Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A093ZMX8

Protein Details
Accession A0A093ZMX8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-73VDYPSRLQRHRRISTKTNSKRKKHHPSRRAATVGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-67RHRRISTKTNSKRKKHHPSRR
Subcellular Location(s) cyto 10, mito 7, nucl 6, cyto_pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000814  TBP  
IPR030491  TBP_CS  
IPR012295  TBP_dom_sf  
IPR033710  TBP_eukaryotic  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00352  TBP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00351  TFIID  
CDD cd04516  TBP_eukaryotes  
Amino Acid Sequences MSKLPKEVEDRKNDISHALSTLFHSLLNLPSGIRRDHRVDYPSRLQRHRRISTKTNSKRKKHHPSRRAATVGETLTCLSPANASNRYHSGAHFAKTFIAPGSLSFPGGAGDLTPPSSEAEKMNGQQKQGANGGQAVQANGQANGHGVTPATPAATPGATQGVSGIVPTLQNIVATVNLDCRLDLKTIALHARNAEYNPKRFAAVIMRIREPKTTALIFASGKMVVTGAKSEDDSKLASRKYARIIQKLGFNAKFTDFKIQNIVGSCDIKFPIRLEGLASKHHNFSSYEPELFPGLIYRMIKPKIVLLIFVSGKIVLTGAKVREEIYQAFEMIYPVLQDFKKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.46
3 0.38
4 0.31
5 0.26
6 0.21
7 0.2
8 0.23
9 0.19
10 0.16
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.16
15 0.15
16 0.12
17 0.16
18 0.19
19 0.22
20 0.23
21 0.27
22 0.31
23 0.35
24 0.41
25 0.44
26 0.46
27 0.51
28 0.58
29 0.61
30 0.63
31 0.67
32 0.7
33 0.73
34 0.78
35 0.79
36 0.78
37 0.77
38 0.79
39 0.81
40 0.83
41 0.84
42 0.85
43 0.86
44 0.86
45 0.88
46 0.9
47 0.91
48 0.91
49 0.92
50 0.9
51 0.91
52 0.91
53 0.89
54 0.82
55 0.71
56 0.64
57 0.58
58 0.49
59 0.39
60 0.31
61 0.22
62 0.19
63 0.18
64 0.14
65 0.09
66 0.09
67 0.12
68 0.16
69 0.21
70 0.22
71 0.26
72 0.28
73 0.31
74 0.3
75 0.27
76 0.3
77 0.27
78 0.28
79 0.26
80 0.23
81 0.22
82 0.22
83 0.22
84 0.14
85 0.13
86 0.1
87 0.1
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.1
95 0.09
96 0.05
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.07
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.13
107 0.15
108 0.18
109 0.24
110 0.25
111 0.24
112 0.28
113 0.28
114 0.28
115 0.28
116 0.26
117 0.2
118 0.18
119 0.19
120 0.16
121 0.15
122 0.12
123 0.1
124 0.12
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.1
174 0.13
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.15
180 0.15
181 0.22
182 0.24
183 0.26
184 0.28
185 0.28
186 0.27
187 0.26
188 0.27
189 0.23
190 0.27
191 0.3
192 0.3
193 0.33
194 0.36
195 0.36
196 0.36
197 0.32
198 0.25
199 0.23
200 0.2
201 0.18
202 0.16
203 0.17
204 0.16
205 0.15
206 0.15
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.12
221 0.14
222 0.18
223 0.18
224 0.21
225 0.23
226 0.25
227 0.3
228 0.37
229 0.41
230 0.43
231 0.47
232 0.46
233 0.49
234 0.49
235 0.51
236 0.44
237 0.39
238 0.34
239 0.33
240 0.32
241 0.28
242 0.33
243 0.26
244 0.26
245 0.3
246 0.29
247 0.28
248 0.27
249 0.29
250 0.22
251 0.23
252 0.22
253 0.19
254 0.2
255 0.18
256 0.18
257 0.16
258 0.19
259 0.18
260 0.18
261 0.19
262 0.24
263 0.25
264 0.3
265 0.34
266 0.31
267 0.33
268 0.33
269 0.32
270 0.28
271 0.29
272 0.32
273 0.31
274 0.3
275 0.28
276 0.29
277 0.27
278 0.25
279 0.22
280 0.15
281 0.12
282 0.15
283 0.16
284 0.17
285 0.24
286 0.26
287 0.28
288 0.27
289 0.29
290 0.32
291 0.31
292 0.29
293 0.23
294 0.28
295 0.27
296 0.26
297 0.24
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.13
302 0.07
303 0.09
304 0.13
305 0.15
306 0.17
307 0.18
308 0.19
309 0.22
310 0.25
311 0.24
312 0.25
313 0.24
314 0.22
315 0.22
316 0.22
317 0.19
318 0.16
319 0.14
320 0.1
321 0.09
322 0.14