Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A179U1Y1

Protein Details
Accession A0A179U1Y1    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-29GSPAQPKLPAKATKKRRREDEEDVLPTKHydrophilic
37-65ATAANDGGSKKKKRKKTKQIVEDPKDADKHydrophilic
327-362VAEVKQKKPKKSDKERKGDKSKKERKEKTGKKQDDEBasic
397-467AENKAKEAKKGKKEKKEKKEKEKKENKEKKVREADEVVEERQDKKKEKKEKKEKKEKRKDKKDVEGKDKLSBasic
483-517GNLENQEKKKSKKSKDKKEKKRSKDKKDKEGVMLPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-19PAKATKKRRR
45-54SKKKKRKKTK
331-358KQKKPKKSDKERKGDKSKKERKEKTGKK
400-468KAKEAKKGKKEKKEKKEKEKKENKEKKVREADEVVEERQDKKKEKKEKKEKKEKRKDKKDVEGKDKLSK
489-511EKKKSKKSKDKKEKKRSKDKKDK
664-673RARAAKEALK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032704  Cms1  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF14617  CMS1  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGSPAQPKLPAKATKKRRREDEEDVLPTKQAAPTAPATAANDGGSKKKKRKKTKQIVEDPKDADKKDGIDESIGKMDGPLLADFFAQQAKRHNSELTAVELDDVYVPEHAFLDTTSWKSPRKLENLPAFLKVYSRKKGSPDSLSTAPEEKGSPHTIVITLAGLRAADITRALRQFQNKDCTVAKLFAKHIKLAEAKEFVKKTRVGIGIGTPVRLNDLAASGELSLTHLKRIVIDGSYVDKKKRGLLDGQQELEENETTRGNLLICLIEYHTSRLFPELAAVLRANMAEWVGWSFSSIEFTLGNLSAAKMGDKRKRSQLLAEDDAVEVAEVKQKKPKKSDKERKGDKSKKERKEKTGKKQDDEEVQDNVEVNGLGMDVEMKDSDEATPLVNGTAGEEAENKAKEAKKGKKEKKEKKEKEKKENKEKKVREADEVVEERQDKKKEKKEKKEKKEKRKDKKDVEGKDKLSKEGEEKGEGEQEAVPGNLENQEKKKSKKSKDKKEKKRSKDKKDKEGVMLPEHGDMTEKPAAVETDAAEVNSVDKTIEGTNGHDEEKKSQRFIVFIGNLPFQTTLEAVQKHFAKIDPSHVRLPSEKGGKKGRGFAFIEFDHYDRMKTCLKLYHHSLFDDGKNPARKINVELTAGGGGSKSETRKARIVEKNTKLSEQRARAAKEALKQKNKADAAKPADDAEAAPVKNDMDDVHPTRRRWVPCP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.82
3 0.85
4 0.87
5 0.87
6 0.87
7 0.86
8 0.85
9 0.84
10 0.81
11 0.74
12 0.64
13 0.55
14 0.47
15 0.4
16 0.31
17 0.23
18 0.17
19 0.18
20 0.2
21 0.23
22 0.23
23 0.23
24 0.24
25 0.24
26 0.23
27 0.2
28 0.2
29 0.19
30 0.26
31 0.33
32 0.4
33 0.49
34 0.58
35 0.67
36 0.76
37 0.85
38 0.89
39 0.91
40 0.93
41 0.94
42 0.96
43 0.97
44 0.92
45 0.89
46 0.81
47 0.78
48 0.73
49 0.63
50 0.55
51 0.46
52 0.41
53 0.38
54 0.37
55 0.3
56 0.27
57 0.28
58 0.28
59 0.28
60 0.25
61 0.2
62 0.17
63 0.17
64 0.14
65 0.14
66 0.12
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.14
73 0.13
74 0.15
75 0.24
76 0.3
77 0.34
78 0.37
79 0.37
80 0.34
81 0.37
82 0.37
83 0.32
84 0.27
85 0.23
86 0.21
87 0.19
88 0.18
89 0.14
90 0.12
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.1
100 0.12
101 0.16
102 0.19
103 0.23
104 0.27
105 0.3
106 0.38
107 0.43
108 0.48
109 0.52
110 0.57
111 0.63
112 0.66
113 0.65
114 0.6
115 0.53
116 0.45
117 0.42
118 0.41
119 0.4
120 0.39
121 0.42
122 0.43
123 0.47
124 0.55
125 0.59
126 0.58
127 0.55
128 0.55
129 0.53
130 0.52
131 0.48
132 0.42
133 0.35
134 0.29
135 0.24
136 0.19
137 0.21
138 0.22
139 0.2
140 0.18
141 0.19
142 0.18
143 0.17
144 0.16
145 0.12
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.09
156 0.13
157 0.15
158 0.17
159 0.21
160 0.27
161 0.34
162 0.39
163 0.46
164 0.42
165 0.45
166 0.44
167 0.44
168 0.4
169 0.38
170 0.33
171 0.29
172 0.32
173 0.34
174 0.35
175 0.33
176 0.31
177 0.32
178 0.34
179 0.32
180 0.33
181 0.31
182 0.31
183 0.35
184 0.36
185 0.32
186 0.34
187 0.33
188 0.3
189 0.33
190 0.33
191 0.27
192 0.27
193 0.27
194 0.29
195 0.28
196 0.27
197 0.19
198 0.17
199 0.18
200 0.17
201 0.15
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.1
212 0.09
213 0.1
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.14
218 0.14
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.15
223 0.22
224 0.23
225 0.22
226 0.24
227 0.24
228 0.28
229 0.3
230 0.29
231 0.29
232 0.34
233 0.42
234 0.44
235 0.44
236 0.4
237 0.36
238 0.33
239 0.29
240 0.22
241 0.13
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.09
255 0.09
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.12
262 0.1
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.08
283 0.07
284 0.08
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.1
296 0.17
297 0.23
298 0.28
299 0.31
300 0.39
301 0.43
302 0.44
303 0.45
304 0.46
305 0.46
306 0.45
307 0.42
308 0.34
309 0.29
310 0.28
311 0.22
312 0.14
313 0.07
314 0.05
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.16
319 0.22
320 0.27
321 0.37
322 0.46
323 0.53
324 0.64
325 0.75
326 0.79
327 0.84
328 0.89
329 0.89
330 0.9
331 0.88
332 0.86
333 0.86
334 0.86
335 0.85
336 0.86
337 0.84
338 0.83
339 0.86
340 0.86
341 0.86
342 0.87
343 0.82
344 0.75
345 0.72
346 0.66
347 0.61
348 0.56
349 0.48
350 0.37
351 0.32
352 0.29
353 0.24
354 0.2
355 0.14
356 0.08
357 0.05
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.06
383 0.07
384 0.1
385 0.1
386 0.09
387 0.13
388 0.15
389 0.2
390 0.29
391 0.37
392 0.44
393 0.55
394 0.64
395 0.7
396 0.8
397 0.85
398 0.87
399 0.9
400 0.91
401 0.91
402 0.93
403 0.93
404 0.93
405 0.93
406 0.92
407 0.92
408 0.92
409 0.9
410 0.9
411 0.84
412 0.83
413 0.82
414 0.74
415 0.67
416 0.59
417 0.51
418 0.47
419 0.45
420 0.35
421 0.27
422 0.26
423 0.25
424 0.28
425 0.31
426 0.31
427 0.39
428 0.48
429 0.56
430 0.66
431 0.75
432 0.8
433 0.86
434 0.91
435 0.93
436 0.94
437 0.95
438 0.96
439 0.95
440 0.95
441 0.96
442 0.95
443 0.93
444 0.93
445 0.91
446 0.88
447 0.86
448 0.83
449 0.76
450 0.73
451 0.65
452 0.56
453 0.48
454 0.41
455 0.35
456 0.33
457 0.31
458 0.26
459 0.25
460 0.24
461 0.25
462 0.23
463 0.21
464 0.15
465 0.13
466 0.11
467 0.1
468 0.09
469 0.06
470 0.07
471 0.11
472 0.12
473 0.15
474 0.18
475 0.27
476 0.33
477 0.38
478 0.48
479 0.53
480 0.62
481 0.7
482 0.78
483 0.8
484 0.86
485 0.93
486 0.94
487 0.95
488 0.96
489 0.95
490 0.95
491 0.95
492 0.95
493 0.95
494 0.93
495 0.93
496 0.92
497 0.87
498 0.81
499 0.77
500 0.7
501 0.62
502 0.55
503 0.44
504 0.36
505 0.3
506 0.24
507 0.18
508 0.14
509 0.16
510 0.16
511 0.16
512 0.14
513 0.15
514 0.16
515 0.15
516 0.16
517 0.1
518 0.1
519 0.11
520 0.1
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.08
525 0.08
526 0.05
527 0.05
528 0.07
529 0.07
530 0.1
531 0.1
532 0.12
533 0.17
534 0.18
535 0.2
536 0.22
537 0.22
538 0.27
539 0.36
540 0.37
541 0.34
542 0.36
543 0.36
544 0.33
545 0.34
546 0.36
547 0.28
548 0.29
549 0.31
550 0.29
551 0.27
552 0.28
553 0.26
554 0.17
555 0.16
556 0.13
557 0.12
558 0.16
559 0.18
560 0.18
561 0.23
562 0.25
563 0.25
564 0.26
565 0.25
566 0.25
567 0.25
568 0.34
569 0.36
570 0.38
571 0.43
572 0.44
573 0.45
574 0.42
575 0.46
576 0.43
577 0.45
578 0.44
579 0.45
580 0.52
581 0.57
582 0.58
583 0.62
584 0.57
585 0.55
586 0.54
587 0.49
588 0.46
589 0.39
590 0.41
591 0.33
592 0.31
593 0.28
594 0.26
595 0.25
596 0.2
597 0.24
598 0.24
599 0.25
600 0.28
601 0.31
602 0.35
603 0.41
604 0.47
605 0.51
606 0.48
607 0.47
608 0.47
609 0.44
610 0.42
611 0.4
612 0.36
613 0.36
614 0.4
615 0.4
616 0.4
617 0.4
618 0.39
619 0.4
620 0.45
621 0.42
622 0.37
623 0.36
624 0.34
625 0.31
626 0.28
627 0.23
628 0.14
629 0.09
630 0.1
631 0.14
632 0.14
633 0.2
634 0.25
635 0.3
636 0.36
637 0.41
638 0.49
639 0.54
640 0.62
641 0.66
642 0.7
643 0.74
644 0.71
645 0.73
646 0.66
647 0.65
648 0.65
649 0.6
650 0.6
651 0.58
652 0.59
653 0.56
654 0.59
655 0.56
656 0.54
657 0.58
658 0.61
659 0.62
660 0.64
661 0.66
662 0.69
663 0.7
664 0.69
665 0.64
666 0.63
667 0.61
668 0.61
669 0.57
670 0.48
671 0.43
672 0.36
673 0.31
674 0.27
675 0.26
676 0.21
677 0.2
678 0.2
679 0.19
680 0.19
681 0.19
682 0.15
683 0.13
684 0.21
685 0.26
686 0.35
687 0.42
688 0.43
689 0.5
690 0.57