Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GIT2

Protein Details
Accession C5GIT2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-71VGVKYCFRYNQRNRQIRNEENHydrophilic
75-99IDLVTVPRTHRRRREKKLMSMDDVNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-89RRRRE
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 7.5, cyto 4.5, mito 4, extr 2, golg 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16473  RING-H2_RNF103  
Amino Acid Sequences MATSTQAGTLPIQPTNTSSSDNSSGGPTSSPLLFFVALGFGVVFTNLWIIVGVKYCFRYNQRNRQIRNEENGDPIDLVTVPRTHRRRREKKLMSMDDVNARFPLMKYKTWRATRADEGLPTAGGIQAPTSRPQSLKNEGGSIILSSAENQETIVQSYPTTNAESSNEPNPQTEPEGVILPAVQKETIASRVESRPSTEHLKETSGFMEDDDDADEHIRNAVPAELLANPGDTCAICLDTIEDDDDVRGLSCGHAFHASCLDPWLTSRRACCPLCKADFYVPKPRPEGAEGNQTSSSGRSRRNLNRNNDPTEPERAFFAGRANPFVSRLVLPGRFITIVPPDERYPGFPRPVYELRNSSRRGRSNSSNNAADGSTTWRSRLPSINFPPVTFSRFRLPGRRNQNATEQASTTPNEPSPRQLESGLT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.27
3 0.27
4 0.25
5 0.24
6 0.28
7 0.31
8 0.31
9 0.29
10 0.27
11 0.26
12 0.22
13 0.22
14 0.17
15 0.15
16 0.16
17 0.15
18 0.14
19 0.15
20 0.14
21 0.13
22 0.13
23 0.11
24 0.09
25 0.09
26 0.08
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.05
31 0.04
32 0.05
33 0.05
34 0.05
35 0.05
36 0.06
37 0.07
38 0.11
39 0.12
40 0.14
41 0.17
42 0.19
43 0.24
44 0.3
45 0.39
46 0.46
47 0.57
48 0.65
49 0.72
50 0.75
51 0.81
52 0.84
53 0.8
54 0.78
55 0.73
56 0.65
57 0.6
58 0.56
59 0.46
60 0.36
61 0.29
62 0.21
63 0.15
64 0.13
65 0.11
66 0.13
67 0.15
68 0.24
69 0.32
70 0.41
71 0.51
72 0.62
73 0.7
74 0.77
75 0.86
76 0.86
77 0.89
78 0.91
79 0.88
80 0.82
81 0.76
82 0.68
83 0.65
84 0.56
85 0.47
86 0.36
87 0.29
88 0.24
89 0.19
90 0.26
91 0.21
92 0.26
93 0.32
94 0.41
95 0.5
96 0.54
97 0.6
98 0.56
99 0.58
100 0.58
101 0.57
102 0.5
103 0.42
104 0.38
105 0.32
106 0.27
107 0.21
108 0.15
109 0.1
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.08
114 0.1
115 0.13
116 0.15
117 0.17
118 0.18
119 0.23
120 0.29
121 0.33
122 0.37
123 0.35
124 0.34
125 0.33
126 0.32
127 0.27
128 0.2
129 0.14
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.08
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.1
148 0.11
149 0.13
150 0.15
151 0.17
152 0.2
153 0.22
154 0.21
155 0.21
156 0.21
157 0.2
158 0.2
159 0.18
160 0.15
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.11
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.06
172 0.07
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.14
177 0.16
178 0.19
179 0.19
180 0.2
181 0.18
182 0.21
183 0.26
184 0.24
185 0.25
186 0.23
187 0.25
188 0.23
189 0.22
190 0.2
191 0.15
192 0.13
193 0.11
194 0.11
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.05
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.06
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.13
244 0.13
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.09
249 0.11
250 0.15
251 0.15
252 0.16
253 0.18
254 0.23
255 0.3
256 0.31
257 0.34
258 0.36
259 0.41
260 0.42
261 0.43
262 0.4
263 0.41
264 0.48
265 0.49
266 0.53
267 0.49
268 0.5
269 0.5
270 0.48
271 0.42
272 0.39
273 0.4
274 0.33
275 0.39
276 0.36
277 0.37
278 0.36
279 0.33
280 0.29
281 0.25
282 0.27
283 0.21
284 0.25
285 0.26
286 0.35
287 0.45
288 0.55
289 0.63
290 0.66
291 0.72
292 0.75
293 0.76
294 0.7
295 0.64
296 0.56
297 0.55
298 0.48
299 0.37
300 0.32
301 0.27
302 0.25
303 0.21
304 0.22
305 0.2
306 0.2
307 0.23
308 0.23
309 0.22
310 0.23
311 0.23
312 0.21
313 0.16
314 0.18
315 0.2
316 0.2
317 0.2
318 0.19
319 0.2
320 0.19
321 0.18
322 0.18
323 0.18
324 0.2
325 0.2
326 0.23
327 0.22
328 0.24
329 0.25
330 0.27
331 0.28
332 0.31
333 0.35
334 0.34
335 0.35
336 0.39
337 0.45
338 0.44
339 0.45
340 0.47
341 0.47
342 0.54
343 0.56
344 0.57
345 0.6
346 0.63
347 0.64
348 0.64
349 0.67
350 0.69
351 0.75
352 0.74
353 0.67
354 0.6
355 0.54
356 0.47
357 0.37
358 0.28
359 0.25
360 0.23
361 0.21
362 0.22
363 0.23
364 0.26
365 0.3
366 0.38
367 0.38
368 0.43
369 0.5
370 0.59
371 0.57
372 0.55
373 0.57
374 0.5
375 0.49
376 0.41
377 0.37
378 0.35
379 0.41
380 0.46
381 0.49
382 0.53
383 0.57
384 0.65
385 0.72
386 0.68
387 0.65
388 0.7
389 0.69
390 0.68
391 0.63
392 0.54
393 0.46
394 0.45
395 0.42
396 0.34
397 0.29
398 0.29
399 0.3
400 0.3
401 0.35
402 0.36
403 0.39
404 0.4