FuNGI

C4JTC4

Protein Details

Accession

C4JTC4

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
411-441	LSEEHPAAQRRRKREERKRRHLEKAEQQASM	Basic
495-516	GSRQAGRKSLGKEKKKRRAAGF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
419-432	QRRRKREERKRRHL
499-515	AGRKSLGKEKKKRRAAG

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019350 RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like
KEGG	ure:UREG_05713 -
Pfam	View protein in Pfam PF10214 Rrn6

Amino Acid Sequences

MFDPTLLSLPWARSDVEAGRGDIRFSSMIFKKIEGASGFQEQNDTKPTFVKFIGQRTELDIVESLYSVELNQESQTASYPYTHSIRKRNKALSSPWVDDDFLVDDMDVPEFQFSTRFQQANRVSNSSDQPFQPAQRIEEWRSEHSWLISNEDELDLDQDGKTIQPQGFDDWISSAVDRLQDQMHSYAASSATLLEILGPPPALDAIDSNTRSFEHFLSTMASVLPATPRQYRLSRLPLPFSATSNLAVYTPVEQSDLSLATVYDSLVYDWLSPLSEQVPNRVRIMREKMIRSVVTEIIFSRISLVRVGTEELDTTNEDEAGALVNESQLQSFGSSQNIISSQTQKSSQGLDPLHEFPEPPYRFLKRYTTLNHQRAPTKRTITTISHWKVNTDPSYYDWQKAADAIKDEQSLSEEHPAAQRRRKREERKRRHLEKAEQQASMQPSTPRLMDGGRLWGSQPVTTPAVSSSGDPRLWSSQVKEESVLPMSQMEKGVFGSRQAGRKSLGKEKKKRRAAGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.23
3	0.27
4	0.27
5	0.26
6	0.29
7	0.29
8	0.29
9	0.25
10	0.25
11	0.18
12	0.17
13	0.24
14	0.23
15	0.28
16	0.28
17	0.29
18	0.31
19	0.31
20	0.36
21	0.29
22	0.28
23	0.27
24	0.32
25	0.32
26	0.27
27	0.31
28	0.26
29	0.28
30	0.32
31	0.29
32	0.23
33	0.27
34	0.28
35	0.28
36	0.28
37	0.33
38	0.31
39	0.39
40	0.45
41	0.42
42	0.41
43	0.42
44	0.45
45	0.37
46	0.33
47	0.25
48	0.19
49	0.18
50	0.17
51	0.12
52	0.09
53	0.09
54	0.07
55	0.08
56	0.07
57	0.08
58	0.08
59	0.09
60	0.09
61	0.1
62	0.12
63	0.12
64	0.12
65	0.13
66	0.14
67	0.18
68	0.22
69	0.28
70	0.33
71	0.42
72	0.51
73	0.59
74	0.67
75	0.7
76	0.73
77	0.74
78	0.74
79	0.73
80	0.7
81	0.64
82	0.58
83	0.52
84	0.45
85	0.37
86	0.32
87	0.24
88	0.17
89	0.14
90	0.11
91	0.1
92	0.1
93	0.11
94	0.09
95	0.07
96	0.07
97	0.07
98	0.07
99	0.08
100	0.09
101	0.15
102	0.22
103	0.23
104	0.23
105	0.33
106	0.4
107	0.47
108	0.49
109	0.45
110	0.4
111	0.43
112	0.48
113	0.41
114	0.37
115	0.29
116	0.31
117	0.31
118	0.31
119	0.33
120	0.3
121	0.29
122	0.33
123	0.38
124	0.35
125	0.4
126	0.42
127	0.39
128	0.4
129	0.39
130	0.33
131	0.29
132	0.32
133	0.25
134	0.26
135	0.23
136	0.21
137	0.19
138	0.18
139	0.17
140	0.11
141	0.12
142	0.07
143	0.08
144	0.07
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.07
149	0.11
150	0.11
151	0.12
152	0.13
153	0.16
154	0.17
155	0.17
156	0.16
157	0.13
158	0.13
159	0.12
160	0.11
161	0.08
162	0.08
163	0.09
164	0.09
165	0.1
166	0.1
167	0.1
168	0.11
169	0.12
170	0.11
171	0.1
172	0.1
173	0.1
174	0.09
175	0.09
176	0.07
177	0.06
178	0.06
179	0.06
180	0.05
181	0.04
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.06
193	0.12
194	0.13
195	0.13
196	0.14
197	0.14
198	0.15
199	0.16
200	0.14
201	0.11
202	0.11
203	0.11
204	0.13
205	0.12
206	0.12
207	0.1
208	0.09
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.1
214	0.12
215	0.14
216	0.18
217	0.2
218	0.24
219	0.29
220	0.36
221	0.4
222	0.4
223	0.4
224	0.37
225	0.4
226	0.37
227	0.32
228	0.26
229	0.19
230	0.18
231	0.15
232	0.15
233	0.1
234	0.09
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.08
243	0.08
244	0.06
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.05
255	0.04
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.05
261	0.07
262	0.1
263	0.1
264	0.16
265	0.21
266	0.23
267	0.25
268	0.26
269	0.26
270	0.29
271	0.36
272	0.36
273	0.37
274	0.37
275	0.38
276	0.39
277	0.39
278	0.34
279	0.29
280	0.25
281	0.2
282	0.18
283	0.16
284	0.14
285	0.14
286	0.12
287	0.12
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.11
292	0.09
293	0.1
294	0.11
295	0.09
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.08
300	0.08
301	0.09
302	0.08
303	0.07
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.04
316	0.05
317	0.06
318	0.07
319	0.08
320	0.08
321	0.09
322	0.09
323	0.1
324	0.1
325	0.12
326	0.13
327	0.16
328	0.16
329	0.18
330	0.2
331	0.2
332	0.21
333	0.23
334	0.22
335	0.24
336	0.24
337	0.23
338	0.25
339	0.26
340	0.26
341	0.22
342	0.21
343	0.16
344	0.26
345	0.25
346	0.24
347	0.28
348	0.3
349	0.32
350	0.36
351	0.41
352	0.35
353	0.42
354	0.45
355	0.5
356	0.57
357	0.63
358	0.63
359	0.6
360	0.63
361	0.61
362	0.61
363	0.58
364	0.53
365	0.48
366	0.47
367	0.48
368	0.45
369	0.45
370	0.5
371	0.45
372	0.45
373	0.44
374	0.42
375	0.38
376	0.41
377	0.38
378	0.31
379	0.29
380	0.26
381	0.36
382	0.36
383	0.36
384	0.3
385	0.27
386	0.25
387	0.27
388	0.26
389	0.19
390	0.21
391	0.21
392	0.23
393	0.24
394	0.23
395	0.21
396	0.19
397	0.18
398	0.17
399	0.2
400	0.17
401	0.17
402	0.23
403	0.3
404	0.36
405	0.43
406	0.48
407	0.51
408	0.61
409	0.71
410	0.77
411	0.81
412	0.85
413	0.88
414	0.92
415	0.95
416	0.94
417	0.94
418	0.92
419	0.91
420	0.89
421	0.89
422	0.83
423	0.73
424	0.64
425	0.59
426	0.53
427	0.44
428	0.37
429	0.27
430	0.25
431	0.26
432	0.26
433	0.21
434	0.19
435	0.18
436	0.2
437	0.2
438	0.24
439	0.24
440	0.24
441	0.24
442	0.26
443	0.27
444	0.23
445	0.23
446	0.2
447	0.2
448	0.2
449	0.2
450	0.17
451	0.19
452	0.18
453	0.18
454	0.19
455	0.22
456	0.23
457	0.23
458	0.26
459	0.27
460	0.29
461	0.31
462	0.3
463	0.34
464	0.38
465	0.39
466	0.37
467	0.34
468	0.35
469	0.34
470	0.31
471	0.22
472	0.2
473	0.2
474	0.21
475	0.21
476	0.18
477	0.16
478	0.17
479	0.21
480	0.19
481	0.19
482	0.24
483	0.27
484	0.35
485	0.36
486	0.37
487	0.37
488	0.43
489	0.48
490	0.52
491	0.57
492	0.6
493	0.69
494	0.77
495	0.84
496	0.87

C4JTC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer