Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A093XHN0

Protein Details
Accession A0A093XHN0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21ESSRGPPRVKNKAPAPQQISHydrophilic
611-640AKSQEALTKKQPRKTKRRRKMDDDTYEEYVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
619-630KKQPRKTKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.666, cyto 9.5, mito_nucl 9.499, cyto_mito 7.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MESSRGPPRVKNKAPAPQQISAEQLLREAVDRQEPGLQAPTQRFADLEELHEFQGRKRKEFEDYVQRNRINMNNWMRYAQWELEQKEFKRARSIFERALDVDSTSVTLWIRYIEAEMKTRNINHARNLLDRAVTILPRVDKLWYKYAYMEEMLGNIPGTRQVFERWMSWEPDEAAWSSYIKLEKRYGEYQRARDIFARFTTVHPEPRNWIKWTRFEEEYGTSDLVREVFGMAVEALGEDFMDERLFIAYARYEAKLKEYERARAIYKYSLDRLPRSKSLALHKSYTTFEKQFGDREGVEDVILSKRRVQYEEQLKENSKNYDTWIDYARLEETSGDLDRVRDVYERAIAQLPPSQEKRHWRRYIYLWIFYAIWEEMDAGDVSRARQVYAECMRLVPHKKFTFAKVWLLAAMFEVRQKDLGKARKLLGQAIGMCPKDKLFTGYIALELKLFEFARCRTLYEKALMFNPANSSAWIKFAELERGLDDLERARAVYELAVNQQMLDMPELVWKSYIDFEEEEGEYERTRDLYERLLEKTGHVKVWISYAHFEINIPDEEEEGEEEERPISDAAKERARKVFERAHKSMKERDLKEERAALLAAHLSFEMTHGDAKSQEALTKKQPRKTKRRRKMDDDTYEEYVDYVFPDEDEQKKMLGGILEAARMWKEKGGGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.79
4 0.74
5 0.7
6 0.63
7 0.58
8 0.51
9 0.44
10 0.34
11 0.28
12 0.22
13 0.19
14 0.18
15 0.17
16 0.17
17 0.2
18 0.2
19 0.21
20 0.25
21 0.25
22 0.26
23 0.28
24 0.28
25 0.27
26 0.3
27 0.34
28 0.31
29 0.31
30 0.28
31 0.26
32 0.3
33 0.26
34 0.27
35 0.25
36 0.25
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.26
41 0.34
42 0.34
43 0.35
44 0.39
45 0.41
46 0.45
47 0.52
48 0.56
49 0.58
50 0.63
51 0.68
52 0.71
53 0.69
54 0.63
55 0.59
56 0.56
57 0.49
58 0.5
59 0.5
60 0.48
61 0.48
62 0.49
63 0.45
64 0.43
65 0.43
66 0.35
67 0.32
68 0.33
69 0.34
70 0.41
71 0.48
72 0.46
73 0.51
74 0.53
75 0.48
76 0.51
77 0.49
78 0.49
79 0.49
80 0.55
81 0.51
82 0.5
83 0.52
84 0.43
85 0.45
86 0.38
87 0.3
88 0.23
89 0.17
90 0.15
91 0.11
92 0.11
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.08
99 0.1
100 0.13
101 0.16
102 0.2
103 0.22
104 0.24
105 0.27
106 0.28
107 0.35
108 0.38
109 0.4
110 0.41
111 0.46
112 0.47
113 0.47
114 0.5
115 0.43
116 0.35
117 0.31
118 0.28
119 0.24
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.19
127 0.22
128 0.26
129 0.33
130 0.31
131 0.32
132 0.33
133 0.34
134 0.33
135 0.28
136 0.25
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.13
141 0.11
142 0.08
143 0.08
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.17
150 0.18
151 0.2
152 0.21
153 0.24
154 0.26
155 0.25
156 0.26
157 0.24
158 0.23
159 0.22
160 0.18
161 0.16
162 0.14
163 0.13
164 0.11
165 0.13
166 0.16
167 0.16
168 0.2
169 0.23
170 0.26
171 0.31
172 0.39
173 0.42
174 0.48
175 0.54
176 0.54
177 0.59
178 0.57
179 0.53
180 0.5
181 0.46
182 0.39
183 0.33
184 0.33
185 0.25
186 0.24
187 0.29
188 0.27
189 0.33
190 0.31
191 0.32
192 0.33
193 0.4
194 0.44
195 0.41
196 0.46
197 0.43
198 0.49
199 0.53
200 0.53
201 0.47
202 0.43
203 0.43
204 0.38
205 0.36
206 0.3
207 0.24
208 0.19
209 0.17
210 0.16
211 0.13
212 0.1
213 0.08
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.02
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.09
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.14
242 0.19
243 0.2
244 0.25
245 0.26
246 0.3
247 0.32
248 0.34
249 0.33
250 0.3
251 0.31
252 0.28
253 0.28
254 0.26
255 0.26
256 0.28
257 0.29
258 0.32
259 0.35
260 0.36
261 0.36
262 0.37
263 0.37
264 0.36
265 0.43
266 0.45
267 0.43
268 0.41
269 0.39
270 0.37
271 0.36
272 0.35
273 0.3
274 0.24
275 0.23
276 0.23
277 0.24
278 0.24
279 0.24
280 0.23
281 0.18
282 0.18
283 0.17
284 0.14
285 0.13
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.12
291 0.14
292 0.17
293 0.19
294 0.22
295 0.23
296 0.28
297 0.37
298 0.41
299 0.4
300 0.41
301 0.41
302 0.41
303 0.42
304 0.36
305 0.26
306 0.22
307 0.21
308 0.22
309 0.22
310 0.2
311 0.19
312 0.18
313 0.17
314 0.17
315 0.16
316 0.11
317 0.1
318 0.09
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.19
341 0.19
342 0.22
343 0.32
344 0.4
345 0.47
346 0.52
347 0.5
348 0.53
349 0.56
350 0.63
351 0.57
352 0.51
353 0.41
354 0.37
355 0.34
356 0.29
357 0.26
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.06
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.09
373 0.09
374 0.16
375 0.19
376 0.21
377 0.18
378 0.19
379 0.2
380 0.25
381 0.3
382 0.26
383 0.31
384 0.3
385 0.34
386 0.35
387 0.38
388 0.4
389 0.37
390 0.38
391 0.31
392 0.3
393 0.27
394 0.25
395 0.21
396 0.14
397 0.12
398 0.08
399 0.08
400 0.09
401 0.08
402 0.11
403 0.12
404 0.15
405 0.21
406 0.29
407 0.31
408 0.34
409 0.35
410 0.37
411 0.37
412 0.36
413 0.3
414 0.26
415 0.23
416 0.22
417 0.25
418 0.22
419 0.21
420 0.19
421 0.17
422 0.16
423 0.15
424 0.15
425 0.11
426 0.13
427 0.15
428 0.14
429 0.16
430 0.16
431 0.15
432 0.12
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.09
438 0.11
439 0.12
440 0.17
441 0.18
442 0.19
443 0.19
444 0.23
445 0.26
446 0.26
447 0.27
448 0.24
449 0.25
450 0.27
451 0.24
452 0.21
453 0.2
454 0.18
455 0.17
456 0.16
457 0.18
458 0.15
459 0.17
460 0.16
461 0.14
462 0.15
463 0.16
464 0.2
465 0.18
466 0.18
467 0.17
468 0.16
469 0.16
470 0.14
471 0.13
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.11
483 0.13
484 0.12
485 0.12
486 0.12
487 0.12
488 0.11
489 0.1
490 0.09
491 0.07
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.1
497 0.11
498 0.13
499 0.14
500 0.13
501 0.13
502 0.14
503 0.17
504 0.17
505 0.17
506 0.16
507 0.16
508 0.14
509 0.14
510 0.13
511 0.11
512 0.11
513 0.12
514 0.12
515 0.16
516 0.21
517 0.24
518 0.26
519 0.29
520 0.28
521 0.28
522 0.34
523 0.31
524 0.27
525 0.24
526 0.23
527 0.21
528 0.25
529 0.25
530 0.2
531 0.19
532 0.2
533 0.21
534 0.19
535 0.19
536 0.16
537 0.17
538 0.16
539 0.15
540 0.14
541 0.12
542 0.13
543 0.13
544 0.12
545 0.11
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.12
555 0.18
556 0.22
557 0.31
558 0.34
559 0.38
560 0.44
561 0.49
562 0.48
563 0.49
564 0.54
565 0.55
566 0.61
567 0.63
568 0.66
569 0.67
570 0.69
571 0.71
572 0.71
573 0.71
574 0.64
575 0.68
576 0.67
577 0.65
578 0.65
579 0.61
580 0.52
581 0.44
582 0.41
583 0.31
584 0.24
585 0.22
586 0.17
587 0.12
588 0.11
589 0.1
590 0.09
591 0.1
592 0.1
593 0.08
594 0.11
595 0.11
596 0.13
597 0.13
598 0.15
599 0.18
600 0.17
601 0.2
602 0.21
603 0.25
604 0.34
605 0.45
606 0.5
607 0.54
608 0.63
609 0.7
610 0.78
611 0.85
612 0.86
613 0.86
614 0.91
615 0.93
616 0.93
617 0.94
618 0.93
619 0.92
620 0.88
621 0.84
622 0.76
623 0.66
624 0.56
625 0.45
626 0.34
627 0.24
628 0.17
629 0.13
630 0.09
631 0.09
632 0.13
633 0.18
634 0.21
635 0.24
636 0.24
637 0.23
638 0.23
639 0.23
640 0.22
641 0.17
642 0.15
643 0.17
644 0.17
645 0.18
646 0.17
647 0.18
648 0.18
649 0.18
650 0.19
651 0.16