Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GS09

Protein Details
Accession C5GS09    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-65QTSSGAKKRTIKAKSRLEKLRKLTSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-61KKRTIKAKSRLEKLRK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito_nucl 11.333, mito 7, cyto_mito 6.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011907  RNase_III  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00636  Ribonuclease_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences MDTKRKLELESSGGITVGKAVKRRKTLPDPEPDNVSTSSQTSSGAKKRTIKAKSRLEKLRKLTSKLLSRPEQVQELLDGSEPDVVVALAELDKALSPKNSAPESLYYSQSSRDRLHSSSLQLHAQKKLPPLPLVLDKQLHTAMLTHEGIHNPNTASLSEKNYERMELLGDAYIEIMATRLVWDTFPRLPAGRLSQIRELLVKNETLAEYTTLYGLDQKLMVPPEIRNQAKTWTKVKGDLFEAYVAAVILSNRDNGVQLVEDWLTQLWIPKLEQIEKEKPVLRYKEELAKLIMDKGIRLSYLDEKKAINHPGGLQTFFIGVYLTGWGHKKECLGSGMGLSKVIAGNEAARKALENPITQQAAAAKQAYHAAKSKDKVAAGHPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.21
3 0.2
4 0.2
5 0.2
6 0.24
7 0.32
8 0.4
9 0.48
10 0.55
11 0.61
12 0.67
13 0.74
14 0.75
15 0.78
16 0.78
17 0.73
18 0.73
19 0.64
20 0.57
21 0.48
22 0.42
23 0.32
24 0.26
25 0.24
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.25
30 0.31
31 0.35
32 0.4
33 0.47
34 0.54
35 0.62
36 0.68
37 0.7
38 0.73
39 0.78
40 0.81
41 0.82
42 0.85
43 0.85
44 0.84
45 0.82
46 0.83
47 0.79
48 0.75
49 0.74
50 0.72
51 0.72
52 0.7
53 0.71
54 0.65
55 0.62
56 0.61
57 0.57
58 0.51
59 0.43
60 0.37
61 0.29
62 0.25
63 0.22
64 0.17
65 0.13
66 0.1
67 0.11
68 0.1
69 0.08
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.05
81 0.07
82 0.07
83 0.1
84 0.13
85 0.19
86 0.19
87 0.2
88 0.22
89 0.23
90 0.29
91 0.29
92 0.29
93 0.25
94 0.25
95 0.29
96 0.3
97 0.31
98 0.27
99 0.29
100 0.31
101 0.3
102 0.35
103 0.33
104 0.34
105 0.35
106 0.36
107 0.36
108 0.37
109 0.39
110 0.38
111 0.38
112 0.38
113 0.37
114 0.41
115 0.39
116 0.35
117 0.33
118 0.33
119 0.35
120 0.34
121 0.33
122 0.29
123 0.26
124 0.27
125 0.26
126 0.22
127 0.16
128 0.14
129 0.11
130 0.14
131 0.13
132 0.12
133 0.13
134 0.14
135 0.15
136 0.15
137 0.15
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.11
142 0.13
143 0.14
144 0.17
145 0.18
146 0.18
147 0.21
148 0.2
149 0.21
150 0.17
151 0.15
152 0.13
153 0.11
154 0.1
155 0.08
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.08
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.14
177 0.16
178 0.19
179 0.2
180 0.22
181 0.24
182 0.25
183 0.25
184 0.25
185 0.22
186 0.18
187 0.16
188 0.13
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.08
193 0.09
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.16
211 0.24
212 0.24
213 0.24
214 0.24
215 0.31
216 0.35
217 0.39
218 0.37
219 0.35
220 0.36
221 0.4
222 0.41
223 0.36
224 0.34
225 0.3
226 0.28
227 0.22
228 0.2
229 0.14
230 0.13
231 0.09
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.07
244 0.06
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.1
253 0.08
254 0.1
255 0.1
256 0.13
257 0.17
258 0.2
259 0.24
260 0.29
261 0.35
262 0.36
263 0.41
264 0.42
265 0.43
266 0.48
267 0.48
268 0.44
269 0.42
270 0.43
271 0.48
272 0.45
273 0.42
274 0.36
275 0.34
276 0.31
277 0.28
278 0.27
279 0.18
280 0.16
281 0.16
282 0.16
283 0.13
284 0.13
285 0.15
286 0.21
287 0.28
288 0.29
289 0.29
290 0.29
291 0.32
292 0.38
293 0.38
294 0.31
295 0.26
296 0.27
297 0.32
298 0.34
299 0.31
300 0.25
301 0.22
302 0.21
303 0.18
304 0.16
305 0.09
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.1
311 0.12
312 0.14
313 0.15
314 0.17
315 0.19
316 0.2
317 0.23
318 0.22
319 0.22
320 0.21
321 0.23
322 0.25
323 0.22
324 0.2
325 0.17
326 0.16
327 0.15
328 0.14
329 0.11
330 0.09
331 0.14
332 0.18
333 0.19
334 0.18
335 0.17
336 0.19
337 0.2
338 0.27
339 0.27
340 0.25
341 0.28
342 0.35
343 0.36
344 0.35
345 0.34
346 0.3
347 0.28
348 0.29
349 0.26
350 0.19
351 0.19
352 0.27
353 0.27
354 0.27
355 0.3
356 0.34
357 0.4
358 0.43
359 0.47
360 0.46
361 0.46
362 0.45