Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GGV7

Protein Details
Accession C5GGV7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-100RASDERPVKRRRVGERRAGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-40VMGKGKAPVRGPARAAEAERASGSRSRRGRG
86-108RPVKRRRVGERRAGGIEAGKGGR
197-209KGKQRAAAVRRKP
Subcellular Location(s) mito 16, cyto_nucl 6.5, nucl 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MVKQSRHSRVMGKGKAPVRGPARAAEAERASGSRSRRGRGHDQERAAPDPSGEIPLVYRDMLAESGAGVEGQSGRSGSLSRASDERPVKRRRVGERRAGGIEAGKGGRDERGGGVGVYVGKPVQTVYDVDVSDDEEEMAWEDVEVSIVTPAAAAAAASASTSASASGLGYHGAAEQQEVGVEESEELLQITLEKPEKGKQRAAAVRRKPITAQEKRWRLDIHKMHVLCLLGHVQLRNLWCNDDKVQNVLKRLLSKHTVMCLNPKETLPQFTRSTTFADGLNQATEAFRRHFKVTVPGMKRPYWLENPNELKDPTGLLDTAEILSSKEDFLKQAVALRGSRDLGAQLFCALLRAVGVDVRLVCSLQVLPFAGVAKGIMPLKPEREYIVVSEDDGSLATHGSTKTHETAPSSRIRRIGQPRFSSSPTFSPKPRLPTALPRAFSESPFPVFWVEAFNEAMQKWVPVDPIVTNTVGKPSKFEPPASDRYNNMSYVIAFEDDASARDVTKRYTKSFNSKTRKQRVESTKNGEEWWARTMNFFEKPFLDDRDQVEIGELTAKVAAEMMPRNVQDFKDHPVYALERHLRRNEVIFPRREIGKVGLSKVSTNKKNPPLESVYRRGDVHVVKSADGWYRLGREVKVGEQPLKRVPVSRSKGDLEHREELSDYEEEGQETPMYAIHQTDLYQPPPVVENRVTKNAYGNIDVYTPSMVPEGGFHLRHTEAANAARILGIDYADAVTGFQFRGRHGTAVVQGIVASVEYRDALCAVLDALEDERVQAEHEKRTAEALGMWKLLLLKLRVAERVRSYAFEGEGDEEEEEEEEKERVSDGDESDDIEGGGGFIRESGQVEALPSQKGLPQFEGAFEAGGFIPEGIDGEEDSTTTGGGFMPPILAPDEAGSSTSATAIGGNSLRPQEKSRYTLIVTPNAASEAHLPQPHTSPTTTPSHAQTARQQTQAQQTHTPQRQQPQSQSQLQQQRPPTTTAPEGSPTAPIAVPSSGSDEECSVEEICGVPDLVHEGESDSEIDQSSMLSHDPEDEDAEPEWLFSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.64
3 0.59
4 0.58
5 0.53
6 0.51
7 0.49
8 0.45
9 0.46
10 0.44
11 0.44
12 0.43
13 0.39
14 0.35
15 0.34
16 0.3
17 0.27
18 0.28
19 0.29
20 0.32
21 0.36
22 0.4
23 0.44
24 0.52
25 0.6
26 0.66
27 0.72
28 0.72
29 0.72
30 0.74
31 0.74
32 0.69
33 0.61
34 0.5
35 0.4
36 0.34
37 0.29
38 0.25
39 0.19
40 0.16
41 0.14
42 0.17
43 0.18
44 0.15
45 0.14
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.09
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.05
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.11
64 0.11
65 0.17
66 0.18
67 0.2
68 0.23
69 0.25
70 0.33
71 0.4
72 0.48
73 0.5
74 0.57
75 0.63
76 0.67
77 0.74
78 0.76
79 0.79
80 0.79
81 0.8
82 0.8
83 0.78
84 0.73
85 0.65
86 0.55
87 0.46
88 0.38
89 0.31
90 0.24
91 0.19
92 0.16
93 0.16
94 0.17
95 0.15
96 0.15
97 0.13
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.13
103 0.14
104 0.12
105 0.12
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.12
114 0.17
115 0.17
116 0.18
117 0.18
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.13
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.07
127 0.06
128 0.07
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.11
179 0.13
180 0.14
181 0.16
182 0.23
183 0.32
184 0.36
185 0.41
186 0.41
187 0.49
188 0.56
189 0.63
190 0.67
191 0.65
192 0.7
193 0.67
194 0.65
195 0.56
196 0.58
197 0.6
198 0.59
199 0.62
200 0.62
201 0.69
202 0.68
203 0.72
204 0.66
205 0.59
206 0.6
207 0.58
208 0.54
209 0.54
210 0.52
211 0.48
212 0.47
213 0.43
214 0.32
215 0.27
216 0.21
217 0.15
218 0.16
219 0.16
220 0.14
221 0.16
222 0.18
223 0.2
224 0.19
225 0.21
226 0.21
227 0.24
228 0.27
229 0.29
230 0.28
231 0.29
232 0.35
233 0.35
234 0.37
235 0.37
236 0.36
237 0.36
238 0.38
239 0.39
240 0.36
241 0.36
242 0.35
243 0.36
244 0.37
245 0.33
246 0.39
247 0.38
248 0.37
249 0.36
250 0.33
251 0.33
252 0.31
253 0.37
254 0.31
255 0.32
256 0.32
257 0.32
258 0.34
259 0.3
260 0.32
261 0.27
262 0.25
263 0.2
264 0.2
265 0.2
266 0.18
267 0.17
268 0.14
269 0.12
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.13
274 0.16
275 0.19
276 0.21
277 0.23
278 0.24
279 0.32
280 0.37
281 0.44
282 0.45
283 0.49
284 0.51
285 0.5
286 0.51
287 0.45
288 0.44
289 0.42
290 0.42
291 0.41
292 0.45
293 0.5
294 0.5
295 0.5
296 0.44
297 0.37
298 0.32
299 0.27
300 0.19
301 0.15
302 0.12
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.15
320 0.17
321 0.18
322 0.18
323 0.19
324 0.2
325 0.19
326 0.19
327 0.14
328 0.13
329 0.12
330 0.12
331 0.1
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.05
338 0.04
339 0.05
340 0.04
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.08
351 0.07
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.1
365 0.12
366 0.16
367 0.17
368 0.18
369 0.17
370 0.18
371 0.18
372 0.17
373 0.18
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.12
378 0.1
379 0.09
380 0.08
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.11
389 0.13
390 0.15
391 0.16
392 0.18
393 0.21
394 0.25
395 0.32
396 0.32
397 0.32
398 0.35
399 0.35
400 0.4
401 0.48
402 0.52
403 0.52
404 0.54
405 0.57
406 0.57
407 0.58
408 0.52
409 0.44
410 0.42
411 0.4
412 0.38
413 0.34
414 0.38
415 0.39
416 0.42
417 0.42
418 0.39
419 0.36
420 0.42
421 0.51
422 0.49
423 0.47
424 0.42
425 0.46
426 0.42
427 0.4
428 0.34
429 0.26
430 0.22
431 0.21
432 0.21
433 0.14
434 0.13
435 0.13
436 0.12
437 0.1
438 0.09
439 0.1
440 0.09
441 0.1
442 0.1
443 0.11
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.07
450 0.08
451 0.08
452 0.1
453 0.11
454 0.11
455 0.1
456 0.1
457 0.16
458 0.16
459 0.16
460 0.16
461 0.17
462 0.24
463 0.25
464 0.26
465 0.25
466 0.29
467 0.37
468 0.39
469 0.39
470 0.33
471 0.36
472 0.37
473 0.33
474 0.27
475 0.2
476 0.16
477 0.15
478 0.14
479 0.09
480 0.07
481 0.07
482 0.06
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.08
489 0.09
490 0.11
491 0.17
492 0.2
493 0.21
494 0.28
495 0.32
496 0.4
497 0.49
498 0.57
499 0.59
500 0.65
501 0.72
502 0.76
503 0.78
504 0.71
505 0.71
506 0.72
507 0.72
508 0.71
509 0.68
510 0.62
511 0.56
512 0.53
513 0.46
514 0.36
515 0.28
516 0.24
517 0.18
518 0.14
519 0.14
520 0.15
521 0.16
522 0.19
523 0.18
524 0.17
525 0.16
526 0.18
527 0.19
528 0.21
529 0.2
530 0.19
531 0.2
532 0.24
533 0.24
534 0.21
535 0.2
536 0.16
537 0.14
538 0.12
539 0.1
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.05
544 0.05
545 0.06
546 0.06
547 0.07
548 0.08
549 0.1
550 0.1
551 0.12
552 0.14
553 0.13
554 0.15
555 0.16
556 0.19
557 0.22
558 0.22
559 0.21
560 0.21
561 0.22
562 0.2
563 0.25
564 0.26
565 0.24
566 0.28
567 0.3
568 0.3
569 0.3
570 0.31
571 0.32
572 0.36
573 0.39
574 0.38
575 0.38
576 0.38
577 0.39
578 0.37
579 0.3
580 0.23
581 0.23
582 0.23
583 0.22
584 0.22
585 0.21
586 0.22
587 0.27
588 0.33
589 0.32
590 0.35
591 0.41
592 0.48
593 0.52
594 0.52
595 0.51
596 0.49
597 0.51
598 0.52
599 0.51
600 0.46
601 0.43
602 0.42
603 0.37
604 0.36
605 0.3
606 0.27
607 0.26
608 0.23
609 0.21
610 0.22
611 0.23
612 0.2
613 0.19
614 0.17
615 0.12
616 0.14
617 0.17
618 0.18
619 0.16
620 0.17
621 0.17
622 0.18
623 0.22
624 0.22
625 0.26
626 0.25
627 0.28
628 0.29
629 0.31
630 0.29
631 0.29
632 0.3
633 0.34
634 0.38
635 0.39
636 0.39
637 0.38
638 0.42
639 0.44
640 0.48
641 0.43
642 0.43
643 0.4
644 0.36
645 0.34
646 0.3
647 0.27
648 0.2
649 0.14
650 0.11
651 0.11
652 0.1
653 0.11
654 0.11
655 0.08
656 0.08
657 0.07
658 0.06
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.06
663 0.07
664 0.08
665 0.13
666 0.15
667 0.15
668 0.17
669 0.16
670 0.16
671 0.18
672 0.18
673 0.17
674 0.19
675 0.24
676 0.26
677 0.33
678 0.33
679 0.31
680 0.34
681 0.35
682 0.32
683 0.28
684 0.25
685 0.19
686 0.19
687 0.19
688 0.15
689 0.11
690 0.09
691 0.08
692 0.08
693 0.07
694 0.06
695 0.06
696 0.1
697 0.13
698 0.14
699 0.13
700 0.16
701 0.16
702 0.18
703 0.18
704 0.15
705 0.14
706 0.16
707 0.18
708 0.14
709 0.14
710 0.13
711 0.12
712 0.11
713 0.09
714 0.07
715 0.05
716 0.05
717 0.05
718 0.05
719 0.05
720 0.04
721 0.04
722 0.05
723 0.05
724 0.07
725 0.08
726 0.09
727 0.15
728 0.16
729 0.17
730 0.16
731 0.19
732 0.2
733 0.21
734 0.21
735 0.15
736 0.13
737 0.12
738 0.12
739 0.09
740 0.06
741 0.04
742 0.04
743 0.04
744 0.04
745 0.05
746 0.05
747 0.05
748 0.05
749 0.05
750 0.05
751 0.05
752 0.05
753 0.05
754 0.05
755 0.06
756 0.06
757 0.06
758 0.07
759 0.06
760 0.08
761 0.13
762 0.16
763 0.2
764 0.22
765 0.23
766 0.23
767 0.24
768 0.24
769 0.18
770 0.17
771 0.17
772 0.17
773 0.17
774 0.16
775 0.15
776 0.15
777 0.16
778 0.16
779 0.13
780 0.13
781 0.16
782 0.18
783 0.24
784 0.25
785 0.29
786 0.29
787 0.33
788 0.32
789 0.31
790 0.32
791 0.28
792 0.27
793 0.22
794 0.2
795 0.17
796 0.16
797 0.16
798 0.13
799 0.1
800 0.1
801 0.1
802 0.09
803 0.08
804 0.08
805 0.07
806 0.07
807 0.07
808 0.08
809 0.08
810 0.09
811 0.12
812 0.11
813 0.15
814 0.15
815 0.16
816 0.16
817 0.16
818 0.13
819 0.1
820 0.09
821 0.05
822 0.06
823 0.05
824 0.04
825 0.04
826 0.05
827 0.06
828 0.07
829 0.08
830 0.08
831 0.09
832 0.1
833 0.13
834 0.14
835 0.14
836 0.13
837 0.13
838 0.15
839 0.18
840 0.2
841 0.19
842 0.2
843 0.2
844 0.21
845 0.23
846 0.2
847 0.17
848 0.14
849 0.13
850 0.1
851 0.1
852 0.09
853 0.06
854 0.05
855 0.05
856 0.06
857 0.05
858 0.05
859 0.05
860 0.06
861 0.06
862 0.06
863 0.07
864 0.07
865 0.06
866 0.06
867 0.06
868 0.05
869 0.05
870 0.06
871 0.05
872 0.06
873 0.06
874 0.08
875 0.09
876 0.09
877 0.09
878 0.09
879 0.11
880 0.1
881 0.11
882 0.1
883 0.09
884 0.09
885 0.09
886 0.08
887 0.07
888 0.07
889 0.07
890 0.09
891 0.09
892 0.1
893 0.12
894 0.17
895 0.19
896 0.21
897 0.25
898 0.31
899 0.37
900 0.4
901 0.41
902 0.42
903 0.42
904 0.46
905 0.47
906 0.45
907 0.4
908 0.37
909 0.33
910 0.29
911 0.27
912 0.22
913 0.2
914 0.17
915 0.2
916 0.22
917 0.23
918 0.24
919 0.28
920 0.3
921 0.29
922 0.27
923 0.24
924 0.27
925 0.32
926 0.33
927 0.32
928 0.33
929 0.39
930 0.4
931 0.42
932 0.46
933 0.51
934 0.53
935 0.54
936 0.52
937 0.49
938 0.57
939 0.6
940 0.55
941 0.52
942 0.54
943 0.59
944 0.64
945 0.66
946 0.62
947 0.65
948 0.7
949 0.7
950 0.73
951 0.72
952 0.74
953 0.74
954 0.74
955 0.73
956 0.74
957 0.71
958 0.69
959 0.67
960 0.67
961 0.61
962 0.61
963 0.55
964 0.5
965 0.5
966 0.45
967 0.41
968 0.36
969 0.36
970 0.32
971 0.3
972 0.25
973 0.23
974 0.2
975 0.17
976 0.16
977 0.15
978 0.15
979 0.14
980 0.19
981 0.17
982 0.18
983 0.19
984 0.17
985 0.18
986 0.17
987 0.19
988 0.14
989 0.13
990 0.12
991 0.12
992 0.11
993 0.11
994 0.1
995 0.08
996 0.08
997 0.11
998 0.11
999 0.11
1000 0.11
1001 0.11
1002 0.12
1003 0.13
1004 0.14
1005 0.1
1006 0.11
1007 0.11
1008 0.11
1009 0.09
1010 0.09
1011 0.09
1012 0.09
1013 0.09
1014 0.09
1015 0.09
1016 0.12
1017 0.14
1018 0.15
1019 0.17
1020 0.17
1021 0.19
1022 0.19
1023 0.2
1024 0.17