Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GR61

Protein Details
Accession C5GR61    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-59EEIKKAYKKKALEHHPDRNYGNBasic
505-525DEPKQAKVGRAKLKRAKRAAAHydrophilic
564-584AQPVPATKSNNKQAKKKGAKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
510-524AKVGRAKLKRAKRAA
575-584KQAKKKGAKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR018253  DnaJ_domain_CS  
IPR036869  J_dom_sf  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00636  DNAJ_1  
PS50076  DNAJ_2  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
CDD cd06257  DnaJ  
Amino Acid Sequences MGQSQSSTAGGNSGAPANEERKTDYYELLGLGRTATEEEIKKAYKKKALEHHPDRNYGNVEASTAIFAEIQAAYEVLSDPQERAWYDSHRDAILAGHNGPAAAQYSHNIKMTTADDITQLIMKFNPRMDFSDAPSGFFGGLRETFEQLAEEEALACQWGDLEPVDYPSFGHKDDDYDSIRPFYSIWSGFATKKSFSWKDVYRYSEAPDRRVRRLMEKENKRLRDEGIREFNDAVRSLVAFVKKRDPRFKATVQNEAERQKSLRDAAAAQAARSRAANEAKLHNQQIPEWARSEETEEEMFSSSSESVIEQDYFECVVCRKTFKSEKQFDAHERSKKHIKAVKQLRWEMRAEDKHIQQLSTETRTGTSSSGSVQDSTQRSSSGATTTQENDEPIPSDAEDELEHTTKPTHEDDPDSISDHHSDLSESNINQAEAETQIQGPEEADDDNDTSDTNEDYAPRAVLENRFATDTTSENASLTMLTEDISKTSISATPMGTSNNDDDNDDEPKQAKVGRAKLKRAKRAAAAAAAAEEGRQGKTFTCAKCHSSFTSKTKLFNHIKELNHAQPVPATKSNNKQAKKKGAKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.17
4 0.2
5 0.23
6 0.23
7 0.27
8 0.28
9 0.33
10 0.33
11 0.31
12 0.3
13 0.28
14 0.28
15 0.24
16 0.21
17 0.16
18 0.14
19 0.12
20 0.11
21 0.1
22 0.1
23 0.15
24 0.16
25 0.19
26 0.25
27 0.28
28 0.34
29 0.41
30 0.47
31 0.49
32 0.53
33 0.59
34 0.64
35 0.71
36 0.76
37 0.78
38 0.8
39 0.8
40 0.8
41 0.73
42 0.68
43 0.61
44 0.51
45 0.44
46 0.33
47 0.28
48 0.22
49 0.22
50 0.16
51 0.13
52 0.12
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.11
68 0.14
69 0.14
70 0.17
71 0.2
72 0.22
73 0.28
74 0.32
75 0.34
76 0.31
77 0.3
78 0.27
79 0.26
80 0.26
81 0.22
82 0.18
83 0.16
84 0.16
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.11
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.15
93 0.19
94 0.21
95 0.21
96 0.19
97 0.22
98 0.22
99 0.24
100 0.2
101 0.17
102 0.16
103 0.16
104 0.17
105 0.16
106 0.15
107 0.12
108 0.13
109 0.15
110 0.16
111 0.19
112 0.22
113 0.21
114 0.25
115 0.3
116 0.31
117 0.32
118 0.4
119 0.36
120 0.35
121 0.33
122 0.29
123 0.23
124 0.21
125 0.18
126 0.1
127 0.11
128 0.12
129 0.14
130 0.15
131 0.15
132 0.14
133 0.15
134 0.12
135 0.12
136 0.1
137 0.09
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.13
155 0.15
156 0.14
157 0.16
158 0.13
159 0.16
160 0.18
161 0.23
162 0.22
163 0.23
164 0.23
165 0.23
166 0.22
167 0.2
168 0.18
169 0.14
170 0.16
171 0.15
172 0.15
173 0.17
174 0.2
175 0.21
176 0.25
177 0.26
178 0.21
179 0.23
180 0.29
181 0.28
182 0.28
183 0.34
184 0.35
185 0.4
186 0.45
187 0.47
188 0.42
189 0.41
190 0.42
191 0.42
192 0.39
193 0.38
194 0.41
195 0.41
196 0.42
197 0.46
198 0.45
199 0.46
200 0.54
201 0.58
202 0.6
203 0.65
204 0.71
205 0.75
206 0.77
207 0.7
208 0.63
209 0.55
210 0.54
211 0.49
212 0.47
213 0.46
214 0.43
215 0.42
216 0.41
217 0.4
218 0.32
219 0.28
220 0.2
221 0.12
222 0.1
223 0.1
224 0.12
225 0.14
226 0.15
227 0.16
228 0.25
229 0.3
230 0.37
231 0.44
232 0.46
233 0.5
234 0.54
235 0.59
236 0.59
237 0.58
238 0.6
239 0.54
240 0.53
241 0.5
242 0.47
243 0.42
244 0.33
245 0.3
246 0.22
247 0.21
248 0.19
249 0.16
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.18
254 0.17
255 0.15
256 0.16
257 0.15
258 0.15
259 0.14
260 0.14
261 0.12
262 0.14
263 0.17
264 0.17
265 0.21
266 0.24
267 0.28
268 0.28
269 0.26
270 0.25
271 0.22
272 0.28
273 0.27
274 0.24
275 0.21
276 0.21
277 0.19
278 0.19
279 0.21
280 0.14
281 0.13
282 0.12
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.08
288 0.08
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.08
304 0.09
305 0.12
306 0.12
307 0.2
308 0.28
309 0.36
310 0.46
311 0.5
312 0.54
313 0.55
314 0.58
315 0.55
316 0.55
317 0.54
318 0.49
319 0.44
320 0.45
321 0.5
322 0.48
323 0.51
324 0.47
325 0.46
326 0.5
327 0.59
328 0.61
329 0.6
330 0.65
331 0.61
332 0.6
333 0.56
334 0.48
335 0.46
336 0.42
337 0.39
338 0.38
339 0.36
340 0.38
341 0.38
342 0.35
343 0.26
344 0.28
345 0.26
346 0.24
347 0.24
348 0.18
349 0.18
350 0.19
351 0.19
352 0.16
353 0.12
354 0.09
355 0.1
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.17
361 0.18
362 0.2
363 0.2
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.18
368 0.14
369 0.15
370 0.13
371 0.15
372 0.16
373 0.18
374 0.18
375 0.17
376 0.16
377 0.14
378 0.15
379 0.13
380 0.13
381 0.1
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.14
394 0.16
395 0.17
396 0.18
397 0.22
398 0.23
399 0.27
400 0.27
401 0.27
402 0.24
403 0.22
404 0.22
405 0.18
406 0.17
407 0.12
408 0.12
409 0.1
410 0.13
411 0.15
412 0.14
413 0.17
414 0.18
415 0.17
416 0.17
417 0.16
418 0.13
419 0.11
420 0.12
421 0.1
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.11
443 0.12
444 0.11
445 0.11
446 0.13
447 0.15
448 0.17
449 0.21
450 0.21
451 0.21
452 0.22
453 0.22
454 0.21
455 0.2
456 0.18
457 0.16
458 0.16
459 0.16
460 0.14
461 0.14
462 0.13
463 0.11
464 0.1
465 0.09
466 0.06
467 0.06
468 0.07
469 0.07
470 0.08
471 0.09
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.12
476 0.13
477 0.15
478 0.15
479 0.16
480 0.17
481 0.19
482 0.19
483 0.19
484 0.19
485 0.21
486 0.21
487 0.2
488 0.2
489 0.22
490 0.25
491 0.24
492 0.23
493 0.2
494 0.2
495 0.22
496 0.23
497 0.26
498 0.3
499 0.38
500 0.46
501 0.54
502 0.64
503 0.71
504 0.78
505 0.82
506 0.81
507 0.78
508 0.74
509 0.73
510 0.68
511 0.62
512 0.53
513 0.44
514 0.36
515 0.3
516 0.24
517 0.16
518 0.13
519 0.1
520 0.11
521 0.11
522 0.11
523 0.12
524 0.19
525 0.26
526 0.26
527 0.33
528 0.37
529 0.42
530 0.45
531 0.49
532 0.49
533 0.5
534 0.56
535 0.54
536 0.6
537 0.58
538 0.6
539 0.6
540 0.65
541 0.65
542 0.62
543 0.65
544 0.62
545 0.61
546 0.62
547 0.65
548 0.6
549 0.59
550 0.53
551 0.45
552 0.42
553 0.45
554 0.44
555 0.42
556 0.43
557 0.43
558 0.52
559 0.62
560 0.67
561 0.69
562 0.71
563 0.76
564 0.81