FuNGI

C5GKF2

Protein Details

Accession

C5GKF2

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1120-1139	EAAKKEKPTFQKLRCAWRNG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
239-278	GSKGGPRKKAGGSEVAADAAIAKKKSSESGKSKEEGSRKP
365-375	RRGGRPSRGGR
592-596	PERGR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006607 DM15 IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd07323 LAM

Amino Acid Sequences

MSTSTSRPGLEMPAFSYAQAAKGFSTPPSVQIVAEKQNKSSTTSSDPSSHRTATGSVDGDGSNRTVASSTDLESSSVATEPADATDKSQSSSERSSDWTVTPPAAGAPWKTATSGTSSPSVGTTSTTTLPKEDDTSGTPNGIPDSSWDKQSQVSGTVEKSSESGESGKEKLKENGWEKDVPVLKELKAAPIPAVNVWQQRREAQEAKAKASAALKSTTTAAAKPFNSKSSVPSENRAEGSKGGPRKKAGGSEVAADAAIAKKKSSESGKSKEEGSRKPGVRSSISTNIDIETAETLPPVGDASSWPTPQLAQGEEFRKAQEKSDKTEKSEKEKAPTAGSRGKEKWMPVPYVPTAVFNTPLPPAARRGGRPSRGGREGGMRSGAHPSAAISSSDRSVPASASAAGGSKQTGSSDRGRSGTRVDSDQSGTTQPARTGSVNAPLSPDEKKAPHDSRPDRASSDSKSVKAPEEPRGTTGGETQTNHPAAETGPRQRQNSKSFGRSHDYSNVTSQRGTEHTGRHAGVQGDSHAGTRFSSGHERRFDNGPRSAEFYKEPPFHPRDRELSNQREREYPRERNDFHRDREYGRERGESRPERGRGGYRGRGGHSNYSGAHNSQYHSPPVGQSQFQSTKPFSLSERHRSHHQASQNGGQQHGSNRGLNMRSPSLPSSGVYGPTPYPIQTDLNAMYGYPVLHQGPMTAIPYHPYMEHSLMSMISMQLEYYFSVDNLCKDLFLRKHMDSQGFVLLSFIAGFKRIKSLTEDMDFLRLVCRQLKSVEYRPGEDGNDRLRKREKWEQWILAMENRDPSAQNEGPPPLSLSTPAHDGNSDGLNSSHLETTALYGNGSLHEISGNAIPSHYSLSNGATSDTRVHQSVLSSAAPEFSPAYVPVTGQNENANVGKPIKDESTFPDEQIENLVIVVRKPGISSPAQSPFLIPSSCSFSSGSVDGYKAAGGTVSTEKRPSLSTRTAQINITSVADGQRRGRSPPSSMSKNSETAAIANTPTFWVKDRDTPIESLPTDLLHESYNVFRKKTLDKRSSGITSDGNLDMDVLYQFWSHFLVRNFNSKMYNEFRSLAFDDLHLNNSTTGLNSIIKFYDGVLASNRPMPDTVSRDLVQLVESELEAAKKEKPTFQKLRCAWRNGAFNFKNRKRIDRIISERLRAELDK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.25
3	0.27
4	0.21
5	0.21
6	0.21
7	0.2
8	0.16
9	0.18
10	0.19
11	0.17
12	0.24
13	0.21
14	0.22
15	0.27
16	0.26
17	0.25
18	0.29
19	0.34
20	0.36
21	0.45
22	0.43
23	0.4
24	0.46
25	0.47
26	0.46
27	0.43
28	0.39
29	0.39
30	0.41
31	0.42
32	0.43
33	0.45
34	0.45
35	0.48
36	0.44
37	0.37
38	0.35
39	0.33
40	0.3
41	0.33
42	0.29
43	0.24
44	0.24
45	0.23
46	0.22
47	0.21
48	0.18
49	0.13
50	0.11
51	0.11
52	0.1
53	0.1
54	0.14
55	0.15
56	0.15
57	0.18
58	0.19
59	0.19
60	0.18
61	0.19
62	0.15
63	0.13
64	0.12
65	0.08
66	0.09
67	0.09
68	0.11
69	0.13
70	0.12
71	0.14
72	0.21
73	0.21
74	0.22
75	0.24
76	0.25
77	0.27
78	0.32
79	0.32
80	0.27
81	0.31
82	0.34
83	0.34
84	0.34
85	0.32
86	0.3
87	0.28
88	0.26
89	0.22
90	0.18
91	0.17
92	0.18
93	0.15
94	0.17
95	0.19
96	0.2
97	0.2
98	0.2
99	0.19
100	0.23
101	0.24
102	0.22
103	0.22
104	0.22
105	0.22
106	0.22
107	0.22
108	0.16
109	0.15
110	0.15
111	0.15
112	0.18
113	0.2
114	0.2
115	0.21
116	0.23
117	0.22
118	0.24
119	0.23
120	0.22
121	0.23
122	0.27
123	0.26
124	0.26
125	0.24
126	0.22
127	0.22
128	0.19
129	0.15
130	0.14
131	0.21
132	0.21
133	0.25
134	0.25
135	0.24
136	0.26
137	0.3
138	0.27
139	0.24
140	0.25
141	0.25
142	0.25
143	0.27
144	0.26
145	0.22
146	0.21
147	0.18
148	0.16
149	0.14
150	0.14
151	0.14
152	0.17
153	0.2
154	0.25
155	0.27
156	0.3
157	0.33
158	0.36
159	0.42
160	0.45
161	0.5
162	0.49
163	0.48
164	0.45
165	0.49
166	0.49
167	0.41
168	0.38
169	0.33
170	0.29
171	0.32
172	0.32
173	0.3
174	0.26
175	0.26
176	0.24
177	0.23
178	0.24
179	0.19
180	0.22
181	0.21
182	0.26
183	0.29
184	0.32
185	0.32
186	0.34
187	0.39
188	0.43
189	0.42
190	0.41
191	0.47
192	0.46
193	0.47
194	0.46
195	0.41
196	0.37
197	0.36
198	0.32
199	0.26
200	0.25
201	0.22
202	0.21
203	0.22
204	0.22
205	0.19
206	0.19
207	0.19
208	0.23
209	0.24
210	0.29
211	0.31
212	0.3
213	0.33
214	0.32
215	0.33
216	0.35
217	0.42
218	0.38
219	0.42
220	0.44
221	0.44
222	0.45
223	0.42
224	0.37
225	0.3
226	0.3
227	0.31
228	0.34
229	0.36
230	0.39
231	0.39
232	0.43
233	0.45
234	0.47
235	0.43
236	0.42
237	0.37
238	0.35
239	0.33
240	0.28
241	0.24
242	0.18
243	0.16
244	0.12
245	0.14
246	0.12
247	0.11
248	0.13
249	0.14
250	0.2
251	0.26
252	0.33
253	0.38
254	0.45
255	0.51
256	0.51
257	0.54
258	0.54
259	0.55
260	0.52
261	0.49
262	0.51
263	0.49
264	0.51
265	0.51
266	0.5
267	0.46
268	0.44
269	0.44
270	0.44
271	0.44
272	0.41
273	0.37
274	0.33
275	0.29
276	0.25
277	0.19
278	0.11
279	0.09
280	0.08
281	0.08
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.06
286	0.05
287	0.04
288	0.05
289	0.11
290	0.15
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.15
295	0.18
296	0.19
297	0.15
298	0.14
299	0.19
300	0.22
301	0.25
302	0.25
303	0.24
304	0.27
305	0.26
306	0.3
307	0.34
308	0.34
309	0.38
310	0.48
311	0.5
312	0.51
313	0.6
314	0.59
315	0.58
316	0.64
317	0.61
318	0.56
319	0.59
320	0.56
321	0.52
322	0.5
323	0.47
324	0.44
325	0.42
326	0.44
327	0.39
328	0.41
329	0.38
330	0.37
331	0.39
332	0.37
333	0.39
334	0.33
335	0.37
336	0.33
337	0.34
338	0.32
339	0.27
340	0.24
341	0.21
342	0.21
343	0.16
344	0.17
345	0.13
346	0.16
347	0.15
348	0.14
349	0.17
350	0.21
351	0.24
352	0.25
353	0.34
354	0.39
355	0.43
356	0.49
357	0.52
358	0.54
359	0.54
360	0.52
361	0.45
362	0.44
363	0.4
364	0.35
365	0.32
366	0.25
367	0.22
368	0.25
369	0.23
370	0.16
371	0.14
372	0.13
373	0.11
374	0.12
375	0.12
376	0.09
377	0.11
378	0.11
379	0.12
380	0.12
381	0.11
382	0.1
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.09
388	0.09
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.07
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.09
397	0.13
398	0.18
399	0.22
400	0.24
401	0.26
402	0.27
403	0.27
404	0.28
405	0.29
406	0.25
407	0.23
408	0.22
409	0.22
410	0.23
411	0.22
412	0.2
413	0.17
414	0.16
415	0.16
416	0.15
417	0.14
418	0.14
419	0.15
420	0.15
421	0.17
422	0.17
423	0.23
424	0.22
425	0.22
426	0.22
427	0.2
428	0.21
429	0.2
430	0.2
431	0.16
432	0.16
433	0.2
434	0.27
435	0.3
436	0.35
437	0.44
438	0.46
439	0.51
440	0.53
441	0.51
442	0.44
443	0.45
444	0.42
445	0.35
446	0.39
447	0.34
448	0.32
449	0.32
450	0.32
451	0.3
452	0.32
453	0.33
454	0.32
455	0.36
456	0.35
457	0.34
458	0.35
459	0.33
460	0.28
461	0.27
462	0.22
463	0.19
464	0.19
465	0.2
466	0.23
467	0.23
468	0.23
469	0.2
470	0.16
471	0.14
472	0.19
473	0.2
474	0.21
475	0.28
476	0.32
477	0.35
478	0.4
479	0.47
480	0.47
481	0.52
482	0.5
483	0.5
484	0.5
485	0.52
486	0.52
487	0.47
488	0.44
489	0.43
490	0.41
491	0.36
492	0.37
493	0.36
494	0.3
495	0.29
496	0.26
497	0.2
498	0.19
499	0.21
500	0.2
501	0.18
502	0.2
503	0.23
504	0.23
505	0.22
506	0.23
507	0.2
508	0.17
509	0.15
510	0.13
511	0.11
512	0.11
513	0.11
514	0.09
515	0.08
516	0.08
517	0.09
518	0.08
519	0.09
520	0.18
521	0.2
522	0.26
523	0.3
524	0.32
525	0.33
526	0.39
527	0.41
528	0.37
529	0.39
530	0.35
531	0.32
532	0.35
533	0.33
534	0.29
535	0.26
536	0.24
537	0.26
538	0.26
539	0.26
540	0.28
541	0.32
542	0.34
543	0.37
544	0.38
545	0.35
546	0.37
547	0.44
548	0.44
549	0.49
550	0.54
551	0.53
552	0.51
553	0.52
554	0.5
555	0.51
556	0.51
557	0.5
558	0.49
559	0.53
560	0.54
561	0.55
562	0.63
563	0.6
564	0.56
565	0.55
566	0.49
567	0.43
568	0.51
569	0.48
570	0.42
571	0.38
572	0.39
573	0.35
574	0.38
575	0.45
576	0.39
577	0.39
578	0.42
579	0.42
580	0.38
581	0.38
582	0.37
583	0.34
584	0.37
585	0.38
586	0.34
587	0.35
588	0.35
589	0.37
590	0.36
591	0.33
592	0.28
593	0.25
594	0.22
595	0.22
596	0.21
597	0.17
598	0.18
599	0.15
600	0.15
601	0.17
602	0.18
603	0.16
604	0.16
605	0.16
606	0.15
607	0.18
608	0.19
609	0.15
610	0.14
611	0.2
612	0.23
613	0.24
614	0.26
615	0.23
616	0.23
617	0.23
618	0.24
619	0.19
620	0.23
621	0.28
622	0.34
623	0.39
624	0.39
625	0.43
626	0.47
627	0.49
628	0.47
629	0.46
630	0.4
631	0.38
632	0.42
633	0.42
634	0.37
635	0.34
636	0.29
637	0.25
638	0.23
639	0.26
640	0.22
641	0.17
642	0.17
643	0.21
644	0.21
645	0.21
646	0.22
647	0.18
648	0.17
649	0.19
650	0.19
651	0.17
652	0.17
653	0.16
654	0.17
655	0.15
656	0.15
657	0.14
658	0.14
659	0.12
660	0.13
661	0.13
662	0.1
663	0.1
664	0.11
665	0.12
666	0.11
667	0.14
668	0.13
669	0.13
670	0.13
671	0.12
672	0.1
673	0.09
674	0.09
675	0.07
676	0.08
677	0.07
678	0.07
679	0.07
680	0.07
681	0.08
682	0.09
683	0.1
684	0.09
685	0.08
686	0.1
687	0.11
688	0.11
689	0.11
690	0.11
691	0.12
692	0.13
693	0.14
694	0.12
695	0.12
696	0.11
697	0.11
698	0.1
699	0.07
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.04
704	0.05
705	0.05
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.08
710	0.08
711	0.09
712	0.11
713	0.1
714	0.09
715	0.1
716	0.17
717	0.17
718	0.21
719	0.25
720	0.25
721	0.31
722	0.35
723	0.36
724	0.3
725	0.3
726	0.29
727	0.23
728	0.22
729	0.16
730	0.12
731	0.1
732	0.09
733	0.07
734	0.04
735	0.06
736	0.07
737	0.07
738	0.12
739	0.12
740	0.13
741	0.18
742	0.21
743	0.23
744	0.24
745	0.26
746	0.22
747	0.24
748	0.22
749	0.17
750	0.16
751	0.13
752	0.13
753	0.16
754	0.16
755	0.16
756	0.18
757	0.22
758	0.27
759	0.33
760	0.4
761	0.37
762	0.38
763	0.39
764	0.39
765	0.36
766	0.31
767	0.28
768	0.28
769	0.35
770	0.33
771	0.36
772	0.4
773	0.42
774	0.48
775	0.55
776	0.55
777	0.55
778	0.63
779	0.61
780	0.57
781	0.58
782	0.51
783	0.44
784	0.38
785	0.29
786	0.22
787	0.2
788	0.19
789	0.16
790	0.16
791	0.2
792	0.2
793	0.21
794	0.22
795	0.23
796	0.23
797	0.23
798	0.23
799	0.16
800	0.15
801	0.15
802	0.14
803	0.14
804	0.17
805	0.17
806	0.16
807	0.15
808	0.15
809	0.15
810	0.15
811	0.13
812	0.1
813	0.1
814	0.1
815	0.11
816	0.12
817	0.1
818	0.09
819	0.09
820	0.08
821	0.1
822	0.12
823	0.11
824	0.1
825	0.1
826	0.1
827	0.1
828	0.11
829	0.09
830	0.06
831	0.06
832	0.06
833	0.07
834	0.09
835	0.09
836	0.08
837	0.08
838	0.09
839	0.09
840	0.12
841	0.11
842	0.11
843	0.1
844	0.12
845	0.14
846	0.14
847	0.14
848	0.12
849	0.13
850	0.15
851	0.16
852	0.16
853	0.16
854	0.16
855	0.16
856	0.16
857	0.16
858	0.17
859	0.15
860	0.13
861	0.13
862	0.13
863	0.12
864	0.12
865	0.11
866	0.08
867	0.09
868	0.09
869	0.11
870	0.11
871	0.11
872	0.14
873	0.18
874	0.19
875	0.18
876	0.2
877	0.18
878	0.2
879	0.2
880	0.17
881	0.15
882	0.15
883	0.16
884	0.15
885	0.17
886	0.17
887	0.17
888	0.18
889	0.22
890	0.29
891	0.28
892	0.27
893	0.29
894	0.27
895	0.26
896	0.27
897	0.21
898	0.13
899	0.12
900	0.14
901	0.1
902	0.1
903	0.12
904	0.1
905	0.1
906	0.1
907	0.12
908	0.14
909	0.15
910	0.19
911	0.23
912	0.29
913	0.31
914	0.3
915	0.3
916	0.28
917	0.29
918	0.27
919	0.21
920	0.16
921	0.22
922	0.22
923	0.23
924	0.21
925	0.18
926	0.21
927	0.21
928	0.21
929	0.15
930	0.15
931	0.14
932	0.13
933	0.12
934	0.1
935	0.09
936	0.07
937	0.05
938	0.08
939	0.14
940	0.16
941	0.18
942	0.2
943	0.2
944	0.22
945	0.25
946	0.26
947	0.28
948	0.32
949	0.35
950	0.39
951	0.46
952	0.47
953	0.45
954	0.42
955	0.37
956	0.3
957	0.28
958	0.21
959	0.16
960	0.18
961	0.19
962	0.2
963	0.22
964	0.28
965	0.28
966	0.32
967	0.38
968	0.37
969	0.4
970	0.46
971	0.51
972	0.51
973	0.53
974	0.56
975	0.54
976	0.53
977	0.48
978	0.42
979	0.33
980	0.27
981	0.26
982	0.2
983	0.17
984	0.14
985	0.14
986	0.13
987	0.14
988	0.14
989	0.14
990	0.17
991	0.19
992	0.27
993	0.33
994	0.37
995	0.39
996	0.4
997	0.4
998	0.42
999	0.39
1000	0.34
1001	0.28
1002	0.23
1003	0.21
1004	0.2
1005	0.18
1006	0.12
1007	0.12
1008	0.12
1009	0.17
1010	0.25
1011	0.27
1012	0.27
1013	0.29
1014	0.33
1015	0.42
1016	0.51
1017	0.56
1018	0.56
1019	0.57
1020	0.6
1021	0.65
1022	0.64
1023	0.56
1024	0.5
1025	0.41
1026	0.34
1027	0.34
1028	0.31
1029	0.24
1030	0.19
1031	0.17
1032	0.13
1033	0.12
1034	0.11
1035	0.07
1036	0.07
1037	0.07
1038	0.07
1039	0.08
1040	0.1
1041	0.1
1042	0.15
1043	0.18
1044	0.26
1045	0.28
1046	0.38
1047	0.39
1048	0.41
1049	0.44
1050	0.4
1051	0.44
1052	0.41
1053	0.43
1054	0.38
1055	0.37
1056	0.34
1057	0.36
1058	0.36
1059	0.31
1060	0.26
1061	0.22
1062	0.24
1063	0.24
1064	0.26
1065	0.22
1066	0.21
1067	0.19
1068	0.19
1069	0.19
1070	0.14
1071	0.14
1072	0.13
1073	0.15
1074	0.15
1075	0.17
1076	0.16
1077	0.17
1078	0.16
1079	0.15
1080	0.19
1081	0.16
1082	0.17
1083	0.19
1084	0.21
1085	0.22
1086	0.26
1087	0.26
1088	0.21
1089	0.21
1090	0.23
1091	0.27
1092	0.3
1093	0.31
1094	0.33
1095	0.33
1096	0.33
1097	0.33
1098	0.3
1099	0.23
1100	0.18
1101	0.16
1102	0.11
1103	0.1
1104	0.11
1105	0.11
1106	0.11
1107	0.12
1108	0.13
1109	0.17
1110	0.23
1111	0.26
1112	0.33
1113	0.41
1114	0.51
1115	0.6
1116	0.66
1117	0.71
1118	0.72
1119	0.8
1120	0.8
1121	0.78
1122	0.75
1123	0.73
1124	0.75
1125	0.68
1126	0.72
1127	0.65
1128	0.66
1129	0.7
1130	0.7
1131	0.72
1132	0.67
1133	0.72
1134	0.7
1135	0.75
1136	0.75
1137	0.75
1138	0.77
1139	0.78
1140	0.8
1141	0.76
1142	0.69
1143	0.62

C5GKF2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer