FuNGI

C4JVR1

Protein Details

Accession

C4JVR1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
70-91	LSSINRMDRRHRRRYDSDGFGI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
91-104	IRGARGVKRGPRKP

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039340 Tfc4/TFIIIC-102/Sfc4 IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	ure:UREG_06653 -
Pfam	View protein in Pfam PF14559 TPR_19 PF13181 TPR_8
PROSITE	View protein in PROSITE PS50005 TPR

Amino Acid Sequences

MDADFASDQSDSEESSGNDDYDEFGRLKPTRRFNSNDVDSDDTNFQPSPEESSDSEPYEATEFIDDEAVLSSINRMDRRHRRRYDSDGFGIRGARGVKRGPRKPLEPSAEFKELHSAATSAFIDSDYDRAIILVKQAIQINPEMFAAHSLLSEIFLAQGQKDKAMAALFSGAHTRPKDQTVWLKVAKMISDHAGDDKSAALQDVVYCYSRVIDIDPKRYDIRFDRAAIYRELGHSGKAVLEYERLLRELPHNTIALRQLAELYIDLNDVEKAKARYDEAIAYYSSLDTLEEAVDFDWSDVNIYVELLGYQNKHWEGVRALRALSRWLLGRKNDIEWDEVWDDDREWDAEDFPRRIAAPWFSQSKYPVESYGIGLPIDLRVKLGIYRLKMGVEFKDEAMSHFMWLSPEETAPGARLYDYGDLFREAADALKEARLYLEALLFYAPLQYTQEYADTNLFMAMADCYLACQNDSDAEGCLLTVVEYDKTNIEARVTLAKFYERLGMMDQALKYVTEAVELGRQESIPMRKRRANFGARIEQLVKEFRSIESSDGAPRDMELELPRLSDQMEAAPISFTGAAQLPTLKESRPEDRIASALQTAEHVRYLYSKSLEMRPAMRAGDEEPTEDWLDIVEALLRTFRSNRVFFPLQKRTMFAGYSKEALRKAGSAQRVDVLDEVDELASRIQAAMGTAEFDPDLIPTDYHGIPFNDWLDLFLEYALVLAGQGHAQEAYDSLTAAADANVWYHSKSSSRQIYVCWFACGIRLQDEEILANIARWFMKEYQFVTDAYRLFATLSRLCGDPRKSLFHSSPSMKFILRQVKAIDYSLVEGPSADTSHPRPTFFAERPSLTTKDEAGNPIPAEDMDVALLVLYGHILYAGNSFTNALNYFLRAYALDPKNPAVLLSVGLSYIHHSLKRQADNRHYLVMQGLSFMQEYRRVREVSSVPQERQEVEFNSARVWHMLGLAHLAVKDYEKCLELDAEIQAERQRKKEITGSEDGVDVEDYTHEAAYALQCLYAFGGDMVSAKRVTERWLVI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.18
3	0.19
4	0.17
5	0.16
6	0.16
7	0.17
8	0.15
9	0.18
10	0.15
11	0.14
12	0.22
13	0.25
14	0.34
15	0.4
16	0.49
17	0.55
18	0.62
19	0.68
20	0.66
21	0.73
22	0.71
23	0.68
24	0.63
25	0.59
26	0.52
27	0.49
28	0.47
29	0.36
30	0.32
31	0.27
32	0.22
33	0.2
34	0.2
35	0.23
36	0.23
37	0.26
38	0.25
39	0.31
40	0.35
41	0.34
42	0.34
43	0.27
44	0.25
45	0.24
46	0.22
47	0.16
48	0.14
49	0.12
50	0.12
51	0.13
52	0.11
53	0.1
54	0.1
55	0.09
56	0.08
57	0.07
58	0.08
59	0.1
60	0.16
61	0.18
62	0.21
63	0.31
64	0.43
65	0.53
66	0.62
67	0.68
68	0.73
69	0.77
70	0.84
71	0.83
72	0.8
73	0.78
74	0.73
75	0.65
76	0.58
77	0.52
78	0.42
79	0.36
80	0.31
81	0.26
82	0.24
83	0.29
84	0.36
85	0.45
86	0.52
87	0.58
88	0.63
89	0.66
90	0.7
91	0.74
92	0.74
93	0.68
94	0.66
95	0.64
96	0.61
97	0.56
98	0.48
99	0.46
100	0.38
101	0.34
102	0.29
103	0.22
104	0.17
105	0.21
106	0.21
107	0.13
108	0.12
109	0.12
110	0.12
111	0.12
112	0.14
113	0.1
114	0.1
115	0.09
116	0.09
117	0.1
118	0.1
119	0.12
120	0.13
121	0.13
122	0.17
123	0.2
124	0.2
125	0.21
126	0.23
127	0.21
128	0.19
129	0.18
130	0.15
131	0.12
132	0.13
133	0.12
134	0.09
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.08
140	0.07
141	0.06
142	0.08
143	0.08
144	0.08
145	0.14
146	0.14
147	0.15
148	0.15
149	0.15
150	0.15
151	0.16
152	0.15
153	0.1
154	0.12
155	0.11
156	0.12
157	0.15
158	0.14
159	0.19
160	0.2
161	0.23
162	0.24
163	0.27
164	0.29
165	0.32
166	0.41
167	0.41
168	0.47
169	0.46
170	0.44
171	0.43
172	0.42
173	0.37
174	0.29
175	0.24
176	0.2
177	0.19
178	0.18
179	0.18
180	0.17
181	0.16
182	0.15
183	0.13
184	0.11
185	0.1
186	0.09
187	0.07
188	0.07
189	0.08
190	0.09
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.11
198	0.12
199	0.19
200	0.24
201	0.32
202	0.34
203	0.37
204	0.39
205	0.39
206	0.42
207	0.39
208	0.4
209	0.37
210	0.37
211	0.39
212	0.41
213	0.43
214	0.38
215	0.35
216	0.29
217	0.25
218	0.27
219	0.22
220	0.18
221	0.16
222	0.15
223	0.14
224	0.13
225	0.13
226	0.1
227	0.11
228	0.12
229	0.14
230	0.14
231	0.14
232	0.14
233	0.14
234	0.18
235	0.21
236	0.23
237	0.23
238	0.23
239	0.22
240	0.25
241	0.26
242	0.23
243	0.2
244	0.17
245	0.14
246	0.14
247	0.14
248	0.11
249	0.09
250	0.07
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.07
256	0.08
257	0.12
258	0.13
259	0.15
260	0.17
261	0.17
262	0.19
263	0.2
264	0.22
265	0.19
266	0.2
267	0.18
268	0.16
269	0.15
270	0.13
271	0.11
272	0.08
273	0.07
274	0.05
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.05
292	0.06
293	0.05
294	0.07
295	0.08
296	0.08
297	0.12
298	0.13
299	0.14
300	0.14
301	0.16
302	0.18
303	0.24
304	0.28
305	0.25
306	0.25
307	0.25
308	0.25
309	0.25
310	0.22
311	0.17
312	0.16
313	0.19
314	0.23
315	0.23
316	0.29
317	0.29
318	0.3
319	0.32
320	0.3
321	0.29
322	0.24
323	0.27
324	0.21
325	0.19
326	0.19
327	0.16
328	0.15
329	0.13
330	0.13
331	0.09
332	0.09
333	0.1
334	0.1
335	0.13
336	0.17
337	0.18
338	0.17
339	0.18
340	0.17
341	0.18
342	0.19
343	0.19
344	0.18
345	0.22
346	0.26
347	0.26
348	0.28
349	0.29
350	0.29
351	0.28
352	0.24
353	0.21
354	0.19
355	0.19
356	0.19
357	0.18
358	0.16
359	0.14
360	0.12
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.09
365	0.07
366	0.07
367	0.07
368	0.08
369	0.13
370	0.14
371	0.15
372	0.17
373	0.18
374	0.18
375	0.19
376	0.2
377	0.17
378	0.18
379	0.17
380	0.15
381	0.17
382	0.17
383	0.17
384	0.18
385	0.17
386	0.13
387	0.12
388	0.12
389	0.1
390	0.11
391	0.1
392	0.07
393	0.07
394	0.08
395	0.08
396	0.07
397	0.08
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.06
402	0.07
403	0.1
404	0.1
405	0.1
406	0.1
407	0.11
408	0.11
409	0.1
410	0.09
411	0.06
412	0.07
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.07
417	0.07
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.06
425	0.07
426	0.07
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.05
431	0.05
432	0.06
433	0.06
434	0.07
435	0.07
436	0.09
437	0.08
438	0.09
439	0.09
440	0.08
441	0.08
442	0.07
443	0.07
444	0.05
445	0.05
446	0.04
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.04
451	0.04
452	0.05
453	0.04
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.07
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.06
463	0.05
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.05
469	0.05
470	0.06
471	0.06
472	0.08
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.08
477	0.09
478	0.16
479	0.16
480	0.15
481	0.14
482	0.15
483	0.15
484	0.15
485	0.17
486	0.1
487	0.11
488	0.11
489	0.12
490	0.12
491	0.14
492	0.13
493	0.1
494	0.1
495	0.09
496	0.08
497	0.08
498	0.07
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.08
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.08
507	0.08
508	0.11
509	0.17
510	0.23
511	0.28
512	0.32
513	0.37
514	0.39
515	0.46
516	0.51
517	0.5
518	0.48
519	0.49
520	0.52
521	0.48
522	0.48
523	0.42
524	0.34
525	0.3
526	0.27
527	0.2
528	0.14
529	0.14
530	0.12
531	0.14
532	0.14
533	0.14
534	0.12
535	0.13
536	0.14
537	0.14
538	0.14
539	0.1
540	0.1
541	0.1
542	0.08
543	0.09
544	0.08
545	0.1
546	0.1
547	0.11
548	0.11
549	0.1
550	0.1
551	0.09
552	0.08
553	0.06
554	0.07
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.06
561	0.05
562	0.05
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.07
567	0.07
568	0.09
569	0.1
570	0.09
571	0.12
572	0.15
573	0.19
574	0.21
575	0.23
576	0.22
577	0.22
578	0.24
579	0.2
580	0.18
581	0.14
582	0.11
583	0.09
584	0.1
585	0.1
586	0.09
587	0.09
588	0.08
589	0.07
590	0.09
591	0.11
592	0.13
593	0.13
594	0.14
595	0.16
596	0.2
597	0.23
598	0.22
599	0.22
600	0.21
601	0.22
602	0.2
603	0.18
604	0.14
605	0.13
606	0.15
607	0.14
608	0.13
609	0.12
610	0.14
611	0.14
612	0.13
613	0.11
614	0.07
615	0.07
616	0.06
617	0.06
618	0.05
619	0.05
620	0.05
621	0.06
622	0.06
623	0.07
624	0.09
625	0.14
626	0.18
627	0.2
628	0.21
629	0.28
630	0.32
631	0.36
632	0.44
633	0.48
634	0.47
635	0.46
636	0.47
637	0.42
638	0.4
639	0.36
640	0.28
641	0.24
642	0.21
643	0.23
644	0.22
645	0.22
646	0.21
647	0.21
648	0.2
649	0.16
650	0.18
651	0.21
652	0.25
653	0.23
654	0.23
655	0.25
656	0.24
657	0.24
658	0.21
659	0.15
660	0.11
661	0.1
662	0.09
663	0.06
664	0.06
665	0.05
666	0.05
667	0.04
668	0.04
669	0.04
670	0.04
671	0.04
672	0.04
673	0.05
674	0.04
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.05
682	0.08
683	0.07
684	0.07
685	0.08
686	0.12
687	0.12
688	0.13
689	0.15
690	0.13
691	0.13
692	0.15
693	0.15
694	0.12
695	0.12
696	0.12
697	0.1
698	0.1
699	0.1
700	0.07
701	0.07
702	0.06
703	0.06
704	0.05
705	0.03
706	0.03
707	0.03
708	0.03
709	0.03
710	0.03
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.05
716	0.06
717	0.06
718	0.06
719	0.06
720	0.06
721	0.06
722	0.06
723	0.06
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.06
728	0.07
729	0.07
730	0.08
731	0.09
732	0.12
733	0.15
734	0.23
735	0.29
736	0.32
737	0.32
738	0.34
739	0.39
740	0.42
741	0.4
742	0.33
743	0.26
744	0.23
745	0.24
746	0.25
747	0.2
748	0.17
749	0.17
750	0.17
751	0.18
752	0.18
753	0.16
754	0.13
755	0.13
756	0.09
757	0.09
758	0.08
759	0.08
760	0.08
761	0.08
762	0.11
763	0.13
764	0.18
765	0.21
766	0.22
767	0.25
768	0.27
769	0.27
770	0.27
771	0.27
772	0.23
773	0.21
774	0.2
775	0.16
776	0.15
777	0.17
778	0.18
779	0.16
780	0.18
781	0.18
782	0.19
783	0.2
784	0.26
785	0.28
786	0.3
787	0.32
788	0.37
789	0.39
790	0.44
791	0.46
792	0.44
793	0.48
794	0.46
795	0.46
796	0.43
797	0.42
798	0.36
799	0.35
800	0.37
801	0.39
802	0.35
803	0.34
804	0.33
805	0.35
806	0.37
807	0.35
808	0.29
809	0.2
810	0.21
811	0.19
812	0.18
813	0.13
814	0.12
815	0.12
816	0.12
817	0.12
818	0.1
819	0.11
820	0.14
821	0.24
822	0.26
823	0.26
824	0.26
825	0.31
826	0.39
827	0.38
828	0.43
829	0.39
830	0.39
831	0.43
832	0.47
833	0.43
834	0.37
835	0.36
836	0.3
837	0.3
838	0.3
839	0.29
840	0.26
841	0.28
842	0.26
843	0.24
844	0.22
845	0.18
846	0.18
847	0.14
848	0.12
849	0.08
850	0.07
851	0.07
852	0.06
853	0.06
854	0.04
855	0.03
856	0.03
857	0.03
858	0.03
859	0.03
860	0.04
861	0.04
862	0.05
863	0.06
864	0.06
865	0.07
866	0.08
867	0.08
868	0.11
869	0.12
870	0.13
871	0.13
872	0.14
873	0.15
874	0.14
875	0.15
876	0.12
877	0.14
878	0.21
879	0.24
880	0.26
881	0.27
882	0.29
883	0.3
884	0.29
885	0.27
886	0.19
887	0.16
888	0.14
889	0.13
890	0.11
891	0.1
892	0.1
893	0.1
894	0.1
895	0.13
896	0.15
897	0.16
898	0.17
899	0.25
900	0.33
901	0.43
902	0.47
903	0.53
904	0.6
905	0.67
906	0.68
907	0.66
908	0.57
909	0.48
910	0.44
911	0.38
912	0.28
913	0.2
914	0.18
915	0.14
916	0.14
917	0.14
918	0.13
919	0.18
920	0.21
921	0.25
922	0.3
923	0.3
924	0.31
925	0.38
926	0.4
927	0.42
928	0.5
929	0.51
930	0.47
931	0.52
932	0.53
933	0.47
934	0.46
935	0.42
936	0.34
937	0.34
938	0.36
939	0.31
940	0.31
941	0.3
942	0.27
943	0.23
944	0.21
945	0.15
946	0.14
947	0.14
948	0.13
949	0.14
950	0.14
951	0.14
952	0.13
953	0.13
954	0.12
955	0.14
956	0.15
957	0.15
958	0.17
959	0.17
960	0.17
961	0.18
962	0.19
963	0.17
964	0.17
965	0.16
966	0.17
967	0.16
968	0.17
969	0.2
970	0.26
971	0.29
972	0.3
973	0.37
974	0.36
975	0.41
976	0.47
977	0.49
978	0.49
979	0.53
980	0.52
981	0.45
982	0.44
983	0.39
984	0.33
985	0.26
986	0.19
987	0.12
988	0.09
989	0.09
990	0.09
991	0.09
992	0.08
993	0.07
994	0.09
995	0.1
996	0.12
997	0.11
998	0.11
999	0.11
1000	0.11
1001	0.12
1002	0.1
1003	0.09
1004	0.07
1005	0.07
1006	0.07
1007	0.09
1008	0.1
1009	0.12
1010	0.12
1011	0.12
1012	0.15
1013	0.16
1014	0.21

C4JVR1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer