FuNGI

A0A094HP79

Protein Details

Accession

A0A094HP79

Localization Confidence

Low

Confidence Score

5.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
593-616	YPLVLRTKIRPQRSKNIDRQRFGG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 18, cyto 3.5, cyto_nucl 3, nucl 1.5, pero 1, golg 1, cysk 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004932 Rer1 IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0005737 C:cytoplasm GO:0016020 C:membrane GO:0016570 P:histone modification GO:0051179 P:localization GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1 PF03248 Rer1

Amino Acid Sequences

MDSMEPEQTPFGAVSEQTSRLQRIYQTYLDKSTPFTAYRWLGTGSLLVIFFLRIFLEQGWYIVAYSLGIYLLNLFLAFLQPKFDPSNEAIDNEMEDGEAGGLPTKQGDEFKPFIRRLPEFKFWHSATRAITIGFVCTFFSIFDVPVFWPVLVIYWFILFTLTMRRQIQHMIKSLWKRAGGWSLHGSARVPERLKLLPPQPRLNQSKNRQHDNRSINIAVMATSSSRGPDRSIHQDYIARIRYSNTLPPPPNPPKLLEIPNTGLSSGQYTTPGFASRLAREQPLNIEADAELGMHIDLVGMPGVFDGDESSIQAAIHAPAPHPHDRALLRPLNSIGKPKVVDSGSSFLRRTEYISSTKGRMDEHTPQKPVVRRAKPADRFQPLPKDLDKEDPEYILAAVQRSFEIAAANVANPLRLRHPSKRNVKLVSSHPMVPDLDAFNDAGGYITIKFQNNPVPPSTTYDKRLESGMLRPFVSSEAANAAHEKAVAAHEHDPSRNPHPGPNQDYEFFLPETTVDAVKFKRKSDVYDADAKNDEGLYTYTNQSGDKCFRFKRIRAYETSEEVQIQGVDRWNSEVVIAVNDGKDGVHQRAAYVYPLVLRTKIRPQRSKNIDRQRFGGEAEEEDTVDFLDVMVREPDESEVASRKKWAEFPNGDGEESEEEAVEEVKGVNGNGNGSASHNEHEVDEDAEAESE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.18
3	0.21
4	0.24
5	0.27
6	0.29
7	0.29
8	0.32
9	0.33
10	0.35
11	0.38
12	0.41
13	0.44
14	0.46
15	0.49
16	0.49
17	0.45
18	0.41
19	0.39
20	0.37
21	0.31
22	0.28
23	0.31
24	0.32
25	0.33
26	0.31
27	0.29
28	0.25
29	0.24
30	0.24
31	0.16
32	0.15
33	0.14
34	0.11
35	0.1
36	0.1
37	0.09
38	0.08
39	0.08
40	0.07
41	0.08
42	0.09
43	0.12
44	0.12
45	0.12
46	0.13
47	0.12
48	0.12
49	0.11
50	0.1
51	0.07
52	0.07
53	0.07
54	0.06
55	0.05
56	0.05
57	0.05
58	0.06
59	0.05
60	0.05
61	0.05
62	0.05
63	0.08
64	0.09
65	0.09
66	0.12
67	0.12
68	0.16
69	0.19
70	0.19
71	0.21
72	0.22
73	0.3
74	0.28
75	0.28
76	0.26
77	0.24
78	0.24
79	0.2
80	0.18
81	0.1
82	0.08
83	0.07
84	0.06
85	0.06
86	0.05
87	0.06
88	0.06
89	0.06
90	0.07
91	0.07
92	0.09
93	0.12
94	0.15
95	0.2
96	0.24
97	0.29
98	0.37
99	0.37
100	0.4
101	0.44
102	0.46
103	0.46
104	0.51
105	0.55
106	0.52
107	0.56
108	0.58
109	0.53
110	0.56
111	0.51
112	0.48
113	0.4
114	0.39
115	0.35
116	0.27
117	0.27
118	0.2
119	0.19
120	0.15
121	0.14
122	0.11
123	0.1
124	0.1
125	0.08
126	0.1
127	0.08
128	0.08
129	0.08
130	0.09
131	0.09
132	0.12
133	0.12
134	0.1
135	0.1
136	0.09
137	0.1
138	0.09
139	0.09
140	0.07
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.06
146	0.06
147	0.14
148	0.16
149	0.22
150	0.23
151	0.24
152	0.25
153	0.33
154	0.39
155	0.37
156	0.4
157	0.38
158	0.43
159	0.48
160	0.52
161	0.48
162	0.43
163	0.38
164	0.36
165	0.41
166	0.35
167	0.34
168	0.32
169	0.3
170	0.3
171	0.3
172	0.26
173	0.21
174	0.24
175	0.26
176	0.24
177	0.22
178	0.26
179	0.27
180	0.29
181	0.33
182	0.36
183	0.39
184	0.44
185	0.5
186	0.51
187	0.58
188	0.62
189	0.64
190	0.67
191	0.68
192	0.73
193	0.72
194	0.77
195	0.74
196	0.73
197	0.74
198	0.7
199	0.64
200	0.6
201	0.53
202	0.43
203	0.38
204	0.31
205	0.22
206	0.16
207	0.12
208	0.06
209	0.07
210	0.06
211	0.07
212	0.08
213	0.09
214	0.1
215	0.13
216	0.18
217	0.26
218	0.31
219	0.31
220	0.32
221	0.35
222	0.35
223	0.39
224	0.39
225	0.31
226	0.26
227	0.27
228	0.28
229	0.28
230	0.32
231	0.29
232	0.32
233	0.33
234	0.35
235	0.43
236	0.46
237	0.48
238	0.44
239	0.41
240	0.38
241	0.41
242	0.44
243	0.38
244	0.35
245	0.33
246	0.34
247	0.32
248	0.28
249	0.22
250	0.17
251	0.16
252	0.13
253	0.1
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.1
258	0.11
259	0.09
260	0.12
261	0.15
262	0.15
263	0.19
264	0.2
265	0.22
266	0.21
267	0.21
268	0.2
269	0.19
270	0.19
271	0.14
272	0.13
273	0.11
274	0.11
275	0.1
276	0.07
277	0.05
278	0.04
279	0.04
280	0.03
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.08
303	0.08
304	0.08
305	0.11
306	0.16
307	0.19
308	0.19
309	0.2
310	0.21
311	0.22
312	0.25
313	0.28
314	0.27
315	0.25
316	0.25
317	0.26
318	0.26
319	0.26
320	0.27
321	0.21
322	0.21
323	0.2
324	0.2
325	0.23
326	0.19
327	0.19
328	0.17
329	0.19
330	0.18
331	0.2
332	0.2
333	0.16
334	0.17
335	0.16
336	0.16
337	0.16
338	0.17
339	0.18
340	0.21
341	0.23
342	0.23
343	0.24
344	0.23
345	0.2
346	0.19
347	0.21
348	0.27
349	0.34
350	0.38
351	0.38
352	0.37
353	0.41
354	0.43
355	0.47
356	0.48
357	0.44
358	0.45
359	0.51
360	0.6
361	0.62
362	0.64
363	0.64
364	0.58
365	0.57
366	0.55
367	0.57
368	0.49
369	0.45
370	0.4
371	0.35
372	0.32
373	0.36
374	0.34
375	0.28
376	0.28
377	0.24
378	0.23
379	0.2
380	0.18
381	0.12
382	0.11
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.06
390	0.06
391	0.05
392	0.06
393	0.06
394	0.06
395	0.07
396	0.07
397	0.08
398	0.08
399	0.09
400	0.1
401	0.16
402	0.22
403	0.29
404	0.38
405	0.47
406	0.57
407	0.65
408	0.69
409	0.68
410	0.64
411	0.61
412	0.57
413	0.55
414	0.47
415	0.4
416	0.34
417	0.32
418	0.29
419	0.24
420	0.21
421	0.14
422	0.12
423	0.1
424	0.1
425	0.08
426	0.07
427	0.07
428	0.05
429	0.05
430	0.05
431	0.04
432	0.06
433	0.09
434	0.1
435	0.11
436	0.13
437	0.21
438	0.23
439	0.25
440	0.25
441	0.26
442	0.27
443	0.32
444	0.35
445	0.32
446	0.34
447	0.36
448	0.35
449	0.32
450	0.32
451	0.29
452	0.25
453	0.28
454	0.28
455	0.26
456	0.25
457	0.24
458	0.24
459	0.22
460	0.22
461	0.15
462	0.1
463	0.11
464	0.11
465	0.11
466	0.12
467	0.12
468	0.1
469	0.1
470	0.1
471	0.07
472	0.08
473	0.09
474	0.11
475	0.13
476	0.17
477	0.19
478	0.2
479	0.22
480	0.25
481	0.3
482	0.33
483	0.31
484	0.33
485	0.39
486	0.47
487	0.5
488	0.52
489	0.5
490	0.45
491	0.46
492	0.42
493	0.36
494	0.28
495	0.22
496	0.16
497	0.12
498	0.14
499	0.12
500	0.11
501	0.09
502	0.12
503	0.15
504	0.23
505	0.25
506	0.24
507	0.31
508	0.32
509	0.37
510	0.44
511	0.48
512	0.45
513	0.52
514	0.52
515	0.47
516	0.47
517	0.42
518	0.33
519	0.26
520	0.21
521	0.12
522	0.12
523	0.1
524	0.11
525	0.13
526	0.14
527	0.15
528	0.15
529	0.16
530	0.21
531	0.26
532	0.28
533	0.34
534	0.35
535	0.44
536	0.52
537	0.55
538	0.6
539	0.64
540	0.65
541	0.64
542	0.7
543	0.65
544	0.62
545	0.59
546	0.49
547	0.39
548	0.34
549	0.29
550	0.21
551	0.16
552	0.13
553	0.16
554	0.16
555	0.15
556	0.18
557	0.17
558	0.17
559	0.16
560	0.15
561	0.11
562	0.12
563	0.12
564	0.11
565	0.11
566	0.11
567	0.11
568	0.08
569	0.11
570	0.13
571	0.15
572	0.17
573	0.17
574	0.18
575	0.21
576	0.22
577	0.21
578	0.18
579	0.16
580	0.14
581	0.18
582	0.19
583	0.19
584	0.21
585	0.24
586	0.34
587	0.42
588	0.49
589	0.56
590	0.63
591	0.71
592	0.79
593	0.84
594	0.84
595	0.87
596	0.87
597	0.8
598	0.76
599	0.7
600	0.61
601	0.52
602	0.47
603	0.37
604	0.29
605	0.28
606	0.25
607	0.19
608	0.17
609	0.16
610	0.11
611	0.09
612	0.07
613	0.05
614	0.07
615	0.07
616	0.09
617	0.1
618	0.11
619	0.11
620	0.12
621	0.13
622	0.12
623	0.12
624	0.13
625	0.2
626	0.22
627	0.23
628	0.27
629	0.29
630	0.32
631	0.39
632	0.42
633	0.45
634	0.47
635	0.51
636	0.56
637	0.55
638	0.51
639	0.44
640	0.4
641	0.32
642	0.29
643	0.24
644	0.14
645	0.12
646	0.12
647	0.12
648	0.1
649	0.08
650	0.06
651	0.07
652	0.09
653	0.09
654	0.12
655	0.13
656	0.14
657	0.14
658	0.15
659	0.14
660	0.15
661	0.19
662	0.18
663	0.18
664	0.18
665	0.18
666	0.18
667	0.2
668	0.19
669	0.17
670	0.15
671	0.14

A0A094HP79

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer