Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GNV1

Protein Details
Accession C5GNV1    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
122-143DESEKWDKRMEKKQRHRDDTAFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-245IRLKKRKDRG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MDKAGVQKANSNSPTCPEEHPISDDAKTLSAEPETNKTVDAAFSRTKEMRERFKALQARAKNATERNLKETAAESQRLATDPSLLSSISRKHAFASHNLLKADTESQGEDFERKRAWDWTIDESEKWDKRMEKKQRHRDDTAFQDYRQDARKIYKRQMRQMQPDLEAYEKEKILAVEKAAASGGLQIVEAEDGELVAVDKNGTFYSTADSVDFAENKPDRAAVDRLVADLRKAEEIRLKKRKDRGRGDEEDDVTYINDQNKKFNQQLARFYNKYTAEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.37
3 0.37
4 0.33
5 0.34
6 0.34
7 0.36
8 0.34
9 0.34
10 0.32
11 0.31
12 0.26
13 0.22
14 0.2
15 0.17
16 0.17
17 0.16
18 0.18
19 0.18
20 0.22
21 0.23
22 0.23
23 0.22
24 0.21
25 0.2
26 0.2
27 0.19
28 0.19
29 0.21
30 0.22
31 0.27
32 0.29
33 0.31
34 0.38
35 0.43
36 0.48
37 0.51
38 0.56
39 0.53
40 0.6
41 0.64
42 0.61
43 0.63
44 0.57
45 0.56
46 0.55
47 0.55
48 0.52
49 0.48
50 0.51
51 0.51
52 0.5
53 0.48
54 0.45
55 0.42
56 0.37
57 0.35
58 0.34
59 0.3
60 0.28
61 0.24
62 0.23
63 0.24
64 0.23
65 0.23
66 0.16
67 0.14
68 0.12
69 0.13
70 0.12
71 0.11
72 0.11
73 0.13
74 0.16
75 0.19
76 0.2
77 0.19
78 0.2
79 0.25
80 0.26
81 0.28
82 0.34
83 0.34
84 0.37
85 0.37
86 0.36
87 0.31
88 0.3
89 0.27
90 0.18
91 0.14
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.12
96 0.13
97 0.13
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.17
103 0.18
104 0.2
105 0.22
106 0.25
107 0.29
108 0.29
109 0.27
110 0.28
111 0.34
112 0.3
113 0.28
114 0.27
115 0.26
116 0.33
117 0.43
118 0.51
119 0.55
120 0.64
121 0.74
122 0.8
123 0.82
124 0.8
125 0.74
126 0.69
127 0.65
128 0.64
129 0.54
130 0.44
131 0.41
132 0.37
133 0.35
134 0.34
135 0.27
136 0.2
137 0.26
138 0.35
139 0.36
140 0.44
141 0.49
142 0.5
143 0.59
144 0.66
145 0.67
146 0.67
147 0.68
148 0.63
149 0.58
150 0.53
151 0.45
152 0.36
153 0.29
154 0.22
155 0.18
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.11
160 0.13
161 0.13
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.11
197 0.12
198 0.14
199 0.14
200 0.11
201 0.19
202 0.19
203 0.2
204 0.2
205 0.19
206 0.17
207 0.21
208 0.23
209 0.17
210 0.2
211 0.2
212 0.2
213 0.22
214 0.22
215 0.18
216 0.18
217 0.17
218 0.18
219 0.18
220 0.19
221 0.24
222 0.33
223 0.43
224 0.5
225 0.55
226 0.58
227 0.68
228 0.74
229 0.77
230 0.8
231 0.79
232 0.79
233 0.8
234 0.79
235 0.77
236 0.69
237 0.6
238 0.5
239 0.4
240 0.31
241 0.25
242 0.22
243 0.2
244 0.24
245 0.23
246 0.31
247 0.36
248 0.42
249 0.44
250 0.49
251 0.53
252 0.54
253 0.64
254 0.64
255 0.68
256 0.62
257 0.61
258 0.61
259 0.53
260 0.5
261 0.44
262 0.41
263 0.38
264 0.39
265 0.41
266 0.39
267 0.4
268 0.36