Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GSR1

Protein Details
Accession C5GSR1    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-40PSSFRTAQYEARKRKQNVQEPGQDVHydrophilic
107-128HSGLGKRKTTKISRKQIEKELSHydrophilic
440-461NVFFEKAKAKARRKQTPLSSDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
449-450KA
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 11, mito_nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
Gene Ontology GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MSSSYFSLPLAPWQQPSSFRTAQYEARKRKQNVQEPGQDVEEHEVSIANTSDDDTSASSSTESGADDENAAGSGPRQSIILTPNEAHQYRVAGQPFHKELPGGSFPHSGLGKRKTTKISRKQIEKELSQLSPPIFIPRAEGQCSSLRLQHLGVITTILHRCLLEGDYARAGRAWGLILRDEFGGHGIDVRSGGRWGIGAEILLWSDHNATAHSSTSTGIGDAGIPHPPPRRHWFTRRGFERAKSYYERLILQFPYRKTAPGALGPLDFYPAMFGLWISLVQEESQSARDAAMMDMSDTAEMYDFDDPTHDDNMSISSDMPHRRRSSNNRKNDIIAETRRKELAEAEQIAAQMDELLISPPFSDSHELLQLRGMLSLWIADLFISSVSPEDDDTDMHMDMRHDGDQTMFSDEGGGQMDSVLARMERGLGMERKMAEMEKANVFFEKAKAKARRKQTPLSSDEVNEDDSVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.37
3 0.4
4 0.41
5 0.4
6 0.39
7 0.42
8 0.43
9 0.48
10 0.54
11 0.61
12 0.62
13 0.68
14 0.76
15 0.74
16 0.8
17 0.82
18 0.81
19 0.81
20 0.8
21 0.8
22 0.74
23 0.72
24 0.64
25 0.54
26 0.45
27 0.4
28 0.31
29 0.21
30 0.18
31 0.15
32 0.13
33 0.15
34 0.14
35 0.09
36 0.08
37 0.1
38 0.1
39 0.09
40 0.1
41 0.09
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.09
51 0.1
52 0.1
53 0.11
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.08
58 0.07
59 0.06
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.13
66 0.16
67 0.19
68 0.19
69 0.19
70 0.23
71 0.29
72 0.29
73 0.27
74 0.25
75 0.25
76 0.24
77 0.29
78 0.28
79 0.25
80 0.27
81 0.33
82 0.36
83 0.34
84 0.32
85 0.27
86 0.25
87 0.28
88 0.3
89 0.25
90 0.24
91 0.24
92 0.24
93 0.28
94 0.29
95 0.25
96 0.28
97 0.33
98 0.38
99 0.39
100 0.45
101 0.49
102 0.58
103 0.67
104 0.7
105 0.74
106 0.75
107 0.81
108 0.82
109 0.82
110 0.79
111 0.7
112 0.65
113 0.59
114 0.5
115 0.41
116 0.38
117 0.29
118 0.24
119 0.22
120 0.2
121 0.17
122 0.16
123 0.2
124 0.23
125 0.26
126 0.26
127 0.27
128 0.26
129 0.28
130 0.31
131 0.28
132 0.26
133 0.23
134 0.22
135 0.21
136 0.21
137 0.18
138 0.16
139 0.14
140 0.12
141 0.11
142 0.13
143 0.13
144 0.11
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.14
154 0.15
155 0.14
156 0.13
157 0.12
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.09
213 0.15
214 0.17
215 0.21
216 0.28
217 0.36
218 0.41
219 0.49
220 0.56
221 0.59
222 0.68
223 0.67
224 0.67
225 0.62
226 0.59
227 0.58
228 0.5
229 0.46
230 0.4
231 0.38
232 0.34
233 0.33
234 0.31
235 0.25
236 0.26
237 0.22
238 0.23
239 0.26
240 0.23
241 0.26
242 0.25
243 0.24
244 0.22
245 0.24
246 0.22
247 0.19
248 0.2
249 0.17
250 0.16
251 0.16
252 0.15
253 0.13
254 0.11
255 0.08
256 0.07
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.04
287 0.04
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.12
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.11
300 0.11
301 0.1
302 0.08
303 0.09
304 0.14
305 0.21
306 0.24
307 0.3
308 0.32
309 0.36
310 0.45
311 0.55
312 0.61
313 0.64
314 0.71
315 0.71
316 0.7
317 0.68
318 0.63
319 0.56
320 0.53
321 0.52
322 0.51
323 0.46
324 0.46
325 0.45
326 0.41
327 0.37
328 0.32
329 0.3
330 0.28
331 0.28
332 0.27
333 0.27
334 0.27
335 0.26
336 0.23
337 0.16
338 0.08
339 0.06
340 0.05
341 0.04
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.07
348 0.09
349 0.12
350 0.12
351 0.15
352 0.22
353 0.22
354 0.21
355 0.23
356 0.22
357 0.19
358 0.19
359 0.16
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.07
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.12
380 0.14
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.13
385 0.14
386 0.17
387 0.16
388 0.14
389 0.14
390 0.15
391 0.15
392 0.16
393 0.18
394 0.15
395 0.14
396 0.14
397 0.14
398 0.14
399 0.14
400 0.12
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.15
414 0.18
415 0.2
416 0.24
417 0.24
418 0.25
419 0.26
420 0.25
421 0.22
422 0.24
423 0.27
424 0.29
425 0.3
426 0.29
427 0.29
428 0.3
429 0.28
430 0.28
431 0.31
432 0.28
433 0.37
434 0.46
435 0.55
436 0.61
437 0.7
438 0.76
439 0.77
440 0.83
441 0.83
442 0.82
443 0.77
444 0.74
445 0.68
446 0.59
447 0.55
448 0.47
449 0.38