Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GHC9

Protein Details
Accession C5GHC9    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
368-399ISPEERRRQEQLPRNPKKRMHEEPIKEEKRKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-124RRK
380-398PRNPKKRMHEEPIKEEKRK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 6, cyto 4, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005606  Sec20  
IPR010989  SNARE  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005484  F:SNAP receptor activity  
GO:0006890  P:retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum  
Pfam View protein in Pfam  
PF03908  Sec20  
Amino Acid Sequences MISPGLQTRITSLSTTHKQTIPLIQRLQNLPATPGTGDDARLDLAAEIHLRLKEMEEQMELLRVELEQLESSRNRKRESGVMEAERERVVVVVGKLEEDLKSARIQFRKAQLQAKRNAEAARRKERQLLFARAEGGEGGSEGMRRKGRAGLTHDDLVASAAEDITAALRRTHQLMQAELSRSQFAQETLEQSTAALSSLSESYSTLDTLLASSRSLAISLLRSQKSDTWYLETAFYILIGTIIWLVFRRILYGPLWWLLWMPLKLMVRMIFPILGGIGLANKSSQIPGSPLTSLSLSNSGASVLSETPSAVINGATLKSASASSSLSSVDAEQTGTPQAENESILGEVENIVKKGSDNHEKGTNVDDISPEERRRQEQLPRNPKKRMHEEPIKEEKRKDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.38
3 0.4
4 0.4
5 0.41
6 0.44
7 0.51
8 0.5
9 0.52
10 0.52
11 0.52
12 0.56
13 0.56
14 0.57
15 0.51
16 0.43
17 0.38
18 0.32
19 0.29
20 0.23
21 0.21
22 0.2
23 0.17
24 0.17
25 0.15
26 0.15
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.12
36 0.12
37 0.13
38 0.13
39 0.15
40 0.2
41 0.21
42 0.23
43 0.2
44 0.21
45 0.21
46 0.25
47 0.22
48 0.16
49 0.14
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.11
54 0.09
55 0.09
56 0.14
57 0.17
58 0.23
59 0.3
60 0.34
61 0.36
62 0.38
63 0.41
64 0.44
65 0.47
66 0.5
67 0.5
68 0.48
69 0.5
70 0.48
71 0.46
72 0.38
73 0.32
74 0.23
75 0.16
76 0.12
77 0.11
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.12
87 0.1
88 0.12
89 0.16
90 0.22
91 0.24
92 0.28
93 0.32
94 0.4
95 0.47
96 0.5
97 0.55
98 0.56
99 0.61
100 0.66
101 0.66
102 0.6
103 0.55
104 0.53
105 0.52
106 0.53
107 0.53
108 0.55
109 0.54
110 0.54
111 0.59
112 0.56
113 0.58
114 0.57
115 0.56
116 0.48
117 0.45
118 0.45
119 0.37
120 0.35
121 0.26
122 0.18
123 0.1
124 0.08
125 0.06
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.15
133 0.2
134 0.22
135 0.27
136 0.32
137 0.33
138 0.36
139 0.36
140 0.35
141 0.3
142 0.27
143 0.21
144 0.15
145 0.09
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.04
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.08
156 0.09
157 0.12
158 0.14
159 0.17
160 0.17
161 0.17
162 0.19
163 0.22
164 0.23
165 0.21
166 0.21
167 0.18
168 0.16
169 0.16
170 0.14
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.11
179 0.11
180 0.08
181 0.07
182 0.05
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.12
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.2
211 0.23
212 0.25
213 0.27
214 0.24
215 0.22
216 0.22
217 0.23
218 0.22
219 0.19
220 0.17
221 0.13
222 0.11
223 0.07
224 0.05
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.09
236 0.09
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.13
242 0.13
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.14
247 0.12
248 0.12
249 0.15
250 0.16
251 0.16
252 0.18
253 0.17
254 0.14
255 0.15
256 0.15
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.07
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.09
274 0.1
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.13
282 0.14
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.1
319 0.09
320 0.1
321 0.12
322 0.12
323 0.11
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.12
328 0.11
329 0.1
330 0.09
331 0.1
332 0.09
333 0.08
334 0.07
335 0.11
336 0.13
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.19
342 0.26
343 0.33
344 0.34
345 0.38
346 0.45
347 0.46
348 0.47
349 0.44
350 0.39
351 0.3
352 0.28
353 0.25
354 0.22
355 0.25
356 0.31
357 0.3
358 0.34
359 0.38
360 0.41
361 0.46
362 0.49
363 0.55
364 0.59
365 0.67
366 0.71
367 0.77
368 0.82
369 0.85
370 0.85
371 0.85
372 0.85
373 0.84
374 0.83
375 0.83
376 0.83
377 0.84
378 0.87
379 0.86
380 0.82
381 0.76