Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GCI1

Protein Details
Accession C5GCI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
165-189SHSSTPIRERTRQPRPPKAKSTAHDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-51RRIGRRGRGGNRESGR
56-75SRNRPFVHGRGRRGVGPSRR
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 9.5, cyto_nucl 8, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
cd16492  RING-CH-C4HC3_NFX1-like  
Amino Acid Sequences MTTIATQSQYLTVQNPPLDQTSARDETLNPNNSGSRRIGRRGRGGNRESGRDVDTSRNRPFVHGRGRRGVGPSRRGAGTGAGTGAGTTISARGRGRDDAPNTTKTVAGMGRSFGGQLTREAPETAEEGRGDGSSAQGEQGSLRPSAPEFIPGVQVPMSTTTPTLSHSSTPIRERTRQPRPPKAKSTAHDIATRTHEDIANGIYECPICTNELGRKTRVWSCSLCWTVFHLSCIKKWSNNEGSVMARPRQQQDHEDGQDHPRQWRCPGCNLPHDILPSTYNCWCEKEMDPRPLPGLPPHSCGQTCSRARRGCPHPCDSVCHSGPCPPCAAMGPTQFCFCGRHESTKKCVDTDYENGWSCREPCGELLPCLQHKCPRPCHEGLCGACEEIVDARCYCGKSETRIMCSNRDEEKQSRLTHGKGTSEERVEEWVGCFDCKEICDRDYDCGVHRCQKRCHPQDVAVPHCPSSPDVITKCACGKTALSDIPGYQPRTSCQDPIPNCKEPCGSLLPCQHKCPVPCHTGPCPPCFLRVSINCRCGKASFQSLCHQGVIEPPQCFRLCKATMNCGRHNCGERCCPGERKAIERQATKRKLKSLNIVNRPNDNDIEAEHICTRVCGRMLKCSKHTCQELCHKGSCGTCREAIFEEISCNCGRSVLYPPLPCGTQPPPCHYDCARPKSCGHPQTSHNCHTDDESCPKCPFLTEKRCLCAKKALKNQPCWLTDPRCGLVCGKELKCGSHTCKNLCHRPGECEDSTEPCHQACGKIKKLCPHPCSDPCHAPFPCQEKTPCQSLITITCPCGRLKQEKRCNASRDDKNRFQQHQQSQSPSPLKCDDECARLQRNRSLASALNISIDPLTTSATPADGDSMTAITGTTLPYSSETLDLYLTLSTTSTLSTLQTYETTLHTLATSQTQRTARFPPARTQLRAFIHFLAADWGFVSESCDPEPHRHVAVFKTAHWVPPRGLGAEMGAHVGVGIGGVSVGECAKMRERERVREREAKRASAAAAEKSRAVYESGVGDFGAISAGAGDGGWAQVASRKRPTAVPPKSAFGFGAVGNGNGVLGGEKGGTLVLRSGVGIAGRVKGRAVVSGSGGGSGSGSGWRQFPAGFAEDVVDNWEEEVEKEEREEREKGHPDVTENGAGEVGGEGASDSAEVIGNANESVNGIA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.27
4 0.28
5 0.29
6 0.27
7 0.27
8 0.3
9 0.31
10 0.31
11 0.29
12 0.28
13 0.34
14 0.43
15 0.45
16 0.38
17 0.37
18 0.42
19 0.42
20 0.45
21 0.41
22 0.41
23 0.42
24 0.5
25 0.56
26 0.59
27 0.67
28 0.73
29 0.77
30 0.79
31 0.76
32 0.77
33 0.73
34 0.71
35 0.64
36 0.57
37 0.5
38 0.42
39 0.41
40 0.41
41 0.45
42 0.47
43 0.49
44 0.53
45 0.51
46 0.54
47 0.58
48 0.57
49 0.59
50 0.6
51 0.62
52 0.64
53 0.67
54 0.65
55 0.64
56 0.64
57 0.62
58 0.61
59 0.59
60 0.55
61 0.52
62 0.49
63 0.44
64 0.38
65 0.32
66 0.25
67 0.2
68 0.16
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.08
73 0.06
74 0.05
75 0.08
76 0.08
77 0.13
78 0.14
79 0.17
80 0.21
81 0.25
82 0.29
83 0.35
84 0.39
85 0.44
86 0.48
87 0.49
88 0.47
89 0.44
90 0.41
91 0.32
92 0.32
93 0.24
94 0.23
95 0.21
96 0.2
97 0.2
98 0.19
99 0.19
100 0.15
101 0.16
102 0.13
103 0.15
104 0.17
105 0.18
106 0.19
107 0.19
108 0.19
109 0.17
110 0.19
111 0.18
112 0.17
113 0.15
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.12
119 0.11
120 0.09
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.1
126 0.13
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.15
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.17
137 0.21
138 0.19
139 0.2
140 0.17
141 0.17
142 0.14
143 0.17
144 0.17
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.17
150 0.19
151 0.17
152 0.17
153 0.21
154 0.27
155 0.31
156 0.35
157 0.41
158 0.44
159 0.5
160 0.58
161 0.64
162 0.69
163 0.73
164 0.78
165 0.81
166 0.85
167 0.87
168 0.87
169 0.86
170 0.84
171 0.76
172 0.76
173 0.72
174 0.65
175 0.6
176 0.52
177 0.48
178 0.45
179 0.45
180 0.36
181 0.32
182 0.29
183 0.24
184 0.24
185 0.21
186 0.18
187 0.15
188 0.14
189 0.12
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.1
196 0.15
197 0.2
198 0.29
199 0.33
200 0.34
201 0.36
202 0.39
203 0.45
204 0.44
205 0.42
206 0.36
207 0.36
208 0.43
209 0.44
210 0.39
211 0.34
212 0.35
213 0.37
214 0.35
215 0.33
216 0.31
217 0.29
218 0.31
219 0.37
220 0.36
221 0.34
222 0.37
223 0.45
224 0.45
225 0.46
226 0.46
227 0.42
228 0.42
229 0.42
230 0.43
231 0.35
232 0.33
233 0.34
234 0.37
235 0.4
236 0.41
237 0.4
238 0.43
239 0.5
240 0.48
241 0.46
242 0.44
243 0.43
244 0.45
245 0.42
246 0.41
247 0.37
248 0.37
249 0.41
250 0.47
251 0.45
252 0.49
253 0.56
254 0.56
255 0.58
256 0.61
257 0.57
258 0.51
259 0.49
260 0.41
261 0.34
262 0.29
263 0.23
264 0.22
265 0.22
266 0.22
267 0.21
268 0.23
269 0.23
270 0.25
271 0.27
272 0.34
273 0.39
274 0.46
275 0.46
276 0.44
277 0.46
278 0.43
279 0.4
280 0.35
281 0.36
282 0.29
283 0.32
284 0.31
285 0.33
286 0.32
287 0.33
288 0.33
289 0.34
290 0.39
291 0.42
292 0.5
293 0.5
294 0.53
295 0.6
296 0.64
297 0.64
298 0.65
299 0.62
300 0.61
301 0.58
302 0.61
303 0.57
304 0.56
305 0.47
306 0.43
307 0.39
308 0.38
309 0.39
310 0.34
311 0.3
312 0.22
313 0.21
314 0.2
315 0.22
316 0.2
317 0.24
318 0.26
319 0.25
320 0.25
321 0.25
322 0.24
323 0.24
324 0.2
325 0.24
326 0.23
327 0.33
328 0.39
329 0.44
330 0.5
331 0.56
332 0.56
333 0.47
334 0.46
335 0.38
336 0.36
337 0.36
338 0.34
339 0.31
340 0.32
341 0.31
342 0.31
343 0.3
344 0.25
345 0.23
346 0.2
347 0.15
348 0.15
349 0.21
350 0.22
351 0.22
352 0.24
353 0.25
354 0.27
355 0.29
356 0.3
357 0.29
358 0.37
359 0.44
360 0.5
361 0.53
362 0.57
363 0.58
364 0.59
365 0.59
366 0.57
367 0.5
368 0.43
369 0.37
370 0.29
371 0.25
372 0.21
373 0.16
374 0.11
375 0.11
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.12
380 0.13
381 0.13
382 0.16
383 0.18
384 0.21
385 0.3
386 0.32
387 0.35
388 0.42
389 0.44
390 0.44
391 0.44
392 0.45
393 0.4
394 0.39
395 0.39
396 0.35
397 0.38
398 0.4
399 0.38
400 0.39
401 0.38
402 0.37
403 0.38
404 0.37
405 0.34
406 0.31
407 0.34
408 0.32
409 0.3
410 0.29
411 0.24
412 0.24
413 0.22
414 0.19
415 0.15
416 0.14
417 0.13
418 0.12
419 0.11
420 0.09
421 0.1
422 0.09
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.16
427 0.17
428 0.2
429 0.21
430 0.22
431 0.22
432 0.24
433 0.25
434 0.3
435 0.35
436 0.39
437 0.43
438 0.51
439 0.59
440 0.61
441 0.66
442 0.62
443 0.6
444 0.61
445 0.62
446 0.58
447 0.53
448 0.47
449 0.41
450 0.37
451 0.32
452 0.26
453 0.22
454 0.18
455 0.17
456 0.17
457 0.21
458 0.21
459 0.22
460 0.24
461 0.21
462 0.2
463 0.16
464 0.15
465 0.15
466 0.19
467 0.18
468 0.16
469 0.16
470 0.16
471 0.2
472 0.24
473 0.22
474 0.19
475 0.19
476 0.19
477 0.25
478 0.26
479 0.24
480 0.23
481 0.29
482 0.31
483 0.39
484 0.44
485 0.45
486 0.44
487 0.43
488 0.41
489 0.33
490 0.33
491 0.3
492 0.25
493 0.23
494 0.31
495 0.37
496 0.38
497 0.4
498 0.4
499 0.38
500 0.38
501 0.37
502 0.35
503 0.33
504 0.34
505 0.37
506 0.38
507 0.42
508 0.43
509 0.4
510 0.39
511 0.34
512 0.34
513 0.3
514 0.27
515 0.26
516 0.3
517 0.35
518 0.37
519 0.44
520 0.42
521 0.42
522 0.42
523 0.36
524 0.32
525 0.28
526 0.3
527 0.25
528 0.27
529 0.3
530 0.32
531 0.32
532 0.29
533 0.26
534 0.17
535 0.18
536 0.2
537 0.2
538 0.18
539 0.17
540 0.21
541 0.21
542 0.22
543 0.2
544 0.21
545 0.19
546 0.25
547 0.26
548 0.32
549 0.38
550 0.43
551 0.47
552 0.43
553 0.44
554 0.41
555 0.45
556 0.39
557 0.36
558 0.35
559 0.32
560 0.33
561 0.33
562 0.34
563 0.3
564 0.35
565 0.33
566 0.34
567 0.39
568 0.42
569 0.44
570 0.45
571 0.49
572 0.52
573 0.6
574 0.61
575 0.56
576 0.57
577 0.59
578 0.58
579 0.59
580 0.58
581 0.59
582 0.62
583 0.66
584 0.6
585 0.56
586 0.55
587 0.48
588 0.39
589 0.3
590 0.21
591 0.15
592 0.17
593 0.14
594 0.13
595 0.12
596 0.12
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.08
601 0.09
602 0.13
603 0.14
604 0.23
605 0.29
606 0.33
607 0.39
608 0.43
609 0.45
610 0.46
611 0.5
612 0.42
613 0.42
614 0.48
615 0.49
616 0.46
617 0.44
618 0.39
619 0.37
620 0.38
621 0.36
622 0.29
623 0.24
624 0.23
625 0.22
626 0.23
627 0.22
628 0.2
629 0.18
630 0.14
631 0.14
632 0.11
633 0.13
634 0.11
635 0.11
636 0.09
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.14
641 0.18
642 0.23
643 0.23
644 0.24
645 0.25
646 0.25
647 0.23
648 0.22
649 0.21
650 0.24
651 0.25
652 0.29
653 0.32
654 0.33
655 0.37
656 0.33
657 0.39
658 0.4
659 0.48
660 0.46
661 0.44
662 0.45
663 0.49
664 0.57
665 0.53
666 0.49
667 0.45
668 0.48
669 0.55
670 0.59
671 0.57
672 0.51
673 0.45
674 0.4
675 0.38
676 0.35
677 0.29
678 0.3
679 0.27
680 0.28
681 0.27
682 0.27
683 0.24
684 0.23
685 0.25
686 0.28
687 0.35
688 0.4
689 0.44
690 0.47
691 0.53
692 0.53
693 0.49
694 0.49
695 0.46
696 0.48
697 0.55
698 0.61
699 0.63
700 0.68
701 0.72
702 0.69
703 0.64
704 0.59
705 0.55
706 0.49
707 0.47
708 0.44
709 0.39
710 0.33
711 0.32
712 0.28
713 0.24
714 0.24
715 0.27
716 0.23
717 0.27
718 0.27
719 0.27
720 0.29
721 0.31
722 0.33
723 0.33
724 0.37
725 0.35
726 0.43
727 0.49
728 0.55
729 0.53
730 0.54
731 0.47
732 0.48
733 0.5
734 0.48
735 0.41
736 0.37
737 0.35
738 0.32
739 0.34
740 0.31
741 0.27
742 0.2
743 0.22
744 0.18
745 0.22
746 0.28
747 0.32
748 0.38
749 0.44
750 0.47
751 0.53
752 0.63
753 0.67
754 0.62
755 0.59
756 0.6
757 0.6
758 0.64
759 0.62
760 0.6
761 0.53
762 0.58
763 0.52
764 0.46
765 0.45
766 0.44
767 0.41
768 0.37
769 0.37
770 0.35
771 0.38
772 0.4
773 0.36
774 0.31
775 0.29
776 0.27
777 0.28
778 0.27
779 0.24
780 0.21
781 0.22
782 0.23
783 0.22
784 0.25
785 0.26
786 0.33
787 0.41
788 0.5
789 0.58
790 0.65
791 0.71
792 0.74
793 0.74
794 0.71
795 0.71
796 0.7
797 0.71
798 0.71
799 0.72
800 0.73
801 0.78
802 0.74
803 0.72
804 0.72
805 0.7
806 0.71
807 0.68
808 0.65
809 0.59
810 0.63
811 0.61
812 0.52
813 0.48
814 0.41
815 0.39
816 0.33
817 0.38
818 0.33
819 0.32
820 0.35
821 0.37
822 0.41
823 0.42
824 0.45
825 0.42
826 0.44
827 0.42
828 0.39
829 0.36
830 0.3
831 0.29
832 0.28
833 0.23
834 0.2
835 0.17
836 0.16
837 0.13
838 0.11
839 0.09
840 0.07
841 0.08
842 0.06
843 0.07
844 0.07
845 0.08
846 0.08
847 0.08
848 0.09
849 0.07
850 0.08
851 0.07
852 0.07
853 0.06
854 0.06
855 0.06
856 0.04
857 0.05
858 0.05
859 0.05
860 0.06
861 0.06
862 0.08
863 0.09
864 0.1
865 0.1
866 0.1
867 0.1
868 0.1
869 0.1
870 0.09
871 0.08
872 0.07
873 0.06
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.06
878 0.06
879 0.06
880 0.07
881 0.08
882 0.09
883 0.09
884 0.09
885 0.1
886 0.11
887 0.12
888 0.13
889 0.12
890 0.12
891 0.11
892 0.11
893 0.11
894 0.17
895 0.19
896 0.17
897 0.24
898 0.27
899 0.29
900 0.32
901 0.36
902 0.39
903 0.44
904 0.46
905 0.48
906 0.55
907 0.6
908 0.6
909 0.58
910 0.57
911 0.54
912 0.55
913 0.49
914 0.4
915 0.35
916 0.31
917 0.27
918 0.23
919 0.18
920 0.14
921 0.11
922 0.1
923 0.09
924 0.09
925 0.12
926 0.09
927 0.11
928 0.12
929 0.14
930 0.16
931 0.21
932 0.26
933 0.26
934 0.27
935 0.27
936 0.28
937 0.29
938 0.36
939 0.32
940 0.28
941 0.32
942 0.31
943 0.35
944 0.36
945 0.36
946 0.28
947 0.33
948 0.35
949 0.28
950 0.28
951 0.23
952 0.2
953 0.19
954 0.18
955 0.12
956 0.1
957 0.08
958 0.07
959 0.07
960 0.05
961 0.04
962 0.03
963 0.02
964 0.02
965 0.02
966 0.02
967 0.03
968 0.03
969 0.04
970 0.05
971 0.07
972 0.14
973 0.21
974 0.24
975 0.34
976 0.4
977 0.51
978 0.6
979 0.67
980 0.69
981 0.72
982 0.72
983 0.73
984 0.72
985 0.65
986 0.58
987 0.51
988 0.44
989 0.4
990 0.4
991 0.36
992 0.35
993 0.32
994 0.31
995 0.29
996 0.29
997 0.23
998 0.22
999 0.16
1000 0.14
1001 0.15
1002 0.15
1003 0.14
1004 0.13
1005 0.12
1006 0.1
1007 0.1
1008 0.08
1009 0.04
1010 0.04
1011 0.03
1012 0.03
1013 0.03
1014 0.03
1015 0.03
1016 0.03
1017 0.03
1018 0.04
1019 0.03
1020 0.04
1021 0.09
1022 0.14
1023 0.19
1024 0.26
1025 0.28
1026 0.3
1027 0.36
1028 0.45
1029 0.51
1030 0.55
1031 0.59
1032 0.56
1033 0.59
1034 0.58
1035 0.55
1036 0.46
1037 0.37
1038 0.3
1039 0.21
1040 0.22
1041 0.17
1042 0.16
1043 0.14
1044 0.14
1045 0.11
1046 0.09
1047 0.09
1048 0.04
1049 0.04
1050 0.05
1051 0.05
1052 0.05
1053 0.05
1054 0.06
1055 0.06
1056 0.06
1057 0.07
1058 0.07
1059 0.07
1060 0.08
1061 0.08
1062 0.09
1063 0.09
1064 0.11
1065 0.11
1066 0.15
1067 0.16
1068 0.16
1069 0.16
1070 0.19
1071 0.19
1072 0.2
1073 0.22
1074 0.19
1075 0.2
1076 0.22
1077 0.22
1078 0.19
1079 0.19
1080 0.15
1081 0.12
1082 0.1
1083 0.09
1084 0.08
1085 0.09
1086 0.11
1087 0.12
1088 0.13
1089 0.14
1090 0.14
1091 0.15
1092 0.17
1093 0.19
1094 0.18
1095 0.17
1096 0.18
1097 0.17
1098 0.17
1099 0.18
1100 0.14
1101 0.11
1102 0.1
1103 0.11
1104 0.1
1105 0.1
1106 0.14
1107 0.13
1108 0.13
1109 0.15
1110 0.21
1111 0.24
1112 0.28
1113 0.31
1114 0.3
1115 0.39
1116 0.46
1117 0.46
1118 0.46
1119 0.44
1120 0.43
1121 0.45
1122 0.46
1123 0.4
1124 0.34
1125 0.31
1126 0.26
1127 0.23
1128 0.2
1129 0.15
1130 0.1
1131 0.05
1132 0.05
1133 0.04
1134 0.04
1135 0.05
1136 0.04
1137 0.04
1138 0.04
1139 0.05
1140 0.05
1141 0.06
1142 0.07
1143 0.08
1144 0.08
1145 0.08
1146 0.08