Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GWR8

Protein Details
Accession C5GWR8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSEYWKSTPKYWCKHCKTYVRDTAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-312KKRRPKHAR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
Amino Acid Sequences MSEYWKSTPKYWCKHCKTYVRDTAFERTQHEATGKHQGNLKRFLRDIHRNNERDERENQKARNEIHRLKGVVSGSPKTGDQQQRPPWKRGLGAGSATGANAEPSASLSANAEQRKRQLAQLVEMGVAIPEEFRGDMALAGDWKVVETTAGNKDRAEADAVAGLNVGVRKRKFEVQEEEEAAGEIVIRKGWGSTTREFPGKEKEEDLDALLERTTELKKKRRETETPDVKAEGKEDIIDGEHEDVAKKDTPSPNDGDILPVKKEEAEGGPTMVGTKYEGEKGVSRSVRETPKETVEEAVPAVVFKKRRPKHAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.86
3 0.86
4 0.84
5 0.85
6 0.85
7 0.8
8 0.75
9 0.7
10 0.69
11 0.64
12 0.59
13 0.52
14 0.47
15 0.42
16 0.39
17 0.37
18 0.31
19 0.29
20 0.37
21 0.35
22 0.32
23 0.37
24 0.4
25 0.44
26 0.52
27 0.53
28 0.48
29 0.47
30 0.49
31 0.53
32 0.58
33 0.6
34 0.6
35 0.66
36 0.63
37 0.67
38 0.71
39 0.66
40 0.6
41 0.58
42 0.56
43 0.56
44 0.61
45 0.59
46 0.56
47 0.58
48 0.57
49 0.6
50 0.61
51 0.57
52 0.57
53 0.59
54 0.54
55 0.48
56 0.49
57 0.4
58 0.35
59 0.33
60 0.28
61 0.24
62 0.24
63 0.23
64 0.2
65 0.28
66 0.32
67 0.34
68 0.42
69 0.5
70 0.6
71 0.65
72 0.67
73 0.64
74 0.59
75 0.54
76 0.49
77 0.45
78 0.37
79 0.33
80 0.3
81 0.25
82 0.22
83 0.2
84 0.15
85 0.11
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.04
90 0.05
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.1
96 0.16
97 0.19
98 0.21
99 0.21
100 0.24
101 0.29
102 0.29
103 0.28
104 0.29
105 0.27
106 0.27
107 0.28
108 0.26
109 0.21
110 0.19
111 0.17
112 0.11
113 0.09
114 0.06
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.07
135 0.14
136 0.16
137 0.17
138 0.17
139 0.18
140 0.18
141 0.19
142 0.17
143 0.1
144 0.08
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.07
153 0.1
154 0.1
155 0.12
156 0.15
157 0.2
158 0.23
159 0.29
160 0.36
161 0.37
162 0.41
163 0.41
164 0.39
165 0.33
166 0.3
167 0.23
168 0.15
169 0.1
170 0.06
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.06
177 0.11
178 0.14
179 0.17
180 0.22
181 0.25
182 0.28
183 0.29
184 0.3
185 0.34
186 0.34
187 0.33
188 0.3
189 0.28
190 0.27
191 0.27
192 0.25
193 0.17
194 0.13
195 0.12
196 0.1
197 0.09
198 0.07
199 0.09
200 0.11
201 0.15
202 0.23
203 0.31
204 0.4
205 0.49
206 0.58
207 0.64
208 0.7
209 0.73
210 0.77
211 0.79
212 0.75
213 0.68
214 0.61
215 0.54
216 0.46
217 0.38
218 0.28
219 0.18
220 0.14
221 0.12
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.12
232 0.15
233 0.15
234 0.2
235 0.26
236 0.29
237 0.33
238 0.36
239 0.35
240 0.34
241 0.33
242 0.3
243 0.3
244 0.29
245 0.26
246 0.22
247 0.21
248 0.19
249 0.19
250 0.18
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.14
259 0.12
260 0.09
261 0.11
262 0.12
263 0.15
264 0.16
265 0.18
266 0.22
267 0.25
268 0.33
269 0.33
270 0.33
271 0.34
272 0.41
273 0.47
274 0.48
275 0.49
276 0.45
277 0.49
278 0.5
279 0.48
280 0.43
281 0.35
282 0.32
283 0.27
284 0.23
285 0.16
286 0.14
287 0.14
288 0.17
289 0.19
290 0.24
291 0.35
292 0.4