Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JN83

Protein Details
Accession C4JN83    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
405-426LVYAHRKHCKHRHKPPIALGFLHydrophilic
926-945TASGRPRDPRRPHLPVQTPFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1015-1020RKKIKR
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 10.666, nucl 6, cyto_nucl 5.833, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005937  26S_Psome_P45-like  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR041569  AAA_lid_3  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR003960  ATPase_AAA_CS  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR032501  Prot_ATP_ID_OB_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0008540  C:proteasome regulatory particle, base subcomplex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0008233  F:peptidase activity  
GO:0036402  F:proteasome-activating activity  
GO:0030163  P:protein catabolic process  
GO:0006508  P:proteolysis  
KEGG ure:UREG_04289  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF17862  AAA_lid_3  
PF16450  Prot_ATP_ID_OB  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00674  AAA  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd19502  RecA-like_PAN_like  
Amino Acid Sequences MPQRNSRRFTRLHVASYGTFECSGSHDHLILEEEYVENQERLRKTKAQASAAPSASDDFDALDRNADERGRVDDMRGSPMSVGNLEEMIDDDHAIISSATGPEYYVSIMSFVDKDLLEPGASILLHHKSVSVVGVLTDDADPLVSVMKLDKAPTESYADIGGLESQIQEVREAVELPLLHPELYEEMGIKPPKGVILYGGPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRIVGSELIQKYLGDGPRLVRQIFQVAAEHAPSIVFIDEIDAIGTKRYESTSGGEREVQRTMLELLNQLDGFDDRGDVKVIMATNKIETLDPALIRPGRIDRKILFENPDHVDLDEFISQKDDLSGADIKAICSEAGLMALRERRMRVQMADFRAARERVMKTKIIALRADGESLCRWSFVWENLVYAHRKHCKHRHKPPIALGFLHPALELKDSLYSMDEFDEEAFKKFFPGSFGKKSRETDVGAQIDKTKRGDTEASLSHEEKPKDQPQNELDSKASPAEAPAPASNPDSSSDESEDDEDEFPVTHDLVFKTHERAITTITVDPSGARMITGSTDCTIKFHDFASLTPSTLRAFKSVEPSAKKNSTASETHPVHVAKFNPISPSQVLVIAATPQPKILSRDGDTLTEFVKGDMYLRDMRNTKGHISEVTSGTWSPTNYNLCATAGTDSTVRIWDANIGRTQKEVIVHKSRAAGSAGRTRMTAVAWGSPAQGGNNILVAAALDGSLVMWSGDGPFTRPSGEIRDAHTRDTWTSGLDISPDGRLIVTRGGDDTIKLWDTRKFKQPVTTVAHPSGSKSYPTSNILFSPNGANIITGSETGELYILNPATLKPELKTSITPNSPLITVLWHEKLNQILTGSANGQTHLLYNPQISRNGALTIMSKAPKRRHIDDDPNLTTDLSLGFSGEGVVQSHASFASRHPTVGLTASGRPRDPRRPHLPVQTPFAKSQPDEKHIKENIPLSSMRDEDPRAALLKYAEKAEKEPLFTNAWKHTQPKPIFAELSDDEEEQRQGPDRKKIKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.49
3 0.51
4 0.44
5 0.35
6 0.29
7 0.24
8 0.21
9 0.19
10 0.21
11 0.2
12 0.21
13 0.19
14 0.19
15 0.2
16 0.22
17 0.2
18 0.17
19 0.14
20 0.12
21 0.12
22 0.15
23 0.16
24 0.13
25 0.15
26 0.21
27 0.25
28 0.29
29 0.35
30 0.4
31 0.43
32 0.51
33 0.57
34 0.58
35 0.59
36 0.61
37 0.62
38 0.56
39 0.52
40 0.44
41 0.37
42 0.31
43 0.25
44 0.19
45 0.12
46 0.12
47 0.14
48 0.13
49 0.15
50 0.14
51 0.14
52 0.17
53 0.17
54 0.17
55 0.16
56 0.2
57 0.23
58 0.23
59 0.24
60 0.27
61 0.29
62 0.34
63 0.33
64 0.29
65 0.25
66 0.26
67 0.26
68 0.2
69 0.19
70 0.13
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.07
83 0.06
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.11
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.13
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.13
111 0.15
112 0.16
113 0.15
114 0.16
115 0.14
116 0.15
117 0.15
118 0.12
119 0.09
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.15
138 0.17
139 0.19
140 0.21
141 0.24
142 0.21
143 0.21
144 0.21
145 0.18
146 0.15
147 0.14
148 0.12
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.16
165 0.15
166 0.14
167 0.13
168 0.14
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.09
173 0.1
174 0.17
175 0.18
176 0.17
177 0.16
178 0.16
179 0.17
180 0.17
181 0.16
182 0.12
183 0.15
184 0.17
185 0.16
186 0.17
187 0.15
188 0.14
189 0.15
190 0.14
191 0.11
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.12
196 0.12
197 0.13
198 0.2
199 0.21
200 0.21
201 0.2
202 0.19
203 0.22
204 0.22
205 0.21
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.13
211 0.1
212 0.11
213 0.15
214 0.15
215 0.16
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.19
220 0.2
221 0.17
222 0.18
223 0.19
224 0.25
225 0.28
226 0.26
227 0.22
228 0.22
229 0.24
230 0.23
231 0.22
232 0.17
233 0.16
234 0.17
235 0.16
236 0.15
237 0.11
238 0.1
239 0.08
240 0.08
241 0.06
242 0.05
243 0.04
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.08
255 0.1
256 0.11
257 0.14
258 0.21
259 0.23
260 0.25
261 0.28
262 0.29
263 0.3
264 0.3
265 0.27
266 0.19
267 0.18
268 0.19
269 0.15
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.15
274 0.15
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.1
288 0.11
289 0.12
290 0.12
291 0.11
292 0.12
293 0.13
294 0.11
295 0.1
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.16
301 0.16
302 0.16
303 0.17
304 0.22
305 0.26
306 0.27
307 0.31
308 0.29
309 0.35
310 0.39
311 0.4
312 0.37
313 0.32
314 0.35
315 0.34
316 0.34
317 0.28
318 0.24
319 0.21
320 0.17
321 0.18
322 0.15
323 0.13
324 0.11
325 0.12
326 0.12
327 0.11
328 0.11
329 0.09
330 0.06
331 0.09
332 0.11
333 0.09
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.1
340 0.08
341 0.08
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.07
347 0.1
348 0.12
349 0.14
350 0.15
351 0.16
352 0.2
353 0.22
354 0.22
355 0.27
356 0.32
357 0.35
358 0.4
359 0.38
360 0.36
361 0.39
362 0.36
363 0.29
364 0.28
365 0.27
366 0.26
367 0.3
368 0.29
369 0.25
370 0.32
371 0.34
372 0.31
373 0.29
374 0.24
375 0.25
376 0.24
377 0.24
378 0.17
379 0.16
380 0.13
381 0.15
382 0.14
383 0.1
384 0.1
385 0.11
386 0.13
387 0.13
388 0.17
389 0.14
390 0.15
391 0.16
392 0.19
393 0.18
394 0.18
395 0.24
396 0.27
397 0.3
398 0.39
399 0.48
400 0.56
401 0.65
402 0.75
403 0.79
404 0.8
405 0.83
406 0.82
407 0.8
408 0.71
409 0.61
410 0.52
411 0.44
412 0.35
413 0.29
414 0.2
415 0.12
416 0.11
417 0.1
418 0.1
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.07
430 0.09
431 0.09
432 0.1
433 0.1
434 0.09
435 0.1
436 0.1
437 0.1
438 0.12
439 0.17
440 0.23
441 0.31
442 0.36
443 0.4
444 0.44
445 0.45
446 0.44
447 0.42
448 0.38
449 0.33
450 0.35
451 0.34
452 0.29
453 0.28
454 0.29
455 0.27
456 0.27
457 0.24
458 0.18
459 0.15
460 0.18
461 0.18
462 0.15
463 0.18
464 0.19
465 0.21
466 0.23
467 0.24
468 0.24
469 0.28
470 0.27
471 0.25
472 0.29
473 0.33
474 0.37
475 0.37
476 0.4
477 0.38
478 0.47
479 0.46
480 0.41
481 0.34
482 0.27
483 0.27
484 0.21
485 0.18
486 0.09
487 0.08
488 0.09
489 0.08
490 0.09
491 0.09
492 0.1
493 0.11
494 0.12
495 0.12
496 0.1
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.13
501 0.13
502 0.13
503 0.13
504 0.13
505 0.12
506 0.1
507 0.1
508 0.08
509 0.07
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.05
515 0.06
516 0.06
517 0.07
518 0.09
519 0.1
520 0.13
521 0.15
522 0.16
523 0.15
524 0.15
525 0.17
526 0.16
527 0.17
528 0.15
529 0.14
530 0.12
531 0.11
532 0.11
533 0.09
534 0.08
535 0.07
536 0.05
537 0.04
538 0.04
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.06
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.1
547 0.1
548 0.11
549 0.1
550 0.13
551 0.12
552 0.13
553 0.17
554 0.15
555 0.15
556 0.14
557 0.15
558 0.12
559 0.14
560 0.15
561 0.11
562 0.13
563 0.14
564 0.2
565 0.23
566 0.28
567 0.3
568 0.32
569 0.37
570 0.38
571 0.37
572 0.31
573 0.3
574 0.28
575 0.27
576 0.27
577 0.3
578 0.3
579 0.29
580 0.32
581 0.3
582 0.27
583 0.29
584 0.25
585 0.2
586 0.21
587 0.21
588 0.2
589 0.2
590 0.22
591 0.19
592 0.2
593 0.15
594 0.14
595 0.13
596 0.11
597 0.1
598 0.09
599 0.1
600 0.1
601 0.09
602 0.09
603 0.09
604 0.11
605 0.14
606 0.16
607 0.18
608 0.19
609 0.24
610 0.25
611 0.26
612 0.25
613 0.22
614 0.2
615 0.17
616 0.14
617 0.1
618 0.09
619 0.08
620 0.08
621 0.08
622 0.11
623 0.15
624 0.16
625 0.21
626 0.22
627 0.24
628 0.27
629 0.28
630 0.27
631 0.24
632 0.24
633 0.21
634 0.23
635 0.25
636 0.22
637 0.2
638 0.19
639 0.16
640 0.16
641 0.17
642 0.14
643 0.11
644 0.15
645 0.17
646 0.16
647 0.17
648 0.17
649 0.15
650 0.15
651 0.15
652 0.11
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.08
657 0.09
658 0.09
659 0.09
660 0.07
661 0.07
662 0.12
663 0.13
664 0.16
665 0.19
666 0.21
667 0.21
668 0.22
669 0.22
670 0.18
671 0.21
672 0.23
673 0.26
674 0.32
675 0.33
676 0.34
677 0.37
678 0.36
679 0.33
680 0.3
681 0.25
682 0.21
683 0.28
684 0.28
685 0.24
686 0.24
687 0.23
688 0.22
689 0.2
690 0.19
691 0.12
692 0.12
693 0.12
694 0.13
695 0.13
696 0.12
697 0.12
698 0.1
699 0.1
700 0.09
701 0.09
702 0.08
703 0.08
704 0.07
705 0.06
706 0.06
707 0.05
708 0.04
709 0.03
710 0.03
711 0.02
712 0.03
713 0.03
714 0.03
715 0.02
716 0.02
717 0.03
718 0.04
719 0.05
720 0.05
721 0.07
722 0.08
723 0.09
724 0.11
725 0.11
726 0.13
727 0.18
728 0.23
729 0.23
730 0.27
731 0.37
732 0.36
733 0.38
734 0.38
735 0.34
736 0.3
737 0.31
738 0.27
739 0.17
740 0.17
741 0.15
742 0.13
743 0.12
744 0.12
745 0.09
746 0.09
747 0.09
748 0.08
749 0.07
750 0.07
751 0.08
752 0.1
753 0.1
754 0.1
755 0.1
756 0.12
757 0.12
758 0.12
759 0.12
760 0.12
761 0.12
762 0.13
763 0.14
764 0.19
765 0.25
766 0.3
767 0.39
768 0.41
769 0.42
770 0.5
771 0.52
772 0.54
773 0.57
774 0.58
775 0.53
776 0.5
777 0.51
778 0.43
779 0.41
780 0.37
781 0.3
782 0.26
783 0.23
784 0.24
785 0.25
786 0.29
787 0.29
788 0.26
789 0.27
790 0.28
791 0.26
792 0.24
793 0.22
794 0.19
795 0.18
796 0.16
797 0.13
798 0.1
799 0.11
800 0.11
801 0.09
802 0.09
803 0.08
804 0.08
805 0.08
806 0.08
807 0.06
808 0.06
809 0.09
810 0.08
811 0.08
812 0.08
813 0.08
814 0.12
815 0.14
816 0.15
817 0.13
818 0.19
819 0.22
820 0.24
821 0.28
822 0.29
823 0.35
824 0.36
825 0.38
826 0.34
827 0.32
828 0.3
829 0.27
830 0.22
831 0.16
832 0.15
833 0.18
834 0.19
835 0.18
836 0.19
837 0.21
838 0.24
839 0.23
840 0.22
841 0.18
842 0.16
843 0.16
844 0.18
845 0.17
846 0.17
847 0.16
848 0.15
849 0.15
850 0.13
851 0.14
852 0.13
853 0.14
854 0.12
855 0.15
856 0.2
857 0.22
858 0.25
859 0.25
860 0.26
861 0.25
862 0.25
863 0.22
864 0.18
865 0.17
866 0.17
867 0.21
868 0.22
869 0.25
870 0.32
871 0.39
872 0.47
873 0.52
874 0.55
875 0.59
876 0.66
877 0.72
878 0.74
879 0.76
880 0.7
881 0.65
882 0.59
883 0.5
884 0.4
885 0.29
886 0.21
887 0.13
888 0.09
889 0.08
890 0.07
891 0.07
892 0.07
893 0.07
894 0.08
895 0.07
896 0.08
897 0.09
898 0.09
899 0.09
900 0.09
901 0.1
902 0.09
903 0.1
904 0.17
905 0.17
906 0.17
907 0.18
908 0.19
909 0.19
910 0.21
911 0.22
912 0.17
913 0.22
914 0.29
915 0.31
916 0.33
917 0.38
918 0.44
919 0.52
920 0.57
921 0.62
922 0.66
923 0.7
924 0.76
925 0.79
926 0.82
927 0.76
928 0.76
929 0.74
930 0.67
931 0.61
932 0.57
933 0.51
934 0.43
935 0.47
936 0.47
937 0.46
938 0.5
939 0.51
940 0.57
941 0.57
942 0.59
943 0.55
944 0.52
945 0.48
946 0.44
947 0.42
948 0.36
949 0.37
950 0.35
951 0.31
952 0.3
953 0.3
954 0.29
955 0.3
956 0.28
957 0.25
958 0.24
959 0.24
960 0.23
961 0.27
962 0.26
963 0.3
964 0.31
965 0.31
966 0.34
967 0.41
968 0.4
969 0.38
970 0.38
971 0.36
972 0.38
973 0.39
974 0.43
975 0.41
976 0.43
977 0.44
978 0.47
979 0.51
980 0.56
981 0.57
982 0.59
983 0.58
984 0.58
985 0.55
986 0.5
987 0.5
988 0.41
989 0.44
990 0.38
991 0.32
992 0.27
993 0.28
994 0.28
995 0.22
996 0.23
997 0.24
998 0.3
999 0.36
1000 0.45