Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A093YE78

Protein Details
Accession A0A093YE78    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
434-460TNAPSKPTTPQKKSPPKPAAKAAKKGGHydrophilic
533-554TSEERAQRKREELKRQLEEKAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
369-380KKIGAIGGVKKA
443-511PQKKSPPKPAAKAAKKGGLGKIGGKKNDPPPAPASPSKEDAPAAPKSEPPTKATKSKLGRIGHKPSKDE
519-563RGRTEAKEEEKPRETSEERAQRKREELKRQLEEKAKAPAKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MPPLLISTSFTVDSYKIYLTDLAHLWCEDLDRRSILRRSLAEDTSIDPSEDAGQLKLFLDKISLGLEGGKDVDLLLGLDTHAAKESSTGARNLELNLSIALPKPVQPLNWTIKLSSCPQSDFATHFTIPLLCAQNARLKELDSLVSMLRDKDNVIQKLVDMLEATGAELGHLFPGVAGKGGRKIPRRVVEEKVKGLEAFSQEQWRNAMRNVEAENEHVDVKTIVQGAFTKNSSVGSLSHAAELPARFDKWWEQLTDGAINLSTPQDGGQEADTGVKVETTEADMDTTEDEGTEGNTDDFQVAATPPRQQVLSSRAKASKSSPLHKPTRKQELTDDGTDDSDDLGASQSQHAVIRDSFPAPKEEARPATKKIGAIGGVKKASKTATKMKPEPESEPEPEPEPEPESEPEHVTRSTRSHKQDDVDGNETETEDEGTNAPSKPTTPQKKSPPKPAAKAAKKGGLGKIGGKKNDPPPAPASPSKEDAPAAPKSEPPTKATKSKLGRIGHKPSKDEAGADEDLRGRTEAKEEEKPRETSEERAQRKREELKRQLEEKAKAPAKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.14
4 0.15
5 0.18
6 0.17
7 0.21
8 0.22
9 0.21
10 0.21
11 0.21
12 0.2
13 0.17
14 0.19
15 0.19
16 0.19
17 0.21
18 0.22
19 0.24
20 0.32
21 0.36
22 0.38
23 0.41
24 0.41
25 0.44
26 0.47
27 0.46
28 0.41
29 0.37
30 0.36
31 0.33
32 0.31
33 0.25
34 0.19
35 0.19
36 0.18
37 0.19
38 0.17
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.14
43 0.15
44 0.13
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.13
73 0.16
74 0.19
75 0.2
76 0.2
77 0.22
78 0.23
79 0.23
80 0.21
81 0.17
82 0.15
83 0.14
84 0.14
85 0.12
86 0.12
87 0.13
88 0.12
89 0.13
90 0.17
91 0.18
92 0.18
93 0.2
94 0.27
95 0.32
96 0.37
97 0.36
98 0.32
99 0.33
100 0.35
101 0.38
102 0.37
103 0.32
104 0.28
105 0.3
106 0.32
107 0.31
108 0.3
109 0.29
110 0.27
111 0.24
112 0.23
113 0.21
114 0.19
115 0.18
116 0.2
117 0.21
118 0.16
119 0.17
120 0.19
121 0.24
122 0.24
123 0.26
124 0.21
125 0.19
126 0.2
127 0.21
128 0.2
129 0.15
130 0.16
131 0.13
132 0.14
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.18
139 0.26
140 0.26
141 0.27
142 0.25
143 0.24
144 0.27
145 0.26
146 0.2
147 0.12
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.04
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.12
167 0.17
168 0.24
169 0.29
170 0.34
171 0.41
172 0.49
173 0.55
174 0.54
175 0.57
176 0.61
177 0.6
178 0.58
179 0.52
180 0.45
181 0.38
182 0.34
183 0.29
184 0.22
185 0.19
186 0.18
187 0.23
188 0.23
189 0.24
190 0.26
191 0.25
192 0.24
193 0.23
194 0.25
195 0.18
196 0.21
197 0.21
198 0.22
199 0.2
200 0.2
201 0.19
202 0.17
203 0.17
204 0.13
205 0.12
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.1
213 0.12
214 0.14
215 0.14
216 0.12
217 0.11
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.13
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.13
228 0.14
229 0.14
230 0.13
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.12
235 0.15
236 0.17
237 0.19
238 0.17
239 0.17
240 0.18
241 0.19
242 0.19
243 0.15
244 0.11
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.06
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.06
290 0.07
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.15
297 0.21
298 0.29
299 0.28
300 0.32
301 0.34
302 0.35
303 0.36
304 0.35
305 0.36
306 0.33
307 0.37
308 0.41
309 0.45
310 0.54
311 0.59
312 0.64
313 0.63
314 0.69
315 0.65
316 0.59
317 0.57
318 0.56
319 0.54
320 0.47
321 0.4
322 0.3
323 0.28
324 0.26
325 0.21
326 0.12
327 0.07
328 0.06
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.1
339 0.1
340 0.12
341 0.13
342 0.14
343 0.15
344 0.15
345 0.17
346 0.17
347 0.2
348 0.21
349 0.25
350 0.29
351 0.33
352 0.36
353 0.37
354 0.41
355 0.4
356 0.37
357 0.33
358 0.3
359 0.27
360 0.28
361 0.27
362 0.27
363 0.27
364 0.27
365 0.25
366 0.24
367 0.24
368 0.23
369 0.25
370 0.3
371 0.37
372 0.45
373 0.5
374 0.54
375 0.59
376 0.58
377 0.58
378 0.54
379 0.5
380 0.45
381 0.43
382 0.39
383 0.35
384 0.32
385 0.29
386 0.24
387 0.21
388 0.19
389 0.19
390 0.2
391 0.2
392 0.21
393 0.22
394 0.22
395 0.22
396 0.22
397 0.21
398 0.22
399 0.25
400 0.31
401 0.37
402 0.42
403 0.45
404 0.48
405 0.49
406 0.54
407 0.55
408 0.53
409 0.49
410 0.42
411 0.37
412 0.33
413 0.31
414 0.23
415 0.17
416 0.12
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.1
421 0.13
422 0.12
423 0.13
424 0.12
425 0.13
426 0.18
427 0.28
428 0.37
429 0.42
430 0.51
431 0.62
432 0.73
433 0.79
434 0.84
435 0.84
436 0.83
437 0.82
438 0.83
439 0.83
440 0.8
441 0.81
442 0.75
443 0.71
444 0.66
445 0.64
446 0.58
447 0.52
448 0.45
449 0.44
450 0.47
451 0.46
452 0.45
453 0.44
454 0.47
455 0.49
456 0.56
457 0.51
458 0.46
459 0.46
460 0.49
461 0.53
462 0.51
463 0.5
464 0.46
465 0.48
466 0.45
467 0.42
468 0.37
469 0.33
470 0.33
471 0.3
472 0.3
473 0.27
474 0.29
475 0.32
476 0.39
477 0.39
478 0.37
479 0.42
480 0.45
481 0.51
482 0.53
483 0.57
484 0.57
485 0.63
486 0.67
487 0.65
488 0.69
489 0.7
490 0.76
491 0.75
492 0.74
493 0.69
494 0.64
495 0.64
496 0.56
497 0.48
498 0.39
499 0.37
500 0.33
501 0.3
502 0.29
503 0.25
504 0.25
505 0.25
506 0.23
507 0.17
508 0.16
509 0.21
510 0.25
511 0.28
512 0.37
513 0.41
514 0.49
515 0.54
516 0.55
517 0.54
518 0.56
519 0.52
520 0.49
521 0.55
522 0.56
523 0.59
524 0.66
525 0.68
526 0.66
527 0.73
528 0.76
529 0.75
530 0.76
531 0.77
532 0.79
533 0.83
534 0.81
535 0.81
536 0.79
537 0.74
538 0.68
539 0.68
540 0.65
541 0.62
542 0.67
543 0.69