Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A094GJ23

Protein Details
Accession A0A094GJ23    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
287-309TTTTNGGRRKKRKGALTNPSQYSHydrophilic
370-391LGAYTVTKKKHVKKMGYQSGMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
294-299RRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 13.5, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MGRRGWIDKKSAQHFTLVHRPQNDPLIHDETVSSMILNPTEAANSNKIKKLDDLTSEFGSDGGRIRANEGEAANHGIYYDDTEYDYMQHMRDIGSGGAETHFVEAPSLQKDKSKGKEKLSLEDALRNSSLDDKPEIFLDEEILPSKNLRKVTYQAQQEVPDALAGFQPDMDPRLREVLEALDDDAYVDEDDEIFGQLAKDGEELDDRTFENEAWDEDDEGWESDATAKPSKEYKDAPVAPDHVGDDEREDHGDGDWMAEFSKFKKDGKKQVAFAMPGQSDIQSSMMTTTTNGGRRKKRKGALTNPSQYSMTSSSVFRTEGLTDLDSRFEKLEERYNEDNGDDDFGSMASSVSSVTGPVRGDFDGIMDEFLGAYTVTKKKHVKKMGYQSGMEQLDEVRKGLGKAIIRPSFV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.54
3 0.58
4 0.56
5 0.54
6 0.51
7 0.53
8 0.51
9 0.57
10 0.5
11 0.42
12 0.42
13 0.42
14 0.38
15 0.35
16 0.31
17 0.24
18 0.24
19 0.21
20 0.15
21 0.1
22 0.12
23 0.11
24 0.12
25 0.11
26 0.09
27 0.11
28 0.13
29 0.15
30 0.2
31 0.26
32 0.32
33 0.36
34 0.37
35 0.38
36 0.4
37 0.42
38 0.41
39 0.42
40 0.42
41 0.41
42 0.41
43 0.39
44 0.35
45 0.3
46 0.24
47 0.18
48 0.15
49 0.13
50 0.14
51 0.14
52 0.16
53 0.18
54 0.19
55 0.21
56 0.19
57 0.18
58 0.17
59 0.21
60 0.18
61 0.16
62 0.15
63 0.12
64 0.11
65 0.13
66 0.12
67 0.09
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.14
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.12
79 0.13
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.11
93 0.14
94 0.16
95 0.15
96 0.18
97 0.23
98 0.31
99 0.4
100 0.47
101 0.5
102 0.55
103 0.63
104 0.62
105 0.63
106 0.59
107 0.55
108 0.46
109 0.45
110 0.4
111 0.33
112 0.31
113 0.24
114 0.21
115 0.21
116 0.21
117 0.17
118 0.19
119 0.17
120 0.17
121 0.18
122 0.19
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.11
132 0.15
133 0.16
134 0.18
135 0.19
136 0.22
137 0.25
138 0.33
139 0.39
140 0.39
141 0.39
142 0.4
143 0.39
144 0.37
145 0.33
146 0.26
147 0.19
148 0.14
149 0.11
150 0.09
151 0.07
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.03
181 0.04
182 0.03
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.05
209 0.05
210 0.07
211 0.08
212 0.11
213 0.13
214 0.13
215 0.14
216 0.19
217 0.21
218 0.23
219 0.23
220 0.25
221 0.31
222 0.33
223 0.33
224 0.32
225 0.32
226 0.29
227 0.27
228 0.23
229 0.15
230 0.14
231 0.12
232 0.11
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.15
249 0.16
250 0.19
251 0.29
252 0.37
253 0.46
254 0.56
255 0.62
256 0.56
257 0.61
258 0.63
259 0.55
260 0.49
261 0.45
262 0.34
263 0.29
264 0.27
265 0.21
266 0.16
267 0.15
268 0.14
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.09
276 0.13
277 0.19
278 0.25
279 0.33
280 0.43
281 0.52
282 0.61
283 0.68
284 0.71
285 0.75
286 0.79
287 0.82
288 0.82
289 0.84
290 0.82
291 0.75
292 0.7
293 0.6
294 0.49
295 0.43
296 0.35
297 0.28
298 0.21
299 0.19
300 0.19
301 0.2
302 0.2
303 0.16
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.16
308 0.15
309 0.16
310 0.16
311 0.19
312 0.18
313 0.18
314 0.17
315 0.15
316 0.17
317 0.18
318 0.27
319 0.27
320 0.34
321 0.36
322 0.37
323 0.38
324 0.35
325 0.33
326 0.25
327 0.24
328 0.17
329 0.13
330 0.11
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.08
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.07
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.14
346 0.13
347 0.14
348 0.13
349 0.13
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.05
359 0.06
360 0.12
361 0.16
362 0.18
363 0.27
364 0.36
365 0.45
366 0.56
367 0.65
368 0.68
369 0.74
370 0.84
371 0.86
372 0.84
373 0.75
374 0.68
375 0.67
376 0.58
377 0.48
378 0.37
379 0.29
380 0.28
381 0.28
382 0.25
383 0.18
384 0.19
385 0.2
386 0.23
387 0.26
388 0.24
389 0.3
390 0.4