Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GKA0

Protein Details
Accession C5GKA0    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSSMRNAVQRRPHRERAQISSREHydrophilic
38-63ARDYNVKKAKLQRLREKARDRNPDEFHydrophilic
203-224LAARRLKKRATEVRRKKVEALRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
198-220ARREMLAARRLKKRATEVRRKKV
257-265KWKIRERKK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSMRNAVQRRPHRERAQISSREKWGILEKHKDYSLRARDYNVKKAKLQRLREKARDRNPDEFAFGMMSEKSNKQGRHGARGSETSTLSHEAIKLLKTQDAGYLRVVGEKVRRQLEGVEQEVRLQDGMNGVLQGDTGRKIVFADSLEEQRRLWIERGDMEDENGDSDEGRSEKGEASFGEKQKQAQKSKKQIEAEEWARREMLAARRLKKRATEVRRKKVEALRVQHKELVAAEQELDRQRAKMENSVGGVNKYGIKWKIRERKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.81
3 0.8
4 0.8
5 0.8
6 0.78
7 0.74
8 0.71
9 0.64
10 0.57
11 0.5
12 0.49
13 0.48
14 0.49
15 0.52
16 0.5
17 0.52
18 0.55
19 0.54
20 0.49
21 0.51
22 0.52
23 0.49
24 0.48
25 0.47
26 0.54
27 0.59
28 0.65
29 0.63
30 0.58
31 0.57
32 0.65
33 0.71
34 0.7
35 0.74
36 0.74
37 0.76
38 0.82
39 0.86
40 0.86
41 0.86
42 0.87
43 0.87
44 0.82
45 0.79
46 0.74
47 0.65
48 0.58
49 0.48
50 0.39
51 0.28
52 0.22
53 0.17
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.17
59 0.23
60 0.23
61 0.26
62 0.35
63 0.37
64 0.44
65 0.45
66 0.43
67 0.4
68 0.42
69 0.4
70 0.34
71 0.31
72 0.22
73 0.21
74 0.21
75 0.18
76 0.16
77 0.14
78 0.13
79 0.14
80 0.13
81 0.14
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.18
87 0.18
88 0.19
89 0.17
90 0.18
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.13
95 0.16
96 0.19
97 0.23
98 0.23
99 0.23
100 0.22
101 0.24
102 0.28
103 0.27
104 0.26
105 0.23
106 0.21
107 0.21
108 0.21
109 0.2
110 0.14
111 0.09
112 0.07
113 0.05
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.09
131 0.1
132 0.15
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.16
137 0.17
138 0.17
139 0.17
140 0.14
141 0.13
142 0.16
143 0.19
144 0.21
145 0.2
146 0.18
147 0.17
148 0.15
149 0.14
150 0.12
151 0.09
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.1
163 0.17
164 0.23
165 0.24
166 0.28
167 0.28
168 0.31
169 0.37
170 0.46
171 0.48
172 0.51
173 0.6
174 0.66
175 0.73
176 0.76
177 0.73
178 0.67
179 0.63
180 0.63
181 0.6
182 0.57
183 0.5
184 0.43
185 0.39
186 0.36
187 0.32
188 0.29
189 0.29
190 0.29
191 0.35
192 0.41
193 0.49
194 0.53
195 0.55
196 0.54
197 0.57
198 0.6
199 0.63
200 0.68
201 0.71
202 0.78
203 0.84
204 0.82
205 0.8
206 0.76
207 0.75
208 0.73
209 0.71
210 0.71
211 0.68
212 0.68
213 0.63
214 0.56
215 0.48
216 0.39
217 0.34
218 0.25
219 0.2
220 0.18
221 0.16
222 0.2
223 0.21
224 0.23
225 0.2
226 0.19
227 0.21
228 0.26
229 0.28
230 0.3
231 0.32
232 0.33
233 0.34
234 0.38
235 0.38
236 0.33
237 0.31
238 0.26
239 0.25
240 0.21
241 0.27
242 0.28
243 0.32
244 0.38
245 0.47