Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C5GKH0

Protein Details
Accession C5GKH0    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
293-315ESQEAKRRRRRASHNMVERRRRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
298-307KRRRRRASHN
311-312RR
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11387  bHLHzip_USF_MITF  
Amino Acid Sequences MAETTFIKNEPEDQGSNPHQFLMSGSAFGMPSPGFGSNFGNSAANDGIDPSELTMQNGGFMSYPFNSQQNLSSSFNLGNSSIDTAELLDLDLNVGRDNSLSFVQDQQRQPTGISMSHQGQMTHVYSNTPDGAPIQSPFIRGNFNYEQFRVNQGHQATSPHMNVNTHFDQHYANGRLGFHGADRNSIDARSPMTPKTPAIAGLNIGTPDSGSFPSQPMRAVSLQSRHQKTLSNQWDGTPGSAQSLIDSPISSPGHPSHHTGISEILKSGKHASLPTKVDLVHGHHHSTSAQSLESQEAKRRRRRASHNMVERRRRDNINERIQDLSHLVPHHRLEDDKIRKQLVNNSALANSTTGSGLSPTNAATSLLAGGSGRRATAGNITMGLPIEEKEKGPNKGDILNGAVGWTRDLMWAMHVKLQQEDELAELITSLGGTWPFEQTEEEKRMRTELIDAMEKNDPNTFSYSRAPGSGLRVPKHTNIAGEALQPDILSPQSLSPAFHSGGSGTNSGGAQPQYWNTSGHAGMSFKEEDEYSMEMN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.39
3 0.43
4 0.39
5 0.35
6 0.3
7 0.28
8 0.27
9 0.26
10 0.2
11 0.16
12 0.16
13 0.17
14 0.16
15 0.16
16 0.17
17 0.1
18 0.1
19 0.12
20 0.14
21 0.12
22 0.14
23 0.18
24 0.17
25 0.19
26 0.19
27 0.19
28 0.16
29 0.19
30 0.18
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.12
35 0.1
36 0.11
37 0.09
38 0.14
39 0.14
40 0.15
41 0.16
42 0.16
43 0.17
44 0.17
45 0.16
46 0.11
47 0.11
48 0.13
49 0.12
50 0.15
51 0.15
52 0.17
53 0.18
54 0.19
55 0.23
56 0.25
57 0.29
58 0.3
59 0.29
60 0.29
61 0.29
62 0.29
63 0.26
64 0.21
65 0.16
66 0.14
67 0.15
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.07
75 0.06
76 0.05
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.17
90 0.23
91 0.31
92 0.33
93 0.37
94 0.39
95 0.38
96 0.38
97 0.34
98 0.31
99 0.25
100 0.24
101 0.23
102 0.22
103 0.25
104 0.26
105 0.22
106 0.2
107 0.23
108 0.22
109 0.2
110 0.18
111 0.15
112 0.15
113 0.17
114 0.18
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.16
122 0.15
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.2
127 0.19
128 0.26
129 0.26
130 0.3
131 0.32
132 0.31
133 0.32
134 0.3
135 0.35
136 0.3
137 0.27
138 0.28
139 0.26
140 0.27
141 0.25
142 0.26
143 0.24
144 0.26
145 0.26
146 0.22
147 0.23
148 0.22
149 0.22
150 0.26
151 0.25
152 0.23
153 0.21
154 0.2
155 0.19
156 0.21
157 0.27
158 0.22
159 0.21
160 0.21
161 0.21
162 0.21
163 0.21
164 0.19
165 0.12
166 0.15
167 0.14
168 0.15
169 0.15
170 0.17
171 0.17
172 0.16
173 0.16
174 0.12
175 0.14
176 0.15
177 0.16
178 0.16
179 0.18
180 0.2
181 0.2
182 0.2
183 0.18
184 0.17
185 0.17
186 0.16
187 0.13
188 0.12
189 0.13
190 0.11
191 0.1
192 0.08
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.12
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.15
205 0.15
206 0.17
207 0.19
208 0.21
209 0.28
210 0.36
211 0.38
212 0.36
213 0.36
214 0.39
215 0.38
216 0.44
217 0.43
218 0.4
219 0.37
220 0.36
221 0.39
222 0.34
223 0.32
224 0.22
225 0.16
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.07
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.13
239 0.14
240 0.18
241 0.19
242 0.22
243 0.2
244 0.22
245 0.22
246 0.21
247 0.22
248 0.2
249 0.19
250 0.16
251 0.14
252 0.11
253 0.12
254 0.14
255 0.11
256 0.11
257 0.12
258 0.15
259 0.2
260 0.22
261 0.22
262 0.22
263 0.21
264 0.21
265 0.21
266 0.22
267 0.21
268 0.2
269 0.21
270 0.19
271 0.2
272 0.18
273 0.18
274 0.15
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.14
281 0.14
282 0.2
283 0.28
284 0.36
285 0.43
286 0.51
287 0.56
288 0.61
289 0.7
290 0.74
291 0.77
292 0.79
293 0.81
294 0.83
295 0.84
296 0.84
297 0.79
298 0.73
299 0.68
300 0.61
301 0.57
302 0.57
303 0.59
304 0.6
305 0.58
306 0.54
307 0.5
308 0.47
309 0.41
310 0.33
311 0.24
312 0.16
313 0.14
314 0.14
315 0.16
316 0.17
317 0.18
318 0.17
319 0.17
320 0.18
321 0.27
322 0.35
323 0.37
324 0.4
325 0.41
326 0.42
327 0.43
328 0.48
329 0.44
330 0.4
331 0.36
332 0.33
333 0.31
334 0.3
335 0.28
336 0.2
337 0.13
338 0.09
339 0.08
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.07
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.07
358 0.07
359 0.06
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.12
364 0.13
365 0.12
366 0.13
367 0.13
368 0.13
369 0.13
370 0.12
371 0.09
372 0.08
373 0.09
374 0.1
375 0.1
376 0.16
377 0.22
378 0.26
379 0.28
380 0.32
381 0.32
382 0.34
383 0.35
384 0.29
385 0.26
386 0.23
387 0.2
388 0.16
389 0.15
390 0.11
391 0.11
392 0.1
393 0.08
394 0.07
395 0.09
396 0.08
397 0.1
398 0.14
399 0.15
400 0.19
401 0.21
402 0.21
403 0.22
404 0.23
405 0.21
406 0.18
407 0.17
408 0.13
409 0.12
410 0.11
411 0.09
412 0.07
413 0.06
414 0.05
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.05
419 0.06
420 0.07
421 0.09
422 0.09
423 0.1
424 0.12
425 0.15
426 0.23
427 0.28
428 0.3
429 0.3
430 0.31
431 0.33
432 0.31
433 0.29
434 0.24
435 0.22
436 0.24
437 0.27
438 0.26
439 0.28
440 0.32
441 0.31
442 0.29
443 0.28
444 0.25
445 0.21
446 0.27
447 0.24
448 0.23
449 0.27
450 0.3
451 0.28
452 0.28
453 0.28
454 0.25
455 0.3
456 0.33
457 0.35
458 0.34
459 0.38
460 0.41
461 0.43
462 0.47
463 0.42
464 0.37
465 0.33
466 0.34
467 0.3
468 0.29
469 0.26
470 0.2
471 0.18
472 0.16
473 0.14
474 0.11
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.14
480 0.15
481 0.16
482 0.18
483 0.22
484 0.22
485 0.21
486 0.21
487 0.17
488 0.21
489 0.22
490 0.2
491 0.16
492 0.17
493 0.16
494 0.16
495 0.19
496 0.15
497 0.14
498 0.16
499 0.19
500 0.21
501 0.23
502 0.24
503 0.22
504 0.26
505 0.25
506 0.24
507 0.24
508 0.21
509 0.21
510 0.24
511 0.23
512 0.19
513 0.2
514 0.18
515 0.17
516 0.19