Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GA83

Protein Details
Accession C5GA83    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-31IPTSQDPRSKRPLKRRALTPVSEHydrophilic
118-152EEARRKDEERTEKNRRKREKKKKAKEKKGAAAPSABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-149ARRKDEERTEKNRRKREKKKKAKEKKGAAA
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSEPIPESIPTSQDPRSKRPLKRRALTPVSEQATQIQSLFKDPSKDIHIPAPSKPRTSASLAPPPEIVANVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLKLMEHELKMEQADEMFERRMEEARRKDEERTEKNRRKREKKKKAKEKKGAAAPSAAGPDAEMPRERNGERNANGGADGNENKVSGTENATDGPREELGVIIHDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.42
3 0.51
4 0.57
5 0.65
6 0.71
7 0.75
8 0.8
9 0.83
10 0.85
11 0.84
12 0.83
13 0.77
14 0.73
15 0.72
16 0.65
17 0.57
18 0.49
19 0.42
20 0.35
21 0.32
22 0.25
23 0.19
24 0.15
25 0.17
26 0.2
27 0.18
28 0.2
29 0.2
30 0.24
31 0.29
32 0.3
33 0.29
34 0.32
35 0.36
36 0.35
37 0.39
38 0.45
39 0.41
40 0.41
41 0.41
42 0.38
43 0.35
44 0.39
45 0.4
46 0.37
47 0.43
48 0.41
49 0.4
50 0.38
51 0.34
52 0.29
53 0.23
54 0.17
55 0.1
56 0.1
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.04
64 0.03
65 0.03
66 0.04
67 0.04
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.07
72 0.07
73 0.12
74 0.19
75 0.26
76 0.31
77 0.35
78 0.41
79 0.5
80 0.57
81 0.61
82 0.61
83 0.56
84 0.51
85 0.49
86 0.47
87 0.42
88 0.35
89 0.28
90 0.2
91 0.18
92 0.17
93 0.15
94 0.11
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.12
104 0.14
105 0.22
106 0.27
107 0.33
108 0.38
109 0.39
110 0.41
111 0.46
112 0.53
113 0.54
114 0.57
115 0.62
116 0.66
117 0.74
118 0.81
119 0.83
120 0.85
121 0.87
122 0.89
123 0.89
124 0.92
125 0.94
126 0.96
127 0.96
128 0.96
129 0.96
130 0.94
131 0.92
132 0.89
133 0.83
134 0.73
135 0.63
136 0.52
137 0.44
138 0.35
139 0.25
140 0.16
141 0.11
142 0.13
143 0.12
144 0.14
145 0.14
146 0.15
147 0.18
148 0.23
149 0.24
150 0.28
151 0.33
152 0.39
153 0.38
154 0.4
155 0.38
156 0.34
157 0.34
158 0.28
159 0.23
160 0.19
161 0.19
162 0.18
163 0.17
164 0.17
165 0.16
166 0.15
167 0.16
168 0.13
169 0.16
170 0.15
171 0.15
172 0.18
173 0.19
174 0.2
175 0.18
176 0.2
177 0.16
178 0.15
179 0.14
180 0.13
181 0.12
182 0.14