Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JML1

Protein Details
Accession C4JML1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-264AANTGKKPRKADASRKTKRKAQEPPINTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
241-257GKKPRKADASRKTKRKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG ure:UREG_04069  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MAPERVLRIPRSDSLDEFILIKTSKSGKNKLDLSLVATEGENPYTGSIKTSQISKLRAKNYRGSDDEWAGILSYVFNQNQDAIESEDWTTGLETVAIVKSMDGEDDDEGDKEILITLRKRIDSITLILQQRLGSITLKQDDDQAIQLFDWTGIAVAQANDVSNEVFSLKAKYRDSESTISHLNAQLEELIQAKKEHDDQLIAKFAQLLNEKKLKIRNQQRLLATAKVDPAKVAELEAANTGKKPRKADASRKTKRKAQEPPINT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.38
3 0.33
4 0.3
5 0.25
6 0.21
7 0.18
8 0.17
9 0.17
10 0.21
11 0.28
12 0.34
13 0.42
14 0.43
15 0.52
16 0.55
17 0.54
18 0.53
19 0.47
20 0.43
21 0.38
22 0.33
23 0.25
24 0.21
25 0.19
26 0.15
27 0.15
28 0.11
29 0.09
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.13
35 0.15
36 0.16
37 0.19
38 0.24
39 0.28
40 0.34
41 0.4
42 0.46
43 0.51
44 0.58
45 0.59
46 0.62
47 0.63
48 0.64
49 0.59
50 0.55
51 0.51
52 0.45
53 0.41
54 0.33
55 0.26
56 0.19
57 0.15
58 0.12
59 0.07
60 0.07
61 0.1
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.09
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.04
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.05
92 0.07
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.08
102 0.09
103 0.12
104 0.15
105 0.15
106 0.15
107 0.15
108 0.17
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.21
113 0.21
114 0.21
115 0.21
116 0.18
117 0.17
118 0.16
119 0.12
120 0.07
121 0.08
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.13
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.12
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.06
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.05
154 0.09
155 0.11
156 0.17
157 0.18
158 0.19
159 0.24
160 0.27
161 0.31
162 0.32
163 0.31
164 0.28
165 0.29
166 0.29
167 0.26
168 0.25
169 0.21
170 0.16
171 0.15
172 0.12
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.13
181 0.15
182 0.17
183 0.17
184 0.2
185 0.21
186 0.24
187 0.28
188 0.26
189 0.23
190 0.22
191 0.21
192 0.23
193 0.27
194 0.26
195 0.27
196 0.33
197 0.34
198 0.37
199 0.45
200 0.47
201 0.51
202 0.59
203 0.64
204 0.65
205 0.72
206 0.7
207 0.68
208 0.64
209 0.57
210 0.48
211 0.39
212 0.37
213 0.32
214 0.3
215 0.24
216 0.22
217 0.21
218 0.19
219 0.18
220 0.15
221 0.13
222 0.14
223 0.17
224 0.17
225 0.15
226 0.17
227 0.23
228 0.28
229 0.33
230 0.36
231 0.4
232 0.49
233 0.59
234 0.68
235 0.72
236 0.76
237 0.81
238 0.87
239 0.88
240 0.84
241 0.83
242 0.83
243 0.83
244 0.82