Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4JFN0

Protein Details
Accession C4JFN0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-295QIGEAIKKARSRNRKKWWCLLISLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-286KKARSRNRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.5, cyto 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010989  SNARE  
IPR045242  Syntaxin  
IPR006011  Syntaxin_N  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG ure:UREG_02364  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00804  Syntaxin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50192  T_SNARE  
CDD cd15849  SNARE_Sso1  
Amino Acid Sequences MSRPGYNNEGYGYGQYDPYSARQDHYNQGGYESQSNYEMSPMPTNPSYGQSSAPDPNAILNQCRDIDNGINDVESYIAQIDTLHKRLLSDVDPVRENAIRAEADELATQTKSLYRNLIERMKTIKRMPDAGSPRNAPQIGKVERRLKAAVEQYQQVQQSFRKESETQMARQYRIVRPDATEQEVQEAVRDTSNQQIFSQALIQSDRRGDAQKVSQMVRARHEEIQKIERDFVELAQMFQDLDALVVQQEAAVTQIDEAGEQVFANVTKGNEQIGEAIKKARSRNRKKWWCLLISLLIIIIIVVVVVVAVLVTKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.16
4 0.16
5 0.18
6 0.23
7 0.22
8 0.23
9 0.27
10 0.32
11 0.37
12 0.42
13 0.43
14 0.37
15 0.39
16 0.4
17 0.37
18 0.37
19 0.32
20 0.27
21 0.23
22 0.24
23 0.21
24 0.19
25 0.19
26 0.17
27 0.2
28 0.19
29 0.23
30 0.23
31 0.25
32 0.25
33 0.26
34 0.27
35 0.24
36 0.26
37 0.23
38 0.27
39 0.28
40 0.28
41 0.25
42 0.21
43 0.22
44 0.24
45 0.23
46 0.22
47 0.19
48 0.21
49 0.22
50 0.22
51 0.21
52 0.19
53 0.21
54 0.2
55 0.2
56 0.17
57 0.16
58 0.15
59 0.14
60 0.12
61 0.08
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.06
67 0.11
68 0.15
69 0.17
70 0.18
71 0.17
72 0.18
73 0.19
74 0.22
75 0.18
76 0.21
77 0.22
78 0.25
79 0.25
80 0.26
81 0.27
82 0.25
83 0.23
84 0.17
85 0.16
86 0.13
87 0.12
88 0.14
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.08
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.15
101 0.15
102 0.19
103 0.25
104 0.31
105 0.29
106 0.3
107 0.35
108 0.35
109 0.39
110 0.37
111 0.37
112 0.33
113 0.36
114 0.36
115 0.38
116 0.41
117 0.4
118 0.41
119 0.38
120 0.37
121 0.38
122 0.36
123 0.27
124 0.24
125 0.28
126 0.3
127 0.32
128 0.38
129 0.4
130 0.42
131 0.45
132 0.42
133 0.34
134 0.34
135 0.34
136 0.33
137 0.28
138 0.27
139 0.25
140 0.28
141 0.28
142 0.24
143 0.2
144 0.17
145 0.2
146 0.21
147 0.21
148 0.21
149 0.21
150 0.23
151 0.29
152 0.3
153 0.27
154 0.32
155 0.34
156 0.31
157 0.33
158 0.36
159 0.31
160 0.33
161 0.33
162 0.26
163 0.26
164 0.31
165 0.31
166 0.3
167 0.28
168 0.23
169 0.23
170 0.23
171 0.2
172 0.15
173 0.14
174 0.1
175 0.09
176 0.1
177 0.09
178 0.15
179 0.17
180 0.18
181 0.16
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.19
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.16
195 0.16
196 0.18
197 0.22
198 0.24
199 0.26
200 0.26
201 0.29
202 0.32
203 0.33
204 0.34
205 0.35
206 0.34
207 0.36
208 0.39
209 0.39
210 0.39
211 0.42
212 0.42
213 0.38
214 0.37
215 0.32
216 0.3
217 0.27
218 0.22
219 0.23
220 0.19
221 0.18
222 0.16
223 0.16
224 0.13
225 0.12
226 0.13
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.03
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.09
254 0.11
255 0.12
256 0.13
257 0.12
258 0.12
259 0.15
260 0.19
261 0.21
262 0.2
263 0.23
264 0.26
265 0.3
266 0.38
267 0.44
268 0.49
269 0.58
270 0.68
271 0.75
272 0.83
273 0.86
274 0.89
275 0.89
276 0.82
277 0.75
278 0.69
279 0.62
280 0.52
281 0.44
282 0.34
283 0.24
284 0.19
285 0.15
286 0.1
287 0.04
288 0.03
289 0.02
290 0.02
291 0.02
292 0.02
293 0.02
294 0.02