Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JIW7

Protein Details
Accession C4JIW7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-28GSIPATHVSKKRKKTGKDSTQVSSKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-17KKRKKT
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG ure:UREG_01574  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MLGSIPATHVSKKRKKTGKDSTQVSSKRRATGNGQDAEKQRIQQLETQISESRKYYNNIVTLLSMLNAERPNLAVAVSLCRVFCRLIAGGHLQQAKGASEQDAILVAWLRERHREYKTALIMILRNSDSSYQATALPLCMRLIKEQSPHRIKGKSHAWDDEYFNDVISALVEANDGDRVRAEFSSKFLREYHDVAVYTVLGLMKYLSSKPATIHLSNVVYLLSQLGTPPPGDHNFETFYTDMSQVGEKLKGPLASVNSYKQRVQAAWLLVLSRDLPRPLRKKLLQTMAHEIAPWFLKPEFLMDFLTDSFDQGGSVSLLALSGLFYLIQHKNLDYPQFYLKLYSLLDADLLHSKHRSRFFRLLDTFLASTHLPATLVASFIKRLSRLALNAPPAAIVAIVPWIYNLLKSHPTCTFMIHRAVRDDSLKAAIDTEGMDDPFDALEPDPTLTNAIESSLWEIEMLQSHYHPNVAALAKIISEQFTKQAYNLEDFLDHSYQALLDAELGEVEKRFKKSPVVEFQIPKRIFTNRLLEENDGKDNEVGNLLRQLWAFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.78
3 0.84
4 0.87
5 0.87
6 0.88
7 0.84
8 0.81
9 0.82
10 0.8
11 0.74
12 0.73
13 0.67
14 0.64
15 0.61
16 0.59
17 0.56
18 0.59
19 0.64
20 0.6
21 0.58
22 0.57
23 0.57
24 0.6
25 0.55
26 0.46
27 0.42
28 0.39
29 0.39
30 0.38
31 0.43
32 0.43
33 0.41
34 0.43
35 0.43
36 0.41
37 0.42
38 0.38
39 0.34
40 0.32
41 0.34
42 0.37
43 0.38
44 0.39
45 0.38
46 0.38
47 0.33
48 0.29
49 0.26
50 0.2
51 0.14
52 0.11
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.13
61 0.1
62 0.1
63 0.14
64 0.15
65 0.16
66 0.15
67 0.15
68 0.17
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.14
74 0.18
75 0.23
76 0.23
77 0.28
78 0.3
79 0.25
80 0.24
81 0.25
82 0.23
83 0.19
84 0.18
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.11
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.08
94 0.1
95 0.13
96 0.15
97 0.21
98 0.26
99 0.32
100 0.35
101 0.4
102 0.4
103 0.46
104 0.48
105 0.43
106 0.39
107 0.35
108 0.33
109 0.3
110 0.31
111 0.22
112 0.19
113 0.18
114 0.18
115 0.17
116 0.17
117 0.17
118 0.13
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.14
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.16
129 0.2
130 0.22
131 0.28
132 0.34
133 0.44
134 0.49
135 0.52
136 0.55
137 0.56
138 0.53
139 0.56
140 0.58
141 0.55
142 0.53
143 0.53
144 0.5
145 0.48
146 0.5
147 0.43
148 0.37
149 0.29
150 0.24
151 0.19
152 0.15
153 0.12
154 0.09
155 0.07
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.08
166 0.1
167 0.1
168 0.12
169 0.11
170 0.14
171 0.23
172 0.23
173 0.24
174 0.23
175 0.27
176 0.27
177 0.3
178 0.29
179 0.24
180 0.24
181 0.22
182 0.21
183 0.17
184 0.14
185 0.12
186 0.1
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.17
198 0.21
199 0.2
200 0.21
201 0.22
202 0.22
203 0.21
204 0.21
205 0.15
206 0.1
207 0.1
208 0.08
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.09
217 0.11
218 0.14
219 0.15
220 0.17
221 0.18
222 0.18
223 0.2
224 0.17
225 0.16
226 0.14
227 0.13
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.1
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.13
240 0.14
241 0.16
242 0.17
243 0.2
244 0.23
245 0.24
246 0.25
247 0.25
248 0.24
249 0.21
250 0.22
251 0.22
252 0.19
253 0.17
254 0.17
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.11
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.12
263 0.2
264 0.25
265 0.29
266 0.36
267 0.38
268 0.43
269 0.49
270 0.55
271 0.53
272 0.51
273 0.54
274 0.48
275 0.45
276 0.38
277 0.31
278 0.23
279 0.18
280 0.15
281 0.09
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.1
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.1
291 0.09
292 0.12
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.07
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.02
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.08
313 0.09
314 0.11
315 0.12
316 0.12
317 0.14
318 0.16
319 0.2
320 0.16
321 0.17
322 0.18
323 0.2
324 0.2
325 0.19
326 0.17
327 0.16
328 0.15
329 0.14
330 0.11
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.09
335 0.11
336 0.11
337 0.12
338 0.14
339 0.16
340 0.22
341 0.29
342 0.33
343 0.36
344 0.44
345 0.46
346 0.54
347 0.54
348 0.51
349 0.45
350 0.43
351 0.36
352 0.27
353 0.26
354 0.16
355 0.14
356 0.11
357 0.1
358 0.07
359 0.07
360 0.09
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.12
368 0.11
369 0.12
370 0.14
371 0.17
372 0.18
373 0.23
374 0.26
375 0.28
376 0.27
377 0.27
378 0.23
379 0.2
380 0.18
381 0.12
382 0.07
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.07
390 0.08
391 0.09
392 0.11
393 0.19
394 0.2
395 0.24
396 0.24
397 0.28
398 0.27
399 0.3
400 0.32
401 0.28
402 0.36
403 0.35
404 0.35
405 0.35
406 0.36
407 0.35
408 0.32
409 0.29
410 0.22
411 0.22
412 0.21
413 0.17
414 0.16
415 0.13
416 0.12
417 0.11
418 0.12
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.09
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.07
427 0.06
428 0.07
429 0.08
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.08
439 0.09
440 0.12
441 0.1
442 0.1
443 0.09
444 0.1
445 0.1
446 0.13
447 0.14
448 0.12
449 0.13
450 0.15
451 0.16
452 0.16
453 0.15
454 0.12
455 0.16
456 0.16
457 0.15
458 0.14
459 0.14
460 0.13
461 0.14
462 0.14
463 0.1
464 0.11
465 0.12
466 0.15
467 0.17
468 0.18
469 0.18
470 0.23
471 0.24
472 0.26
473 0.26
474 0.23
475 0.21
476 0.22
477 0.26
478 0.21
479 0.18
480 0.15
481 0.14
482 0.13
483 0.13
484 0.12
485 0.08
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.13
494 0.18
495 0.21
496 0.24
497 0.27
498 0.36
499 0.43
500 0.52
501 0.57
502 0.61
503 0.65
504 0.69
505 0.73
506 0.74
507 0.67
508 0.59
509 0.52
510 0.49
511 0.45
512 0.45
513 0.49
514 0.43
515 0.49
516 0.5
517 0.51
518 0.51
519 0.5
520 0.49
521 0.4
522 0.37
523 0.32
524 0.3
525 0.26
526 0.25
527 0.21
528 0.18
529 0.22
530 0.21
531 0.22