 0.36
1137 0.34
1138 0.27
1139 0.22
1140 0.19
1141 0.15
1142 0.13
1143 0.11
1144 0.1
1145 0.1
1146 0.1
1147 0.1
1148 0.1
1149 0.11
1150 0.11
1151 0.09
1152 0.1
1153 0.09
1154 0.08
1155 0.07
1156 0.07
1157 0.06
1158 0.08
1159 0.09
1160 0.09
1161 0.08
1162 0.1
1163 0.12
1164 0.16
1165 0.2
1166 0.25
1167 0.29
1168 0.36
1169 0.44
1170 0.52
1171 0.54
1172 0.56
1173 0.58
1174 0.54